Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00992820

Standard Name

SEC24 (translocation protein SEC24)

Aliases

PreTt18344 | 186.m00060

Description

Sec23/Sec24 zinc finger family protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF08383 ) Maf N-terminal region
  • ( PF04810 ) Sec23/Sec24 zinc finger
  • ( PF00400 ) WD domain, G-beta repeat
  • ( PF04811 ) Sec23/Sec24 trunk domain
  • ( PF08033 ) Sec23/Sec24 beta-sandwich domain
  • ( PF04667 ) cAMP-regulated phosphoprotein/endosulfine conserved region

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

TetraMine Data

TTHERM_00992820

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_04369.19.997093137033517e-262Sec23/Sec24 zinc finger family
protein (1002 aa)
OxytrichaContig903.1.g869.003625457657353e-25Sec23/Sec24 trunk domain
DictyBaseDDB_G02812552.999534586690157e-23sec24 on chromosome: 3 positio
n 4298212 to 4301618
WormBaseWBGene000047567.002638123733849e-21locus:sec-24.2 status:Partia
lly_confirmed UniProt:Q23368
protein_id:CAA92988.3
SGDYIL109C1.9991095569230066e-20SEC24 Component of the Sec23p-
Sec24p heterodimer of the COPI
I vesicle coat, required for c
argo selection during vesicle
formation in ER to Golgi trans
port; homologous to Sfb2p and
Sfb3p

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00992820(coding)
ATGAGTGTTCATTAAAAAATAATTAAAAGAGGAGAAGAAAAAAATCATCTTTCAAACTCA
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AATCAAATAAGAAATTAAAATGAGTACGATCTGTCTGACTCTTAAGAGGATATCGATGAC
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TATGGAATCTCAAAAGAATAGGAAGAGAAAGAACAATAATATAATTTATAAAAAAGGAGA
GAGCAAGAAGAAGCTAAGCTAAAACATTAAAAACTATTAGATTAATCTAAAAATAAAAAT
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TATTTTCCTATAAATAATAAAATTTAGAACGAGTGCCGCATACCTTTAGCAATATCACTA
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TTATACTTAACTCCATACATGAATGAAGAAGATGTACCTAGATGTTAAGCATGCTAGACA
ATAATTAATCCTTTCTGTGAAATTTTAGAAAGTTTATGCAAATGGAAATGCAATATGTGT
TTTAATATGCAGCCAGTACCAAAAGTATACAAAGATTAAATTTTTAATATCAGAGCTGTC
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TAAAAGCAAGCAGCAAAATAAAATTAGAATATATTTTTTAAAGCACTTGAATTTAGTTTA
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GCTCCAGTTAATAAAAATTATACAATATTTTCAATATAAAATAAGTTCGAAGACACTTTT
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GTTTTAAGACTTAGATGCTCAAATGGGTGGTCAATTTCTAATTGTATGGGTAATACTAGC
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TTAGAAGTTTAAAATGAAATACAATAAAATAAAATAAATTATTTCTGCTTTTAGAGTTGT
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GCTTTACTCCCATGTATGGAAATAGTTATTTTAAGCATCTTAGGGTTGTTTAAGCAGAAG
AATTTTCTATAAAAAGATATTCCTTAAGGATTAGATAGTGCATTAAATTAGATAATTTCC
TATTAACGAATGAGTCCAACTGAGTTAGATTCATAATTTGTGCCAATCATATTTGACTTA
GAGGAAATCAAAAACTCTAAAGTATATGATGAAAAAGGACAATATGTCTTTCCTAAATCT
CTAAGTTTGAGCTATTAAAGTATTTATGATAAAGAAATTATATTAGGAGATTTTGGAAAA
GAATTTATTATTTTCATTATTTCAGCGAATGTACAGTAAGATACCTTAAAATCTGTCTTT
AATACTACAGATTTAACCGAAATAAAGAAAAAAACTAAGGATGAATTTTATAAAAATACA
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TCTTATGTAGATTTCAGTATTATAATTACAGATTAAGGTGACCCAAGAGAATTTGAGTTT
TATTATAAATTAATTGAGGATAAATACGAATCGTTCTAAAAAGGCTATAATAAGAGCTAC
GAAGAGTTTGTTGACGAGCTTTTAAAATAAATTAATTGA


>TTHERM_00992820(protein)
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LEVQNEIQQNKINYFCFQSCLLFTNTKQQRIMRVHNFILPLTNNHLNIFQSINPKILMTY
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LSLSYQSIYDKEIILGDFGKEFIIFIISANVQQDTLKSVFNTTDLTEIKKKTKDEFYKNT
SSVSEKVMILLNSLSYIKTRSYVDFSIIITDQGDPREFEFYYKLIEDKYESFQKGYNKSY
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>TTHERM_00992820(gene)
ATGAGTGTTCATTAAAAAATAATTAAAAGAGGAGAAGAAAAAAATCATCTTTCAAACTCA
TAGCTTTAAAATACAAGTGCAACTGACAATTATCTAAGAGATGAAAACGATGATTATGAT
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TATTTTCCTATAAATAATAAAATTTAGAACGAGTGCCGCATACCTTTAGCAATATCACTA
GCTCCTTTTCATGAGCCTGAAGTAATTTTAAGTTATTTAAATTTTTAATACTGGAAAATA
AATAGTATTATTATTTGTTGTTTTATCTGGGTTGTTATTTAGCATTTTTAAATAAATAAA
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TCTAACATGGTTCTTACGATATATTGCTTCCTAGCAAGTAAAATTAAATTTTGTTTATAA
TTTTTGAACAATGTTGAATTAAAAATGATGTTTTAAATGAAAAAGTTATCAAAGATTGAA
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GTGAAGAGAGATCTAGAAGTAGTGTATTGGTTTATGATAGATGTTAGTCAGTAATCTGTT
AGCAATGGGTTTTTAAGGAGTACTTGTGAAGGAATAAGAAGCGCTCTAATGTCGAAAACA
ATGCAATCAAATAAATCACATATTAAGGTTTTTATAAAATATAATTTTAGTTAATTCCTA
ATTATTTTAAATATATAATTTAAAAAGATAGGAATTATAGGATATGATAATGAACTACAC
TTGTTCAACATAAGCAGTAGATTGAAAAATCCATAAATATTTGTGTATAAAGATTTAGAG
GAATAAATGGATATCTTAAACAAAGATACTTTGTTTCATTTAAATGAATAAACTACAGAA
AATTAAGAAGAAAAGGGTGAGAAAGGTTTCTTTACTAAACTTATAGAAAATATAAAACCC
AAGTAAGATCCAATTGTTAAATAAGCAATAGAGCCTAAACATTAAAAATTAGATTACGAA
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GTTCAAGCTCCAGTTAATAAAAATTATACAATATTTTCAATATAAAATAAGTTCGAAGAC
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GAATCAGTTTTAAGACTTAGATGCTCAAATGGGTGGTCAATTTCTAATTGTATGGGTAAT
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GTGCCAATCATATTTGACTTAGAGGAAATCAAAAACTCTAAAGTATATGATGAAAAAGGA
CAATATGTCTTTCCTAAATCTCTAAGTTTGAGCTATTAAAGTATTTATGATAAAGAAATT
ATATTAGGAGATTTTGGAAAAGAATTTATTATTTTCATTATTTCAGCGTAAGAATATTTC
TTTTTCTTCTGAATAGCTAAAATTATATTTACTTAATAGGAATGTACAGTAAGATACCTT
AAAATCTGTCTTTAATACTACAGATTTAACCGAAATAAAGAAAAAAACTAAGGTATTTTT
TTGAAAATAAATAATAAATTATTTAAATTAATTTATATTTAAAAAAATAAAAAGGATGAA
TTTTATAAAAATACATCTTCGGTATCTGAAAAAGTAATGATACTTTTAAACAGTCTATCT
TAGTAAATTTATTAATTTGAATGTAAATTTATTAATGTAATATAAATAAATAAAGTATCA
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GGTTTTATTATAAATTAATTGAGGATAAATACGAATCGTTCTAAAAAGGCTATAATAAGA
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