Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00492460Standard Name
TKU80 (Tetrahymena KU80 ortholog )Aliases
PreTt04182 | 61.m00169 | 3711.m00017Description
TKU80 Ku70/Ku80 beta-barrel domain protein; Ku70/Ku80 beta-barrel domain containing protein; component of KU heterodimer; repairs non-homologous end breaks in DNAGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
Cellular Component
- nucleus (IEA) | GO:0005634
Molecular Function
- ATP-dependent DNA helicase activity (IEA) | GO:0004003
- DNA binding (IEA) | GO:0003677
Biological Process
- double-strand break repair via nonhomologous end joining (IEA) | GO:0006303
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 17%
TetraMine Data
TTHERM_00492460
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_12939.1 9.997093137033517e-262 Ku70/Ku80 beta-barrel domain-c
ontaining protein (759 aa)
Oxytricha Contig9679.0.g87 5.999773492405769e-126 Ku C terminal domain like
DictyBase DDB_G0286303 2.0006821221283624e-88 ku80 on chromosome: 4 position
4329334 to 4331844
Stentor Coeruleus SteCoe_28760 5.0345753587649823e-45 SGD YMR106C 0.00000000030007160092483236 YKU80 Subunit of the telomeric
Ku complex (Yku70p-Yku80p), i
nvolved in telomere length mai
ntenance, structure and telome
re position effect; relocates
to sites of double-strand clea
vage to promote nonhomologous
end joining during DSB repair
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00492460(coding)
ATGGCAGGAAAAGAAGCTACTATTATCCTATTAGATATGGGTAGTTCTATGCAATAGTAT
TTAGGTGATAGAGGAACTAATGGTTAAAAAAGAATCGAAATAGCCGTTAATTGCATAAAA
CTCTTATTATAACAAAAAATGTTTAATACAAAGACTCATGAAGTTGGACTTATTTTATTT
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ATTGACTTTTTAAAGAATGTTCAAGATTTGAAAGATTATTAATCTGATGAATGCGAAGGA
GGAGATATTTTTGAAGCTATTGAGCAAACAATAGATGTTATTCATGATTACGTTAAAGAA
AAAAAATATGAAAAGAAAATTCAATTGATGACAGCAGGATTTGGAAAAACCAGCTACAAG
GAAAAATAAATAATGGATTTAATTGAAAAGGCCAGAAAGGTTCAAACTAAAATTAATGTT
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GAGCAGTTTAGAACTCGTCAAGTTAATCTTAGATCAAAGTTTAATGGTGATTTGTAGCTT
GCTCCTAATCTCAATATAGCAGTGCAAATGTTCACAAAAACTTCAGAGGAAAAACTCCCT
GGCTTAAAAATGTATTCATTAGCTGTTGACTTTAATCCTCATTGTGAAAGCGGATAAATC
GAGCGTGATGTAATAATGGCACTTTAAGAAGATCCAAACTTGAATCCTATTGATAAATCT
AACATAACTAAGGCATATCATTATGGAAAATAACTCATTCCTGTTACTTAAGCTTTGGAG
GCTTAAATGAATTATACTTCAAATCGTGAATTGAAGGTTTTAGGTTTTGTAGATTCCAAA
AAAGTTCCAAGATAGTCCTTTATGGCTGGTGTAGATATTATTATTGCTAATAAAAATGAT
TCTGTTGCTAAAAAAGGTATTGCTGCTCTTTGTCATAGTATGATCTAAACCAATAAATAT
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AAATACACTTTTAATCCTACCCGTTAATACTTTTATTAAACTGTTTTCCATCGAGTATTT
AATCCTCCCGATGCTGATACTAAAATTCCTCCACTTGATCCTAATATCAGAGACTATATA
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CTCTTTAATCCTAACTATCAAGTACCTGCTGCAAATATTAATGCTCCTCAAGTCTAAATT
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AAAATGCTCATATAATAAGGTATAACTCTAATTACAGATAAAGAAAGCACAAAATCTAAT
TTTACCACTAAAGAAGCTCTCTAGTTTTTGCACTAAGAAGAAGATGTCATTTAAAATATA
CCTGAAGTAAGAAAATAAATCGAAGATTATGATATCATGGACGAACTAGAATGA>TTHERM_00492460(protein)
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FTTKEALQFLHQEEDVIQNIPEVRKQIEDYDIMDELE>TTHERM_00492460(gene)
ATGGCAGGAAAAGAAGCTACTATTATCCTATTAGATATGGGTAGTTCTATGCAATAGTAT
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CTCTTATTATAACAAAAAATGTTTAATACAAAGACTCATGAAGTTGGACTTATTTTATTT
GGTCTTAAAGATGAAGGTGACGATAAAATTATGTATATCAGAGGTATAGGAAAGCCTGAT
ATTGACTTTTTAAAGAATGTTCAAGATTTGAAAGATTATTAATCTGATGAATGCGAAGGA
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AAAAAATATGAAAAGAAAATTCAATTGATGACAGCAGGATTTGGAAAAACCAGCTACAAG
GAAAAATAAATAATGGATTTAATTGAAAAGGCCAGAAAGGTATTTTATTTCATTCATGTT
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CTATCATAATTTGAATTTTTTCCCCTTCATTAGAAGCTCTATCCAAACCTCCCCCTTTAG
AATTAACTATAATTTTACTCTGATCTTTTTTTTTTTCAAAATTAATAAATTAGCATTTTA
AAAGTTTTAAAGTATATTAAACACATTTTTTTTAATTTTTCTAGGAGGGCAAGATTTATT
TTTAATTAAGTGTATTAATTGTTTCAAAATATCATTTTTTCATATCAAAAAATTTCAAAA
AATAATTATTTATTTTTCATTTATTTAATAATAGAAATATTCAAAAATTTAATATATTTT
TAAATATTTAAACAGGTTCAAACTAAAATTAATGTTATTGGTTTTGACTTCTTAAAGAAA
TATAATCCTGAAGAAAGCAATACTGATGTGTTGAAAAAAGACGATGCTGCATAAAATACC
AGATAAAATTTAAATTAAAAGCTATTCTCAGTTGTTAAAGATGAATTAGGTGAACAAATT
CAACTTTTCCCTTCAGATGTTGCTATTAAAATTTATGAGCAGTTTAGAACTCGTCAAGTT
AATCTTAGATCAAAGTTTAATGGTGATTTGTAGCTTGCTCCTAATCTCAATATAGCAGTG
CAAATGTTCACAAAAACTTCAGAGGAAAAACTCCCTGGCTTAAAAATGTATTCATTAGCT
GTTGACTTTAATCCTCATTGTGAAAGCGGATAAATCGAGCGTGATGTAATAATGGCACTT
TAAGAAGATCCAAACTTGAATCCTATTGATAAATCTAACATAACTAAGGCATATCATTAT
GGAAAATAACTCATTCCTGTTACTTAAGCTTTGGAGGCTTAAATGAATTATACTTCAAAT
CGTGAATTGAAGGTTTTAGGTTTTGTAGATTCCAAAAAAGTTCCAAGATAGTCCTTTATG
GCTGGTGTAGATATTATTATTGCTAATAAAAATGATTCTGTTGCTAAAAAAGGTATTGCT
GCTCTTTGTCATAGTATGATCTAAACCAATAAATATGCTATAGCCCGTTATGTATGGCGT
AATAATGGTGCTCCCAAGCTTTGCGTTTTGACTCCATAAATTGGTAAAGACTATGAATGC
CTTTACATGTGCTAAATTCCTACTTCTGAAAGTGTCCGCGATTTTTAGTTTAATTCTCTC
AAAGAAAGCACAAAAGAATAACAAGATTTAATGGGATCTCTTATAGACAAAATGGATTTA
ATGAATCTTGAAGATGGCGAAGAAGCATTATAGATGAAATACACTTTTAATCCTACCCGT
TAATACTTTTATTAAACTGTTTTCCATCGAGTATTTAATCCTCCCGATGCTGATACTAAA
ATTCCTCCACTTGATCCTAATATCAGAGACTATATAACTCCTGAAAAGAAGGTTTACCCC
AAAGCTGCAGAAGAGTTAAAGAAAATAAAAGAGTCTTTCTAACTTTAAGAGCAAGAAATT
AAAGACGAAATTTCAAAGAAAATTTTTTGGTAATAACTCTTTAATCCTAACTATCAAGTA
CCTGCTGCAAATATTAATGCTCCTCAAGTCTAAATTAAGATGGAAAACGGCTAGATGGAG
TCAGAAGATGTAGAACAGTAAGCTTAAATTCTTGTAGATGTAAAAGAAGAATTAGAAAAT
ATTCCTATCTCAAAGAAATTTGCTTTCGACGATTATAACAAAGACGATGTAGTACGCAAG
GTTTCATCAGTATCGCCTGTTGATGATTTCTTCAAGATGATGACAAACAAGCGCGAAGAT
CTCGTTTCTGATGCTATATCACAAATATAAGGTATGATATCTCAGTTAATAGAAACAAGT
ATCCGTGGCTCTTATTATGAAAAAGCTCTTGAATGTATCAAAGCATTTAGAAAAGGTTGT
ACTTCAGAATACGAACAGTTAGAAGCACCCAAATTTAATAATTTCCTTAATACTTTCAAA
GACAAGTTGTTAAAGTCAGATTAAAAAGGATTTTGGAAAATGCTCATATAATAAGGTATA
ACTCTAATTACAGATAAAGAAAGCACAAAATCTAATTTTACCACTAAAGAAGCTCTCTAG
GTAAACAATATTTTAATTACTTTTAACCAGTTTTGGAATTCGCTCAATATTAATCACACA
TTTAATTATAAAGTTAAATTGTAAATTTGCTTATTTTTTAATTATTATTTAATATTAAAA
GTTTTTGCACTAAGAAGAAGATGTCATTTAAAATATACCTGAAGTAAGAAAATAAATCGA
AGATTATGATATCATGGACGAACTAGAATGA