Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00547950

Standard Name

SFR6 (Sfi1 Repeat containing protein)

Aliases

PreTt15047 | 71.m00174 | 3729.m00051

Description

SFR6 hypothetical protein; cortical row basal body localization; predicted to have 12 Sfi1 repeats; Leucine Rich Repeat family protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00467 ) KOW motif
  • ( PF01920 ) Prefoldin subunit
  • ( PF07989 ) Spindle associated
  • ( PF00560 ) Leucine Rich Repeat
  • ( PF08182 ) Pedibin/Hym-346 family
  • ( PF04394 ) Protein of unknown function, DUF536
  • ( TIGR02413 ) Bacillus tandem small hypothetical proetin
  • ( TIGR00042 ) non-canonical purine NTP pyrophosphatase, rdgB/HAM1

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%

TetraMine Data

TTHERM_00547950

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_17049.19.997093137033517e-262hypothetical protein (1041 aa)
WormBaseWBGene000173200.0000000010002658722841845Uncharacterized protein F09G8.
5 status:Partially_confirmed
UniProt:P34390 protein_id
:CCD62650.1
DictyBaseDDB_G02841010.00000030014504373857585snrpA1 on chromosome: 4 positi
on 1571395 to 1572487
SGDYPL169C0.000009999254677478949MEX67 Poly(A)RNA binding prote
in involved in nuclear mRNA ex
port, component of the nuclear
pore; ortholog of human TAP

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00547950(coding)
ATGAGTCTACATAACTCTAAACAATACATTTCCAGTAAAAGCCCTTTCAAAGGCCCATTT
CCACTTTCTTAGTTCCTTGAAGAAAGACATTAAGATATATAAGGAAACCATTTAGTGTTT
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TCTTAGACAGATGTAGAAGAAAATACAAGATAAGTCAAGTTTATGAACAACTAACTGAAT
TTACTTTATGAGAATTATTTGAAAATAGTGGAATTACAATCTATAATTTAAAGATTGCTG
ACACATAAAGAATATATATTCACCTTTGAACCTAATGTTATGAATCCACCATTTAATTTG
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CGTTTTCGAGATGCATGTGAAAATTAAAAGTACAATAAAAAGAAAGTTATAGCCATGACT
TAAAGAATACAATGGGCAATGCTTAAGTATAATTTTAGAGAGTTTAAGCTTGAAGATATC
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CTTTAATGCATGAAAATACATACTTAACTGGTAAAAGAGAAAAAAATACTTGACAAAAAA
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GTCCTTTAAAAGTAAAAATTGAAAAATGTCTTCAAGATCTAAAATTCTTAAAAGATATTC
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AGTGCTTTGAAATTCTATTAAAAAAATCAATATTAAAAACAAGGCTACTAATTTATATCT
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AAAGAGATTAACATCCAACTGACAGAAGTTGCTGAGAAAAGAGAAGAAAACAATTAGAAT
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AATATTGAGCTCAATGCAAAAATAGAAGAAATAAGTGAGTTTAAAAGCATAACAGCAGCA
AAGAATGAAGATTTTTACTAAGAAATAACCCAACTAAAGAACAAAATTTTAGCTTAAGAT
AAAATAATTGCAGAATACGAAGAGATGACAAAAAGCTTGTCAAATACAAACAAAGAAGTA
GAGAGCTTAAACATTCATCTGAATGTAAGGGTAGAGTCTTTGCAAGAAAGAATTTCAAAT
TTGCAAAAAGAATCAGCTATGCAAGTTTCTTCACTTGAGAAGTAGTTAGAATTTGCTAAC
AGAGAGAGATCAAACTTGATTGCACAAAACACTTCTCTGATGAATTAAAATAAAACTTTT
TAAGCAGAATTAAATCAGCTAAATCAAAACCTAAAAAAAGAGGAGTTTAAAGTCTCTCTT
CTCAGAGAGTAAGATTATGACAAAACTTCGTAATTTATACAGTTGGCCAAAAATATTAAT
TCACCTAGCAGAAAACAAGCATCGTCTCCATTAAGATTTACTGGAAGACTAAAAACTCTT
CCTGAAGATTCTTTGATAGATGAAAGAGTTCTCAATACATCTCATTCAAGAATAAACACA
TTAATACAATAAAAAACAGACAGAAATTTATTCACTTAACCAATTACTTAGGAAAATGGA
ATTTAAAATCCAAATAACAATTCTATATCATAATTTTTCTCCCATAAGGTTCCCCAAATG
AATCAAACTTAACATAATTCTATAAAAAAAGAAGTCTCTCCTTTGAGGGAATATCTAACT
GACATGAAATTCAGGGCCTCAGTGTTTATAAAAACAATTGACATGGATGAAAAAAATAAA
AAAAGCATAAGAAACTCACCATAAAAAGGCTGTATTTCCCCTTAAAAGACCTCATCACCA
CAGCTATATAAAAGCCAAAGAAATTTATAGAATCAATCACAAACAAGTGTGATAAAAGAT
GAAATTCAAAGAAGATTGAACAATTTAGACTATAAATTTAATGAGGATATCAAAAAATTT
TAATCTTAGCAATAGCAGTGA


>TTHERM_00547950(protein)
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YKLTLMTILPKLQVLDSKKLSQTDVEENTRQVKFMNNQLNLLYENYLKIVELQSIIQRLL
THKEYIFTFEPNVMNPPFNLQKFRKIFSYGDTIDEKAQQEIKTNLLADVQTIQNEILKTQ
KIEEAFAEMERRQIDKIQQLENTVLQKVKEYKYNCLDIEIFHKLNKNNTKIQNLKKFINF
TRQEQKQEVVVVGNKGKIQRNRKDQQNIYVEDSQSSQSQQNKNEQGQIQQDFQTDESLRG
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LESNLNIIQDEYEQQIRNLKNVQIQFDKERDLLNSNIQNLNIELNAKIEEISEFKSITAA
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LIQQKTDRNLFTQPITQENGIQNPNNNSISQFFSHKVPQMNQTQHNSIKKEVSPLREYLT
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>TTHERM_00547950(gene)
ATGAGTCTACATAACTCTAAACAATACGTAAGGAATTTTTATAAATATTCATTAAATAAT
TGTATTCATTTTATTTTAACTTACTATTTTATAGATTTCCAGTAAAAGCCCTTTCAAAGG
CCCATTTCCAGTATGATTTATTAATGATGTTGAAGATAAATTAAAGACTTTGCTAAAAAA
TTATTAAAATAGCTTTCTTAGTTCCTTGAAGAAAGACATTAAGATATATAAGGAAACCAT
TTAGTGTTTTAAAATCACAATATCGATGAAATTGATGAGCTCTACATGGATATGTCAAAA
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TAAGATTTAAGAAACTTAAATATTTCAAATAACTAAGTACATTTTACAAAAGAAAACCAA
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TTCTATCTTAAAGAGTTGCAGAATTTATAGATCCTAAATTTGAATAACAATCCAGTTGTT
TAATAATAAAACTACAAACTCACTTTAATGACTATTCTACCTAAATTATAGGTTTTAGAT
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TTAATTGTGATTTTTTATTTTTATAAAAAGAAATTATCTTAGACAGATGTAGAAGAAAAT
ACAAGATAAGTCAAGTTTATGAACAACTAACTGAATTTACTTTATGAGAATTATTTGAAA
ATAGTGGAATTACAATCTGTAAGCAAAGTTTTTTAGATAAAAATAGAAAATATTTTAAAA
ATTAATTATAAGTTTTATATTAAAAAGATATTATTAAATCTTAAATAAATTTAATAAAAT
TTCAAAAGATAATTTAAAGATTGCTGACACATAAAGAATATATATTCACCTTTGAACCTA
ATGTTATGAATCCACCATTTAATTTGTAGAAATTTAGGAAAATTTTTAGCTATGGAGATA
CTATAGATGAAAAAGCTTAATAAGAAATCAAAACAAATTTATTAGCTGACGTTTAAACAA
TTTAAAATGAAATATTGAAAACGTAGGACTTTATTTTTTTTAAAACTCTTGTTTTTTAAA
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TAAAATCTAGTAATTAGAGAATACTGTGCTATAAAAAGTTAAAGAGTACAAATACAACTG
TCTCGATATTGAGATTTTCCATAAGCTGAATAAAAATAATACCAAAATACAGAACTTAAA
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TTATTAATTTTAGAAAAGAATTATAAAATTAATATTTAATTATTTACCAAAATTAACACT
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AAAACGAATAAGGTTAAATTTAATAAGATTTTTAAACAGATGAAAGCTTAAGAGGATCTT
TTTAAAATTAAACTTTTACTGAAAGAGACCTGAAAAGATTAGCGAACATAAATAGTAAAT
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AAAAGGCTTTACTGCAATCTTCTAATGATCAAGAAATGCTCAGAAAAAAAGAAGAAGAGT
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AAAATATAGATGAGTGCTTTTAAACTCTTTAAACATAGTTGGAATAAATCAAAGAACTCA
GATAACTACTTGAATAGCAATAAATTGAAGAGGAAAACACACTAAAAGCAGATTACTTTT
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ATATCTCAGTCATTGGAAATAATACCATGTTTTTTCAAAAATAAGAAAAACAAAATAAGA
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GAAAAAAGCATTAAAATAATTCTAAGAAAAATTCGAAAAAGGATTAGCAGTAATTTAGTT
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CAGATGAGAAATACTCTTTTCTACTTTTGAAGAAAGGTTTCCAATCACTCTTTTATAATC
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AAGTAAAAAAATAAATATATTTTTATAATAAATTGAAGTTAACTTGAAAAATGATTAATA
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CAAGTTTATTTAATTATATATAATATATTGAATAAAGGAATCAATCACAAACAAGTGTGA
TAAAAGATGAAATTCAAAGAAGATTGAACAATTTAGACTATAAATTTAATGAGGATATCA
AAAAATTTTAATCTTAGCAATAGCAGTGA