Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00189400

Standard Name

SEN1 (putative helicase SEN1)

Aliases

PreTt08690 | 15.m00401 | 3697.m00113

Description

SEN1 AAA domain protein; putative helicase required for processing of tRNAs- rRNAs- and small nuclear RNAs

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Gene Ontology Annotations

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Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.9%

TetraMine Data

TTHERM_00189400

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_06264.19.997093137033517e-262hypothetical protein (822 aa)
DictyBaseDDB_G02743994.001158060863534e-95DDB_G0274399 on chromosome: 2
position 4681340 to 4684368
OxytrichaContig9372.0.1.g139.996907204735647e-62AAA domain
SGDYLR430W3.0014802379878627e-60SEN1 Presumed helicase require
d for RNA polymerase II transc
ription termination and proces
sing of RNAs; homolog of Senat
axin which causes Ataxia-Oculo
motor Apraxia 2 and a dominant
form of amyotrophic lateral s
clerosis
WormBaseWBGene000048805.997865882830678e-40locus:smg-2 Regulator of non
sense transcripts 1 status:C
onfirmed UniProt:O76512 pr
otein_id:CCD73461.1
Stentor CoeruleusSteCoe_144611.185064864233981e-27

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00189400(coding)
ATGAGTAATTAGAATCCTAAAGAAGAGATAGAAAAAAAGGATAACAGAATCTTAGATGGT
CTTCATTATTATTTGTGCTCTAGGGATTATAACATTAATTTTGATGAATCTATTGACAAC
ATTAATTTAAATGTAGAAGGAGATGATGAGAATAAAAATAGTGATTTAAATAATATAATT
CCAGAGGAAACTGCTGATAAAAATGCAGATTAAGTTGAATAATAAAATACTTTATAGTAG
CCTTAGATGAGTTTTACAAATTTGGCAAATATTCCATTATCTTTTAACGACCCAGAAGAT
TATGTTAAAACATTTGAATAACATCTCTTTTCTGAAGCAAAAGCATAAATTATCAAAGCC
CAAGTTACAGAATCAAGAGCTCCTGAAATTATGAGATTAAAAAACTCTTAGGTAATTGCT
CTAAAAAATAATTCAGAGCTTTTCTTCAGAAAGCTAACTATGGAGAAAGTTGCTGACTCA
GAAACAAAATATGGAACTCATGATTTTATAGTTATATCATTACAAGATCCTTCCAAAGTA
ATATCAGGAGAACATATGTTAGGTGTAGTAGAAAGAGCTGAAGGAAATGAAATTTTAGTC
AAAGTAGTTTTTGATGAAAATAGCAGCGACCCACGTAATTAAAAAATACTTAAAGTCATG
TAACAAGATGAAAGCGTTTGGAGAAATTGGTATGTGAAAAAGTTTTGCAGTATAGTTACT
ATTCAAAGAGAATACGAAGCTCTACACAATTTTAATGATTTGCTTTTAAAAGAGTTCATA
CTTAATCCTGAAAAGTTAACTCAGAAGAAAGAAGAGAAGTTTTCTATCCCTGAATAGCTT
TCAATTCGTTTAAATTAGATTTATAATCCCTCCCAAATTCAAGCTATTAACTCAACACTA
AAGAAATAAGGTGTTACTTTAATTTAAGGTCCTCCTGGTACAGGTAAAACACGTACTGTG
CTAGGTACTGTTTCAGTGCTTATTAATTCATTTAATGAAGACTAGCTTAAGTAAAAGCAC
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TTAGCTATGCCATGGATGTAGCCTAATTATGTTGATTGGAGAGATAGTACTTTTGATCAC
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ATTTGTGGTCCTTCAAATGCAGCTATAGATGAAATCGTTCGTAAAATGAAAAAAGAAGGT
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AATTATGATAAAGATTTGGAGGATGTATCTTTAGATTATTTAGTCAAGTAAAAACTTGGC
GAATAAAATATCAGATCAGAAGATGCTTAAGAAATAAGAAAGAAAATATTAAAAGAAGCC
AAGATTATCTGTGGTACTCTCAGTTCAACTGGTTCATAAATTTTAGCATCTGCTAACTTT
AAATTTGATACTGTCGTAATTGATGAAGCTGCTCAGTCTACAGAAATAAGTACTCTCATT
CCTTTGCAATATTAATGTACTAGACTTATTTTAATTGGTGATCATAATTAATTGCCTGCT
ACTATATTCTCTAAAAAATGTGAAAAGTTTAATTATCATTAGAGTTTATTCGAACGTTTT
GAAAAATGTAAAGTTGAAGTTCATATGTTAAATTAACAATATAGAATGAACCCCATTATT
AGTAAGTTTATTTCTTAAACTTTTTACTAAGACAAAATTTCAGATGCCGAAAAAATTAAC
GAGCTTGTAGGTTAACCTGAAATTTATTAGTTAAGACTATTTTAGCCTGTCGTTTTCTTT
AACGTTGAAGGTAATGAAATATTTGAAAAATCTTCATATAAGAACGAGGAAGAGTCAAAA
GCTATTGTTGAAATTTATAATAAATTGAGAACTACCTTCCCTAATTTCGATTTGAATAAG
TTAGGTATTATTACTGCTTACTCTCGTTAAGTTAAGGAAATAGAAAAAAAAATTAAAGCT
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GAAAAGGATATAATTATATTCTCTACTGTGAGAGCTAGTTAGGTAAATGGAGAAAAAAAT
ACTAAAAAAACTATTGGTTTCTTAAATGACAGAAGAAGAATGAATGTCAGTTTAAGTAGA
GCAAGATTATGTGTTATAGTTGTGGGTGATCTCAAATAACTTAAATTTTCTAAATTATGG
AAAGGATTAGCAGAATATTCAATAGAATAAAGAAGTTGTTATAATATGGTTGCCCCATAT
TAAACTTTTGTTAGTAAATTAGAATTACACTTTGATTAATACAAAGTTTATAGGGCAACA
TAGAATTGA


>TTHERM_00189400(protein)
MSNQNPKEEIEKKDNRILDGLHYYLCSRDYNINFDESIDNINLNVEGDDENKNSDLNNII
PEETADKNADQVEQQNTLQQPQMSFTNLANIPLSFNDPEDYVKTFEQHLFSEAKAQIIKA
QVTESRAPEIMRLKNSQVIALKNNSELFFRKLTMEKVADSETKYGTHDFIVISLQDPSKV
ISGEHMLGVVERAEGNEILVKVVFDENSSDPRNQKILKVMQQDESVWRNWYVKKFCSIVT
IQREYEALHNFNDLLLKEFILNPEKLTQKKEEKFSIPEQLSIRLNQIYNPSQIQAINSTL
KKQGVTLIQGPPGTGKTRTVLGTVSVLINSFNEDQLKQKHSMEIEDKSKLVEQSGEFHFE
LAMPWMQPNYVDWRDSTFDHLHNDFSNFTKTKKYITADQTDKVIPILKAQEEHAPPEKIL
ICGPSNAAIDEIVRKMKKEGLLDKNGNIYDPSKIIVRIGENYDKDLEDVSLDYLVKQKLG
EQNIRSEDAQEIRKKILKEAKIICGTLSSTGSQILASANFKFDTVVIDEAAQSTEISTLI
PLQYQCTRLILIGDHNQLPATIFSKKCEKFNYHQSLFERFEKCKVEVHMLNQQYRMNPII
SKFISQTFYQDKISDAEKINELVGQPEIYQLRLFQPVVFFNVEGNEIFEKSSYKNEEESK
AIVEIYNKLRTTFPNFDLNKLGIITAYSRQVKEIEKKIKAHDKTDKCMVEVHTVDGFQGR
EKDIIIFSTVRASQVNGEKNTKKTIGFLNDRRRMNVSLSRARLCVIVVGDLKQLKFSKLW
KGLAEYSIEQRSCYNMVAPYQTFVSKLELHFDQYKVYRATQN


>TTHERM_00189400(gene)
ATGAGTAATTAGAATCCTAAAGAAGAGATAGAAAAAAAGGATAACAGAATCTTAGATGGT
CTTCATTATTATTTGTGCTCTAGGGATTATAACATTAATTTTGATGAATCTATTGACAAC
ATTAATTTAAATGTAGAAGGAGATGATGAGAATAAAAATAGTGATTTAAATAATATAATT
CCAGAGGAAACTGCTGATAAAAATGCAGATTAAGTTGAATAATAAAATACTTTATAGTAG
CCTTAGATGAGTTTTACAAATTTGGCAAATATTCCATTATCTTTTAACGACCCAGAAGAT
TATGTTAAAACATTTGAATAACATCTCTTTTCTGAAGCAAAAGCATAAATTATCAAAGCC
CAAGTTACAGAAGTAAGTTTACTACAATTAAACAATATAGATTTGTTTTAAAATAAATAT
AAAATGTTTAAAAAAGTCAAGAGCTCCTGAAATTATGAGATTAAAAAACTCTTAGGTAAT
TGCTCTAAAAAATAATTCAGAGCTTTTCTTCAGAAAGCTAACTATGGAGAAAGTTGCTGA
CTCAGAAACAAAATATGGAACTCATGATTTTATAGTTATATCATTACAAGATGTAAATCA
AATATTTTATTTCTACATAAATTGCAATCAATTTAAGATTAAAAATTTAATTGATTGTTG
AATTTTAAAATATATTTTATTTTTAATCAATAAAGCCTTCCAAAGTAATATCAGGAGAAC
ATATGTTAGGTGTAGTAGAAAGAGCTGAAGGAAATGAAATTTTAGTCAAAGTAGTTTTTG
ATGAAAATAGCAGCGACCCACGTAATTAAAAAATACTTAAAGTCATGTAACAAGATGAAA
GCGTTTGGAGAAATTGGTATGTGAAAAAGTTTTGCAGTATAGTTACTATTCAAAGAGAAT
ACGAAGTAAATTACTTTATTATATATTTATTTGTCTATTAGTCTTGGATATTTGTGGCAA
AGTTTTATGATTTGATTTCGAAGTTATTAAAACTATTTTTATTATCGTAAAGGCTCTACA
CAATTTTAATGATTTGCTTTTAAAAGAGTTCATACTTAATCCTGAAAAGTTAACTCAGAA
GAAAGAAGAGAAGTTTTCTATCCCTGAATAGCTTTCAATTCGTTTAAATTAGATTTATAA
TCCCTCCCAAATTCAAGCTATTAACTCAACACTAAAGAAATAAGGTGTTACTTTAATTTA
AGGTCCTCCTGGTACAGGTAAAACACGTACTGTGCTAGGTACTGTTTCAGTGCTTATTAA
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GTTAGTTGAGCAGTCAGGCGAATTCCATTTCGAATTGTAATATTTTATTCTAATTTTGTC
TTTAAAAACTAATTAAAATTTTTAAAAATTAGAGCTATGCCATGGATGTAGCCTAATTAT
GTTGATTGGAGAGATAGTACTTTTGATCACTTGCATAATGATTTTTCTAATTTTACTAAA
ACAAAAAAATATATCACTGCTGATTAAACTGATAAAGTCATTCCTATCCTAAAAGCTTAG
GAAGAGCATGCACCCCCTGAAAAAATTTTAATTTGTGGTCCTTCAAATGCAGCTATAGAT
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TTCATTTATTTCAGAAATTTCATTATTTTTATATATTTTATTTATTCAAAAGGGTTTATT
GGACAAAAATGGTAATATTTATGATCCTTCTAAAATTATAGTCAGAATTGGTGAGAATTA
TGATAAAGATTTGGAGGATGTATCTTTAGATTATTTAGTCAAGTAAAAACTTGGCGAATA
AAATATCAGATCAGAAGATGCTTAAGAAATAAGAAAGAAAATATTAAAAGAAGCCAAGAT
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TTAAAAAATAAATAATTCAACTATTTTGATTTAAATAATATGTTTATTTTCATCAAGAAA
TTTGATACTGTCGTAATTGATGAAGCTGCTCAGTCTACAGAAATAAGTACTCTCATTCCT
TTGCAATATTAATGTACTAGACTTATTTTAATTGGTGATCATAATTAATTGCCTGCTACT
ATATTCTCTAAAAAATGTGAAAAGTTTAATTATCATTAGAGTTTATTCGAACGTTTTGAA
AAATGTAAAGTTGAAGTTCATATGTTAAATGTAATAATTTATTTATATCCCATTTTGAGT
TTTAATTTAATAATATTTTTAGTAACAATATAGAATGAACCCCATTATTAGTAAGTTTAT
TTCTTAAACTTTTTACTAAGACAAAATTTCAGATGCCGAAAAAATTAACGAGCTTGTAGG
TTAACCTGAAATTTATTAGTTAAGACTATTTTAGCCTGTCGTTTTCTTTAACGTTGAAGT
AATTTTTTATATATAAATTAAGATAGGTTAAATTAAAAATCAATTAAAAATTATAGGGTA
ATGAAATATTTGAAAAATCTTCATATAAGAACGAGGAAGAGTCAAAAGCTATTGTTGAAA
TTTATAATAAATTGAGAACTACCTTCCCTAATTTCGATTTGAATAAGTTAGGTATTATTA
CTGCTTACTCTCGTTAAGTTAAGGAAATAGAAAAAAAAATTAAAGCTCACGATAAAACAG
ACAAGTGTATGGTTGAAGTACACACAGTTGATGGTTTCTAAGGTAGAGAAAAGGATATAA
TTATATTCTCTACTGTGAGAGCTAGTTAGGTAAATGGAGAAAAAAATACTAAAAAAACTA
TTGGTTTCTTAAATGACAGAAGAAGAATGAATGTCAGTTTAAGTAGAGCAAGATTATGTG
TTATAGTTGTGGGTGATCTCAAATAACTTAAATTTTCTAAATTATGGAAAGGATTAGCAG
AATATTCAATAGAATAAAGAAGTTGTTATAATATGGTTGCCCCATATTAAACTTTTGTTA
GTAAATTAGAATTACACTTTGATTAATACAAAGTTTATAGGGCAACATAGAATTGA