Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00992820

Standard Name

SEC24 (translocation protein SEC24)

Aliases

PreTt18344 | 186.m00060

Description

SEC24 Sec23/Sec24 zinc finger protein; Sec23/Sec24 zinc finger family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• COPII vesicle coat (IEA) | GO:0030127

Molecular Function

• zinc ion binding (IEA) | GO:0008270
• protein binding (IEA) | GO:0005515

Biological Process

• ER to Golgi vesicle-mediated transport (IEA) | GO:0006888
• intracellular protein transport (IEA) | GO:0006886

Domains

• ( PF08383 ) Maf N-terminal region
• ( PF04810 ) Sec23/Sec24 zinc finger
• ( PF00400 ) WD domain, G-beta repeat
• ( PF04811 ) Sec23/Sec24 trunk domain
• ( PF08033 ) Sec23/Sec24 beta-sandwich domain
• ( PF04667 ) cAMP-regulated phosphoprotein/endosulfine conserved region

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%

TetraMine Data

TTHERM_00992820

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_04369.1	9.997093137033517e-262	Sec23/Sec24 zinc finger family protein (1002 aa)
Oxytricha	Contig903.1.g86	9.003625457657353e-25	Sec23/Sec24 trunk domain
DictyBase	DDB_G0281255	2.999534586690157e-23	sec24 on chromosome: 3 positio n 4298212 to 4301618
WormBase	WBGene00004756	7.002638123733849e-21	locus:sec-24.2 status:Partia lly_confirmed UniProt:Q23368 protein_id:CAA92988.3
SGD	YIL109C	1.9991095569230066e-20	SEC24 Component of the Sec23p- Sec24p heterodimer of the COPI I vesicle coat, required for c argo selection during vesicle formation in ER to Golgi trans port; homologous to Sfb2p and Sfb3p

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00992820(coding)
ATGAGTGTTCATTAAAAAATAATTAAAAGAGGAGAAGAAAAAAATCATCTTTCAAACTCA
TAGCTTTAAAATACAAGTGCAACTGACAATTATCTAAGAGATGAAAACGATGATTATGAT
GGTTTTAATTAGGAAAACGATTACGACTAATATTAATAGCAAGTAAACAATTCTTATGAT
GAGTAAAAGCTTGGGGATATTATGAACGATTCTAATGAATATGAATTAAATGGTTAATCT
CATAGTAACTAAATGTAAAGCAATATTTAGGATTTATAGAATGGAGGCCATAACAGCTAT
TAAAAAAATAATTATAATTAAGCACAAAGTTAATACAACTATGATCATTTATAATAGCAA
AATGTTTATAATAGGCAATAAGAATAATCTTATCAATAAGCAAGCAGTAACTAGCAAAAT
TAAATTTAGCAAAGCAAATAGTATTACAATAATGTAATAAAACCTCAATATTAGCAAGCC
AATCAAATAAGAAATTAAAATGAGTACGATCTGTCTGACTCTTAAGAGGATATCGATGAC
AACAATCAATTCAGCAATAATGTTTAAAATGTTCATTATTCTGAAATAGAAAGAGAAATT
TATGGAATCTCAAAAGAATAGGAAGAGAAAGAACAATAATATAATTTATAAAAAAGGAGA
GAGCAAGAAGAAGCTAAGCTAAAACATTAAAAACTATTAGATTAATCTAAAAATAAAAAT
AAATAAAGAGATTCTAGAGATTATAATAGTTCTCCAGAGTGTATTTAGAGCAGTAGCAAT
TATTTTCCTATAAATAATAAAATTTAGAACGAGTGCCGCATACCTTTAGCAATATCACTA
GCTCCTTTTCATGAGCCTGAATGCTTAGATACAGTCAATTTTAAGCTTAAGAAAAATTAA
TTATACTTAACTCCATACATGAATGAAGAAGATGTACCTAGATGTTAAGCATGCTAGACA
ATAATTAATCCTTTCTGTGAAATTTTAGAAAGTTTATGCAAATGGAAATGCAATATGTGT
TTTAATATGCAGCCAGTACCAAAAGTATACAAAGATTAAATTTTTAATATCAGAGCTGTC
AGGCCAGAACTCTAACATGGTTCTTACGATATATTGCTTCCTAGCAAGTATAGAGTGAAG
AGAGATCTAGAAGTAGTGTATTGGTTTATGATAGATGTTAGTCAGTAATCTGTTAGCAAT
GGGTTTTTAAGGAGTACTTGTGAAGGAATAAGAAGCGCTCTAATGTCGAAAACAATGCAA
TCAAATAAATCACATATTAAGATAGGAATTATAGGATATGATAATGAACTACACTTGTTC
AACATAAGCAGTAGATTGAAAAATCCATAAATATTTGTGTATAAAGATTTAGAGGAATAA
ATGGATATCTTAAACAAAGATACTTTGTTTCATTTAAATGAATAAACTACAGAAAATTAA
GAAGAAAAGGGTGAGAAAGGTTTCTTTACTAAACTTATAGAAAATATAAAACCCAAGTAA
GATCCAATTGTTAAATAAGCAATAGAGCCTAAACATTAAAAATTAGATTACGAATATCCT
TTTCCAGATGACATAGTTAACAGCTTTTCAGATTGTGAAAAGCATCTTTTTACTTTATTA
GATTAAATTGAAATAATGTACGAATAGAAATATAAAAATTTTGATAGTGAATCTAGTAGT
TAAAAGCAAGCAGCAAAATAAAATTAGAATATATTTTTTAAAGCACTTGAATTTAGTTTA
GATCATATTAAATTTACAGGTGGAAAGTTATTTATTTTTCATTCTAGTCTGAATGTTCAA
GCTCCAGTTAATAAAAATTATACAATATTTTCAATATAAAATAAGTTCGAAGACACTTTT
ATTACTCCTTGCATATTTTATTAGAAATCTATGTTATCTAGGGATATAGTATCCTTTGTT
TATAAAATAACTAAAGAAACAAATGGAGAAATTTATGATATTTCCCCAGCTGACATCTAA
AATAAAAAGTATCAAAGTGACCTAGCAGAATCAATTACTATTAAGTAAAGTTTCGAATCA
GTTTTAAGACTTAGATGCTCAAATGGGTGGTCAATTTCTAATTGTATGGGTAATACTAGC
TTGAGGACAGATACATATAATTTGCTAAATATGAACTGCGATGTGAAAACTCATATTATT
TTAGAAGTTTAAAATGAAATACAATAAAATAAAATAAATTATTTCTGCTTTTAGAGTTGT
CTTCTTTTTACAAACACTAAACAGCAGAGGATTATGAGAGTTCATAATTTTATATTGCCT
TTGACGAATAATCATTTGAACATATTTTAAAGTATAAACCCAAAGATATTAATGACTTAT
TACTCTAAACTATACTTGGAATAAATAATTCACAAGATAGGAGATAGCAAGCAATTTGAA
ACATATGTAACTCAGTAGCTTAGATTATTAATATCTATTTAATTGTAATGTAACAGAGCA
GCTTTACTCCCATGTATGGAAATAGTTATTTTAAGCATCTTAGGGTTGTTTAAGCAGAAG
AATTTTCTATAAAAAGATATTCCTTAAGGATTAGATAGTGCATTAAATTAGATAATTTCC
TATTAACGAATGAGTCCAACTGAGTTAGATTCATAATTTGTGCCAATCATATTTGACTTA
GAGGAAATCAAAAACTCTAAAGTATATGATGAAAAAGGACAATATGTCTTTCCTAAATCT
CTAAGTTTGAGCTATTAAAGTATTTATGATAAAGAAATTATATTAGGAGATTTTGGAAAA
GAATTTATTATTTTCATTATTTCAGCGAATGTACAGTAAGATACCTTAAAATCTGTCTTT
AATACTACAGATTTAACCGAAATAAAGAAAAAAACTAAGGATGAATTTTATAAAAATACA
TCTTCGGTATCTGAAAAAGTAATGATACTTTTAAACAGTCTATCTTATATCAAGACAAGA
TCTTATGTAGATTTCAGTATTATAATTACAGATTAAGGTGACCCAAGAGAATTTGAGTTT
TATTATAAATTAATTGAGGATAAATACGAATCGTTCTAAAAAGGCTATAATAAGAGCTAC
GAAGAGTTTGTTGACGAGCTTTTAAAATAAATTAATTGA

>TTHERM_00992820(protein)
MSVHQKIIKRGEEKNHLSNSQLQNTSATDNYLRDENDDYDGFNQENDYDQYQQQVNNSYD
EQKLGDIMNDSNEYELNGQSHSNQMQSNIQDLQNGGHNSYQKNNYNQAQSQYNYDHLQQQ
NVYNRQQEQSYQQASSNQQNQIQQSKQYYNNVIKPQYQQANQIRNQNEYDLSDSQEDIDD
NNQFSNNVQNVHYSEIEREIYGISKEQEEKEQQYNLQKRREQEEAKLKHQKLLDQSKNKN
KQRDSRDYNSSPECIQSSSNYFPINNKIQNECRIPLAISLAPFHEPECLDTVNFKLKKNQ
LYLTPYMNEEDVPRCQACQTIINPFCEILESLCKWKCNMCFNMQPVPKVYKDQIFNIRAV
RPELQHGSYDILLPSKYRVKRDLEVVYWFMIDVSQQSVSNGFLRSTCEGIRSALMSKTMQ
SNKSHIKIGIIGYDNELHLFNISSRLKNPQIFVYKDLEEQMDILNKDTLFHLNEQTTENQ
EEKGEKGFFTKLIENIKPKQDPIVKQAIEPKHQKLDYEYPFPDDIVNSFSDCEKHLFTLL
DQIEIMYEQKYKNFDSESSSQKQAAKQNQNIFFKALEFSLDHIKFTGGKLFIFHSSLNVQ
APVNKNYTIFSIQNKFEDTFITPCIFYQKSMLSRDIVSFVYKITKETNGEIYDISPADIQ
NKKYQSDLAESITIKQSFESVLRLRCSNGWSISNCMGNTSLRTDTYNLLNMNCDVKTHII
LEVQNEIQQNKINYFCFQSCLLFTNTKQQRIMRVHNFILPLTNNHLNIFQSINPKILMTY
YSKLYLEQIIHKIGDSKQFETYVTQQLRLLISIQLQCNRAALLPCMEIVILSILGLFKQK
NFLQKDIPQGLDSALNQIISYQRMSPTELDSQFVPIIFDLEEIKNSKVYDEKGQYVFPKS
LSLSYQSIYDKEIILGDFGKEFIIFIISANVQQDTLKSVFNTTDLTEIKKKTKDEFYKNT
SSVSEKVMILLNSLSYIKTRSYVDFSIIITDQGDPREFEFYYKLIEDKYESFQKGYNKSY
EEFVDELLKQIN

>TTHERM_00992820(gene)
ATGAGTGTTCATTAAAAAATAATTAAAAGAGGAGAAGAAAAAAATCATCTTTCAAACTCA
TAGCTTTAAAATACAAGTGCAACTGACAATTATCTAAGAGATGAAAACGATGATTATGAT
GGTTTTAATTAGGAAAACGATTACGACTAATATTAATAGCAAGTAAACAATTCTTATGAT
GAGTAAAAGCTTGGGGATATTATGAACGATTCTAATGAATATGAATTAAATGGTTAATCT
CATAGTAACTAAATGTAAAGCAATATTTAGGATTTATAGAATGGAGGCCATAACAGCTAT
TAAAAAAATAATTATAATTAAGCACAAAGTTAATACAACTATGATCATTTATAATAGCAA
AATGTTTATAATAGGCAATAAGAATAATCTTATCAATAAGCAAGCAGTAACTAGCAAAAT
TAAATTTAGCAAAGCAAATAGTATTACAATAATGTAATAAAACCTCAATATTAGCAAGCC
AATCAAATAAGAAATTAAAATGAGTACGATCTGTCTGACTCTTAAGAGGATATCGATGAC
AACAATCAATTCAGCAATAATGTTTAAAATGTTCATTATTCTGAAATAGAAAGAGAAATT
TATGGAATCTCAAAAGAATAGGAAGAGAAAGAACAATAATATAATTTATAAAAAAGGAGA
GAGCAAGAAGAAGCTAAGCTAAAACATTAAAAACTATTAGATTAATCTAAAAATAAAAAT
AAATAAAGAGATTCTAGAGATTATAATAGTTCTCCAGAGTGTATTTAGAGCAGTAGCAAT
TATTTTCCTATAAATAATAAAATTTAGAACGAGTGCCGCATACCTTTAGCAATATCACTA
GCTCCTTTTCATGAGCCTGAAGTAATTTTAAGTTATTTAAATTTTTAATACTGGAAAATA
AATAGTATTATTATTTGTTGTTTTATCTGGGTTGTTATTTAGCATTTTTAAATAAATAAA
TAAACAAACAGTGCTTAGATACAGTCAATTTTAAGCTTAAGAAAAATTAATTATACTTAA
CTCCATACATGAATGAAGAAGATGTACCTAGATGTTAAGCATGCTAGACAATAATTAATC
CTTTCTGTGAAATTTTAGAAAGTTTATGCAAATGGAAATGCAATATGTGTTTTAATATGC
AGCCAGTACCAAAAGTATACAAAGATTAAATTTTTAATATCAGAGCTGTCAGGCCAGAAC
TCTAACATGGTTCTTACGATATATTGCTTCCTAGCAAGTAAAATTAAATTTTGTTTATAA
TTTTTGAACAATGTTGAATTAAAAATGATGTTTTAAATGAAAAAGTTATCAAAGATTGAA
ATCTTAGCTTACATTTTAATCGTAAACTAAATTTATTATTTTAATTTTAACAGGTATAGA
GTGAAGAGAGATCTAGAAGTAGTGTATTGGTTTATGATAGATGTTAGTCAGTAATCTGTT
AGCAATGGGTTTTTAAGGAGTACTTGTGAAGGAATAAGAAGCGCTCTAATGTCGAAAACA
ATGCAATCAAATAAATCACATATTAAGGTTTTTATAAAATATAATTTTAGTTAATTCCTA
ATTATTTTAAATATATAATTTAAAAAGATAGGAATTATAGGATATGATAATGAACTACAC
TTGTTCAACATAAGCAGTAGATTGAAAAATCCATAAATATTTGTGTATAAAGATTTAGAG
GAATAAATGGATATCTTAAACAAAGATACTTTGTTTCATTTAAATGAATAAACTACAGAA
AATTAAGAAGAAAAGGGTGAGAAAGGTTTCTTTACTAAACTTATAGAAAATATAAAACCC
AAGTAAGATCCAATTGTTAAATAAGCAATAGAGCCTAAACATTAAAAATTAGATTACGAA
TATCCTTTTCCAGATGACATAGTTAACAGCTTTTCAGATTGTGAAAAGCATCTTTTTACT
TTATTAGATTAAATTGAAATAATGTACGAATAGAAATATAAAAATTTTGATAGTGAATCT
AGTAGTTAAAAGCAAGCAGCAAAATAAAATTAGAATATATTTTTTAAAGCACTTGAATTT
AGTTTAGATCATATTAAATTTACAGGTGGAAAGTTATTTATTTTTCATTCTAGTCTGAAT
GTTCAAGCTCCAGTTAATAAAAATTATACAATATTTTCAATATAAAATAAGTTCGAAGAC
ACTTTTATTACTCCTTGCATATTTTATTAGAAATCTATGTTATCTAGGGATATAGTATCC
TTTGTTTATAAAATAACTAAAGAAACAAATGGAGAAATTTATGATATTTCCCCAGCTGAC
ATCTAAAATAAAAAGTATCAAAGTGACCTAGCAGAATCAATTACTATTAAGTAAAGTTTC
GAATCAGTTTTAAGACTTAGATGCTCAAATGGGTGGTCAATTTCTAATTGTATGGGTAAT
ACTAGCTTGAGGACAGATACATATAATTTGCTAAATATGAACTGCGATGTGTAATTTTAT
TTTTAAAATTAAAATAATCAAATCTTATTTTTATTTATAGGAAAACTCATATTATTTTAG
AAGTTTAAAATGAAATACAATAAAATAAAATAAATTATTTCTGCTTTTAGGTAAATTAGC
TCATTATTATATCAATTATTTATTTGGAATAATTTTCAATTAAATCTAAAAATATAATTT
AAATTTTATTATCTTAGACTTAATTATTCACTTTTTGAAAAAAATTAAATACAATATTCA
GTTTATTTTATCATAAATTTAAATAGAGTTGTCTTCTTTTTACAAACACTAAACAGCAGA
GGATTATGAGAGTTCATAATTTTATATTGCCTTTGACGAATAATCATTTGAACATATTTT
AAAGTATAAACCCAAAGATATTAATGACTTATTACTCTAAACTATACTTGGAATAAGTAA
AAAAGACTTTATTAAATTATAAAGTTATATGAGATATATTCAATATAAACAGATAATTCA
CAAGATAGGAGATAGCAAGCAATTTGAAACATATGTAACTCAGTAGCTTAGATTATTAAT
ATCTATTTAATTGTAATGTAACAGAGTAACTAACTAACTATTTTATTCTGTTTTTTTAGA
TTGAAATTAATTTATTAATTATAAAGGCAGCTTTACTCCCATGTATGGAAATAGTTATTT
TAAGCATCTTAGGGTTGTTTAAGCAGAAGAATTTTCTATAAAGTAATTTAAATTCATAAT
AAATCAAGTAAAATATTTATTTATTACAAAATAGAAGATATTCCTTAAGGATTAGATAGT
GCATTAAATTAGATAATTTCCTATTAACGAATGAGTCCAACTGAGTTAGATTCATAATTT
GTGCCAATCATATTTGACTTAGAGGAAATCAAAAACTCTAAAGTATATGATGAAAAAGGA
CAATATGTCTTTCCTAAATCTCTAAGTTTGAGCTATTAAAGTATTTATGATAAAGAAATT
ATATTAGGAGATTTTGGAAAAGAATTTATTATTTTCATTATTTCAGCGTAAGAATATTTC
TTTTTCTTCTGAATAGCTAAAATTATATTTACTTAATAGGAATGTACAGTAAGATACCTT
AAAATCTGTCTTTAATACTACAGATTTAACCGAAATAAAGAAAAAAACTAAGGTATTTTT
TTGAAAATAAATAATAAATTATTTAAATTAATTTATATTTAAAAAAATAAAAAGGATGAA
TTTTATAAAAATACATCTTCGGTATCTGAAAAAGTAATGATACTTTTAAACAGTCTATCT
TAGTAAATTTATTAATTTGAATGTAAATTTATTAATGTAATATAAATAAATAAAGTATCA
AGACAAGATCTTATGTAGATTTCAGTATTATAATTACAGATTAAGGTGACCCAAGAGAAT
TTGAGTATAAATTTATAAATAAAATAACAAATATTTGAATAAAAATATTATTTTTATTTA
GGTTTTATTATAAATTAATTGAGGATAAATACGAATCGTTCTAAAAAGGCTATAATAAGA
GCTACGAAGAGTTTGTTGACGAGCTTTTAAAATAAATTAATTGA