Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00138430

Standard Name

SFB2 (transport protein SFB2)

Aliases

PreTt24470 | 10.m00519 | 3698.m00236

Description

Sec23/Sec24 trunk domain containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• COPII vesicle coat (IEA) | GO:0030127

Molecular Function

• zinc ion binding (IEA) | GO:0008270
• protein binding (IEA) | GO:0005515

Biological Process

• ER to Golgi vesicle-mediated transport (IEA) | GO:0006888
• intracellular protein transport (IEA) | GO:0006886

Domains

• ( PF08181 ) DegQ (SacQ) family
• ( PF04810 ) Sec23/Sec24 zinc finger
• ( PF04811 ) Sec23/Sec24 trunk domain
• ( PF04815 ) Sec23/Sec24 helical domain
• ( PF08033 ) Sec23/Sec24 beta-sandwich domain

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_00138430

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_05904.1	9.997093137033517e-262	Sec23/Sec24 trunk domain-conta ining protein (831 aa)
Oxytricha	Contig903.1.g86	3.0008389609965914e-128	Sec23/Sec24 trunk domain
DictyBase	DDB_G0281255	2.0006821221283624e-88	sec24 on chromosome: 3 positio n 4298212 to 4301618
WormBase	WBGene00004756	3.000298514542485e-73	locus:sec-24.2 status:Partia lly_confirmed UniProt:Q23368 protein_id:CAA92988.3
SGD	YIL109C	1.0002758036576784e-62	SEC24 Component of the Sec23p- Sec24p heterodimer of the COPI I vesicle coat, required for c argo selection during vesicle formation in ER to Golgi trans port; homologous to Sfb2p and Sfb3p
Stentor Coeruleus	SteCoe_22962	5.74952226429356e-19

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00138430(coding)
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>TTHERM_00138430(protein)
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>TTHERM_00138430(gene)
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ATTAAATTTTTGATGTGA