Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00470500

Standard Name

TBS2 (Fusion of SEC7-family GTPase and TBC1 domain GTPase activator)

Aliases

PreTt22464 | 56.m00168 | 3686.m00011

Description

Fusion of SEC7-family GTPase and TBC1 domain GTPase activator

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• intracellular (IEA) | GO:0005622

Molecular Function

• ARF guanyl-nucleotide exchange factor activity (IEA) | GO:0005086

Biological Process

• regulation of ARF protein signal transduction (IEA) | GO:0032012

Domains

• ( PF00169 ) PH domain
• ( PF00566 ) TBC domain
• ( PF01369 ) Sec7 domain
• ( PF07813 ) LTXXQ motif
• ( TIGR00166 ) ribosomal protein S6
• ( PF06295 ) conserved hypothetical protein
• ( TIGR00162 ) conserved hypothetical protein TIGR00162

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 15.6%

TetraMine Data

TTHERM_00470500

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_11393.1	9.997093137033517e-262	Sec7 domain-containing protein (1182 aa)
Oxytricha	Contig17452.0.g48	5.0012639607461234e-61	Sec7 domain
DictyBase	DDB_G0279241	1.999981404597394e-31	DDB_G0279241 on chromosome: 3 position 1814829 to 1818189
SGD	YDR170C	3.99801309251602e-27	SEC7 Guanine nucleotide exchan ge factor (GEF) for ADP ribosy lation factors involved in pro liferation of the Golgi, intra -Golgi transport and ER-to-Gol gi transport; found in the cyt oplasm and on Golgi-associated coated vesicles
WormBase	WBGene00012386	7.996806159126539e-24	locus:agef-1 status:Partiall y_confirmed UniProt:G5EFH7 protein_id:CAA21704.3
Stentor Coeruleus	SteCoe_9424	0.000000000000012664165549094176

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00470500(coding)
ATGGTGATAATTTTGAGATTTTAGGTAATAATTCTAAAATATACTATTGAATTGGTTTAT
TTTGATTTGAAATTTATTATAGAAGATACTTTCTTTTTAATTTTCTATCTATCTATCAAA
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AATTAATGGAATTGTGTAATGAGTACCTAATAAAATATTTCTTTGAATAAATAAAATAAA
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AATTCTAATTAGAATTCAAATGATTAACAATAAATTTAATAGTAAATAAATGGTGACACC
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AGCGAGTAAAATATAAAGTCTGATGAAAATAAAATGAATAATATTCCATAATAGAGTTAA
TAGTACCTAAATAGAAATTAATTTGACATAGATGAGAAAGATTAATTTGATATAGAAGAT
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AATGATAATCCTTAGAACATAAACGAAGATTTGTATATAAACGAAAACTTTAACAATCTA
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TATTATAGCGAATATACTCATGTAGATAATGCTTTACTATAACCAACATAAGGATTATAT
GATATTTGTGACAATATAAATGAAAATGAAAATGATTCTAAATAACTTAACTAAAAATAA
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ATAATGTGTGCTTTTTCTGAATCATATCATGAGCAAAATCCGAATACTTTTGAAAATTCT
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AAATAATTTGAATGTGAGTAAGATGCTTTTGAGAAGGCATATGACATTCTACTTATATCT
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AATGGAAGTTTATTTTTAAAATATGGAAGATCAGGTAGTCCTAAGGAAAAATTTGTAAAT
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GAAATCTTAATAGATGATATATATGAAATAACAATTGGGAGTGATAAAACTGAAGTACTT
AGAAAAAATAAAGTTCCTAAGCAGTTTGATAATTTATGCTTCTCTTTACTTGTAATAGGA
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TGGGTTCGTTTTTGCTACTAAAGACTACTTTTTGCTAAGTAGCAAGCATTCGAATTCAAA
AAGGCTAAATTTAGTATGTAAGAATACAAAGAAGAAATAGCTGGAATTTGGAAGAGCTAA
ATTTTTGAATAGTTTGATAAATTTTGGGATTATGAAAAAAATTTACCTCTTAATATGGAT
AAGTTTTACAAGTTTAAAAGCAAAAGTAAAGAAAATAGCAAAAACTTATGGAAGAATGTA
ATGAAAAAGAAAAAGCAATAAACATAAAGATATTCTTAAGTTGGAATTTTTAATGAAAGC
GAAATGATAAGAGAACACATAGAAGATTTGCAAAAAGACAAAGAAATACTATTCATTAGA
TTATGGAAATAGGGACTACCTCATTTTGTTAGAAAGACTCTATATAAGCTATCTATTGGA
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TCAGGCTTAGGGTCTCCTAGAATGAGGGAGTACTCTCTTTTTGATAAAATTTAATAGATG
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ATATAAAACGTATTAAAATATACATTGTACGTTCGCTAGGATTTGAACTACCTAAACTAT
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TATTTCATTAATTTGATTTATAGCTATCACTTTAAGCCCTTATATAGTGGTGATAAAATC
AAAATTGAGTTTTACAATTAGTTCTTTTATCAAAGCTTCTAAAAAGAGATGAAAGATTTA
CATGAGAGATTCATAGGTTTAAACTTAGGGCCCTAAAATTATCTCTATAGTTGGATGCTC
TCACTATTTTCAAATTATTTTTAAGATGTCAATATAGTATATAGAATTTTAGATAATGTT
CTAATAGAAGGTGAGTATTATATTTTTAAAGCAGCACTAGGTATTATAAAAATGTTTGAA
ATAGATCTCAGGTTTTCATCTTTTACTATAGCCTTCAAATTTTTAACTGAAACATCTAAA
AACGTAAATGAAGAGTTTCTATTTGATACCATAGAATGCATCGATATAAATAAGTAAGAT
TATGAAAAATTTTTCACTGATTTAAAGAAATCGCAAGCTAAATCACTAATACATGAAATA
TTAGTAGAATTGTGA

>TTHERM_00470500(protein)
MVIILRFQVIILKYTIELVYFDLKFIIEDTFFLIFYLSIKNQHQSYLLKFKKQKLTQFLI
FVILHLKQMSQPQLEQDKRIQEIHINQHEYGNKNQIEEKQVPFWLINCQATSSRQVLSHQ
NIAEPNPEQSQNHQNSQEYEQPSFPSRQIDLIEVDENSNFDSKNAHVQSKQIEHIQDKAM
TPQKQAQAFDDILLDLIVPSERSINQNQKKYDLQTQEYAINQWNCVMSTQQNISLNKQNK
DQDELKDEQNLKDQIQKEWSNSNQNSNDQQQIQQQINGDTFFDLKEFNKQFNDLKETNDF
SEQNIKSDENKMNNIPQQSQQYLNRNQFDIDEKDQFDIEDKNEQGFTLITKNQNKQLIES
NDNPQNINEDLYINENFNNLIETIDEQEFEQKQQSRYKQRYYSEYTHVDNALLQPTQGLY
DICDNINENENDSKQLNQKQKKMQLLHNQSSKDMFQSAQNGFKNNRLSHNVQLSTNVPDP
LDFYSHRPPTGYFTLKRGVTGVSQVVDLLQEANILKEEQKKQLKRDQFMIEFNTDPNSAI
QKLEQDQKLSLQNIAEFLLKAEGIRKNTLGQFFGKETQKNQDILREFCKIIDFNNQTIDE
ALRSLMSKFRLPGESQQIDRIMCAFSESYHEQNPNTFENSDIVYILAYSIIMLHTDIHSD
KIEKKDKMKRQDYVERTINVTKSKTVTFKVLSEIYDRIQAKQFECEQDAFEKAYDILLIS
HADNQTDFSKLLNKDIKIFQNGSLFLKYGRSGSPKEKFVNLSESGDKIQWCDPKNKSKKR
EILIDDIYEITIGSDKTEVLRKNKVPKQFDNLCFSLLVIGHDNGKRSLDLKAKDEDQRNK
WVRFCYQRLLFAKQQAFEFKKAKFSMQEYKEEIAGIWKSQIFEQFDKFWDYEKNLPLNMD
KFYKFKSKSKENSKNLWKNVMKKKKQQTQRYSQVGIFNESEMIREHIEDLQKDKEILFIR
LWKQGLPHFVRKTLYKLSIGNSLQITHQYYLIVKQQAEQSIFKQSNNNNNKFAQSEIIRQ
SGLGSPRMREYSLFDKIQQMEADMVEFLEKNPIFKPNHEMIQNVLKYTLYVRQDLNYLNY
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HERFIGLNLGPQNYLYSWMLSLFSNYFQDVNIVYRILDNVLIEGEYYIFKAALGIIKMFE
IDLRFSSFTIAFKFLTETSKNVNEEFLFDTIECIDINKQDYEKFFTDLKKSQAKSLIHEI
LVEL

>TTHERM_00470500(gene)
ATGGTGATAATTTTGAGATTTTAGGTAATAATTCTAAAATATACTATTGAATTGGTTTAT
TTTGATTTGAAATTTATTATAGAAGATACTTTCTTTTTAATTTTCTATCTATCTATCAAA
AATTAACATTAGAGTTACTTATTAAAATTTAAGAAACAAAAATTAACTTAATTTCTAATT
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AATAATTATTAACTGTTTGTTCATAACATGGAAATTTTTTTATAAAATATTTTTAGAATT
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ATTGTCAGGCAACATCTTCAAGGCAAGTTTTAAGTCACCAAAATATTGCTGAACGTAAAT
AATCTTTAGAAATAAGCAAAGTAGTAATAAAATAATTCGTTTATAATTAGCCAATCCTGA
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ATTTGATGATATATTATTGGATCTTATAGTTCCTTCAGAGAGATCTATAAATTAAAATTA
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ATGAGCAAAATCCGAATACTTTTGAAAATTCTGACATCGTTTACATTTTAGCCTATTCTA
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AGGTAGTCCTAAGGAAAAATTTGTAAATCTATCTGAATCTGGAGATAAAATTCAATGGTG
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GATAATTTATGCTTCTCTTTACTTGTAATAGGACATGACAATGGTAAAAGAAGTCTTGAC
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TTTAAATAAACATTTTAGATTGAGTTTTACAATTAGTTCTTTTATCAAAGCTTCTAAAAA
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AATAAGTAAGATTATGAAAAATTTTTCACTGATTTAAAGAAATCGCAAGCTAAATCACTA
ATACATGAAATATTAGTAGAATTGTGA