Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00992820

Standard Name

SEC24 (translocation protein SEC24)

Aliases

PreTt18344 | 186.m00060

Description

SEC24 Sec23/Sec24 zinc finger protein; Sec23/Sec24 zinc finger family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• COPII vesicle coat (IEA) | GO:0030127

Molecular Function

• protein binding (IEA) | GO:0005515
• zinc ion binding (IEA) | GO:0008270

Biological Process

• ER to Golgi vesicle-mediated transport (IEA) | GO:0006888
• intracellular protein transport (IEA) | GO:0006886

Domains

• ( PF08383 ) Maf N-terminal region
• ( PF04810 ) Sec23/Sec24 zinc finger
• ( PF00400 ) WD domain, G-beta repeat
• ( PF04811 ) Sec23/Sec24 trunk domain
• ( PF08033 ) Sec23/Sec24 beta-sandwich domain
• ( PF04667 ) cAMP-regulated phosphoprotein/endosulfine conserved region

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%

TetraMine Data

TTHERM_00992820

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_04369.1	9.997093137033517e-262	Sec23/Sec24 zinc finger family protein (1002 aa)
Oxytricha	Contig903.1.g86	9.003625457657353e-25	Sec23/Sec24 trunk domain
DictyBase	DDB_G0281255	2.999534586690157e-23	sec24 on chromosome: 3 positio n 4298212 to 4301618
WormBase	WBGene00004756	7.002638123733849e-21	locus:sec-24.2 status:Partia lly_confirmed UniProt:Q23368 protein_id:CAA92988.3
SGD	YIL109C	1.9991095569230066e-20	SEC24 Component of the Sec23p- Sec24p heterodimer of the COPI I vesicle coat, required for c argo selection during vesicle formation in ER to Golgi trans port; homologous to Sfb2p and Sfb3p

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00992820(coding)
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>TTHERM_00992820(protein)
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>TTHERM_00992820(gene)
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GCTACGAAGAGTTTGTTGACGAGCTTTTAAAATAAATTAATTGA