Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00189400Standard Name
SEN1 (putative helicase SEN1)Aliases
PreTt08690 | 15.m00401 | 3697.m00113Description
SEN1 AAA domain protein; putative helicase required for processing of tRNAs- rRNAs- and small nuclear RNAsGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.9%
TetraMine Data
TTHERM_00189400
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_06264.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (822 aa)
DictyBase DDB_G0274399 4.001158060863534e-95 DDB_G0274399 on chromosome: 2
position 4681340 to 4684368
Oxytricha Contig9372.0.1.g13 9.996907204735647e-62 AAA domain
SGD YLR430W 3.0014802379878627e-60 SEN1 Presumed helicase require
d for RNA polymerase II transc
ription termination and proces
sing of RNAs; homolog of Senat
axin which causes Ataxia-Oculo
motor Apraxia 2 and a dominant
form of amyotrophic lateral s
clerosis
WormBase WBGene00004880 5.997865882830678e-40 locus:smg-2 Regulator of non
sense transcripts 1 status:C
onfirmed UniProt:O76512 pr
otein_id:CCD73461.1
Stentor Coeruleus SteCoe_14461 1.185064864233981e-27
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00189400(coding)
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CTTCATTATTATTTGTGCTCTAGGGATTATAACATTAATTTTGATGAATCTATTGACAAC
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TAGAATTGA>TTHERM_00189400(protein)
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EKDIIIFSTVRASQVNGEKNTKKTIGFLNDRRRMNVSLSRARLCVIVVGDLKQLKFSKLW
KGLAEYSIEQRSCYNMVAPYQTFVSKLELHFDQYKVYRATQN>TTHERM_00189400(gene)
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TTTAATTTAATAATATTTTTAGTAACAATATAGAATGAACCCCATTATTAGTAAGTTTAT
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