Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00522410

Standard Name

SFR3 (Sfi1 repeat containing protein)

Aliases

PreTt12356 | 65.m00174 | 3717.m00053

Description

basal body localization; predicted to have 26 Sfi1 repeats

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00249 ) Myb-like DNA-binding domain
  • ( PF02671 ) Paired amphipathic helix repeat
  • ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_00522410

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

  • ( SD03303 ) Micronucleus: cen2-1[Δ::NEO2]
  • ( SD03304 ) Micronucleus: cen2-1[Δ::NEO2]
  • ( SD03305 ) Micronucleus: cen2-1[Δ::NEO2]

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_12865.17.996885557285438e-77hypothetical protein (385 aa)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00522410(coding)
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>TTHERM_00522410(protein)
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>TTHERM_00522410(gene)
ATGAGCGGATCTCAAGAAGAATAATTAAAAGCTTTTTATGATCAGCTCGATAGATTTAAT
AGTTTTTGGATTAAGAAGAGGATCTTTTCAAGATGGAAAGAGCATTTTGTTGATACAAAA
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