Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00470500Standard Name
TBS2 (Fusion of SEC7-family GTPase and TBC1 domain GTPase activator)Aliases
PreTt22464 | 56.m00168 | 3686.m00011Description
TBS2 Sec7 domain protein; Fusion of SEC7-family GTPase and TBC1 domain GTPase activatorGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
Cellular Component
- intracellular (IEA) | GO:0005622
Molecular Function
- ARF guanyl-nucleotide exchange factor activity (IEA) | GO:0005086
Biological Process
- regulation of ARF protein signal transduction (IEA) | GO:0032012
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 15.6%
TetraMine Data
TTHERM_00470500
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_11393.1 9.997093137033517e-262 Sec7 domain-containing protein
(1182 aa)
Oxytricha Contig17452.0.g48 5.0012639607461234e-61 Sec7 domain
DictyBase DDB_G0279241 1.999981404597394e-31 DDB_G0279241 on chromosome: 3
position 1814829 to 1818189
SGD YDR170C 3.99801309251602e-27 SEC7 Guanine nucleotide exchan
ge factor (GEF) for ADP ribosy
lation factors involved in pro
liferation of the Golgi, intra
-Golgi transport and ER-to-Gol
gi transport; found in the cyt
oplasm and on Golgi-associated
coated vesicles
WormBase WBGene00012386 7.996806159126539e-24 locus:agef-1 status:Partiall
y_confirmed UniProt:G5EFH7
protein_id:CAA21704.3
Stentor Coeruleus SteCoe_9424 0.000000000000012664165549094176
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00470500(coding)
ATGGTGATAATTTTGAGATTTTAGGTAATAATTCTAAAATATACTATTGAATTGGTTTAT
TTTGATTTGAAATTTATTATAGAAGATACTTTCTTTTTAATTTTCTATCTATCTATCAAA
AATTAACATTAGAGTTACTTATTAAAATTTAAGAAACAAAAATTAACTTAATTTCTAATT
TTTGTTATATTACACTTAAAGCAGATGAGCTAACCACAATTGGAATAAGACAAAAGAATT
TAGGAAATACATATAAACTAACATGAGTATGGTAATAAAAATTAGATTGAAGAAAAGTAA
GTACCTTTTTGGTTAATAAATTGTCAGGCAACATCTTCAAGGCAAGTTTTAAGTCACCAA
AATATTGCTGAACCCAATCCTGAATAATCACAGAATCACTAAAACAGCCAGGAGTATGAA
TAACCATCATTCCCTTCTAGATAAATCGATTTAATAGAGGTTGATGAAAATTCAAATTTT
GATAGTAAAAATGCTCACGTTTAAAGTAAATAAATCGAACACATTTAAGATAAAGCTATG
ACCCCTTAAAAGCAGGCTTAAGCATTTGATGATATATTATTGGATCTTATAGTTCCTTCA
GAGAGATCTATAAATTAAAATTAAAAAAAATATGACTTATAAACATAAGAATATGCTATA
AATTAATGGAATTGTGTAATGAGTACCTAATAAAATATTTCTTTGAATAAATAAAATAAA
GATTAGGATGAACTTAAAGATGAGTAAAACTTAAAAGATCAAATTTAGAAAGAATGGAGT
AATTCTAATTAGAATTCAAATGATTAACAATAAATTTAATAGTAAATAAATGGTGACACC
TTTTTTGATTTAAAAGAATTCAACAAATAGTTCAATGATTTAAAAGAAACGAATGATTTC
AGCGAGTAAAATATAAAGTCTGATGAAAATAAAATGAATAATATTCCATAATAGAGTTAA
TAGTACCTAAATAGAAATTAATTTGACATAGATGAGAAAGATTAATTTGATATAGAAGAT
AAAAATGAATAAGGCTTTACTTTGATAACAAAAAACTAAAATAAATAATTGATAGAATCA
AATGATAATCCTTAGAACATAAACGAAGATTTGTATATAAACGAAAACTTTAACAATCTA
ATTGAAACTATAGATGAATAGGAATTTGAACAAAAATAATAAAGTAGGTACAAATAAAGA
TATTATAGCGAATATACTCATGTAGATAATGCTTTACTATAACCAACATAAGGATTATAT
GATATTTGTGACAATATAAATGAAAATGAAAATGATTCTAAATAACTTAACTAAAAATAA
AAAAAAATGTAATTACTACACAACTAATCATCAAAAGATATGTTTCAATCGGCATAAAAT
GGGTTTAAAAATAATAGACTGAGTCATAATGTCTAGCTTTCCACGAATGTACCAGATCCA
TTAGATTTTTACTCTCACAGACCACCTACAGGATATTTCACTCTGAAAAGAGGTGTCACA
GGAGTTTCTCAAGTAGTAGATCTTTTGCAAGAAGCCAATATTCTGAAGGAAGAGCAAAAA
AAGTAGTTAAAGAGAGATTAATTTATGATTGAGTTTAATACAGATCCCAACTCAGCTATC
TAAAAATTAGAGTAAGACTAAAAACTCAGTCTATAAAATATAGCAGAATTTTTGTTGAAG
GCTGAAGGAATAAGAAAAAATACTCTTGGATAATTTTTTGGGAAAGAAACATAAAAAAAT
CAAGATATTTTAAGAGAGTTCTGTAAAATCATCGATTTCAATAATTAAACGATTGATGAA
GCTTTGAGGTCTTTGATGAGTAAATTCAGACTTCCAGGAGAATCTTAATAAATAGACAGA
ATAATGTGTGCTTTTTCTGAATCATATCATGAGCAAAATCCGAATACTTTTGAAAATTCT
GACATCGTTTACATTTTAGCCTATTCTATAATAATGCTACACACAGATATCCACTCTGAC
AAAATAGAAAAAAAAGATAAGATGAAAAGATAAGATTATGTTGAGAGAACAATAAATGTT
ACAAAAAGTAAAACAGTTACTTTTAAAGTACTTTCTGAAATATATGATAGGATATAAGCA
AAATAATTTGAATGTGAGTAAGATGCTTTTGAGAAGGCATATGACATTCTACTTATATCT
CATGCAGATAATCAAACAGATTTTTCTAAGCTTCTTAATAAAGATATTAAAATATTTTAG
AATGGAAGTTTATTTTTAAAATATGGAAGATCAGGTAGTCCTAAGGAAAAATTTGTAAAT
CTATCTGAATCTGGAGATAAAATTCAATGGTGTGACCCTAAAAATAAAAGTAAGAAAAGA
GAAATCTTAATAGATGATATATATGAAATAACAATTGGGAGTGATAAAACTGAAGTACTT
AGAAAAAATAAAGTTCCTAAGCAGTTTGATAATTTATGCTTCTCTTTACTTGTAATAGGA
CATGACAATGGTAAAAGAAGTCTTGACCTAAAAGCGAAAGATGAGGATTAAAGAAATAAA
TGGGTTCGTTTTTGCTACTAAAGACTACTTTTTGCTAAGTAGCAAGCATTCGAATTCAAA
AAGGCTAAATTTAGTATGTAAGAATACAAAGAAGAAATAGCTGGAATTTGGAAGAGCTAA
ATTTTTGAATAGTTTGATAAATTTTGGGATTATGAAAAAAATTTACCTCTTAATATGGAT
AAGTTTTACAAGTTTAAAAGCAAAAGTAAAGAAAATAGCAAAAACTTATGGAAGAATGTA
ATGAAAAAGAAAAAGCAATAAACATAAAGATATTCTTAAGTTGGAATTTTTAATGAAAGC
GAAATGATAAGAGAACACATAGAAGATTTGCAAAAAGACAAAGAAATACTATTCATTAGA
TTATGGAAATAGGGACTACCTCATTTTGTTAGAAAGACTCTATATAAGCTATCTATTGGA
AACAGTTTATAAATAACTCACTAATATTATTTAATTGTCAAGCAATAAGCTGAATAAAGT
ATTTTTAAATAAAGTAATAATAATAACAATAAGTTTGCTCAGTCAGAGATAATTAGATAA
TCAGGCTTAGGGTCTCCTAGAATGAGGGAGTACTCTCTTTTTGATAAAATTTAATAGATG
GAAGCAGATATGGTTGAGTTTTTAGAGAAAAATCCCATCTTCAAACCTAATCATGAAATG
ATATAAAACGTATTAAAATATACATTGTACGTTCGCTAGGATTTGAACTACCTAAACTAT
ATGATAAATATTGCAGCCTTAATTGTGAACGTTTTCTAAAATGAAAGTGATTCATTTATA
TATTTCATTAATTTGATTTATAGCTATCACTTTAAGCCCTTATATAGTGGTGATAAAATC
AAAATTGAGTTTTACAATTAGTTCTTTTATCAAAGCTTCTAAAAAGAGATGAAAGATTTA
CATGAGAGATTCATAGGTTTAAACTTAGGGCCCTAAAATTATCTCTATAGTTGGATGCTC
TCACTATTTTCAAATTATTTTTAAGATGTCAATATAGTATATAGAATTTTAGATAATGTT
CTAATAGAAGGTGAGTATTATATTTTTAAAGCAGCACTAGGTATTATAAAAATGTTTGAA
ATAGATCTCAGGTTTTCATCTTTTACTATAGCCTTCAAATTTTTAACTGAAACATCTAAA
AACGTAAATGAAGAGTTTCTATTTGATACCATAGAATGCATCGATATAAATAAGTAAGAT
TATGAAAAATTTTTCACTGATTTAAAGAAATCGCAAGCTAAATCACTAATACATGAAATA
TTAGTAGAATTGTGA>TTHERM_00470500(protein)
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TPQKQAQAFDDILLDLIVPSERSINQNQKKYDLQTQEYAINQWNCVMSTQQNISLNKQNK
DQDELKDEQNLKDQIQKEWSNSNQNSNDQQQIQQQINGDTFFDLKEFNKQFNDLKETNDF
SEQNIKSDENKMNNIPQQSQQYLNRNQFDIDEKDQFDIEDKNEQGFTLITKNQNKQLIES
NDNPQNINEDLYINENFNNLIETIDEQEFEQKQQSRYKQRYYSEYTHVDNALLQPTQGLY
DICDNINENENDSKQLNQKQKKMQLLHNQSSKDMFQSAQNGFKNNRLSHNVQLSTNVPDP
LDFYSHRPPTGYFTLKRGVTGVSQVVDLLQEANILKEEQKKQLKRDQFMIEFNTDPNSAI
QKLEQDQKLSLQNIAEFLLKAEGIRKNTLGQFFGKETQKNQDILREFCKIIDFNNQTIDE
ALRSLMSKFRLPGESQQIDRIMCAFSESYHEQNPNTFENSDIVYILAYSIIMLHTDIHSD
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WVRFCYQRLLFAKQQAFEFKKAKFSMQEYKEEIAGIWKSQIFEQFDKFWDYEKNLPLNMD
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LVEL>TTHERM_00470500(gene)
ATGGTGATAATTTTGAGATTTTAGGTAATAATTCTAAAATATACTATTGAATTGGTTTAT
TTTGATTTGAAATTTATTATAGAAGATACTTTCTTTTTAATTTTCTATCTATCTATCAAA
AATTAACATTAGAGTTACTTATTAAAATTTAAGAAACAAAAATTAACTTAATTTCTAATT
TTTGTTATATTACACTTAAAGCAGATGAGCTAACCACGTACTCAATTAGTTTTCTTTGAG
AATAATTATTAACTGTTTGTTCATAACATGGAAATTTTTTTATAAAATATTTTTAGAATT
GGAATAAGACAAAAGAATTTAGGAAATACATATAAACTAACATGGTAAATAAAATATACA
ATATACTTTATGTTTTTAATCATCAAGACCTCTAAAAGAAATATTTTTAAATATAAATTT
TACTAGAGTATGGTAATAAAAATTAGATTGAAGAAAAGTAAGTACCTTTTTGGTTAATAA
ATTGTCAGGCAACATCTTCAAGGCAAGTTTTAAGTCACCAAAATATTGCTGAACGTAAAT
AATCTTTAGAAATAAGCAAAGTAGTAATAAAATAATTCGTTTATAATTAGCCAATCCTGA
ATAATCACAGAATCACTAAAACAGCCAGGAGTATGAATAACCATCATTCCCTTCTAGATA
GTAAAATTAAAAATTTTTTTATCATGAATTAATAAAGGATGAAAATTTATTTTAAAAAAG
AATCGATTTAATAGAGGTTGATGAAAATTCAAATTTTGATAGTAAAAATGCTCACGTTTA
AAGTAAATAAATCGAACACATTTAAGATAAAGCTATGACCCCTTAAAAGCAGGCTTAAGC
ATTTGATGATATATTATTGGATCTTATAGTTCCTTCAGAGAGATCTATAAATTAAAATTA
AAAAAAATATGACTTATAAACATAAGAATATGCTATAAATTAATGGAATTGTGTAATGAG
TACCTAATAAAATATTTCTTTGAATAAATAAAATAAAGATTAGGATGAACTTAAAGATGA
GTAAAACTTAAAAGATCAAATTTAGAAAGAATGGAGTAATTCTAATTAGAATTCAAATGA
TTAACAATAAATTTAATAGTAAATAAATGGTGACACCTTTTTTGATTTAAAAGAATTCAA
CAAATAGTTCAATGATTTAAAAGAAACGAATGATTTCAGCGAGTAAAATATAAAGTCTGA
TGAAAATAAAATGAATAATATTCCATAATAGAGTTAATAGTACCTAAATAGAAATTAATT
TGACATAGATGAGAAAGATTAATTTGATATAGAAGATAAAAATGAATAAGGCTTTACTTT
GATAACAAAAAACTAAAATAAATAATTGATAGAATCAAATGATAATCCTTAGAACATAAA
CGAAGATTTGTATATAAACGAAAACTTTAACAATCTAATTGAAACTATAGATGAATAGGA
ATTTGAACAAAAATAATAAAGTAGGTACAAATAAAGATATTATAGCGAATATACTCATGT
AGATAATGCTTTACTATAACCAACATAAGGATTATATGATATTTGTGACAATATAAATGA
AAATGAAAATGATTCTAAATAACTTAACTAAAAATAAAAAAAAATGTAATTACTACACAA
CTAATCATCAAAAGATATGTTTCAATCGGCATAAAATGGGTTTAAAAATAATAGACTGAG
TCATAATGTCTAGCTTTCCACGAATGTACCAGATCCATTAGATTTTTACTCTCACAGACC
AGTAATTTGATCATATATTAATAAAAAGGCTTGAAATTTAAATTTTTTTTCTTCAGCCTA
CAGGATATTTCACTCTGAAAAGAGGTGTCACAGGAGTTTCTCAAGTAGTAGATCTTTTGC
AAGAAGCCAATATTCTGAAGGAAGAGCAAAAAAAGTAGTTAAAGAGAGATTAATTTATGA
TTGAGTTTAATACAGATCCCAACTCAGCTATCTAAAAATTAGAGTAAGACTAAAAACTCA
GTCTATAAAATATAGCAGAATTTTTGTTGAAGGCTGAAGGAATAAGAAAAAATACTCTTG
GATAATTTTTTGGGTATATATATTTCTATATAAATAAATAATATTTATTAATCAATCTTG
AAAATGTTAAACAGGAAAGAAACATAAAAAAATCAAGATATTTTAAGAGAGTTCTGTAAA
ATCATCGATTTCAATAATTAAACGATTGATGAAGCTTTGAGGTATTAATTTTATCATGGC
TTATTAAAAAATTTATTTTAATTGATTAATAATTTGATAGGTCTTTGATGAGTAAATTCA
GACTTCCAGGAGAATCTTAATAAATAGACAGAATAATGTGTGCTTTTTCTGAATCATATC
ATGAGCAAAATCCGAATACTTTTGAAAATTCTGACATCGTTTACATTTTAGCCTATTCTA
TAATAATGCTACACACAGATATCCACTCTGACAAAATAGAAAAAAAAGATAAGATGAAAA
GATAAGATTATGTTGAGAGAACAATAAATGTTACAAAAAGTAAAACAGTTACTTTTAAAG
TACTTTCTGAAATATATGATAGGATATAAGCAAAATAATTTGAATGTGAGTAAGATGGTA
AATTATTACAGTTTTATATATTTAAGTTATATCAAAATAATAATCTTAATTAGCTTTTGA
GAAGGCATATGACATTCTACTTATATCTCATGCAGATAATCAAACAGATTTTTCTAAGCT
TCTTAATAAAGATATTAAAATATTTTAGAATGGAAGTTTATTTTTAAAATATGGAAGATC
AGGTAGTCCTAAGGAAAAATTTGTAAATCTATCTGAATCTGGAGATAAAATTCAATGGTG
TGACCCTAAAAATAAAAGTAAGAAAAGAGAAATCTTAATAGATGATGTAATTAATTAACA
TAAATTTATTTTGGTTGTTATAATAAATTTAATTTAAAATATAATTATAAGATATATGAA
ATAACAATTGGGAGTGATAAAACTGAAGTACTTAGAAAAAATAAAGTTCCTAAGCAGTTT
GATAATTTATGCTTCTCTTTACTTGTAATAGGACATGACAATGGTAAAAGAAGTCTTGAC
CTAAAAGCGAAAGATGAGGATTAAAGAAATAAATGGGTTCGTTTTTGCTACTAAAGACTA
CTTTTTGCTAAGTAGCAAGCATTCGAATTCAAAAAGGCTAAATTTAGTATGTAAGAATAC
AAAGAAGAAATAGCTGGAATTTGGAAGAGCTAAATTTTTGAATAGTTTGATAAATTTTGG
GATTATGAAAAAAATTTACCTCTTAATATGGATAAGTTTTACAAGTTTAAAAGCAAAAGT
AAAGAAAATAGCAAAAACTTATGGAAGAATGTAATGAAAAAGAAAAAGCAATAAACATAA
AGATATTCTTAAGTTGGAATTTTTAATGAAAGCGAAATGATAAGAGAACACATAGAAGAT
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GTTAGAAAGACTCTATATAAGCTATCTATTGGAAACAGTTTATAAATAACTCACTAATAT
TATTTAATTGTCAAGCAATAAGCTGAATAAAGTATTTTTAAATAAAGTAATAATAATAAC
AATAAGTTTGCTCAGTCAGAGATAATTAGATAATCAGGCTTAGGGTCTCCTAGAATGAGG
GAGTACTCTCTTTTTGATAAAATTTAATAGATGGAAGCAGATATGGTTGAGTTTTTAGAG
AAAAATCCCATCTTCAAACCTAATCATGAAGTAATTAATTTGCTATTATTTAAATTTCAT
TTGAGTATTAAGTTTTTTGAATTTTTTAAGAAAAACAAAAAAATTTCTTTAAATAAGCAC
TAAATAAAAAATTTAAAGCTAGATTTTGATATTTTAATAATAAATTATTCATTAAAATTA
ATTAGATGATATAAAACGTATTAAAATATACATTGTACGTTCGCTAGGATTTGAACTACC
TAAACTATATGATAAATATTGCAGCCTTAATTGTGAACGTTTTCTAAAATGAAAGTGATT
CATTTATATATTTCATTAATTTGATTTATAGCTATCACTTTAAGCCCTTATATAGTGGTG
ATAAAATCAAAGTAAAACAATTTAAATTTATCATCATATTTTAATTAACTATATGCTAAT
TTTAAATAAACATTTTAGATTGAGTTTTACAATTAGTTCTTTTATCAAAGCTTCTAAAAA
GAGATGAAAGATTTACATGAGAGATTCATAGGTTTAAACTTAGGGCCCTAAAATTATCTC
TATAGTTGGATGCTCTCACTATTTTCAAATTATTTTTAAGATGTCAATATAGTATATAGA
ATTTTAGATAATGTTCTAATAGAAGGTGAGTATTATATTTTTAAAGCAGCACTAGGTATT
ATAAAAATGTTTGAAATAGATCTCAGGTTTTCATCTTTTACTATAGCCTTCAAATTTTTA
ACTGAAACATCTAAAAACGTAAATGAAGAGTTTCTATTTGATACCATAGAATGCATCGAT
GTAATAATTCCATTTTATTATTAATTAATAAATACATTTTTTATTATTTTATAAAAGATA
AATAAGTAAGATTATGAAAAATTTTTCACTGATTTAAAGAAATCGCAAGCTAAATCACTA
ATACATGAAATATTAGTAGAATTGTGA