Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00494100

Standard Name

TGT1 (tRNA-guanine transglycosylase 1)

Aliases

PreTt04247 | 61.m00234 | 3711.m00081

Description

TGT1 queuine tRNA-ribosyltransferase; queuine tRNA-ribosyltransferase family protein

Genome Browser (Macronucleus)

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Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF03716 ) WCCH motif
  • ( PF01702 ) Queuine tRNA-ribosyltransferase
  • ( TIGR00430 ) queuine tRNA-ribosyltransferase
  • ( TIGR00449 ) tRNA-guanine transglycosylases, various specificities

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%

TetraMine Data

TTHERM_00494100

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_13009.19.997093137033517e-262queuine tRNA-ribosyltransferas
e (430 aa)
OxytrichaContig21753.0.0.g221.0000297864968827e-159Queuine tRNA-ribosyltransferas
e
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n 770747 to 772090
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tRNA-ribosyltransferase sta
tus:Confirmed UniProt:Q23623
protein_id:CAA98076.1
Stentor CoeruleusSteCoe_135071.4788975056432133e-74

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00494100(coding)
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TCTAAATTATGTGAAATTTCTGAAGAAGGTGTAAAGTTTGAATCACCAGTTGATGGATCT
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ATGATGGCTCTTGATGATGTAGTATAAACAACAACTGTAGGAGAAAGAATGAAAATTGCA
TGTGAAAGAACAGTCAGATGGATTGATAGAAATATTTAAGCTCATGAAAGAAAAGAAGTT
TAAAATCTTTACCCTATCGTATAAGGCGGTTTAGATTTTGGCTTGAGAAAATACTGTTTA
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>TTHERM_00494100(protein)
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AKEETACHLISQHNLYFLLNLMKQFRQSILDGRMEEFVNEFFKNYFSHEKQIPQWIQDAM
VAAKINLNIKFDE


>TTHERM_00494100(gene)
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ATTTTACTTATTATCCTAAAACAATATGAAAAGCAAATACTTTATAATGAACATAATTTC
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AATTCTACTTTTACTAATAAAATAAATCGTTTTATAAGATCTTCATTAATTCACTAATTT
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ATTATTAAATGGATTCCTTTTATTTAAGACTCTATACACTATCTAATGCATTATTATTCT
TATTTGGGATAATCATTTAAATGAACATTTATACATTATTTGAAACATTATTTAGAAATA
TCTTTAATAGCATATGCCATGCAAACTATTTTGTCATGATCAAACTAGCTATTTACACTT
TCAAATTCACCAAATGTATCTTTTTTCAAATAAAACATTTCCTTATATGTATTTAAGCTA
ATAGTGTCATCATAAAATTATTCAATTTTTTCTTTCCATTCTTTCTCAGTAGACATTTTA
TATTTCTTTTGTTTGTTAACTTTCTCTAGTATTCTTTAGTTTTCTTTAAGTTTAAATGGA
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AAAATATTTTAGCAACATTAAAAGCATAAAATAGTTTTTAGTCTTTAACTTTATAGCTTA
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TACATTACCTCACGGTGAAGTTTTAACTCCTGTTTATATGCCAGTAGGAACAAAGGGTAC
TATAAAGGGTAAATATATATAAATTCTTTAATTTTTTTGATGAAAATGAAGGAAAATAAT
TATATTTTTTGGATTAATTTAAAAGGATTAACATCCTAAGAAATGGAAAATCTTGGTTGC
AGATTACTTCTAGGTAACACATACCATCTTGCTTACTAGCCTGGTGGAGATTATTTAGAA
AAAGTTGGTGGTTTGCATAAGTTTATGAATTGGAAATATAATATTTTGACAGATTCTGGT
GGTTTTTAAATGGTTTCACTTTCTAAATTATGTGAAATTTCTGAAGAAGGTGTAAAGTTT
GAATCACCAGTTGATGGATCTGAAATGTTTTTAAGACCTGAAGATTCTGTTCATAATTAG
AATTAAATTGGAGCTGATATAATGATGGCTCTTGATGATGTAGTATAAACAACAACTGTA
GGAGAAAGAATGAAAATTGCATGTGAAAGAACAGTCAGATGGATTGATAGAAATATTTAA
GCTCATGAAAGAAAAGAAGTTTAAAATCTTTACCCTATCGTATAAGGCGGTTTAGATTTT
GGCTTGAGAAAATAGTAATTAATTTCTTAAATATTTCAGTTTAGCTTATCTTTTTAAGTA
GATGCTTTTATCTCTAAAATAAAGAATTTACTTTTTAATTACATTCTTATTCTTTTGTCC
AATTATTGTCAAATATTAAGTTTGTTATTAAGTTAAATATGCCTAATTATTCGGTATTGT
CAACTAAAAAATATTTGAATTCAAAGATTATAAAATTATTTCGTTTTTTAATAAATATTT
TATATAAAGCTGTTTAGATGAATTAATTAAAAGAGATGCTCCAGGATACGCTATAGGTGG
TTTAGCAGGAGGAGAAGACAAATAAGATTTTTGGAAGATAGTCAATTTTTGTACAGATCA
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TTGCTCATGTTTAGGTGTTGATTAGTTTGACTGTGTTTTCTCTACAAGAACTGCAAGATT
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TGTTATTAAAAGTGAGTTCTTTAAAAACTATTTCAGCCATGAAAAGTAAATTCCATAGTG
GATACAAGATGCTATGGTTGCTGCTAAGATAAACTTAAATATAAAATTTGATGAGTGA