Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00420610

Standard Name

SOR1 (Sortilin 1 )

Aliases

PreTt07186 | 46.m00241 | 3679.m00091

Description

BNR/Asp-box repeat family/ VPS10 domain containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF02012 ) BNR/Asp-box repeat
• ( PF06645 ) Microsomal signal peptidase 12 kDa

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: Yes
Presense Probability: 70.5%

TetraMine Data

TTHERM_00420610

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_11013.1	9.997093137033517e-262	BNR/Asp-box repeat family prot ein (876 aa)
Oxytricha	Contig4955.0.0.g74	2.9991470337942304e-139	BNR/Asp-box repeat
Stentor Coeruleus	SteCoe_29949	4.834541638053336e-68
SGD	YJL222W	7.00293386439118e-45	VTH2 Putative membrane glycopr otein with strong similarity t o Vth1p and Pep1p/Vps10p, may be involved in vacuolar protei n sorting
DictyBase	DDB_G0290081	1.999683289470905e-41	sort1 on chromosome: 5 positio n 3627939 to 3630336

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00420610(coding)
ATGAAAGCGTACAAGCATTTATAGCTCATAGGTATTGTATTGCTTATTTCAGCTCTACAG
TTCACTGCAACAGCTAAATAGCAAGATATTTCTTTTAGCAAGAACTTTCTTGATTCTGAA
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ACTAATAACGTTTGTGCCAAAAGCTAAAAAGCTCCATGCTTTTCTTTTGCTATACTATGG
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TGGGGTAATTTAAACTTTACTAATAGCTAAGTTCCTCAACAAAGAATATTTTGGGTTTAA
GAAGATGGAAATAAGCAAAACCAAAATAGATATGGATTGCATGAAAAAAGAAACTTTTAT
TACAGCGATGACTTTTTAGCTTCAAAGAAGCTACTCATGACCAAAGGAAATGTCTTTTAC
ATTGATTATAATTACCTTTATGTTGTTCAACTTTTAGAATAAAATTCATAGCAAGTTAAC
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AAGCTGTAAAACCATAAGTTTACAATTTTAGATACTCGTGAAGGATAGGTTTTCTTAAAT
GTAAATCATTTAGGTTCAACATCTCCTATGGGTACTCTTTATATATCAGACTCATTAGGT
GCTCGCTTTTCCTCAAGCTTGTAGGGTCATCTTAGAAGTGAAAATGGTGATACAGATTTT
GAGCGCTTACATGGAATTTATGGAATTTATATAGCAAATGTTTATGAATAAAAAAGAAGA
GAAGAGTTTGAGAATATGTATGCAAGCGAATAAAATGATGATGATGAAAATTAAGGATAA
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AATGCTGTAGGTTTAGTTTTAGCAAATGGAAATGTTGGTAAGTATCTTTCACATAGTCCA
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GGAGCTTATGTTTTCGAAATAGGTGATCATGGTTCAATAATAGTTATGGCTAAAGATAAG
GATTATGGAACCACTAAATTTATCGAATATACTTTAGATGAAGGTATTACTTGGAACCAA
GTTTAAATATCAGATACTGATATCGAAATAGATAATATAATAACAGAGCCATCAAATACT
GGAACCTCATTCATGGTTCTTGCAAAAACACTATCAACAGATAAAAAATAATATGGATTA
GCTATAACAATAGATTTTGCTAATCAGTTTAATAGAAACTGTTCTGGTGCAACAAGTCCA
GATGATCCTGATTCTGATTATGAAAAATGGATACCTCATAGCTATAAATCATCTCAATGT
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GAAGATTATGAAAGACAAATAGAACTTTAAGCATGTGTCTGCTCTGAAGAAGACTGGGAG
TGTGATATCGGCTATATTAGAAATGGATAAAATGGTCCATGTGTAAAGGATGGAACACTT
AGTGATGAAGAATATGAAGGAGTGATCCCAGAAATATGTACTGATTATTATTAAGTAAGT
AGAGGTTATAGAAAAATTCCTTACAATACATGCTAAGGAGGTGTAAATTATTCAGCGGAA
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TTGTTAATTTACTTAAGTTCTTTGATCCCTCTAATTTATTCTCATCGTAAAGATTATATT
GACTTTTCCAAAGCAAAGTCAGACCATGAAGAAAAGGAAAATAAATTTATGAATCTATTT
TCATTTAGCAACAAAAAAAATGTTAATCATTACAGCAACGTAAATGAAAGTGAAGATTAT
GAAGATAGTGAAGATCATTAACATCTTAATAACCAAAATTACAATCATTTAAATTAACAT
AACTATTTTACTGATAACCAAGATGAAGAGAGTCATTATGATTGA

>TTHERM_00420610(protein)
MKAYKHLQLIGIVLLISALQFTATAKQQDISFSKNFLDSEIVDVIWCGTDTQNDQNVLVQ
TDSGTIYRSQNKMVHFENISDNLVNAGIKYVADNSQIVESEVIRMIRSQANPNVIVLQGK
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YSDDFLASKKLLMTKGNVFYIDYNYLYVVQLLEQNSQQVNLKVANPQDLDIKLRDVQLGE
KLQNHKFTILDTREGQVFLNVNHLGSTSPMGTLYISDSLGARFSSSLQGHLRSENGDTDF
ERLHGIYGIYIANVYEQKRREEFENMYASEQNDDDENQGQDSKNKKSNTSIKQDKKAVKM
KDLVTQKIQTMITFDKGGMWSRINAPTTDQENKEIKCGDNCFLNIHSNSNDLYNSFYSSK
NAVGLVLANGNVGKYLSHSPTQVNTYLSRDAGLTWKQIKRGAYVFEIGDHGSIIVMAKDK
DYGTTKFIEYTLDEGITWNQVQISDTDIEIDNIITEPSNTGTSFMVLAKTLSTDKKQYGL
AITIDFANQFNRNCSGATSPDDPDSDYEKWIPHSYKSSQCLLGQKVTYSRKKQESVCLNG
EDYERQIELQACVCSEEDWECDIGYIRNGQNGPCVKDGTLSDEEYEGVIPEICTDYYQVS
RGYRKIPYNTCQGGVNYSAETRRCPGNSIFSFNTLKNLILLILAIAAIYYGIQYKSQLSS
LLIYLSSLIPLIYSHRKDYIDFSKAKSDHEEKENKFMNLFSFSNKKNVNHYSNVNESEDY
EDSEDHQHLNNQNYNHLNQHNYFTDNQDEESHYD

>TTHERM_00420610(gene)
ATGAAAGCGTACAAGCATTTATAGCTCATAGGTATTGTATTGCTTATTTCAGCTCTACAG
TTCACTGCAACAGCTAAATAGCAAGATATTTCTTTTAGCAAGAACTTTCTTGATTCTGAA
ATAGTTGATGTCATTTGGTGTGGCACCGACACATAGAATGACTAAAACGTTTTGGTTCAA
ACTGATAGTGGAACCATTTATAGATCTTAAAACAAAATGGTACACTTCGAAAATATTAGC
GATAATCTTGTTAATGCTGGTATCAAATATGTAGCTGATAATAGTTAAATAGTAAGTTTT
ACATTCAGAAAAAGGTTTTATTACATTTAACTTTATAATAATAATCAACTTAAAGGTAGA
AAGTGAAGTTATTAGAATGATAAGAAGTCAAGCTAATCCTAATGTTATTGTTCTTTAAGG
CAAAAATGAAGTCAACTGGGTAACAAGAGACTGCGGTAATACATTTAGAGCCTTTTCAAG
AAAGAAAGATAGGTAAATTTTACAAGAATTGTTAGACTAGAAATAATTTGACTGAATTTT
CTTTTTTATTTAAGAATAAACACATTTAAGTTGCATCCCAGTTAAGAAGCATGGATGTTA
GCAAGCACTAATAACGTTTGTGCCAAAAGCTAAAAAGCTCCATGCTTTTCTTTTGCTATA
CTATGGTTAAGTAAAGATTTAGGAAATAGTTGGGAGAAGCTTACTCAATATGTTTACAAA
TTCGAATGGTAAATTTCAAAATAATAAAGACAAAGCTCATCACTAATTTATTTTAAAAAT
AAAATCAATTTAGGGGTAATTTAAACTTTACTAATAGCTAAGTTCCTCAACAAAGAATAT
TTTGGGTTTAAGAAGATGGAAGTAATCTAATTTTTAAAATAAATTCAAAAATAGCAAATA
AAATTTTAATAATTAGATAAGCAAAACCAAAATAGATATGGATTGCATGAAAAAAGAAAC
TTTTATTACAGCGATGACTTTTTAGCTTCAAAGAAGCTACTCATGACCAAAGGAAATGTC
TTTTACATTGATTATAATTACCTTTATGTTGTTCAACGTAAATATTTTTATTCACAATAC
TTAGCGAATTTAAATATCTTAAAATAAATTAGTTTTAGAATAAAATTCATAGCAAGTTAA
CCTAAAAGTTGCTAATCCTTAAGACTTAGATATTAAATTAAGGGATGTTTAGTTAGGCGA
GAAGCTGTAAAACCATAAGTTTACAATTTTAGATACTCGTGAAGGATAGGTTTTCTTAAA
TGTAAATCATTTAGGTTCAACATCTCCTATGGGTACTCTTTATATATCAGACTCATTAGG
TGCTCGCTTTTCCTCAAGCTTGTAGGGTCATCTTAGAAGTGAAAATGGTGATACAGATTT
TGAGCGCTTACATGGAATTTATGGAATTTATATAGCAAATGTTTATGAATAAAAAAGAAG
AGAAGAGTTTGAGAATATGTATGCAAGCGAATAAAATGATGATGATGAAAATTAAGGATA
AGACTCCAAAAATAAAAAAAGCAATACATCAATTAAATAGGATAAAAAAGCAGTAAAGAT
GAAAGATTTGGTCACCCAAAAAATATAGACAATGATTACTTTCGATAAAGGTGGTATGTG
GAGTAGAATTAATGCTCCAACCACAGACTAGGAAAACAAAGAAATTAAATGTGGTGACAA
CTGCTTCTTAAATATACATTCTAATTCTAATGACTTATATAATTCATTCTACTCATCAAA
AAATGCTGTAGGTTTAGTTTTAGCAAATGGAAATGTTGGTAAGTATCTTTCACATAGTCC
AACTCAAGTTAATACTTACCTTTCAAGAGATGCAGGTTTAACTTGGAAATAAGTAATTTA
AAATTAAGATTTAACTTCATATTTATTTATTCTTTCAATGATTTAAAAGATTAAAAGAGG
AGCTTATGTTTTCGAAATAGGTGATCATGGTTCAATAATAGTTATGGCTAAAGATAAGGA
TTATGGAACCACTAAATTTATCGAATATACTTTAGATGAAGGTATTACTTGGAACCAAGT
TTAAATATCAGATACTGATATCGAAATAGATAATATAATAACAGAGCCATCAAATACTGG
AACCTCATTCATGGTTCTTGCAAAAACACTATCAACAGATAAAAAATAATATGGATTAGC
TATAACAATAGATTTTGCTAATCAGTTTAATAGAAACTGTTCTGGTGCAACAAGTCCAGA
TGATCCTGATTCTGATTATGAAAAATGGATACCTCATAGCTATAAATCATCTCAATGTCT
CTTAGGTTAGAAAGTGACTTACTCACGTAAAAAACAAGAATCTGTTTGCTTAAATGGAGA
AGTAAAATATTTTAGATATAAAAAAAAAAAATTAAATTAGTAAATTGTAACAAAAGGATT
ATGAAAGACAAATAGAACTTTAAGCATGTGTCTGCTCTGAAGAAGACTGGGAGTGTGATA
TCGGCTATATTAGAAATGGATAAAATGGTCCATGTGTAAAGGATGGAACACTTAGTGATG
AAGAATATGAAGGAGTGATCCCAGAAATATGTACTGATTATTATTAAGTAAGTAGAGGTT
ATAGAAAAATTCCTTACAATACATGCTAAGGAGGTGTAAATTATTCAGCGGAAACTAGAA
GATGCCCTGGAAATTCAATTTTTAGCTTTAATACTTTAAAAAATTTGATTCTTTTGATTT
TAGCTATTGCAGCTATTTATTATGGAATTCAGTATAAGAGTTAACTCTCTAGCTTGTTAA
TTTACTTAAGTTCTTTGATCCCTCTAATTTATTCTCATCGTAAAGATTATATTGACTTTT
CCAAAGCAAAGTCAGACCATGAAGAAAAGGAAAATAAATTTATGAATCTATTTTCATTTA
GCAACAAAAAAAATGTTAATCATTACAGCAACGTAAATGAAAGTGAAGATTATGAAGATA
GTGAAGATCATTAACATCTTAATAACCAAAATTACAATCATTTAAATTAACATAACTATT
TTACTGATAACCAAGATGAAGAGAGTCATTATGATTGA