Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00501000

Standard Name

TNT1 (tRNA-nucleotidyltransferase 1)

Aliases

PreTt08044 | 63.m00222 | 3716.m00075

Description

TNT1 poly(A) polymerase putative; tRNA-nucleotidyltransferase

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• nucleotidyltransferase activity (IEA) | GO:0016779
• RNA binding (IEA) | GO:0003723

Biological Process

• RNA processing (IEA) | GO:0006396

Domains

• ( TIGR01942 ) poly(A) polymerase
• ( TIGR02692 ) tRNA adenylyltransferase
• ( PF01743 ) tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase family protein

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.3%

TetraMine Data

TTHERM_00501000

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_09625.1	9.997093137033517e-262	polyA polymerase (572 aa)
SGD	YER168C	5.0023264312997875e-87	CCA1 ATP (CTP):tRNA-specific t RNA nucleotidyltransferase; di fferent forms targeted to the nucleus, cytosol, and mitochon drion are generated via the us e of multiple transcriptional and translational start sites
DictyBase	DDB_G0293504	1.999469658314961e-75	DDB_G0293504 on chromosome: 6 position 2968920 to 2970687
Oxytricha	Contig19735.0.g24	3.9983507938127826e-75	Poly A polymerase head domain
Stentor Coeruleus	SteCoe_13750	8.194012623990515e-40
WormBase	WBGene00010089	0.00000000000009996062864481225	locus:hpo-31 status:Confirme d UniProt:Q93795 protein_i d:CAB02125.2

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00501000(coding)
ATGATTAGCTTTATTGGTAAAAATCAAATTAAATAGTTTTTTAGTCTCAATTTTAATATA
AACAGATAATATAATAAACAATTAAAATATCATTAAAAAGCATAATCCTAGTTTGAAGGA
AAAAGTAATCAAAATATAATTAAAATATATTAGCAAGAATAATAAAGACACCTATTTTAC
TAAGGATAGTATTCATTTAATAGATTAAGAGCTTGTGCAAGAAGGATGGAAATAGAATCT
GATATTAAAATTACTTTAAATGAAAAAGAAAAGTAATTATTTGACTTTTTACTAGAATTT
GTTAAAGCCAAAAATATATAAGTAGTACTTCGTTCAGCTGGAGGTTGGGTTCGTGATAAG
ATTTTAGGCTAAGAATGTCATGATATTGATATTACATTAGATACTATGACTGGTGAGTAG
TTTATTAACTTATTGATTGACTACCTCAAGGAAAAGGGTTAGGAAGACCTTATATCAGGT
CATGGTGTTATTAAAAGTAACCCTGATAAATCTAAGCATTTAGAAACAGTCACTTTCAAA
ATTTTTGGATACGACATTGATATCGCTAATTTAAGACATGAAGAATATACAAAATCTAGA
ATTCCTACTATGAAATTTGGTACTCCACTTTAAGATGCTGAAAGAAGAGATTTAACAATA
AATTCAATGTTCTACAATATTAATACTTGTTAAATAGAAGATTTTACAGGTAAAGGTCTT
AGTGATCTTTAAAACAAAATCATCAGAACTCCATTAGATCCTACATAAACCTTTATTGAT
GATCCCTTGAGAATTTTGAGAACATTTAGATTCGCAACAAAGTATTCTTTTTCAATAGTT
CCAGACATTATTGAAGCACTTAAATAAGAATAAATAAGAATTAGTTTAGAAGAAAAAGTT
AGCAGAGAAAGAATAAGAACTGAGCTTGAAAAAATATTGAAAGATAAGAATGTGGAGATA
GGATTGAACTTAATATTCTAAAATAATTTATGGTCAATTGTATTCTAGATGCCAGATAAA
TGTGACGAATTGAAAGATAAAGTGTTCTATGATTAAAAATAACTAGAATCATATAACCTT
GCAATCAGATCAGTTTAAGAACTAAAAACTGTATAAGATATGCCCATTTTATCACAGGAC
TTCTAATAATAAGATGTTTAATTATTATTCTTAATGTCTGCTATTTCTTTCCCATTCGCT
AAAATTTAGTATAAAATTAATAAAACAATAATGTCTCTTCCTCAATATTTAGCTTTTGAA
TCCCTTAAATTCCCTGATAAAGCCTTGAAGGTTTGCACTATTATAACTCAAACTTGTGAA
AATGCTCTCAAGATTTAAGAAATTATTAAGAAAAATTTCGATGAAGAATTTAATAATATA
GCTCAACTAATTAAAAAGCTAGGAAATACATGGGAGCTCGCGTTTTCTATTGCTAGAATA
AGTGACTCTATCTAATTCAAGGATGAATTTTCCTCAAGTTATGATAAGTTAATTGAGTTT
ATTTATTTTAACAAAATCGAAAAAGTATATGCAATGAAACCTTTAATTGACGGTAAAGAA
ATTATGGGAATATTTGAACTGGATAAGTAAGGCCCTGTTGTAGGAAAAATTAATACAAAC
ATCTTTCTTTGGTAAGCTAAAAATATGGATAAGTAGAAGGATGACTTAATAGCAGAAATA
GTTAAAAATAAATAAAAGTTTATGTTATGA

>TTHERM_00501000(protein)
MISFIGKNQIKQFFSLNFNINRQYNKQLKYHQKAQSQFEGKSNQNIIKIYQQEQQRHLFY
QGQYSFNRLRACARRMEIESDIKITLNEKEKQLFDFLLEFVKAKNIQVVLRSAGGWVRDK
ILGQECHDIDITLDTMTGEQFINLLIDYLKEKGQEDLISGHGVIKSNPDKSKHLETVTFK
IFGYDIDIANLRHEEYTKSRIPTMKFGTPLQDAERRDLTINSMFYNINTCQIEDFTGKGL
SDLQNKIIRTPLDPTQTFIDDPLRILRTFRFATKYSFSIVPDIIEALKQEQIRISLEEKV
SRERIRTELEKILKDKNVEIGLNLIFQNNLWSIVFQMPDKCDELKDKVFYDQKQLESYNL
AIRSVQELKTVQDMPILSQDFQQQDVQLLFLMSAISFPFAKIQYKINKTIMSLPQYLAFE
SLKFPDKALKVCTIITQTCENALKIQEIIKKNFDEEFNNIAQLIKKLGNTWELAFSIARI
SDSIQFKDEFSSSYDKLIEFIYFNKIEKVYAMKPLIDGKEIMGIFELDKQGPVVGKINTN
IFLWQAKNMDKQKDDLIAEIVKNKQKFML

>TTHERM_00501000(gene)
ATGATTAGCTTTATTGGTAAAAATCAAATTAAATAGTTTTTTAGTCTCAATTTTAATATA
AACAGATAATATAATAAACAATTAAAATATCATTAAAAAGCATAATCCTAGTTTGAAGGA
AAAAGTAATCAAAATATAATTAAAATATATTAGCAAGAATAATAAAGACACCTATTTTAC
TAAGGATAGTATTCATTTAATAGATTAAGAGCTTGTGCAAGAAGGATGGAAATAGAATCT
GATATTAAAATTACTTTAAATGAAAAAGAAAAGTAATTATTTGACTTTTTACTAGAATTT
GTTAAAGCCAAAAATATATAAGTAGTACTTCGTTCAGCTGGAGGTTGGGTTCGTGATAAG
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TCTTAAAAATATTTTTGTATTTAACTCCAGATTTTAGGCTAAGAATGTCATGATATTGAT
ATTACATTAGATACTATGACTGGTGAGTAGTTTATTAACTTATTGATTGACTACCTCAAG
GAAAAGGGTTAGGAAGACCTTATATCAGGTCATGGTGTTATTAAAAGTAACCCTGATAAA
TCTAAGCATTTAGAAACAGTCACTTTCAAAATTTTTGGATACGACATTGATATCGCTAAT
TTAAGACATGAAGAATATACAAAATCTAGAATTCCTACTATGGTAATCAAAATTTACATT
CAAAAAGACTAAACTTAATGAAAAAATAATGCAAATAATATTAAAAGAAATTTGGTACTC
CACTTTAAGATGCTGAAAGAAGAGATTTAACAATAAATTCAATGTTCTACAATATTAATA
CTTGTTAAATAGAAGATTTTACAGGTAAAGGTCTTAGTGATCTTTAAAACAAAATCATCA
GAACTCCATTAGATCCTACATAAGTAAATAGCTTGAAATATTAAGTTGAAATTAATTTAA
TAATAAATAAAGACCTTTATTGATGATCCCTTGAGAATTTTGAGAACATTTAGATTCGCA
ACAAAGTATTCTTTTTCAATAGTTCCAGACATTATTGAAGCACTTAAATAAGAATAAATA
AGAGTATTAAATTTTTGTATCTTTTACTAACTTATTTATTATTAATTAAAATAAAAAAAT
AGATTAGTTTAGAAGAAAAAGTTAGCAGAGAAAGAATAAGAACTGAGCTTGAAAAAATAT
TGAAAGATAAGAATGTGGAGATAGGATTGAACTTAATATTCTAAAATAATTTATGGTCAA
TTGTATTCTAGATGCCAGATAAATGTGACGAATTGAAAGATAAAGTGTTCTATGATTAAA
AATAACTAGAATCATATAACCTTGCAATCAGATCAGTTTAAGAACTAAAAACTGTATAAG
ATATGCCCATTTTATCACAGGACTTCTAATAATAAGATGTTTAATTATTATTCTTAATGT
CTGCTATTTCTTTCCCATTCGCTAAAATTTAGTATAAAATTAATAAAACAATAATGTCTC
TTCCTCAATATTTAGCTTTTGAATCCCTTAAAGTAATTAATTAATTAAAAAATTATTACA
TTAAATATAAAAATTCATAAAAAATATTTTTCATAGTTCCCTGATAAAGCCTTGAAGGTT
TGCACTATTATAACTCAAACTTGTGAAAATGCTCTCAAGATTTAAGAAATTATTAAGAAA
AATTTCGATGAAGAATTTAATAATATAGCTCAACTAATTAAAAAGCTAGGAAATACATGG
GAGCTCGCGTTTTCTATTGCTAGAATAAGTGACTCTATCTAATTCAAGGATGAATTTTCC
TCAAGTTATGATAAGTTAATTGAGTTTATTTATTTTAACAAAATCGAAAAAGTATATGCA
ATGAAACCTTTAATTGACGTAAAAAATTAATAAATAAATATGGATCTAAAGTAATATTTA
TATCTTCTTTTTAACTTAAATTAGGGTAAAGAAATTATGGGAATATTTGAACTGGATAAG
TAAGGCCCTGTTGTAGGAAAAATTAATACAAACATCTTTCTTTGGTAAGCTAAAAATATG
GATAAGTAGAAGGATGACTTAATAGCAGAAATAGTTAAAAATAAATAAAAGTTTATGTTA
TGA