Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00494100

Standard Name

TGT1 (tRNA-guanine transglycosylase 1)

Aliases

PreTt04247 | 61.m00234 | 3711.m00081

Description

queuine tRNA-ribosyltransferase family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• queuine tRNA-ribosyltransferase activity (IEA) | GO:0008479

Biological Process

• tRNA modification (IEA) | GO:0006400
• queuosine biosynthetic process (IEA) | GO:0008616

Domains

• ( PF03716 ) WCCH motif
• ( PF01702 ) Queuine tRNA-ribosyltransferase
• ( TIGR00430 ) queuine tRNA-ribosyltransferase
• ( TIGR00449 ) tRNA-guanine transglycosylases, various specificities

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%

TetraMine Data

TTHERM_00494100

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_13009.1	9.997093137033517e-262	queuine tRNA-ribosyltransferas e (430 aa)
Oxytricha	Contig21753.0.0.g22	1.0000297864968827e-159	Queuine tRNA-ribosyltransferas e
DictyBase	DDB_G0291802	2.9992103642374242e-151	qtrt1 on chromosome: 6 positio n 770747 to 772090
WormBase	WBGene00006566	2.0001701965494945e-132	locus:tgt-1 Probable queuine tRNA-ribosyltransferase sta tus:Confirmed UniProt:Q23623 protein_id:CAA98076.1
Stentor Coeruleus	SteCoe_13507	1.4788975056432133e-74

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00494100(coding)
ATGCAAAGTTATGCAAAATCTAAAAAAAAATTAATTAAACACTCCAAGAAGGATAATAAT
ATTAAAAGGCTTATCATTAAAAATTAGCTAAATAAATAAAAACTTATTAATTTATTTTGT
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AATTGGAAATATAATATTTTGACAGATTCTGGTGGTTTTTAAATGGTTTCACTTTCTAAA
TTATGTGAAATTTCTGAAGAAGGTGTAAAGTTTGAATCACCAGTTGATGGATCTGAAATG
TTTTTAAGACCTGAAGATTCTGTTCATAATTAGAATTAAATTGGAGCTGATATAATGATG
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GCTAAGATAAACTTAAATATAAAATTTGATGAGTGA

>TTHERM_00494100(protein)
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NFGENPVKKLKTESLSMNKALKFVVHKTCNKARASTLTLPHGEVLTPVYMPVGTKGTIKG
LTSQEMENLGCRLLLGNTYHLAYQPGGDYLEKVGGLHKFMNWKYNILTDSGGFQMVSLSK
LCEISEEGVKFESPVDGSEMFLRPEDSVHNQNQIGADIMMALDDVVQTTTVGERMKIACE
RTVRWIDRNIQAHERKEVQNLYPIVQGGLDFGLRKYCLDELIKRDAPGYAIGGLAGGEDK
QDFWKIVNFCTDHLPQDKPRYLMGVGYPDDLIVCSCLGVDQFDCVFSTRTARFGTAFTKY
GFMRLKNADKEFDLKPIEEGCECPTCQRYSRSFLHNTIAKEETACHLISQHNLYFLLNLM
KQFRQSILDGRMEEFVNEFFKNYFSHEKQIPQWIQDAMVAAKINLNIKFDE

>TTHERM_00494100(gene)
AATTAATGCAAAGTTATGCAAAATCTAAAAAAAAATTAATTAAACACTCCAAGAAGGATA
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TTTGTATATAGTTAGATTATATGGATAATCAAGACTCTAAAGTCGAATAATTAGGTTAAT
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TTTATCTCTAAAATAAAGAATTTACTTTTTAATTACATTCTTATTCTTTTGTCCAATTAT
TGTCAAATATTAAGTTTGTTATTAAGTTAAATATGCCTAATTATTCGGTATTGTCAACTA
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AAGCTGTTTAGATGAATTAATTAAAAGAGATGCTCCAGGATACGCTATAGGTGGTTTAGC
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ATAAGATAAGCCAAGATATCTTATGGGAGTTGGATATCCTGATGATTTGATTGTTTGCTC
ATGTTTAGGTGTTGATTAGTTTGACTGTGTTTTCTCTACAAGAACTGCAAGATTTGGAAC
TGCTTTTACTAAGTATGGATTTATGAGATTAAAAAATGCTGATAAAGAATTCGACCTTAA
GCCTATTGAAGAAGGCTGTGAATGTCCAGTAAAATATTATTTTATTTATTTATTTACTTA
CATTTGCTAATTTTGATGAAAACATAAAATAGACTTGCCAAAGATATTCAAGATCATTCC
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AATTTGTTAAGTAAATATTTAAAAAATTTAATTATTCTCTAATTTTTCCTAATTTGTTAT
TAAAAGTGAGTTCTTTAAAAACTATTTCAGCCATGAAAAGTAAATTCCATAGTGGATACA
AGATGCTATGGTTGCTGCTAAGATAAACTTAAATATAAAATTTGATGAGTGATATAATTT
ATTAGTTGATGTATTATTATTTTTTTGTGATCTTTTAATGTAAATAGTAAATTAATTTAA
CGAAAATTAAATCTATCAATTATAATATTTTATTGTATGAACA