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Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00467390Standard Name
SOR3 (Sortilin 3)Aliases
PreTt18641 | 55.m00196 | 3710.m00045Description
BNR/Asp-box repeat family/ VPS10 domain containing proteinGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
- Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: Yes
Presense Probability: 73.8%
TetraMine Data
TTHERM_00467390
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_14774.1 9.997093137033517e-262 BNR/Asp-box repeat family prot
ein (917 aa)
Oxytricha Contig4955.0.0.g74 9.997093137033517e-262 BNR/Asp-box repeat
Stentor Coeruleus SteCoe_29949 5.440559879258653e-75 SGD YIL173W 5.997098480211051e-62 VTH1 Putative membrane glycopr
otein with strong similarity t
o Vth2p and Pep1p/Vps10p, may
be involved in vacuolar protei
n sorting
DictyBase DDB_G0290081 4.9981275274605926e-36 sort1 on chromosome: 5 positio
n 3627939 to 3630336
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00467390(coding)
ATGAAAAAAGAAATAAGAATAGCTCTTATAGCTTTATTTTGCTGCATTTTGACAGTAAAT
TGTAGAAATGAATACTCAAGCAGTGTCATTGGAAACCCCTCAAGTTTGGATTCACCTCTT
TAGGACATTTAATGGTGTGGTGAAAATTCATCAAATGATAATTTGGTTGTCCTCTTAACT
TAAAAGGGTAGCGTTTACAGATCAGAAGATAGAGGAGCATCTTGGATAAAGATGGTTGAC
TCTTTTGCGAGAGTTGGTGTAAATGTAAAGATGGATCTGAGCTCAAACGTAGGTATTGTT
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ATTAACTGGATCACTACTGATTGTGGTGTTACCATTTAAGCCCTTGGAATCAACTTAAAT
TTGAGAGAATTTATGTATCACCCAACTGAAAAGAATTGGATGCTTGCTTCTTCCTTTAAC
AACTGTGAAAAGCAAAACAACCAAAAAGATAAGAGAAAAAAGGACACTGAATGCTTTAAG
ACTAAAGATTTGTTTTTCTCTGAAAATAAGGGTAAAAGCTGGAGAGTTTTACTTAAATAT
GTTGTACAATTCGGATGGGCTCACAAAGTTAATTCTAAGCTAACAAATGTCCCAACTTCA
AGAATTATATACTCTAAGGAAGTCGGAAATAGTGGTCACCAAGTGATGAAGGGTTGGAGC
ATGAAAACTCATTTATTCTATACTGATGATTTCATGAAAAACTAGAATATGATTGTTAAC
TAAGGAAATAAGTTTTTGATTACTGAAAACTACTTGTTCGCTGCATAAGTTCACAGTAGT
GATAATTAACTAGTCAAGTTAATGGTTTCTTAATCTAATTAAAAAGAATACTCTTTCACT
TATGCTGAAATTCCTGAAGATATACACTAGCACTCATTCACTATTTTAGATACTAAGGAA
GGTTAGGTATTCTTAAATATTAATCACTTGGGCAGTAACTCTCCTATGGGTAATATTTAC
TAATCTGACTCAACTGGTACTCGTTTCTCTCTTTCTCTTGAAGATAATGTAAGAGGAAGA
GATGGTTAATGCGATTTTGAATCAGTTAATGGTGTTGAAGGTATTTTTATCTCAAATATA
TTCGCTCCTAGCAAAAAGTTAAAGGGTATCAAGCAAATGTTGAAATCCAAAAATCCTGAT
ACAAGCGATGAAGATATTCCAACTGAAAACACAAGAAAGAAAGGTCAAGCATAAAATTCT
GAAGATGTCTTAAAAGAATCCTTAAAAAGTCTTAGAGATAACATGGTAACTCGTATCACT
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TAAATTAATTGTGATATTAATAAAAAGTGTTCTCTTCACCTTCACTCAGTTTCTTCATAA
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AACACAGGATAATTCTTAAGTCATAAAGCAGGTAGCGTCAACACTTATCTTTCTCGTGAT
GGTGGTCTTGTTTGGGAAGAAATCCGTAAGGGGTCTCACATATATGAAGTTGCTGATCAT
GGCTCTATCATAGTTATGGCTACTGATTAAGAACCTACTAAGAACATTATTTTCTCTTGG
GATGAAGGCCGCACATGGAACACCAAGTAAATTAGCGATACTCCTGTCATGATTTCAAAT
ATTATCACTGAACCTGGCAATACTTCTGACAAGTTCTTAGTTTATGGATCTATTGAAGGT
GAATCTGATATTTCAGGAATAATTGTCCTTCTTGACTTTGCTTCTCTTCATCCTCGCGAT
TGCTAAGGTTATGAAAACCCTGACACTTCTGATTCTGATTATGAATACTGGACTCCTCAT
AATCCCAGTGAATTCTGTTTATTAGGACGTGAAATTAAATATGTCAGAAGAAAAAGAGAT
GCTGCTTGCTTTAATCCCGAAACTTTTGAAAGATCTTATGTTGTTAGAAAATGTGAATGT
ACTGAACTTGATTGGGAATGTGATGTCGGATTTGCTCGTGCTAAAGACGATAGCAAAGAA
AGAACTGGCCCTTGCGTTCCTTTAAAAGACTTCAAAGTGGATTACAATCCTCCATAAACT
TGCAGTGGCTCTTACCAAGTTACATAAGGTTACAGAAGAGTAGCTGGTAATTAATGTATA
GGCGGTATTGATCATGCTCCAATTTAATACCCTTGTCCTATGTTTGGCTTCTTGAGCTAT
AACAACCTTTTCACCAATGTTCTTATTTTAGGAGCTATGGCTGGTGTTTTCTACTTAATT
ATATAAAATAAAGAAGTAGTAATAACATTTGTAGCTACATCAAATCTTGATGCCTACATT
AACTTAGGTAAAACTTACCTAAAGAAGGGTTATACTTTTGTTACATCAATTGTCCTTCCA
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TCTCATTCCTTAAAGGATCAACATCATTAATTCCATGATAATTTAATTGAAAGCCATGAT
CATGATGATGAGGAAGAGTAAAGTGATGCAGTATAATAATAATTAACTTCTTCTTAAGTC
CCTTAAAATAATAGTAACAAAAACAATAATAATAGTAATACACCAAACTAAGCTCAGCAC
AAAGATCTTCTTGATGAACATGATGGTGAAGAAGATCCTTTTGATCCTAGAAATTGA>TTHERM_00467390(protein)
MKKEIRIALIALFCCILTVNCRNEYSSSVIGNPSSLDSPLQDIQWCGENSSNDNLVVLLT
QKGSVYRSEDRGASWIKMVDSFARVGVNVKMDLSSNVGIVTQMIASPIDSNEIVFMGSDG
INWITTDCGVTIQALGINLNLREFMYHPTEKNWMLASSFNNCEKQNNQKDKRKKDTECFK
TKDLFFSENKGKSWRVLLKYVVQFGWAHKVNSKLTNVPTSRIIYSKEVGNSGHQVMKGWS
MKTHLFYTDDFMKNQNMIVNQGNKFLITENYLFAAQVHSSDNQLVKLMVSQSNQKEYSFT
YAEIPEDIHQHSFTILDTKEGQVFLNINHLGSNSPMGNIYQSDSTGTRFSLSLEDNVRGR
DGQCDFESVNGVEGIFISNIFAPSKKLKGIKQMLKSKNPDTSDEDIPTENTRKKGQAQNS
EDVLKESLKSLRDNMVTRITFDKGGMWSLLRAPAKDSNGKQINCDINKKCSLHLHSVSSQ
LSFGPAYSSENSLGLIIATGNTGQFLSHKAGSVNTYLSRDGGLVWEEIRKGSHIYEVADH
GSIIVMATDQEPTKNIIFSWDEGRTWNTKQISDTPVMISNIITEPGNTSDKFLVYGSIEG
ESDISGIIVLLDFASLHPRDCQGYENPDTSDSDYEYWTPHNPSEFCLLGREIKYVRRKRD
AACFNPETFERSYVVRKCECTELDWECDVGFARAKDDSKERTGPCVPLKDFKVDYNPPQT
CSGSYQVTQGYRRVAGNQCIGGIDHAPIQYPCPMFGFLSYNNLFTNVLILGAMAGVFYLI
IQNKEVVITFVATSNLDAYINLGKTYLKKGYTFVTSIVLPQASNQQQGYFQANQDEENRK
SHSLKDQHHQFHDNLIESHDHDDEEEQSDAVQQQLTSSQVPQNNSNKNNNNSNTPNQAQH
KDLLDEHDGEEDPFDPRN>TTHERM_00467390(gene)
ATGAAAAAAGAAATAAGAATAGCTCTTATAGCTTTATTTTGCTGCATTTTGACAGTAAAT
TGTAGAAATGAATACTCAAGCAGTGTCATTGGAAACCCCTCAAGTTTGGATTCACCTCTT
TAGGACATTTAATGGTGTGGTGAAAATTCATCAAATGATAATTTGGTTGTCCTCTTAACT
TAAAAGGGTAGCGTTTACAGATCAGAAGATAGAGGAGCATCTTGGATAAAGATGGTTGAC
TCTTTTGCGAGAGTTGGTGTAAATGTAAAGATGGATCTGAGCTCAAACGTAATTACTTTT
TTTCAATTGCAAAATACTTCAATTTTTTCCATTTTCATTCTGTTTTATTAATAACTTAAA
TTTTATAAACAGGTAGGTATTGTTACTTAAATGATTGCAAGTCCTATTGATTCTAATGAA
ATAGTCTTTATGGGCTCTGATGGTATTAACTGGATCACTACTGATTGTGGTGTTACCATT
TAAGCCCTTGGAATCAACTTAAATTTGAGAGAATTTATGTATCACCCAACTGAAAAGAAT
TGGATGCTTGCTTCTTCCTTTAACAACTGTGAAAAGCAAAACAACCAAAAAGATAAGAGA
AAAAAGGACACTGAATGCTTTAAGACTAAAGATTTGTTTTTCTCTGAAAATAAGGGTAAA
AGCTGGAGAGTTTTACTTAAATATGTTGTACAATTCGGATGGTATACCATTTATTTATTC
TATAAAGCAAACAGTTTATTAAAACATTATATAATAATATCAAAAAGGGCTCACAAAGTT
AATTCTAAGCTAACAAATGTCCCAACTTCAAGAATTATATACTCTAAGGAAGTCGGAAGT
AATTCGTTTTTCTTTAATGAAGCATCTCAATAAACTAATATAATAATAAAAGATAGTGGT
CACCAAGTGATGAAGGGTTGGAGCATGAAAACTCATTTATTCTATACTGATGATTTCATG
AAAAACTAGAATATGATTGTTAACTAAGGAAATAAGGTAAAACAAATTATTAAAATTTGA
AGCTTTTGTTAATATTGAATATTTCTTAACCAAATAGTTTTTGATTACTGAAAACTACTT
GTTCGCTGCATAAGTTCACAGTAGTGATAATTAACTAGTCAAGTTAATGGTTTCTTAATC
TAATTAAAAAGAATACTCTTTCACTTATGCTGAAATTCCTGAAGATATACACTAGCACTC
ATTCACTATTTTAGATACTAAGGAAGTATGATTTTACTATTTTTTTTTAATTAATTTAAA
TAGATAGGCAAATAATTTACAGCAAATTATGCAATTAAAAAAGATTATAAAAAAATATAA
TAAAAAGCAAGTGTTTAAAAATTAAGAATAATTTAGTTTATAAAAATAGAGAAAAATTAT
AAAAGCAATTAATTAATAAATTTATGATTAATTGAATAGTCAAGCTATTAAATTACATTT
TAAAGAGATTTTTCTCAAATTTTTAAAGATTAGGTTTATTAATTAAAATAAATTTAAAAA
TAGGGTTAGGTATTCTTAAATATTAATCACTTGGGCAGTAACTCTCCTATGGGTAATATT
TACTAATCTGACTCAACTGGTACTCGTTTCTCTCTTTCTCTTGAAGATAATGTAAGAGGA
AGAGATGGTTAATGCGATTTTGAATCAGTTAATGGTGTTGAAGGTATTTTTATCTCAAAT
ATATTCGCTCCTAGCAAAAAGTTAAAGGGTATCAAGCAAATGTTGAAATCCAAAAATCCT
GATACAAGCGATGAAGATATTCCAACTGAAAACACAAGAAAGAAAGGTCAAGCATAAAAT
TCTGAAGATGTCTTAAAAGAATCCTTAAAAAGTCTTAGAGATAACATGGTAACTCGTATC
ACTTTCGACAAGGGTGGTATGTGGAGTTTGCTTAGGGCTCCTGCTAAAGATTCTAATGGA
AAATAAATTAATTGTGATATTAATAAAAAGTGTTCTCTTCACCTTCACTCAGTTTCTTCA
TAACTAAGTTTTGGACCTGCTTACTCAAGTGAAAATTCATTAGGTTTAATTATTGCTACT
GGTAACACAGGATAATTCTTAAGTCATAAAGCAGGTAGCGTCAACACTTATCTTTCTCGT
GATGGTGGTCTTGTTTGGGAAGAAATCCGTAAGGGGTCTCACATATATGAAGTTGCTGAT
CATGGCTCTATCATAGTTATGGCTACTGATTAAGAACCTACTAAGAACATTATTTTCTCT
TGGGATGAAGGCCGCACATGGAACACCAAGTAAATTAGCGATACTCCTGTCATGATTTCA
AATATTATCACTGAACCTGGCAATACTTCTGACAAGTTCTTAGTTTATGGATCTATTGAA
GGTGAATCTGATATTTCAGGAATAATTGTCCTTCTTGACTTTGCTTCTCTTCATCCTCGC
GATTGCTAAGGTTATGAAAACCCTGACACTTCTGATTCTGATTATGAATACTGGACTCCT
CATAATCCCAGTGAATTCTGTTTATTAGGTAAATTTATTTTATTAATATCAAGCCATTTT
AAGGAAATATCTTGAAAAGCTTAATTGATTAATATTCTTTTTAAAAAATATAAAAACGCA
CTTTTAATATTTGATTATTTATTTCAATTAAAATAATTATTCTTGCTTAAATTAAAAAGG
ACGTGAAATTAAATATGTCAGAAGAAAAAGAGATGCTGCTTGCTTTAATCCCGAAACTTT
TGAAAGATCTTATGTTGTTAGAAAATGTGAATGTACTGAACTTGATTGGGAATGTGATGT
CGGATTTGCTCGTGCTAAAGACGATAGCAAAGAAAGAACTGGCCCTTGCGTTCCTTTAAA
AGACTTCAAAGTGGATTACAATCCTCCATAAACTTGCAGTGGCTCTTACCAAGTTACATA
AGGTTACAGAAGAGTAGCTGGTAATTAATGTATAGGCGGTATTGATCATGCTCCAATTTA
ATACCCTTGTCCTATGTTTGGCTTCTTGAGCTATAACAACCTTTTCACCAATGTTCTTAT
TTTAGGAGCTATGGCTGGTGTTTTCTACTTAATTATATAAAATAAAGAAGTAGTAATAAC
ATTTGTAGCTACATCAAATCTTGATGCCTACATTAACTTAGGTAAAACTTACCTAAAGAA
GGGTTATACTTTTGTTACATCAATTGTCCTTCCACAAGCTTCAAATTAATAATAAGGATA
TTTCCAAGCTAACCAAGATGAGGAAAATAGAAAATCTCATTCCTTAAAGGATCAACATCA
TTAATTCCATGATAATTTAATTGAAAGCCATGATCATGATGATGAGGAAGAGTAAAGTGA
TGCAGTATAATAATAATTAACTTCTTCTTAAGTCCCTTAAAATAATAGTAACAAAAACAA
TAATAATAGTAATACACCAAACTAAGCTCAGCACAAAGATCTTCTTGATGAACATGATGG
TGAAGAAGATCCTTTTGATCCTAGAAATTGA
