Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00584730Standard Name
RRP412 (exosome complex exonuclease RRP41-2)Aliases
PreTt04081 | 80.m00127 | 3675.m00025Description
RRP412 3-prime exoribonuclease family 1 proteinGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
- ( PF03725 ) 3' exoribonuclease family, domain 2
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%
TetraMine Data
TTHERM_00584730
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_15234.1 9.997962730346853e-122 hypothetical protein (1709 aa)
WormBase WBGene00007201 0.0000000000008001317446409227 locus:exos-4.1 Putative exos
ome complex component RRP41
status:Confirmed UniProt:Q17
533 protein_id:CAA97771.3
DictyBase DDB_G0271396 0.00000000039982266684865623 DDB_G0271396 on chromosome: 2
position 213822 to 214686
Oxytricha Contig15304.0.g55 0.00000000039982266684865623 3 exoribonuclease family, doma
in 1
SGD YGR195W 0.000000030002053728821195 SKI6 Exosome non-catalytic cor
e component; involved in 3-5 R
NA processing and degradation
in both the nucleus and the cy
toplasm; has similarity to E.
coli RNase PH and to human hRr
p41p (EXOSC4)
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00584730(coding)
ATGAATATTAAAGAATAAATTACTGAAAAATAATCCCTTCTTTCTGTAAGACCTTAAAAT
TATATCTAGTTGCAACAGGGAAATTCTAGTGCAAGATGTTGCTTGCAAACATAAGATTCA
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CTTTCACTAGGCATTAGTGGATGTAATAAAATATCTACTTTGATGAGTACGTTGTTGATA
GAGTAGAACGCAGTGTTAAGCAATTGA>TTHERM_00584730(protein)
MNIKEQITEKQSLLSVRPQNYIQLQQGNSSARCCLQTQDSRIICSIIGPYHGIKVLQQDC
EIKCIINFLNKNDSNMHEETEQDIILKRDLVNMLSEIVNIKQYPKSILQLTFDIIQVNGP
VFPYLVNVACFALSLAGIQILDIFSSAYMGFIGNNLIIDPSDKEFALMNKKLCIVQMKNS
QKIIYLDMNGSLDFEEIQKLLSLGISGCNKISTLMSTLLIEQNAVLSN>TTHERM_00584730(gene)
ATGAATATTAAAGAATAAATTACTGAAAAATAATCCCTTCTTTCTGTAAGACCTTAAAGT
AAAATATTATGCTAAATGAAATAGATTTTACTCTAAGCTAAATATAAAAATCAACAAAAT
ATATTTCAAAATAATTGATGTTATAACTAATTCAAACTTAAAAATAGATTATATCTAGTT
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GGTTAACGTAGCTTGCTTTGCTCTGTCCTTAGCTGGAATCTAAATTTTAGATATATTTTC
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ATCATTTTATTAAATCTTTTACTTTAATTAATAGGGTTTTATAGGAAATAATTTAATTAT
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ATAAAAAATTATTTAAGATGCATTAATAAATCATCCGAAAAGATACTTTTTTTTTCTTTG
GCATATCTTTTAACGAATTTTTTCAGATCTAAACATAAAAGAAATAATTAATGGGTGAAA
AAAATCTATTAAAAGCTTGAATATGAAATTAACATTAAAATGTCATTAATCCTACACATG
AATCAAATTAAAATTTTTGTATTAATTAAAATTAGCTTCTTTCACTAGGCATTAGTGGAT
GTAATAAAATATCTACTTTGATGAGTACGTTGTTGATAGAGTAGAACGCAGTGTTAAGCA
ATTGA