Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00467390

Standard Name

SOR3 (Sortilin 3)

Aliases

PreTt18641 | 55.m00196 | 3710.m00045

Description

BNR/Asp-box repeat family/ VPS10 domain containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF02012 ) BNR/Asp-box repeat
• ( PF05151 ) Photosystem II reaction centre M

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: Yes
Presense Probability: 73.8%

TetraMine Data

TTHERM_00467390

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_14774.1	9.997093137033517e-262	BNR/Asp-box repeat family prot ein (917 aa)
Oxytricha	Contig4955.0.0.g74	9.997093137033517e-262	BNR/Asp-box repeat
Stentor Coeruleus	SteCoe_29949	5.440559879258653e-75
SGD	YIL173W	5.997098480211051e-62	VTH1 Putative membrane glycopr otein with strong similarity t o Vth2p and Pep1p/Vps10p, may be involved in vacuolar protei n sorting
DictyBase	DDB_G0290081	4.9981275274605926e-36	sort1 on chromosome: 5 positio n 3627939 to 3630336

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00467390(coding)
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TGTAGAAATGAATACTCAAGCAGTGTCATTGGAAACCCCTCAAGTTTGGATTCACCTCTT
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GAATCTGATATTTCAGGAATAATTGTCCTTCTTGACTTTGCTTCTCTTCATCCTCGCGAT
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TGCAGTGGCTCTTACCAAGTTACATAAGGTTACAGAAGAGTAGCTGGTAATTAATGTATA
GGCGGTATTGATCATGCTCCAATTTAATACCCTTGTCCTATGTTTGGCTTCTTGAGCTAT
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AACTTAGGTAAAACTTACCTAAAGAAGGGTTATACTTTTGTTACATCAATTGTCCTTCCA
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CCTTAAAATAATAGTAACAAAAACAATAATAATAGTAATACACCAAACTAAGCTCAGCAC
AAAGATCTTCTTGATGAACATGATGGTGAAGAAGATCCTTTTGATCCTAGAAATTGA

>TTHERM_00467390(protein)
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DGQCDFESVNGVEGIFISNIFAPSKKLKGIKQMLKSKNPDTSDEDIPTENTRKKGQAQNS
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IQNKEVVITFVATSNLDAYINLGKTYLKKGYTFVTSIVLPQASNQQQGYFQANQDEENRK
SHSLKDQHHQFHDNLIESHDHDDEEEQSDAVQQQLTSSQVPQNNSNKNNNNSNTPNQAQH
KDLLDEHDGEEDPFDPRN

>TTHERM_00467390(gene)
ATGAAAAAAGAAATAAGAATAGCTCTTATAGCTTTATTTTGCTGCATTTTGACAGTAAAT
TGTAGAAATGAATACTCAAGCAGTGTCATTGGAAACCCCTCAAGTTTGGATTCACCTCTT
TAGGACATTTAATGGTGTGGTGAAAATTCATCAAATGATAATTTGGTTGTCCTCTTAACT
TAAAAGGGTAGCGTTTACAGATCAGAAGATAGAGGAGCATCTTGGATAAAGATGGTTGAC
TCTTTTGCGAGAGTTGGTGTAAATGTAAAGATGGATCTGAGCTCAAACGTAATTACTTTT
TTTCAATTGCAAAATACTTCAATTTTTTCCATTTTCATTCTGTTTTATTAATAACTTAAA
TTTTATAAACAGGTAGGTATTGTTACTTAAATGATTGCAAGTCCTATTGATTCTAATGAA
ATAGTCTTTATGGGCTCTGATGGTATTAACTGGATCACTACTGATTGTGGTGTTACCATT
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TGGATGCTTGCTTCTTCCTTTAACAACTGTGAAAAGCAAAACAACCAAAAAGATAAGAGA
AAAAAGGACACTGAATGCTTTAAGACTAAAGATTTGTTTTTCTCTGAAAATAAGGGTAAA
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TATAAAGCAAACAGTTTATTAAAACATTATATAATAATATCAAAAAGGGCTCACAAAGTT
AATTCTAAGCTAACAAATGTCCCAACTTCAAGAATTATATACTCTAAGGAAGTCGGAAGT
AATTCGTTTTTCTTTAATGAAGCATCTCAATAAACTAATATAATAATAAAAGATAGTGGT
CACCAAGTGATGAAGGGTTGGAGCATGAAAACTCATTTATTCTATACTGATGATTTCATG
AAAAACTAGAATATGATTGTTAACTAAGGAAATAAGGTAAAACAAATTATTAAAATTTGA
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GTTCGCTGCATAAGTTCACAGTAGTGATAATTAACTAGTCAAGTTAATGGTTTCTTAATC
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TAAAGAGATTTTTCTCAAATTTTTAAAGATTAGGTTTATTAATTAAAATAAATTTAAAAA
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AGAGATGGTTAATGCGATTTTGAATCAGTTAATGGTGTTGAAGGTATTTTTATCTCAAAT
ATATTCGCTCCTAGCAAAAAGTTAAAGGGTATCAAGCAAATGTTGAAATCCAAAAATCCT
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TCTGAAGATGTCTTAAAAGAATCCTTAAAAAGTCTTAGAGATAACATGGTAACTCGTATC
ACTTTCGACAAGGGTGGTATGTGGAGTTTGCTTAGGGCTCCTGCTAAAGATTCTAATGGA
AAATAAATTAATTGTGATATTAATAAAAAGTGTTCTCTTCACCTTCACTCAGTTTCTTCA
TAACTAAGTTTTGGACCTGCTTACTCAAGTGAAAATTCATTAGGTTTAATTATTGCTACT
GGTAACACAGGATAATTCTTAAGTCATAAAGCAGGTAGCGTCAACACTTATCTTTCTCGT
GATGGTGGTCTTGTTTGGGAAGAAATCCGTAAGGGGTCTCACATATATGAAGTTGCTGAT
CATGGCTCTATCATAGTTATGGCTACTGATTAAGAACCTACTAAGAACATTATTTTCTCT
TGGGATGAAGGCCGCACATGGAACACCAAGTAAATTAGCGATACTCCTGTCATGATTTCA
AATATTATCACTGAACCTGGCAATACTTCTGACAAGTTCTTAGTTTATGGATCTATTGAA
GGTGAATCTGATATTTCAGGAATAATTGTCCTTCTTGACTTTGCTTCTCTTCATCCTCGC
GATTGCTAAGGTTATGAAAACCCTGACACTTCTGATTCTGATTATGAATACTGGACTCCT
CATAATCCCAGTGAATTCTGTTTATTAGGTAAATTTATTTTATTAATATCAAGCCATTTT
AAGGAAATATCTTGAAAAGCTTAATTGATTAATATTCTTTTTAAAAAATATAAAAACGCA
CTTTTAATATTTGATTATTTATTTCAATTAAAATAATTATTCTTGCTTAAATTAAAAAGG
ACGTGAAATTAAATATGTCAGAAGAAAAAGAGATGCTGCTTGCTTTAATCCCGAAACTTT
TGAAAGATCTTATGTTGTTAGAAAATGTGAATGTACTGAACTTGATTGGGAATGTGATGT
CGGATTTGCTCGTGCTAAAGACGATAGCAAAGAAAGAACTGGCCCTTGCGTTCCTTTAAA
AGACTTCAAAGTGGATTACAATCCTCCATAAACTTGCAGTGGCTCTTACCAAGTTACATA
AGGTTACAGAAGAGTAGCTGGTAATTAATGTATAGGCGGTATTGATCATGCTCCAATTTA
ATACCCTTGTCCTATGTTTGGCTTCTTGAGCTATAACAACCTTTTCACCAATGTTCTTAT
TTTAGGAGCTATGGCTGGTGTTTTCTACTTAATTATATAAAATAAAGAAGTAGTAATAAC
ATTTGTAGCTACATCAAATCTTGATGCCTACATTAACTTAGGTAAAACTTACCTAAAGAA
GGGTTATACTTTTGTTACATCAATTGTCCTTCCACAAGCTTCAAATTAATAATAAGGATA
TTTCCAAGCTAACCAAGATGAGGAAAATAGAAAATCTCATTCCTTAAAGGATCAACATCA
TTAATTCCATGATAATTTAATTGAAAGCCATGATCATGATGATGAGGAAGAGTAAAGTGA
TGCAGTATAATAATAATTAACTTCTTCTTAAGTCCCTTAAAATAATAGTAACAAAAACAA
TAATAATAGTAATACACCAAACTAAGCTCAGCACAAAGATCTTCTTGATGAACATGATGG
TGAAGAAGATCCTTTTGATCCTAGAAATTGA