Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00474750Standard Name
SEC23 (protein transport protein Sec23)Aliases
PreTt02275 | 57.m00214 | 3709.m00074Description
SEC23 protein transporter Sec23A; Sec23/Sec24 trunk domain containing proteinGenome Browser (Macronucleus)
![]()
Genome Browser (Micronucleus)
![]()
Gene Ontology Annotations
Cellular Component
- COPII vesicle coat (IEA) | GO:0030127
Molecular Function
- protein binding (IEA) | GO:0005515
- zinc ion binding (IEA) | GO:0008270
Biological Process
- ER to Golgi vesicle-mediated transport (IEA) | GO:0006888
- intracellular protein transport (IEA) | GO:0006886
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.8%
TetraMine Data
TTHERM_00474750
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Stentor Coeruleus SteCoe_35301 0 Tetrahymena borealis EI9_13151.1 9.997093137033517e-262 Sec23/Sec24 trunk domain-conta
ining protein (751 aa)
Oxytricha Contig21712.0.g108 9.997093137033517e-262 Sec23/Sec24 trunk domain
SGD YPR181C 9.997093137033517e-262 SEC23 GTPase-activating protei
n, stimulates the GTPase activ
ity of Sar1p; component of the
Sec23p-Sec24p heterodimer of
the COPII vesicle coat, involv
ed in ER to Golgi transport
DictyBase DDB_G0281985 1.0000509032773212e-171 sec23 on chromosome: 3 positio
n 5216752 to 5219266
WormBase WBGene00004754 2.9990837046884738e-127 locus:sec-23 status:Confirme
d UniProt:Q9U2Z1 protein_i
d:CAB60476.2
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00474750(coding)
ATGATAGATATTTACGAAATAGAGTAAAAAGACGGTGTTAGATGTGTATGGAATAATATA
CCTCCTACTAAACTTGCAGCAACAAGGGCTGTTGTTCCAATTGGTATCCATTACACACCT
TATAAGGAATTAGATCCTAGCAATAGAATGGAATATGAAGCTTTACGTTGCAGATGCCAA
GCAATTTTGAATCCCTACTGCTAAGTTGATTTTAATCAAAAGTTCTGGATTTGCCCTTTT
TGTACTTCCAGAAATCCATTCCCTTAAATTTATCATCAAATTACTCCTTAAAATCTTCCT
GCAGAATTAATGGAAGACTATTCGACTATCGAATATGTTTATTCAAAGGAAAAGCCCGTT
CCAAATATCTTCTTATTAGTTGTTGATGTTAGTTTAGAATAGATTGAATTAGAAGCATTA
AGAGATTCTATTTAGCAATCATTGAATATTATTCCTCCTGATTCATATGTCGGTTTAATT
ACATTCGGAAAGTTTGTTTTTGTTCATGAATTAGGCTTTTAGGAGTGTCCTAAATCATAT
GCATTTAAAGGAAGCAAAGACTATACTACTACATAAGTTTAAGAAATGCTTGGTCTTATT
GCTCCTGGTACTTAGCCAAAGCCTGGAAAAAATATGGACGTTATTAAACGTTTCTTACTT
CCATTGAACGAATGTGAATTTACTTTAAATAGTATTCTTGATGATCTTCAACCTGATCCT
TGGAACGTTCCTTAAGGAGAAAGAGAATAGCGTGCTTCAGGCGTTGCTATCAATGCTGCT
ATCAGCTTAATTGAAGCTTGCCCTATCCCTGGCTCTAGAGTTATGTTCTTCACTGGTGGT
CCTTGCACTATTGGTCCAGGTTAAGTTTTTGGAATCAAGTAAGAGGAAACTCCTCGTTCT
TACTTGGATATCGGCCAAGATAATAGTATTGCTTAATACGTTAAAAAAGCAACTAAATAC
TATCAAACTCTTGCTCTTAGAGCTATAAAAAGCTAGATAACAGTAGATATTTATGGTTTT
TGCCCTGATCAATTTGGTTTGTACGAAATGAAATATATGGCAGAAAAGACTGGAGGTTAC
ATTGTTTTTAATGAAGAATTCAATTCAGATCCTTTCAGAGAAACATTTAGAAAAATATTT
GATAAGGATTAAAATGATGAATTAAGATTTGCATCAGCAGCTAGAATAGATATGTTTGTT
TGCAAGGAAGTTAAGATCTAAGGCGCTTTTGGTTCATGCTCTTCACTAAAGAAGGGTGGC
CCAATGGTTGCTGAAACTCCTATTGGTTAAGGTGGTACCACTCAATGGTATATTGGTGGT
ATGGATAGAAACTCAACATTGACTTTCATGCTAGATTTATCTGCTCACAACAAAGAATAA
AACTAAGCAAAGAGAGCTTTCTTCTAATTCTAAACAACTTACAAATCACCTTCTGGAGAG
ACAAAATTAAGAGTCACAACTTTCTTTAGAAAGTTTGCTGATCCTATAAGTAACTTTGAG
TTAGTTCAAGGTTTTGATTAAGAAGCTGCTTGTGTCTTAATGGCTCGTTTAGGTATTTAA
AAATCTGAATCTGAAGAGCCTATAGAAATTTTAAAATGGCTTGATAGAACCTTAATTAGG
TTTGTAACTCGTTTTGCTGAATATAAGCCAAATATAACTGATTCATTTAAATTACATGAT
AATTTAGCATTGTATCCTTAATTTATGTATCATTTAAGAAGAAGTCACTTCACTTAAATT
TTTGGTTTAAATCCTGATACAATCTCTTATTATCGTTGCACTTTTAATAGAGAAAATGTC
TCTAACTGTTAAGTTATGATTCAACCTGCTATATTCTCTTATTCAATTTAAAATCCAAGT
CCATCTCCTGTTAGTCTCGATGACACAGCTATGAGAAAAGACGTCATTTTATTGCTTGAT
AATTATTTCTAAGTTATTACTTGGTTAGGTCCTCAAATTAAATAATGGAAAGATAAGGAA
TATCATTTGGATCCCACTTATATTTCATTTAAGAACTTGTTAGATTCTCCAATGGAAGAT
GTTAAAGCTATTCTTGAAGATAGATTCCCTACTCCCATTTTTTATGAAACTTACGAAAAT
CATACAAAAGAAAGATATTTAAAATCAAGAATCAATCCTACAGGAAAAAATCAAGACCTT
ATAGATAGTGGTCATACATAAACTGATGATGCCTCATTAAACTAATTTATGGATCATTTA
ATAAAATTAGCTGTTTCCTAACCAAATAGTTGA>TTHERM_00474750(protein)
MIDIYEIEQKDGVRCVWNNIPPTKLAATRAVVPIGIHYTPYKELDPSNRMEYEALRCRCQ
AILNPYCQVDFNQKFWICPFCTSRNPFPQIYHQITPQNLPAELMEDYSTIEYVYSKEKPV
PNIFLLVVDVSLEQIELEALRDSIQQSLNIIPPDSYVGLITFGKFVFVHELGFQECPKSY
AFKGSKDYTTTQVQEMLGLIAPGTQPKPGKNMDVIKRFLLPLNECEFTLNSILDDLQPDP
WNVPQGEREQRASGVAINAAISLIEACPIPGSRVMFFTGGPCTIGPGQVFGIKQEETPRS
YLDIGQDNSIAQYVKKATKYYQTLALRAIKSQITVDIYGFCPDQFGLYEMKYMAEKTGGY
IVFNEEFNSDPFRETFRKIFDKDQNDELRFASAARIDMFVCKEVKIQGAFGSCSSLKKGG
PMVAETPIGQGGTTQWYIGGMDRNSTLTFMLDLSAHNKEQNQAKRAFFQFQTTYKSPSGE
TKLRVTTFFRKFADPISNFELVQGFDQEAACVLMARLGIQKSESEEPIEILKWLDRTLIR
FVTRFAEYKPNITDSFKLHDNLALYPQFMYHLRRSHFTQIFGLNPDTISYYRCTFNRENV
SNCQVMIQPAIFSYSIQNPSPSPVSLDDTAMRKDVILLLDNYFQVITWLGPQIKQWKDKE
YHLDPTYISFKNLLDSPMEDVKAILEDRFPTPIFYETYENHTKERYLKSRINPTGKNQDL
IDSGHTQTDDASLNQFMDHLIKLAVSQPNS>TTHERM_00474750(gene)
ATGATAGATATTTACGAAATAGAGTAAAAAGACGGTGTTAGATGTGTATGGAATAATATA
CCTCCTACTAAACTTGCAGCAACAAGGGCTGTTGTTCCAATTGGTATCCATTACACACCT
TATAAGGAATTAGATCCTAGCAATAGAATGGAATATGAAGCTTTACGTTGCAGATGCCAA
GCAATTTTGAATCCCTACTGCTAAGTTGATTTTAATCAAAAGTTCTGGATTTGCCCTTTT
TGTACTTCCAGAAATCCATTCCCTTAAATTTATCATCAAATTACTCCTTAAAATCTTCCT
GCAGAATTAATGGAAGACTATTCGACTATCGAATATGTATAAATATTTTTATTTAAAAAT
TGAATAATAACAGCTTCAAATTGTGAAATTAAACTTCAAGCAAAATAAATTTAAAACTAG
AATAAAATATTTTTCTTAATTTTTGATAAAATATTTAATAAAAAATATGTTTAAATTCTA
TTTTAAAAGAAATTTCTATCTTTTCTTAACAGTTTTTTAAGTTATCATTTAAAAATAAAA
ATAAAGGTTTATTCAAAGGAAAAGCCCGTTCCAAATATCTTCTTATTAGTTGTTGATGTT
AGTTTAGAATAGATTGAATTAGAAGCATTAAGAGATTCTATTTAGCAATCATTGAATATT
ATTCCTCCTGATTCATATGTCGGTTTAATTACATTCGGAAAGTTTGTTTTTGTTCATGAA
TTAGGCTTTTAGGAGTGTCCTAAATCATATGCATTTAAAGGAAGCAAAGACTATACTACT
ACATAAGTTTAAGAAATGCTTGGTCTTATTGCTCCTGGTACTTAGCCAAAGCCTGGAAAA
AATATGGACGTTATTAAACGTTTCTTACTTCCATTGAACGAATGTGAATTTACTTTAAAT
AGTATTCTTGATGATCTTCAACCTGATCCTTGGAACGTTCCTTAAGGAGAAAGAGAATAG
CGTGCTTCAGGCGTTGCTATCAATGCTGCTGTAATTATTTTATATTTTTCAATTATCAAA
TACACTTAAATACTAGCTTTTATTTCAATTAAATGTAAAAATAAGAAAAAAAATGTTTTT
AATAAATTCAAAGAAATATATTAATCTTATTTTAATATTTAATAGATCAGCTTAATTGAA
GCTTGCCCTATCCCTGGCTCTAGAGTTATGTTCTTCACTGGTGGTCCTTGCACTATTGGT
CCAGGTTAAGTTTTTGGAATCAAGTAAGAGGAAACTCCTCGTTCTTACTTGGATATCGGC
CAAGATAATAGTATTGCTTAATACGTTAAAAAAGCAACTAAATACTATCAAACTCTTGCT
CTTAGAGCTATAAAAAGCTAGATAACAGTAGATATTTATGGTTTTTGCCCTGATCAATTT
GGTTTGTACGAAATGAAATATATGGCAGAAAAGACTGGAGGTTACATTGTTTTTAATGAA
GAATTCAATTCAGATCCTTTCAGAGAAACATTTAGAAAAATATTTGATAAGGATTAAAAT
GATGAATTAAGATTTGCATCAGCAGCTAGAATAGATATGTTTGTTTGCAAGGAAGTTAAG
ATCTAAGGCGCTTTTGGTTCATGCTCTTCACTAAAGAAGGGTGGCCCAATGGTTGCTGAA
ACTCCTATTGGTTAAGGTGGTACCACTCAATGGTAATTTTTTTTATGCAATTTAAAATAA
GAAATTAATATTATTTTTTTTAGGTATATTGGTGGTATGGATAGAAACTCAACATTGACT
TTCATGCTAGATTTATCTGCTCACAACAAAGAATAAAACTAAGCAAAGAGAGCTTTCTTC
TAATTCTAAACAACTTACAAATCACCTTCTGGAGAGACAAAATTAAGAGTCACAACTTTC
TTTAGAAAGTTTGCTGATCCTATAAGTAACTTTGAGTTAGTTCAAGGTTTTGATTAAGAA
GCTGCTTGTGTCTTAATGGCTCGTTTAGGTATTTAAAAATCTGAATCTGAAGAGCCTATA
GAAATTTTAAAATGGCTTGATAGAACCTTAATTAGGTTTGTAACTCGTTTTGCTGAATAT
AAGCCAAATATAACTGATTCATTTAAATTACATGATAATTTAGCATTGTATCCTTAATTT
ATGTATCATTTAAGAAGAAGTCACTTCACTTAAATTTTTGGTTTAAATCCTGATACAATC
TCTTATTATCGTTGCACTTTTAATAGAGAAAATGTCTCTAACTGTTAAGTTATGATTCAA
CCTGCTATATTCTCTTATTCAATTTAAAATCCAAGTCCATCTCCTGTTAGTCTCGATGAC
ACAGCTATGAGAAAAGACGTCATTTTATTGCTTGATAATTATTTCTAAGTTATTACTTGG
TTAGGTCCTCAAATTAAATAATGGAAAGATAAGGAATATCATGTAAATAATTTAATAAAA
AATTCAAAAAATATTTATAAATTTTATTTTTAAATTAGTTGGATCCCACTTATATTTCAT
TTAAGAACTTGTTAGATTCTCCAATGGAAGATGTTAAAGCTATTCTTGAAGATAGATTCC
CTACTCCCATTTTTTATGAAACTTACGAAAATCATACAAAAGAAAGATATTTAAAATCAA
GAATCAATCCTACAGGAAAAAATCAAGACCTTATAGATAGTGGTCATACATAAACTGATG
ATGCCTCATTAAACTAATTTATGGATCATTTAATAAAATTAGCTGTTTCCTAACCAAATA
GTTGA