Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00438910

Standard Name

RRN3 (RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3)

Aliases

PreTt05448 | 49.m00220 | 3708.m00069

Description

RNA polymerase I specific transcription initiation factor

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF05327 ) RNA polymerase I specific transcription

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

TetraMine Data

TTHERM_00438910

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_12433.19.997093137033517e-262hypothetical protein (743 aa)
SGDYKL125W7.001446474249442e-19RRN3 Protein required for tran
scription of rDNA by RNA polym
erase I; transcription factor
independent of DNA template; i
nvolved in recruitment of RNA
polymerase I to rDNA
DictyBaseDDB_G02895870.0000000000000299873730555305DDB_G0289587 on chromosome: 5
position 2981034 to 2983254
WormBaseWBGene000079800.00000000000020009182674645818Uncharacterized protein C36E8.
1 status:Confirmed UniProt
:P48322 protein_id:CAA84645.
1
OxytrichaContig22798.0.g850.00000000019994075865167896RNA polymerase I specific tran
scription initiation factor RR
N3

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00438910(coding)
ATGAGCAAATCAAATACTCATCCAGCACCTCAAATGAGGAAACCAGTAAATATTTAATAA
AATGTGGGGTCCCAAGTTAAGAAGGCCCCTTAGGGTGAACAAATCAGTTAAAAAAATGAT
TCAGCTAATCATGCTTAAATGCAAGAAGATGAAGAAAAAATTTATAGAGTTCTTAGTAGC
TGTTACGACGATTATCTAAAGGGTAATAAGGTTTTAATGAATAAGATCGTGAATGAAATG
TCGAATAGGCACAAGGAAAAGGAACATATAAAAATGTGGTTAAGGGCATCCACTAAAAAG
CTGATTGATCTATTTAAGAATAAGCAAGATGTCAACTTTTTGATAGAGGTAATATTGTAC
TAAATGCCTTGGTTTGAAGCAGGTAACGAATATGAGATTTAGTTGCAAGAGCAAGAGTAG
AAAAAGATACTGTAGCAATAGCAAACTCATGCAAACTAGCAATAGCAGCATGGAATCGGA
AGTAGTACCTCGCTTTTCAGCAATGCATCAAGTTCAAAGAGAAACATTTAGTAGTAGCAT
GGACAATAATTAACAATAAAAAAACCATCTCCTCACTTCGATTTGTTTTCAGAGCTTTCT
AAATTTATAATGACTCTGCTGTCTTTCAGTAATGCCTTTGCACCATAGATTATTAAGTTC
CTCATTTCCAATATTGTGCCTATGGAAGTGAAGGAAATGGAAAAAAATAAGAAATCCGAA
ATAGAATTAGAAGTTGAAGGAAAGGTTTTTGAAAACCAAAAAAAGCTATTAATGTATATC
AGAGACATAATGAATAAGTATATTCTTAACAGTATAAATGACGTCAAAGAATTAAACAAA
GAAGATACTAATTTTTTATTAGGAGTCCTCAAATACCATCCTAATTCAAAAGAAAAAATG
TAAAGATACGTCAAGCTAATTATTGGTTAAGCATAATTCGATGACAAAATCTCGAAATGC
TTATACATTCAAAACAAAGAAGGTTAGAAGATAGATATTTCTTATGTAAAAAGTGTGTTT
AATTTAGTTGATGAATAATTCTAAAAAATTGGATTAAAGCAAGGCTCCCCAAATTAAAAA
AAGATGATGTTACAAGTTGTTGATTTGCTAGCAAAAATAATTAAAATATATCCTCTTTAC
TAAAATGACCTATGTCGCATTTTACAAGAATCTTATCCTCATAGAGTGCAAGGAGAATAA
TTCCATAAAATATATCTTACTAACATTTTATAACTCGCTATTAAATGCCCATAGCTTATG
CCTAAAATACTGATAATTGCTGTTTAAAAATTGATTGAAATAGACTCAGAAATCAAGCTT
GATCATGACGCCTAAGAAAATGAGAAGAATAGTTAAATTATGGCTGAAAAACTTGATTGG
CTGATGCTAATAATTTTTGAATTCATAGATTATTAATTAAAAGATAAAGTTAGTAGCGAT
TCTTGTTTTGGACAAAAAGAAGAATTAAAATAAAATAGCTAAGATAAAAAAGATAAATCT
TAAATGGAAGACAAATTTTTTAAAATATTTTTAAATGTATTTAGTGAATAAATATTAATC
ACCCATTAAAGCAAATATGTTTAGTTTATAATATTTTATCTTTGCTCACTTCGTAACTCA
TTTTAAAACGCTTTTTTAAATCACCTTGTAAAAAATATAACTGAGAAAAATCCTTTGATT
TACAAATCAACCTAAATCAATTCTATTTATTATCTTGGCAGCTACATTGCTCGTGCAAAA
TACATCGAAAATGAAACTATTAGAAAAATATTTGAATACCTTATTACTCATTTAAATAGA
TATATTCAAAAATTTGATGAGAGACAAAAAGAAGAAAACTATAATGAAGGTCTCCATAAA
ATTCACTTAAATTTATACCATCTTTTACAAGCAATGCTTTATATCTTATGCTATCGTTTC
AAAGCAGTCTTAGAAAGCAAAGAAAATCTTTTGTAGAAATTCTACGAGATTATGGACAAG
GCCTGTTCTAATTTTAATGCATTATTTTTTATTTCTCCTCATATTTAAAATGTTTTTAGT
GATGTTTGCGTTAGCTACGGCGAAGATTAATTAGTAGAACTTTTTGAAAAAACTAGCTAA
ACAAGTTAAGCAACAGAATCAATATCAGCTGCTCTGCAACAAAGAGCTTAGCTCTTAGAT
AACTACTTTCCATTTGATCCCTATTGCTTACAATATAGTGATAAGTTTATTTGCGAAATA
TATTAAAATTGGTAAGACACAAATTCTTTATCATCTCAATCTTTTGTTGAATAATAATTA
GAAAAGCAACAACCTTAAACCAATAATAATAAAAAATCCAAAAAAATGTCAAAAGGTAAT
AATGCTAATAATGCTAGCTCTAACTTAAATATCAACAATCCTCCAATAATTTAAAATAGT
CCTCACTTTAATAATAGCCTAAATAATAGTTTTATATGCAGCCAATCTCATAATAATCCT
AACAATATAACAGGAACTTTATTAAATACAAGTAGAAGCAACTATGGTTTCACTATTGAT
AAGCTGAACAATATTAATGACTTAGAATACGACAGGGATAACATGATTTATGATGACGAA
GATGTAAAAGCTAATAATAATAATCATATTTTAGATTTCATAAATGAAAGTGATCCTGAA
TTCTAAATATAATAAGCCAAATATCATAAAGACAAAAAATCTTTAAATGGAAAACGTAAA
AACCCAAGTACGACTGATAATTCTGTGAATAACACTCCAATTACAAATAATGATGAAGAC
AGCAACAATTAACCTATTGTTGACTCAAAAAAAATTAGTAAAAAATCTAAAAAATCTTCT
GATATTGAAGATGATTTTAACAATGCCTCTTTTGGTAATAAAAAGTTGTGCATATAAGAA
ATGTAATTCTGA


>TTHERM_00438910(protein)
MSKSNTHPAPQMRKPVNIQQNVGSQVKKAPQGEQISQKNDSANHAQMQEDEEKIYRVLSS
CYDDYLKGNKVLMNKIVNEMSNRHKEKEHIKMWLRASTKKLIDLFKNKQDVNFLIEVILY
QMPWFEAGNEYEIQLQEQEQKKILQQQQTHANQQQQHGIGSSTSLFSNASSSKRNIQQQH
GQQLTIKKPSPHFDLFSELSKFIMTLLSFSNAFAPQIIKFLISNIVPMEVKEMEKNKKSE
IELEVEGKVFENQKKLLMYIRDIMNKYILNSINDVKELNKEDTNFLLGVLKYHPNSKEKM
QRYVKLIIGQAQFDDKISKCLYIQNKEGQKIDISYVKSVFNLVDEQFQKIGLKQGSPNQK
KMMLQVVDLLAKIIKIYPLYQNDLCRILQESYPHRVQGEQFHKIYLTNILQLAIKCPQLM
PKILIIAVQKLIEIDSEIKLDHDAQENEKNSQIMAEKLDWLMLIIFEFIDYQLKDKVSSD
SCFGQKEELKQNSQDKKDKSQMEDKFFKIFLNVFSEQILITHQSKYVQFIIFYLCSLRNS
FQNAFLNHLVKNITEKNPLIYKSTQINSIYYLGSYIARAKYIENETIRKIFEYLITHLNR
YIQKFDERQKEENYNEGLHKIHLNLYHLLQAMLYILCYRFKAVLESKENLLQKFYEIMDK
ACSNFNALFFISPHIQNVFSDVCVSYGEDQLVELFEKTSQTSQATESISAALQQRAQLLD
NYFPFDPYCLQYSDKFICEIYQNWQDTNSLSSQSFVEQQLEKQQPQTNNNKKSKKMSKGN
NANNASSNLNINNPPIIQNSPHFNNSLNNSFICSQSHNNPNNITGTLLNTSRSNYGFTID
KLNNINDLEYDRDNMIYDDEDVKANNNNHILDFINESDPEFQIQQAKYHKDKKSLNGKRK
NPSTTDNSVNNTPITNNDEDSNNQPIVDSKKISKKSKKSSDIEDDFNNASFGNKKLCIQE
MQF


>TTHERM_00438910(gene)
GGAGAAAAATAAATTTAAAGCAAATTTATCTAAAGGGGTTTCGTCGTCTTATATATTCAT
ATAGTAATAAGAAAAAAAAGAAATTGGCTTTGATAATTTTATATTAGCACGCACTACTTT
TTAAATTTAAAAATGAGCAAATCAAATACTCATCCAGCACCTCAAATGAGGAAACCAGTA
AATATTTAATAAAATGTGGGGTCCCAAGTTAAGAAGGCCCCTTAGGGTGAACAAATCAGT
TAAAAAAATGATTCAGCTAATCATGCTTAAATGCAAGAAGATGAAGAAAAAATTTATAGA
GTTCTTAGTAGCTGTTACGACGATTATCTAAAGGTAATTATTTTCGTTTTAAATCACTTT
ACTTAAATCAAGAAATCATTTTAAAGCTGATTTATCTCTCTGATCCAAGATTGTTGTTAA
GAAATTGTGAAAAATAATGATGAATTTATTATTAGATGATATAAATTTATGTACTCACTT
ATATAATATGACTCACTTTTATTATTTTATTACACTTAGGGTAATAAGGTTTTAATGAAT
AAGATCGTGAATGAAATGTCGAATAGGCACAAGGAAAAGGAACATATAAAAATGTGGTTA
AGGGCATCCACTAAAAAGCTGATTGATCTATTTAAGAATAAGCAAGATGTCAACTTTTTG
ATAGAGGTAATATTGTACTAAATGCCTTGGTTTGAAGCAGGTAACGAATATGAGATTTAG
TTGCAAGAGCAAGAGTAGAAAAAGATACTGTAGCAATAGCAAACTCATGCAAACTAGCAA
TAGCAGCATGGAATCGGAAGTAGTACCTCGCTTTTCAGCAATGCATCAAGTTCAAAGAGA
AACATTTAGTAGTAGCATGGACAATAATTAACAATAAAAAAACCATCTCCTCACTTCGAT
TTGTTTTCAGAGCTTTCTAAATTTATAATGACTCTGCTGTCTTTCAGTAATGCCTTTGCA
CCATAGATTATTAAGTTCCTCATTTCCAATATTGTGCCTATGTATTTTATTCTTTTTCTT
TATTATACTTCCTTCATACATCTTTCAATTTTTTTGCTTTTCTTCTACCTTTTTTCGTTT
GTTTCTATTTTCCATATTTAATGCAAACGCTAACCTAACCTAACCATCCAAGCAATCAAG
TTTTCATTAATTCATTCATTCATTCATGCATACTTCTTTAGCATATTTTCTTTTCATCTT
CACATCCAATCTAGCTAAATGGTTCTCATCATCATTCATTCAGTCAATTATTCATTCATT
TATTCATTCATTAGTTTAGTCTTGAGTTTCAATAATACCTTTGGAGTATTTATTAAAATT
AGATTTTTCTAATATACAAACATAGAAGATATGTGTTTCAAACACCTAACTTAATCAATG
TGTGTCAAACCATCGATTTGACATGAAGATTGAGTGTGTTTTGCAAAAGATGGCGGAATC
AAAATTTTGAACGAACGTATGGTTTTTAAGCTCACAAAGTTTGAAAGTGGAACGGAATGA
GTTTAGCAAACATCATACTGTAATAAAAAGACATATTCTTCAAAGTATCAGGAGACGTTT
CAGGGTTCTTTCGGTCGGTCTCTAGATAAAAGTAATGTAGTGATAGAATTTGTAGAAATT
TCATAATATTATAATACTAAAATCAACAGAATAATCTTAGTATGAACCAAATAAATAAGA
CTATCTATCTTGATTAAGAGGAAGTTAAATTAATGATCGTTTGTATTCCCATAATCTCAA
AGTATTTATAAGTAAGTATGATGAGAATCAAGAATGACAAGAGCGATCAATCGATTTCAT
TGTTCTAGCTAGCTAGATTTATTTATTTATTACAAAGCTGACATTTTCTTTTTATAAAAT
TTTAATAAGAAAAGCAAAAATATAATTTTGTTATCTTGAACCTTGCAAAGTTTTTTTTCT
AGCAAGACTTACTTAAGGCTTAATTAGCCATTTTCCGAAAATAAGCGAAATGGAATAATT
ATGCTTTAAGTAGCAAGATACATTTTTAGATGAATAATAGGGATTAAATGTTAAGAAAAT
TATATAAAAAATAGGGAAGTGAAGGAAATGGAAAAAAATAAGAAATCCGAAATAGAATTA
GAAGTTGAAGGAAAGGTTTTTGAAAACCAAAAAAAGCTATTAATGTATATCAGAGACATA
ATGAATAAGTATATTCTTAACAGTATAAATGACGTCAAAGAATTAAACAAAGAAGATACT
AATTTTTTATTAGGAGTCCTCAAATACCATCCTAATTCAAAAGAAAAAATGTAAAGATAC
GTCAAGCTAATTATTGGTTAAGCATAATTCGATGACAAAATCTCGAAATGCTTATACATT
CAAAACAAAGAAGGTTAGAAGATAGATATTTCTTATGTAAAAAGTGTGTTTAATTTAGTT
GATGAATAATTCTAAAAAATTGGATTAAAGCAAGGCTCCCCAAATTAAAAAAAGATGATG
TTACAAGTTGTTGATTTGCTAGCAAAAATAATTAAAATATATCCTCTTTACTAAAATGAC
CTATGTCGCATTTTACAAGAATCTTATCCTCATAGAGTGCAAGGAGAATAATTCCATAAA
ATATATCTTACTAACATTTTATAACTCGCTATTAAATGCCCATAGCTTATGCCTAAAATA
CTGATAATTGCTGTTTAAAAATTGATTGAAATAGACTCAGAAATCAAGCTTGATCATGAC
GTAAATAACATTTATTTGATTATAATTAATTCTTCCTAAATTTGCTATATATTACTTCCA
TTCATTCATACATACATTCATTTTAACTTTATTGATAACTTATTTTCTACATCAATTTAA
ATTAAATCCTTAAAAAAATATACTGAGTAAATGGTCATTTATTGCTACGCGGAATCTTTT
TTTATAAATAATTTCAGAATTTATTAGTAAAACCGCGAAACTGAAGATAAAAATTATTTA
ATATTAATGCTGTAAAAAACTCATCACATAAAAAATAATACACTTTTTTTAATTTCTTCA
CAAAAATTTCTTTAAAAATCTTAAAGTCAATTTTGTTTTACTTTCTTTATTGTTTGATAT
TTGAAATTAAATTAAATTTTGCAAACAATTATTAGGATAAATTTAAAAAAATTAATTTTG
TAATTAAAAAAAAGCAATCCTTTTAAATGAATGGATGAAACTTAATTAAAAAATTTTAAT
GAAAATATTTATTTATTTCTAAATTTTGAATAAGTATACCATAATTTTTCATAAACTCCC
CCATTTTTGTTGAAAAAAATTTAGAAATCCCCCACCCAAAACCCACATATTTTTTTTTAA
TTAGACTAGTTAATAAGCTCAATTATTAAAAAAAAAATAGATTAAATGTGAATATTATAT
TAAATGTTTTAAAATAAATTTTTAATTTAGTAATTTATTAAAATTAAAAATTATAAATAA
AAGGCCTAAGAAAATGAGAAGAATAGTTAAATTATGGCTGAAAAACTTGATTGGCTGATG
CTAATAATTTTTGAATTCATAGATTATTAATTAAAAGATAAAGTTAGTAGCGATTCTTGT
TTTGGACAAAAAGAAGAATTAAAATAAAATAGCTAAGATAAAAAAGATAAATCTTAAATG
GAAGACAAATTTTTTAAAATATTTTTAAATGTATTTAGTGAATAAATATTAATCACCCAT
TAAAGCAAATATGTTTAGTTTATAATATTTTATCTTTGCTCACTTCGTAACTCATTTTAA
AACGCTTTTTTAAATCACCTTGTAAAAAATATAACTGAGAAAAATCCTTTGATTTACAAA
TCAACCTAAATCAATTCTATTTATTATCTTGGCAGCTACATTGCTCGTGCAAAATACATC
GAAAATGAAACTATTAGAAAAATATTTGAATACCTTATTACTCATTTAAATAGATATATT
CAAAAATTTGATGAGAGACAAAAAGAAGAAAACTATAATGAAGGTCTCCATAAAATTCAC
TTAAATTTATACCATCTTTTACAAGCAATGCTTTATATCTTATGCTATCGTTTCAAAGCA
GTCTTAGAAAGCAAAGAAAATCTTTTGTAGAAATTCTACGAGATTATGGACAAGGCCTGT
TCTAATTTTAATGCATTATTTTTTATTTCTCCTCATATTTAAAATGTTTTTAGTGATGTT
TGCGTTAGCTACGGCGAAGATTAATTAGTAGAACTTTTTGAAAAAACTAGCTAAACAAGT
TAAGCAACAGAATCAATATCAGCTGCTCTGCAACAAAGAGCTTAGCTCTTAGATAACTAC
TTTCCATTTGATCCCTATTGCTTACAATATAGTGATAAGTTTATTTGCGAAATATATTAA
AATTGGTAAGACACAAATTCTTTATCATCTCAATCTTTTGTTGAATAATAATTAGAAAAG
CAACAACCTTAAACCAATAATAATAAAAAATCCAAAAAAATGTCAAAAGGTAATAATGCT
AATAATGCTAGCTCTAACTTAAATATCAACAATCCTCCAATAATTTAAAATAGTCCTCAC
TTTAATAATAGCCTAAATAATAGTTTTATATGCAGCCAATCTCATAATAATCCTAACAAT
ATAACAGGAACTTTATTAAATACAAGTAGAAGCAACTATGGTTTCACTATTGATAAGCTG
AACAATATTAATGACTTAGAATACGACAGGGATAACATGATTTATGATGACGAAGATGTA
AAAGCTAATAATAATAATCATATTTTAGATTTCATAAATGAAAGTGATCCTGAATTCTAA
ATATAATAAGCCAAATATCATAAAGACAAAAAATCTTTAAATGGAAAACGTAAAAACCCA
AGTACGACTGATAATTCTGTGAATAACACTCCAATTACAAATAATGATGAAGACAGCAAC
AATTAACCTATTGTTGACTCAAAAAAAATTAGTAAAAAATCTAAAAAATCTTCTGATATT
GAAGATGATTTTAACAATGCCTCTTTTGGTAATAAAAAGTTGTGCATATAAGAAATGTAA
TTCTGAGGAAACTTAAAATGAAATAATTTAATTGATAAGCTTCGCTACTATTAAATAAAT
CTTAGCTTAGATATTTCAATCTATAATAATAATAATAACTATAAAAAAATAATAAAAAAA
TTTACTAATAAAAAATTTAAATATTTTAATTCATTATTTGCTTTGAATTATTATCACTCG
TAAATCAAGAAATAAAAAATAAATAAATAAATGAGTGAAATGTTTCTAGCGGGATTAATA
ATTTAGCATACATACATACTTTAAGCATTTAAGACAAATAAATAAATAATAAGTAAAAAA
CAAACTAATTGAATGAAAGAATAAACGAAAAAACTATAAATAAACTATACATAAATACAT
ATTCAAAAATATTATTTAAACCCTTAATATATTATTGTTAATTAAAACTTTTCAAATTTT
GTCTGTAAATCTCTTTATTTTATTCTACATA