Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00672190Standard Name
THD13 (Tetrahymena Histone Deacetylase 13)Aliases
PreTt10965 | 101.m00120Description
THD13 Sir2 family transcriptional regulator; Sir2-like histone deacetylase; suppresses DNA transcription by deacetylation of histones; homolog of Rattus norvegicus SIRT3Genome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- zinc ion binding (IEA) | GO:0008270
- NAD+ binding (IEA) | GO:0070403
- hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in linear amides (IEA) | GO:0016811
Biological Process
- protein deacetylation (IEA) | GO:0006476
- chromatin silencing (IEA) | GO:0006342
- regulation of transcription (IEA) | GO:0045449
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%
TetraMine Data
TTHERM_00672190
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_14307.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (944 aa)
Oxytricha Contig20663.0.g91 2.9992476920535046e-16 Kelch motif
WormBase WBGene00002186 0.0002999184360822198 locus:kel-10 Kelch repeat-co
ntaining protein kel-10 stat
us:Confirmed UniProt:P34569
protein_id:CAA83141.3
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:18178773: Smith JJ, Torigoe SE, Maxson J, Fish LC, Wiley EA (2008) A class II histone deacetylase acts on newly synthesized histones in Tetrahymena. Eukaryotic cell 7(3):471-82
- Ref:SUPR000242
- Ref:SUPR000118
- Ref:SUPR000071
- Ref:SUPR000215
- Ref:SUPR000157
- Ref:SUPR000232
Sequences
>TTHERM_00672190(coding)
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TTGAATCAATAAGAAATTTTAGCAACTCATTGTTTTTGA>TTHERM_00672190(protein)
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SQYFPSLKQLQGVTNVIKIGLNQQEILATHCF>TTHERM_00672190(gene)
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