Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00467390

Standard Name

SOR3 (Sortilin 3)

Aliases

PreTt18641 | 55.m00196 | 3710.m00045

Description

BNR/Asp-box repeat family/ VPS10 domain containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF02012 ) BNR/Asp-box repeat
  • ( PF05151 ) Photosystem II reaction centre M

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: Yes
Presense Probability: 73.8%

TetraMine Data

TTHERM_00467390

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_14774.19.997093137033517e-262BNR/Asp-box repeat family prot
ein (917 aa)
OxytrichaContig4955.0.0.g749.997093137033517e-262BNR/Asp-box repeat
Stentor CoeruleusSteCoe_299495.440559879258653e-75
SGDYIL173W5.997098480211051e-62VTH1 Putative membrane glycopr
otein with strong similarity t
o Vth2p and Pep1p/Vps10p, may
be involved in vacuolar protei
n sorting
DictyBaseDDB_G02900814.9981275274605926e-36sort1 on chromosome: 5 positio
n 3627939 to 3630336

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00467390(coding)
ATGAAAAAAGAAATAAGAATAGCTCTTATAGCTTTATTTTGCTGCATTTTGACAGTAAAT
TGTAGAAATGAATACTCAAGCAGTGTCATTGGAAACCCCTCAAGTTTGGATTCACCTCTT
TAGGACATTTAATGGTGTGGTGAAAATTCATCAAATGATAATTTGGTTGTCCTCTTAACT
TAAAAGGGTAGCGTTTACAGATCAGAAGATAGAGGAGCATCTTGGATAAAGATGGTTGAC
TCTTTTGCGAGAGTTGGTGTAAATGTAAAGATGGATCTGAGCTCAAACGTAGGTATTGTT
ACTTAAATGATTGCAAGTCCTATTGATTCTAATGAAATAGTCTTTATGGGCTCTGATGGT
ATTAACTGGATCACTACTGATTGTGGTGTTACCATTTAAGCCCTTGGAATCAACTTAAAT
TTGAGAGAATTTATGTATCACCCAACTGAAAAGAATTGGATGCTTGCTTCTTCCTTTAAC
AACTGTGAAAAGCAAAACAACCAAAAAGATAAGAGAAAAAAGGACACTGAATGCTTTAAG
ACTAAAGATTTGTTTTTCTCTGAAAATAAGGGTAAAAGCTGGAGAGTTTTACTTAAATAT
GTTGTACAATTCGGATGGGCTCACAAAGTTAATTCTAAGCTAACAAATGTCCCAACTTCA
AGAATTATATACTCTAAGGAAGTCGGAAATAGTGGTCACCAAGTGATGAAGGGTTGGAGC
ATGAAAACTCATTTATTCTATACTGATGATTTCATGAAAAACTAGAATATGATTGTTAAC
TAAGGAAATAAGTTTTTGATTACTGAAAACTACTTGTTCGCTGCATAAGTTCACAGTAGT
GATAATTAACTAGTCAAGTTAATGGTTTCTTAATCTAATTAAAAAGAATACTCTTTCACT
TATGCTGAAATTCCTGAAGATATACACTAGCACTCATTCACTATTTTAGATACTAAGGAA
GGTTAGGTATTCTTAAATATTAATCACTTGGGCAGTAACTCTCCTATGGGTAATATTTAC
TAATCTGACTCAACTGGTACTCGTTTCTCTCTTTCTCTTGAAGATAATGTAAGAGGAAGA
GATGGTTAATGCGATTTTGAATCAGTTAATGGTGTTGAAGGTATTTTTATCTCAAATATA
TTCGCTCCTAGCAAAAAGTTAAAGGGTATCAAGCAAATGTTGAAATCCAAAAATCCTGAT
ACAAGCGATGAAGATATTCCAACTGAAAACACAAGAAAGAAAGGTCAAGCATAAAATTCT
GAAGATGTCTTAAAAGAATCCTTAAAAAGTCTTAGAGATAACATGGTAACTCGTATCACT
TTCGACAAGGGTGGTATGTGGAGTTTGCTTAGGGCTCCTGCTAAAGATTCTAATGGAAAA
TAAATTAATTGTGATATTAATAAAAAGTGTTCTCTTCACCTTCACTCAGTTTCTTCATAA
CTAAGTTTTGGACCTGCTTACTCAAGTGAAAATTCATTAGGTTTAATTATTGCTACTGGT
AACACAGGATAATTCTTAAGTCATAAAGCAGGTAGCGTCAACACTTATCTTTCTCGTGAT
GGTGGTCTTGTTTGGGAAGAAATCCGTAAGGGGTCTCACATATATGAAGTTGCTGATCAT
GGCTCTATCATAGTTATGGCTACTGATTAAGAACCTACTAAGAACATTATTTTCTCTTGG
GATGAAGGCCGCACATGGAACACCAAGTAAATTAGCGATACTCCTGTCATGATTTCAAAT
ATTATCACTGAACCTGGCAATACTTCTGACAAGTTCTTAGTTTATGGATCTATTGAAGGT
GAATCTGATATTTCAGGAATAATTGTCCTTCTTGACTTTGCTTCTCTTCATCCTCGCGAT
TGCTAAGGTTATGAAAACCCTGACACTTCTGATTCTGATTATGAATACTGGACTCCTCAT
AATCCCAGTGAATTCTGTTTATTAGGACGTGAAATTAAATATGTCAGAAGAAAAAGAGAT
GCTGCTTGCTTTAATCCCGAAACTTTTGAAAGATCTTATGTTGTTAGAAAATGTGAATGT
ACTGAACTTGATTGGGAATGTGATGTCGGATTTGCTCGTGCTAAAGACGATAGCAAAGAA
AGAACTGGCCCTTGCGTTCCTTTAAAAGACTTCAAAGTGGATTACAATCCTCCATAAACT
TGCAGTGGCTCTTACCAAGTTACATAAGGTTACAGAAGAGTAGCTGGTAATTAATGTATA
GGCGGTATTGATCATGCTCCAATTTAATACCCTTGTCCTATGTTTGGCTTCTTGAGCTAT
AACAACCTTTTCACCAATGTTCTTATTTTAGGAGCTATGGCTGGTGTTTTCTACTTAATT
ATATAAAATAAAGAAGTAGTAATAACATTTGTAGCTACATCAAATCTTGATGCCTACATT
AACTTAGGTAAAACTTACCTAAAGAAGGGTTATACTTTTGTTACATCAATTGTCCTTCCA
CAAGCTTCAAATTAATAATAAGGATATTTCCAAGCTAACCAAGATGAGGAAAATAGAAAA
TCTCATTCCTTAAAGGATCAACATCATTAATTCCATGATAATTTAATTGAAAGCCATGAT
CATGATGATGAGGAAGAGTAAAGTGATGCAGTATAATAATAATTAACTTCTTCTTAAGTC
CCTTAAAATAATAGTAACAAAAACAATAATAATAGTAATACACCAAACTAAGCTCAGCAC
AAAGATCTTCTTGATGAACATGATGGTGAAGAAGATCCTTTTGATCCTAGAAATTGA


>TTHERM_00467390(protein)
MKKEIRIALIALFCCILTVNCRNEYSSSVIGNPSSLDSPLQDIQWCGENSSNDNLVVLLT
QKGSVYRSEDRGASWIKMVDSFARVGVNVKMDLSSNVGIVTQMIASPIDSNEIVFMGSDG
INWITTDCGVTIQALGINLNLREFMYHPTEKNWMLASSFNNCEKQNNQKDKRKKDTECFK
TKDLFFSENKGKSWRVLLKYVVQFGWAHKVNSKLTNVPTSRIIYSKEVGNSGHQVMKGWS
MKTHLFYTDDFMKNQNMIVNQGNKFLITENYLFAAQVHSSDNQLVKLMVSQSNQKEYSFT
YAEIPEDIHQHSFTILDTKEGQVFLNINHLGSNSPMGNIYQSDSTGTRFSLSLEDNVRGR
DGQCDFESVNGVEGIFISNIFAPSKKLKGIKQMLKSKNPDTSDEDIPTENTRKKGQAQNS
EDVLKESLKSLRDNMVTRITFDKGGMWSLLRAPAKDSNGKQINCDINKKCSLHLHSVSSQ
LSFGPAYSSENSLGLIIATGNTGQFLSHKAGSVNTYLSRDGGLVWEEIRKGSHIYEVADH
GSIIVMATDQEPTKNIIFSWDEGRTWNTKQISDTPVMISNIITEPGNTSDKFLVYGSIEG
ESDISGIIVLLDFASLHPRDCQGYENPDTSDSDYEYWTPHNPSEFCLLGREIKYVRRKRD
AACFNPETFERSYVVRKCECTELDWECDVGFARAKDDSKERTGPCVPLKDFKVDYNPPQT
CSGSYQVTQGYRRVAGNQCIGGIDHAPIQYPCPMFGFLSYNNLFTNVLILGAMAGVFYLI
IQNKEVVITFVATSNLDAYINLGKTYLKKGYTFVTSIVLPQASNQQQGYFQANQDEENRK
SHSLKDQHHQFHDNLIESHDHDDEEEQSDAVQQQLTSSQVPQNNSNKNNNNSNTPNQAQH
KDLLDEHDGEEDPFDPRN


>TTHERM_00467390(gene)
ATGAAAAAAGAAATAAGAATAGCTCTTATAGCTTTATTTTGCTGCATTTTGACAGTAAAT
TGTAGAAATGAATACTCAAGCAGTGTCATTGGAAACCCCTCAAGTTTGGATTCACCTCTT
TAGGACATTTAATGGTGTGGTGAAAATTCATCAAATGATAATTTGGTTGTCCTCTTAACT
TAAAAGGGTAGCGTTTACAGATCAGAAGATAGAGGAGCATCTTGGATAAAGATGGTTGAC
TCTTTTGCGAGAGTTGGTGTAAATGTAAAGATGGATCTGAGCTCAAACGTAATTACTTTT
TTTCAATTGCAAAATACTTCAATTTTTTCCATTTTCATTCTGTTTTATTAATAACTTAAA
TTTTATAAACAGGTAGGTATTGTTACTTAAATGATTGCAAGTCCTATTGATTCTAATGAA
ATAGTCTTTATGGGCTCTGATGGTATTAACTGGATCACTACTGATTGTGGTGTTACCATT
TAAGCCCTTGGAATCAACTTAAATTTGAGAGAATTTATGTATCACCCAACTGAAAAGAAT
TGGATGCTTGCTTCTTCCTTTAACAACTGTGAAAAGCAAAACAACCAAAAAGATAAGAGA
AAAAAGGACACTGAATGCTTTAAGACTAAAGATTTGTTTTTCTCTGAAAATAAGGGTAAA
AGCTGGAGAGTTTTACTTAAATATGTTGTACAATTCGGATGGTATACCATTTATTTATTC
TATAAAGCAAACAGTTTATTAAAACATTATATAATAATATCAAAAAGGGCTCACAAAGTT
AATTCTAAGCTAACAAATGTCCCAACTTCAAGAATTATATACTCTAAGGAAGTCGGAAGT
AATTCGTTTTTCTTTAATGAAGCATCTCAATAAACTAATATAATAATAAAAGATAGTGGT
CACCAAGTGATGAAGGGTTGGAGCATGAAAACTCATTTATTCTATACTGATGATTTCATG
AAAAACTAGAATATGATTGTTAACTAAGGAAATAAGGTAAAACAAATTATTAAAATTTGA
AGCTTTTGTTAATATTGAATATTTCTTAACCAAATAGTTTTTGATTACTGAAAACTACTT
GTTCGCTGCATAAGTTCACAGTAGTGATAATTAACTAGTCAAGTTAATGGTTTCTTAATC
TAATTAAAAAGAATACTCTTTCACTTATGCTGAAATTCCTGAAGATATACACTAGCACTC
ATTCACTATTTTAGATACTAAGGAAGTATGATTTTACTATTTTTTTTTAATTAATTTAAA
TAGATAGGCAAATAATTTACAGCAAATTATGCAATTAAAAAAGATTATAAAAAAATATAA
TAAAAAGCAAGTGTTTAAAAATTAAGAATAATTTAGTTTATAAAAATAGAGAAAAATTAT
AAAAGCAATTAATTAATAAATTTATGATTAATTGAATAGTCAAGCTATTAAATTACATTT
TAAAGAGATTTTTCTCAAATTTTTAAAGATTAGGTTTATTAATTAAAATAAATTTAAAAA
TAGGGTTAGGTATTCTTAAATATTAATCACTTGGGCAGTAACTCTCCTATGGGTAATATT
TACTAATCTGACTCAACTGGTACTCGTTTCTCTCTTTCTCTTGAAGATAATGTAAGAGGA
AGAGATGGTTAATGCGATTTTGAATCAGTTAATGGTGTTGAAGGTATTTTTATCTCAAAT
ATATTCGCTCCTAGCAAAAAGTTAAAGGGTATCAAGCAAATGTTGAAATCCAAAAATCCT
GATACAAGCGATGAAGATATTCCAACTGAAAACACAAGAAAGAAAGGTCAAGCATAAAAT
TCTGAAGATGTCTTAAAAGAATCCTTAAAAAGTCTTAGAGATAACATGGTAACTCGTATC
ACTTTCGACAAGGGTGGTATGTGGAGTTTGCTTAGGGCTCCTGCTAAAGATTCTAATGGA
AAATAAATTAATTGTGATATTAATAAAAAGTGTTCTCTTCACCTTCACTCAGTTTCTTCA
TAACTAAGTTTTGGACCTGCTTACTCAAGTGAAAATTCATTAGGTTTAATTATTGCTACT
GGTAACACAGGATAATTCTTAAGTCATAAAGCAGGTAGCGTCAACACTTATCTTTCTCGT
GATGGTGGTCTTGTTTGGGAAGAAATCCGTAAGGGGTCTCACATATATGAAGTTGCTGAT
CATGGCTCTATCATAGTTATGGCTACTGATTAAGAACCTACTAAGAACATTATTTTCTCT
TGGGATGAAGGCCGCACATGGAACACCAAGTAAATTAGCGATACTCCTGTCATGATTTCA
AATATTATCACTGAACCTGGCAATACTTCTGACAAGTTCTTAGTTTATGGATCTATTGAA
GGTGAATCTGATATTTCAGGAATAATTGTCCTTCTTGACTTTGCTTCTCTTCATCCTCGC
GATTGCTAAGGTTATGAAAACCCTGACACTTCTGATTCTGATTATGAATACTGGACTCCT
CATAATCCCAGTGAATTCTGTTTATTAGGTAAATTTATTTTATTAATATCAAGCCATTTT
AAGGAAATATCTTGAAAAGCTTAATTGATTAATATTCTTTTTAAAAAATATAAAAACGCA
CTTTTAATATTTGATTATTTATTTCAATTAAAATAATTATTCTTGCTTAAATTAAAAAGG
ACGTGAAATTAAATATGTCAGAAGAAAAAGAGATGCTGCTTGCTTTAATCCCGAAACTTT
TGAAAGATCTTATGTTGTTAGAAAATGTGAATGTACTGAACTTGATTGGGAATGTGATGT
CGGATTTGCTCGTGCTAAAGACGATAGCAAAGAAAGAACTGGCCCTTGCGTTCCTTTAAA
AGACTTCAAAGTGGATTACAATCCTCCATAAACTTGCAGTGGCTCTTACCAAGTTACATA
AGGTTACAGAAGAGTAGCTGGTAATTAATGTATAGGCGGTATTGATCATGCTCCAATTTA
ATACCCTTGTCCTATGTTTGGCTTCTTGAGCTATAACAACCTTTTCACCAATGTTCTTAT
TTTAGGAGCTATGGCTGGTGTTTTCTACTTAATTATATAAAATAAAGAAGTAGTAATAAC
ATTTGTAGCTACATCAAATCTTGATGCCTACATTAACTTAGGTAAAACTTACCTAAAGAA
GGGTTATACTTTTGTTACATCAATTGTCCTTCCACAAGCTTCAAATTAATAATAAGGATA
TTTCCAAGCTAACCAAGATGAGGAAAATAGAAAATCTCATTCCTTAAAGGATCAACATCA
TTAATTCCATGATAATTTAATTGAAAGCCATGATCATGATGATGAGGAAGAGTAAAGTGA
TGCAGTATAATAATAATTAACTTCTTCTTAAGTCCCTTAAAATAATAGTAACAAAAACAA
TAATAATAGTAATACACCAAACTAAGCTCAGCACAAAGATCTTCTTGATGAACATGATGG
TGAAGAAGATCCTTTTGATCCTAGAAATTGA