Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00760630

Standard Name

RRP12 (ribosomal RNA processing protein 12)

Aliases

PreTt18548 | 125.m00112 | 3672.m00045

Description

RRP12 Pre-rRNA processing protein putative; ribosomal RNA processing protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF02985 ) HEAT repeat
• ( PF08161 ) NUC173 domain

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.7%

TetraMine Data

TTHERM_00760630

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_19006.1	9.997093137033517e-262	hypothetical protein (1168 aa)
Oxytricha	Contig11042.0.g61	1.000403801267624e-40	NUC173 domain
SGD	YPL012W	4.001630327199692e-20	RRP12 Protein required for exp ort of the ribosomal subunits; associates with the RNA compo nents of the pre-ribosomes; ha s a role in nuclear import in association with Pse1p; contai ns HEAT-repeats
DictyBase	DDB_G0280797	0.0000000000002999981760818895	DDB_G0280797 on chromosome: 3 position 3760317 to 3764888
Stentor Coeruleus	SteCoe_14827	0.0000000000006914400106940203

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00760630(coding)
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AAGGTGAAATAATGA

>TTHERM_00760630(protein)
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DVIMNKKEDGALKGLKTSNKKVKQ

>TTHERM_00760630(gene)
ATGGAACAAGAGAACACATTTACCTAATTATACTCCTTCACTTAGTCTAAGGATTCTGAC
CTCTATAAGAACGCCAAGATTGTTTTAGATTCAATCAAGGAAGCTCTTTAGGTAAATTTC
ATTTTTCATTTTTTGCATTTTTACTGCAGTTGTTAATTAGTAGACTTAGGTATTTTAGAT
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