Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00584730

Standard Name

RRP412 (exosome complex exonuclease RRP41-2)

Aliases

PreTt04081 | 80.m00127 | 3675.m00025

Description

exosome complex exonuclease

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF03725 ) 3' exoribonuclease family, domain 2

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%

TetraMine Data

TTHERM_00584730

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_15234.1	9.997962730346853e-122	hypothetical protein (1709 aa)
WormBase	WBGene00007201	0.0000000000008001317446409227	locus:exos-4.1 Putative exos ome complex component RRP41 status:Confirmed UniProt:Q17 533 protein_id:CAA97771.3
DictyBase	DDB_G0271396	0.00000000039982266684865623	DDB_G0271396 on chromosome: 2 position 213822 to 214686
Oxytricha	Contig15304.0.g55	0.00000000039982266684865623	3 exoribonuclease family, doma in 1
SGD	YGR195W	0.000000030002053728821195	SKI6 Exosome non-catalytic cor e component; involved in 3-5 R NA processing and degradation in both the nucleus and the cy toplasm; has similarity to E. coli RNase PH and to human hRr p41p (EXOSC4)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00584730(coding)
ATGAATATTAAAGAATAAATTACTGAAAAATAATCCCTTCTTTCTGTAAGACCTTAAAAT
TATATCTAGTTGCAACAGGGAAATTCTAGTGCAAGATGTTGCTTGCAAACATAAGATTCA
AGAATAATTTGCTCAATAATTGGACCTTATCATGGCATTAAAGTTCTTTAATAAGATTGC
GAAATTAAGTGCATTATAAATTTTCTCAATAAAAATGACTCAAACATGCATGAAGAGACA
GAGTAGGATATAATATTAAAGAGAGATCTAGTTAATATGCTTAGTGAAATTGTGAATATC
AAATAATACCCAAAAAGTATTTTGCAGCTTACTTTTGATATAATATAAGTTAATGGACCA
GTGTTCCCATATTTGGTTAACGTAGCTTGCTTTGCTCTGTCCTTAGCTGGAATCTAAATT
TTAGATATATTTTCAAGCGCCTATATGGGTTTTATAGGAAATAATTTAATTATCGATCCT
AGCGACAAAGAGTTCGCTCTTATGAATAAAAAATTATGTATAGTGTAAATGAAAAATTCC
CAAAAGATAATTTACTTGGATATGAATGGTTCTTTAGATTTTGAAGAGATTTAGAAGCTT
CTTTCACTAGGCATTAGTGGATGTAATAAAATATCTACTTTGATGAGTACGTTGTTGATA
GAGTAGAACGCAGTGTTAAGCAATTGA

>TTHERM_00584730(protein)
MNIKEQITEKQSLLSVRPQNYIQLQQGNSSARCCLQTQDSRIICSIIGPYHGIKVLQQDC
EIKCIINFLNKNDSNMHEETEQDIILKRDLVNMLSEIVNIKQYPKSILQLTFDIIQVNGP
VFPYLVNVACFALSLAGIQILDIFSSAYMGFIGNNLIIDPSDKEFALMNKKLCIVQMKNS
QKIIYLDMNGSLDFEEIQKLLSLGISGCNKISTLMSTLLIEQNAVLSN

>TTHERM_00584730(gene)
ATGAATATTAAAGAATAAATTACTGAAAAATAATCCCTTCTTTCTGTAAGACCTTAAAGT
AAAATATTATGCTAAATGAAATAGATTTTACTCTAAGCTAAATATAAAAATCAACAAAAT
ATATTTCAAAATAATTGATGTTATAACTAATTCAAACTTAAAAATAGATTATATCTAGTT
GCAACAGGGAAATTCTAGTGCAAGATGTTGCTTGCAAACATAAGATTCAAGAATAATTTG
CTCAATGTAATTTATATATTTAATGAACCAATAATTTAATTAAACTTTAAATATCATCAA
GAATTGGACCTTATCATGGCATTAAAGTTCTTTAATAAGATTGCGAAATTAAGTGCATTA
TAAATTTTCTCAATAAAAATGACTCAAACATGCATGAAGAGACAGTAATTTAATTTTTAG
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AATGATCAAAAATATTATTTTGTTAAATAATATTATCCATCTTCTTTATTTAATTGCTTA
TGTGAATGAGCTAACTAAAATAATAGCATTTTAAAGAATGAATTAGATTATCTTGAAAAA
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GAAAAAAATTTAATTATTTTTGTATGCTATATTCTGTCTAAAAATACTTTGTTACAAGAT
ATTAGTCTAAAAATCAACAAATATTACTAGCTAAAATTGAAATAATCACATTTTCCTTCT
AGAAAAAAGTTAATATAAGCATAGTTTTGTTGAAAGAAGTATTTTAATTACAGTTTATTA
CACTTGCTTTTAGCAACTTGGATTTAGCTTAACTATCATTTGATCAATAACAAAAAAAAA
GAGATATTTAAAAAATTTTAGCTTCATTTACAAGTGGCCAAATTAAATTTCAAATTTTAG
AAACAATTTAATAGCATTCAATCATTTTAAAATATTTAAGAATAGTTAGCCAATTTAAAC
TGCAAATTATTGGCAATACTTATGAGGAATGTAAACTTAACTAAAAGATTAAAAGCAGTC
TATTAAATTTAATTCAATAGATATACTTTATGTTATTCAATTCCTATTTGAAAGCTCGGC
ATTTAAATACAGTCTTTATCATTTTTTTGGTTTTTCAACATTACTATTTTGCAAGTATAA
TTTTTAGTTTTTGTAATGTAGATTTAAATTCCGCGAAAAATTATATGTGTGATGCAAATT
TTTTAGAACAACTTTATTAATTTAATTTTTTTTTTACTGGTAATAGGAGTAGGATATAAT
ATTAAAGAGAGATCTAGTTAATATGCTTAGTGAAATTGTGAATATCAAATAATACCCAAA
AAGTATTTTGCAGCTTACTTTTGATATAATATAAGTTAATGGACCAGTGTTCCCATATTT
GGTTAACGTAGCTTGCTTTGCTCTGTCCTTAGCTGGAATCTAAATTTTAGATATATTTTC
AAGCGCCTATATGGTAAACCTAAATTTTAATAACCTAATTTTTAATTGTACTTTACATAG
ATCATTTTATTAAATCTTTTACTTTAATTAATAGGGTTTTATAGGAAATAATTTAATTAT
CGATCCTAGCGACAAAGAGTTCGCTCTTATGAATAAAAAATTATGTATAGTGTAAATGAA
AAATTCCCAAAAGATAATTTACTTGGATATGAATGGTTCTTTAGATTTTGAAGAGATTTA
GAAGGTAAATATTATATCTTTAAATAATTTTTAAGAAATTTCTAGGAGTTAATGATGATT
TAGTTCTCAAATACTTTTTGATTGCAATTTCAATCACAAAAAATTTCAAATACTATTTTA
ATTCCAGTAGGCTCTTTTATTGCGCATTTAATAGTATCATTTTAAATATTACGAATCATA
ATAAAAAATTATTTAAGATGCATTAATAAATCATCCGAAAAGATACTTTTTTTTTCTTTG
GCATATCTTTTAACGAATTTTTTCAGATCTAAACATAAAAGAAATAATTAATGGGTGAAA
AAAATCTATTAAAAGCTTGAATATGAAATTAACATTAAAATGTCATTAATCCTACACATG
AATCAAATTAAAATTTTTGTATTAATTAAAATTAGCTTCTTTCACTAGGCATTAGTGGAT
GTAATAAAATATCTACTTTGATGAGTACGTTGTTGATAGAGTAGAACGCAGTGTTAAGCA
ATTGA