Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00127000Standard Name
TMLH1 (Tetrahymena homolog of budding yeast MLH1)Aliases
PreTt09363 | 9.m00384 | 3699.m00093Description
TMLH1 DNA mismatch repair protein putative; DNA mismatch repair protein- C-terminal domain containing proteinGenome Browser (Macronucleus)
![]()
Genome Browser (Micronucleus)
![]()
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- mismatched DNA binding (IEA) | GO:0030983
- ATP binding (IEA) | GO:0005524
Biological Process
- mismatch repair (IEA) | GO:0006298
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.4%
TetraMine Data
TTHERM_00127000
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_09117.1 9.997093137033517e-262 DNA mismatch repair protein do
main-containing protein (747 a
a)
SGD YMR167W 8.999119107228014e-72 MLH1 Protein required for mism
atch repair in mitosis and mei
osis as well as crossing over
during meiosis; forms a comple
x with Pms1p and Msh2p-Msh3p d
uring mismatch repair; human h
omolog is associated with here
ditary non-polyposis colon can
cer
DictyBase DDB_G0287393 9.999565105288807e-71 mlh1 on chromosome: 5 position
247623 to 250277
Oxytricha Contig14864.0.g42 6.9991332754409754e-68 DNA mismatch repair protein, C
-terminal domain
WormBase WBGene00003373 9.004195835458823e-61 locus:mlh-1 status:Confirmed
UniProt:Q9XU10 protein_id
:CAB07283.2
Stentor Coeruleus SteCoe_23547 2.3802664086944007e-26
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:23935123: Lukaszewicz A, Howard-Till RA, Loidl J (2013) Mus81 nuclease and Sgs1 helicase are essential for meiotic recombination in a protist lacking a synaptonemal complex. Nucleic acids research 41(20):9296-309
Sequences
>TTHERM_00127000(coding)
ATGAATCATTCCTAACCCTTAGAAAATACTGGTCCTCAGATCAAGAAGCTCCCATAAGAG
CTTATCGATAAGATTGCAGCTGGTGAAGTAGTACAACGTCCATCTGCAGCTGTTAAGGAG
CTTATTGAGAACTGTCTTGATGCTGGATCAAGTGAAATTTCAGTAGGGTTAGTATAAGGA
GGGTTAAAGTAGCTTATTGTAGAAGATAATGGTTCTGGAATTCACAAAGACGATTTTCCA
CTTCTCTGCGAAAGGTTTGCTACCTCTAAGATAAATGAGTTTAATGACCTTTAGAGTTTA
GTTTCATTTGGCTTTAGAGGAGAAGCGTTAGCCTCTATTTCTTTTGTCTCCAACTTGAAA
ATCACATCTCGAAAACCTAATTCTGACCTAGGATATAAAGCTAGTTTCAAAAACGGTGTT
ATGCTTGGTGAAGAGCCTGAAGCAGTGAACTGTACTGAAGGGACTACAGTAGATGTCTAG
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GAAGATGGAAATAACAATTCAAATCAAAAAAATTATCAAAGTATTAATTATATTGAAGAG
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ATGCTCCCAATGATTAAAAAAAAACTTTCACTCCCTAAATTAGATATTAGCGAGTTTACA
GTTAAGCTATTTAAGCAAGAAGATGCATACAAGATCTTCGAAAGATGTTGA>TTHERM_00127000(protein)
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MLPMIKKKLSLPKLDISEFTVKLFKQEDAYKIFERC>TTHERM_00127000(gene)
ATGAATCATTCCTAACCCTTAGAAAATACTGGTCCTCAGATCAAGAAGCTCCCATAAGAG
CTTATCGATAAGATTGCAGCTGGTGAAGTAGTACAACGTCCATCTGCAGGTATTTGAATC
CGTCCTTTTCTATTTTTCAATATCCTGATGATAGTTTCTTTCAAATCAAAGCATCACTTC
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AATTAATTATAGCTGTTAAGGAGCTTATTGAGAACTGTCTTGATGCTGGATCAAGTGAAA
TTTCAGTAGGGTTAGTATAAGGAGGGTTAAAGTAGCTTATTGTAGAAGATAATGGTTCTG
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AGTTTAATGACCTTTAGAGTTTAGTTTCATTTGGCTTTAGAGGAGAAGCGTTAGCCTCTA
TTTCTTTTGTCTCCAACTTGAAAATCACATCTCGAAAACCTAATTCTGACCTAGGATATA
AAGCTAGTTTCAAAAACGGTGTTATGCTTGGTGAAGAGCCTGAAGCAGTGAACTGTACTG
AAGGGACTACAGTAGATGTCTAGGATTTATTTTTTAACTATGATGCAAGGTAAATTCAAT
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GATTATTATTAAATTAATGAATGCGCACAATTTTTTTTTATAAATGAATTAATATTTGAC
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TATTAATTTAAATTTCTTGTTCGTTCACCCATAAAACAAACAAAAAAGTTTTTACTTTAA
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CTTGAGCTTAGAAATGAATCCAAAGAACTTGGATCCTAATGTTCACCCAACAAAAAAAGA
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CAATGAAGAAAGAAATTAAACTTCAATCAGTAATATAGGAAGCTCTGACTAATTAGATGC
TAATAATGCTCGTTCAAGTGTCATCGATAGGGCAAATTCTTAAGTTAATGACCCACGTAT
TTAAGTATAATAATAGTTATTGTCTTTAAGGAATCAAGATATCCATGATACAACAAGTTC
TTTCTTTAAAAATCTTACGTATGTTGGCTGTATTTCTTCTAATCACTTTCTAGCTCAATT
TAGAGATGATCTCTACCTTATAAACTCTATTCCATTATGGTAAATTCATCTTTAAATCAT
TCGCTCTTTCTTTTAAATTTTAATGGAAACAAAAAAATAAACCAAAATATTTATTTATCA
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GCAATAGGTTTGAAGGATATTTTAGAGTATTTTTTATTAAATTTTGATGAGATACCGAAT
GAGAAAAAGGAGTTCCATCTGTCAAATATGGATGTATGTTAGTTATTTGTTAATTTTATC
AATAAATAAAATATTTTGATTAAAATTAGACTTACATCGAGTAATTTGGCTTATTGAGTG
ACTTTTTAAGAGACTCCGTAGGCATAGTCATCAAAGATTAAAAGCTCTTGGCTTTCCCTA
ATTTATTTAATTTATTTGAAAATGATAATAACTTTAAAGATATCTCATACATTCTGTTGA
GAATAATCACCAAAGTAAATAAATAAATAAAAAGCTATTTGCTTATTTACAAACAATATA
TAATAAACTTTTTAAATTCAAAGGTTAATTTTAGCGAAATACTCTAATCAGGTATGGGCT
TAGCAAACGAATTATCATTCTACTTTGCTTGGCAATTAGAAAAATCGTTTAAAAATTAAT
TGTAAAGACAGCATTTCTAGGAAACGCAAAAGCAGAAATGGGACGATTTCTTTGAATAAA
AAATGCTCCCAATGATTAAAAAAAAACTTTCACTCCCTAAATTAGATATTAGCGAGTTTA
CAGTTAAGCTATTTAAGCAAGAAGATGCATACAAGATCTTCGAAAGATGTTGA