Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00723650

Standard Name

TDP1 (a member of the phospholipase D family )

Aliases

PreTt18125 | 116.m00150 | 3671.m00074

Description

Tyrosyl-DNA phosphodiesterase family protein; homolog to human TDP1

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• nucleus (IEA) | GO:0005634

Molecular Function

• phosphoric diester hydrolase activity (IEA) | GO:0008081

Biological Process

• DNA repair (IEA) | GO:0006281

Domains

• ( PF08257 ) Sulfakinin family
• ( PF06087 ) Tyrosyl-DNA phosphodiesterase
• ( PF00614 ) phospholipase D active site domain

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.4%

TetraMine Data

TTHERM_00723650

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_14839.1	9.997093137033517e-262	tyrosyl-DNA phosphodiesterase (580 aa)
Oxytricha	Contig18880.0.g20	2.99915080840225e-45	Tyrosyl-DNA phosphodiesterase
Stentor Coeruleus	SteCoe_19350	7.781132241133797e-20
DictyBase	DDB_G0273869	0.00000000019994075865167896	DDB_G0273869 on chromosome: 2 position 3501162 to 3503366
WormBase	WBGene00018678	0.000000100009565553302	status:Confirmed UniProt:U4P RC2 protein_id:CDH93125.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00723650(coding)
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TGA

>TTHERM_00723650(protein)
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EFIDKICPYFDVKEMLDINLRNYQIKGINFMLVSSLPGKFSGSQIHDYGKMRIRKICQVF
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GSQEIKEEIIEIMNYKFPAKPYREKEKPYISDIDHPIFQK

>TTHERM_00723650(gene)
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AGTAAAAAACGAGATTACAAATAATATTCTCAGTAGAATGAAGCTGAAGAATTTACTTTA
GGAGAGCTTGAAGAAAGGAATAAATTTAAATTATATAGCGAAAGAATATACTAAAATGAT
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A