Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00438910Standard Name
RRN3 (RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3)Aliases
PreTt05448 | 49.m00220 | 3708.m00069Description
RNA polymerase I specific transcription initiation factorGenome Browser (Macronucleus)
![]()
Genome Browser (Micronucleus)
![]()
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
- ( PF05327 ) RNA polymerase I specific transcription
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.4%
TetraMine Data
TTHERM_00438910
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_12433.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (743 aa)
SGD YKL125W 7.001446474249442e-19 RRN3 Protein required for tran
scription of rDNA by RNA polym
erase I; transcription factor
independent of DNA template; i
nvolved in recruitment of RNA
polymerase I to rDNA
DictyBase DDB_G0289587 0.0000000000000299873730555305 DDB_G0289587 on chromosome: 5
position 2981034 to 2983254
WormBase WBGene00007980 0.00000000000020009182674645818 Uncharacterized protein C36E8.
1 status:Confirmed UniProt
:P48322 protein_id:CAA84645.
1
Oxytricha Contig22798.0.g85 0.00000000019994075865167896 RNA polymerase I specific tran
scription initiation factor RR
N3
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00438910(coding)
ATGAGCAAATCAAATACTCATCCAGCACCTCAAATGAGGAAACCAGTAAATATTTAATAA
AATGTGGGGTCCCAAGTTAAGAAGGCCCCTTAGGGTGAACAAATCAGTTAAAAAAATGAT
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TGTTACGACGATTATCTAAAGGGTAATAAGGTTTTAATGAATAAGATCGTGAATGAAATG
TCGAATAGGCACAAGGAAAAGGAACATATAAAAATGTGGTTAAGGGCATCCACTAAAAAG
CTGATTGATCTATTTAAGAATAAGCAAGATGTCAACTTTTTGATAGAGGTAATATTGTAC
TAAATGCCTTGGTTTGAAGCAGGTAACGAATATGAGATTTAGTTGCAAGAGCAAGAGTAG
AAAAAGATACTGTAGCAATAGCAAACTCATGCAAACTAGCAATAGCAGCATGGAATCGGA
AGTAGTACCTCGCTTTTCAGCAATGCATCAAGTTCAAAGAGAAACATTTAGTAGTAGCAT
GGACAATAATTAACAATAAAAAAACCATCTCCTCACTTCGATTTGTTTTCAGAGCTTTCT
AAATTTATAATGACTCTGCTGTCTTTCAGTAATGCCTTTGCACCATAGATTATTAAGTTC
CTCATTTCCAATATTGTGCCTATGGAAGTGAAGGAAATGGAAAAAAATAAGAAATCCGAA
ATAGAATTAGAAGTTGAAGGAAAGGTTTTTGAAAACCAAAAAAAGCTATTAATGTATATC
AGAGACATAATGAATAAGTATATTCTTAACAGTATAAATGACGTCAAAGAATTAAACAAA
GAAGATACTAATTTTTTATTAGGAGTCCTCAAATACCATCCTAATTCAAAAGAAAAAATG
TAAAGATACGTCAAGCTAATTATTGGTTAAGCATAATTCGATGACAAAATCTCGAAATGC
TTATACATTCAAAACAAAGAAGGTTAGAAGATAGATATTTCTTATGTAAAAAGTGTGTTT
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TAAAATGACCTATGTCGCATTTTACAAGAATCTTATCCTCATAGAGTGCAAGGAGAATAA
TTCCATAAAATATATCTTACTAACATTTTATAACTCGCTATTAAATGCCCATAGCTTATG
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GATCATGACGCCTAAGAAAATGAGAAGAATAGTTAAATTATGGCTGAAAAACTTGATTGG
CTGATGCTAATAATTTTTGAATTCATAGATTATTAATTAAAAGATAAAGTTAGTAGCGAT
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TAAATGGAAGACAAATTTTTTAAAATATTTTTAAATGTATTTAGTGAATAAATATTAATC
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TACATCGAAAATGAAACTATTAGAAAAATATTTGAATACCTTATTACTCATTTAAATAGA
TATATTCAAAAATTTGATGAGAGACAAAAAGAAGAAAACTATAATGAAGGTCTCCATAAA
ATTCACTTAAATTTATACCATCTTTTACAAGCAATGCTTTATATCTTATGCTATCGTTTC
AAAGCAGTCTTAGAAAGCAAAGAAAATCTTTTGTAGAAATTCTACGAGATTATGGACAAG
GCCTGTTCTAATTTTAATGCATTATTTTTTATTTCTCCTCATATTTAAAATGTTTTTAGT
GATGTTTGCGTTAGCTACGGCGAAGATTAATTAGTAGAACTTTTTGAAAAAACTAGCTAA
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AACTACTTTCCATTTGATCCCTATTGCTTACAATATAGTGATAAGTTTATTTGCGAAATA
TATTAAAATTGGTAAGACACAAATTCTTTATCATCTCAATCTTTTGTTGAATAATAATTA
GAAAAGCAACAACCTTAAACCAATAATAATAAAAAATCCAAAAAAATGTCAAAAGGTAAT
AATGCTAATAATGCTAGCTCTAACTTAAATATCAACAATCCTCCAATAATTTAAAATAGT
CCTCACTTTAATAATAGCCTAAATAATAGTTTTATATGCAGCCAATCTCATAATAATCCT
AACAATATAACAGGAACTTTATTAAATACAAGTAGAAGCAACTATGGTTTCACTATTGAT
AAGCTGAACAATATTAATGACTTAGAATACGACAGGGATAACATGATTTATGATGACGAA
GATGTAAAAGCTAATAATAATAATCATATTTTAGATTTCATAAATGAAAGTGATCCTGAA
TTCTAAATATAATAAGCCAAATATCATAAAGACAAAAAATCTTTAAATGGAAAACGTAAA
AACCCAAGTACGACTGATAATTCTGTGAATAACACTCCAATTACAAATAATGATGAAGAC
AGCAACAATTAACCTATTGTTGACTCAAAAAAAATTAGTAAAAAATCTAAAAAATCTTCT
GATATTGAAGATGATTTTAACAATGCCTCTTTTGGTAATAAAAAGTTGTGCATATAAGAA
ATGTAATTCTGA>TTHERM_00438910(protein)
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QMPWFEAGNEYEIQLQEQEQKKILQQQQTHANQQQQHGIGSSTSLFSNASSSKRNIQQQH
GQQLTIKKPSPHFDLFSELSKFIMTLLSFSNAFAPQIIKFLISNIVPMEVKEMEKNKKSE
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QRYVKLIIGQAQFDDKISKCLYIQNKEGQKIDISYVKSVFNLVDEQFQKIGLKQGSPNQK
KMMLQVVDLLAKIIKIYPLYQNDLCRILQESYPHRVQGEQFHKIYLTNILQLAIKCPQLM
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NYFPFDPYCLQYSDKFICEIYQNWQDTNSLSSQSFVEQQLEKQQPQTNNNKKSKKMSKGN
NANNASSNLNINNPPIIQNSPHFNNSLNNSFICSQSHNNPNNITGTLLNTSRSNYGFTID
KLNNINDLEYDRDNMIYDDEDVKANNNNHILDFINESDPEFQIQQAKYHKDKKSLNGKRK
NPSTTDNSVNNTPITNNDEDSNNQPIVDSKKISKKSKKSSDIEDDFNNASFGNKKLCIQE
MQF>TTHERM_00438910(gene)
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ATAGTAATAAGAAAAAAAAGAAATTGGCTTTGATAATTTTATATTAGCACGCACTACTTT
TTAAATTTAAAAATGAGCAAATCAAATACTCATCCAGCACCTCAAATGAGGAAACCAGTA
AATATTTAATAAAATGTGGGGTCCCAAGTTAAGAAGGCCCCTTAGGGTGAACAAATCAGT
TAAAAAAATGATTCAGCTAATCATGCTTAAATGCAAGAAGATGAAGAAAAAATTTATAGA
GTTCTTAGTAGCTGTTACGACGATTATCTAAAGGTAATTATTTTCGTTTTAAATCACTTT
ACTTAAATCAAGAAATCATTTTAAAGCTGATTTATCTCTCTGATCCAAGATTGTTGTTAA
GAAATTGTGAAAAATAATGATGAATTTATTATTAGATGATATAAATTTATGTACTCACTT
ATATAATATGACTCACTTTTATTATTTTATTACACTTAGGGTAATAAGGTTTTAATGAAT
AAGATCGTGAATGAAATGTCGAATAGGCACAAGGAAAAGGAACATATAAAAATGTGGTTA
AGGGCATCCACTAAAAAGCTGATTGATCTATTTAAGAATAAGCAAGATGTCAACTTTTTG
ATAGAGGTAATATTGTACTAAATGCCTTGGTTTGAAGCAGGTAACGAATATGAGATTTAG
TTGCAAGAGCAAGAGTAGAAAAAGATACTGTAGCAATAGCAAACTCATGCAAACTAGCAA
TAGCAGCATGGAATCGGAAGTAGTACCTCGCTTTTCAGCAATGCATCAAGTTCAAAGAGA
AACATTTAGTAGTAGCATGGACAATAATTAACAATAAAAAAACCATCTCCTCACTTCGAT
TTGTTTTCAGAGCTTTCTAAATTTATAATGACTCTGCTGTCTTTCAGTAATGCCTTTGCA
CCATAGATTATTAAGTTCCTCATTTCCAATATTGTGCCTATGTATTTTATTCTTTTTCTT
TATTATACTTCCTTCATACATCTTTCAATTTTTTTGCTTTTCTTCTACCTTTTTTCGTTT
GTTTCTATTTTCCATATTTAATGCAAACGCTAACCTAACCTAACCATCCAAGCAATCAAG
TTTTCATTAATTCATTCATTCATTCATGCATACTTCTTTAGCATATTTTCTTTTCATCTT
CACATCCAATCTAGCTAAATGGTTCTCATCATCATTCATTCAGTCAATTATTCATTCATT
TATTCATTCATTAGTTTAGTCTTGAGTTTCAATAATACCTTTGGAGTATTTATTAAAATT
AGATTTTTCTAATATACAAACATAGAAGATATGTGTTTCAAACACCTAACTTAATCAATG
TGTGTCAAACCATCGATTTGACATGAAGATTGAGTGTGTTTTGCAAAAGATGGCGGAATC
AAAATTTTGAACGAACGTATGGTTTTTAAGCTCACAAAGTTTGAAAGTGGAACGGAATGA
GTTTAGCAAACATCATACTGTAATAAAAAGACATATTCTTCAAAGTATCAGGAGACGTTT
CAGGGTTCTTTCGGTCGGTCTCTAGATAAAAGTAATGTAGTGATAGAATTTGTAGAAATT
TCATAATATTATAATACTAAAATCAACAGAATAATCTTAGTATGAACCAAATAAATAAGA
CTATCTATCTTGATTAAGAGGAAGTTAAATTAATGATCGTTTGTATTCCCATAATCTCAA
AGTATTTATAAGTAAGTATGATGAGAATCAAGAATGACAAGAGCGATCAATCGATTTCAT
TGTTCTAGCTAGCTAGATTTATTTATTTATTACAAAGCTGACATTTTCTTTTTATAAAAT
TTTAATAAGAAAAGCAAAAATATAATTTTGTTATCTTGAACCTTGCAAAGTTTTTTTTCT
AGCAAGACTTACTTAAGGCTTAATTAGCCATTTTCCGAAAATAAGCGAAATGGAATAATT
ATGCTTTAAGTAGCAAGATACATTTTTAGATGAATAATAGGGATTAAATGTTAAGAAAAT
TATATAAAAAATAGGGAAGTGAAGGAAATGGAAAAAAATAAGAAATCCGAAATAGAATTA
GAAGTTGAAGGAAAGGTTTTTGAAAACCAAAAAAAGCTATTAATGTATATCAGAGACATA
ATGAATAAGTATATTCTTAACAGTATAAATGACGTCAAAGAATTAAACAAAGAAGATACT
AATTTTTTATTAGGAGTCCTCAAATACCATCCTAATTCAAAAGAAAAAATGTAAAGATAC
GTCAAGCTAATTATTGGTTAAGCATAATTCGATGACAAAATCTCGAAATGCTTATACATT
CAAAACAAAGAAGGTTAGAAGATAGATATTTCTTATGTAAAAAGTGTGTTTAATTTAGTT
GATGAATAATTCTAAAAAATTGGATTAAAGCAAGGCTCCCCAAATTAAAAAAAGATGATG
TTACAAGTTGTTGATTTGCTAGCAAAAATAATTAAAATATATCCTCTTTACTAAAATGAC
CTATGTCGCATTTTACAAGAATCTTATCCTCATAGAGTGCAAGGAGAATAATTCCATAAA
ATATATCTTACTAACATTTTATAACTCGCTATTAAATGCCCATAGCTTATGCCTAAAATA
CTGATAATTGCTGTTTAAAAATTGATTGAAATAGACTCAGAAATCAAGCTTGATCATGAC
GTAAATAACATTTATTTGATTATAATTAATTCTTCCTAAATTTGCTATATATTACTTCCA
TTCATTCATACATACATTCATTTTAACTTTATTGATAACTTATTTTCTACATCAATTTAA
ATTAAATCCTTAAAAAAATATACTGAGTAAATGGTCATTTATTGCTACGCGGAATCTTTT
TTTATAAATAATTTCAGAATTTATTAGTAAAACCGCGAAACTGAAGATAAAAATTATTTA
ATATTAATGCTGTAAAAAACTCATCACATAAAAAATAATACACTTTTTTTAATTTCTTCA
CAAAAATTTCTTTAAAAATCTTAAAGTCAATTTTGTTTTACTTTCTTTATTGTTTGATAT
TTGAAATTAAATTAAATTTTGCAAACAATTATTAGGATAAATTTAAAAAAATTAATTTTG
TAATTAAAAAAAAGCAATCCTTTTAAATGAATGGATGAAACTTAATTAAAAAATTTTAAT
GAAAATATTTATTTATTTCTAAATTTTGAATAAGTATACCATAATTTTTCATAAACTCCC
CCATTTTTGTTGAAAAAAATTTAGAAATCCCCCACCCAAAACCCACATATTTTTTTTTAA
TTAGACTAGTTAATAAGCTCAATTATTAAAAAAAAAATAGATTAAATGTGAATATTATAT
TAAATGTTTTAAAATAAATTTTTAATTTAGTAATTTATTAAAATTAAAAATTATAAATAA
AAGGCCTAAGAAAATGAGAAGAATAGTTAAATTATGGCTGAAAAACTTGATTGGCTGATG
CTAATAATTTTTGAATTCATAGATTATTAATTAAAAGATAAAGTTAGTAGCGATTCTTGT
TTTGGACAAAAAGAAGAATTAAAATAAAATAGCTAAGATAAAAAAGATAAATCTTAAATG
GAAGACAAATTTTTTAAAATATTTTTAAATGTATTTAGTGAATAAATATTAATCACCCAT
TAAAGCAAATATGTTTAGTTTATAATATTTTATCTTTGCTCACTTCGTAACTCATTTTAA
AACGCTTTTTTAAATCACCTTGTAAAAAATATAACTGAGAAAAATCCTTTGATTTACAAA
TCAACCTAAATCAATTCTATTTATTATCTTGGCAGCTACATTGCTCGTGCAAAATACATC
GAAAATGAAACTATTAGAAAAATATTTGAATACCTTATTACTCATTTAAATAGATATATT
CAAAAATTTGATGAGAGACAAAAAGAAGAAAACTATAATGAAGGTCTCCATAAAATTCAC
TTAAATTTATACCATCTTTTACAAGCAATGCTTTATATCTTATGCTATCGTTTCAAAGCA
GTCTTAGAAAGCAAAGAAAATCTTTTGTAGAAATTCTACGAGATTATGGACAAGGCCTGT
TCTAATTTTAATGCATTATTTTTTATTTCTCCTCATATTTAAAATGTTTTTAGTGATGTT
TGCGTTAGCTACGGCGAAGATTAATTAGTAGAACTTTTTGAAAAAACTAGCTAAACAAGT
TAAGCAACAGAATCAATATCAGCTGCTCTGCAACAAAGAGCTTAGCTCTTAGATAACTAC
TTTCCATTTGATCCCTATTGCTTACAATATAGTGATAAGTTTATTTGCGAAATATATTAA
AATTGGTAAGACACAAATTCTTTATCATCTCAATCTTTTGTTGAATAATAATTAGAAAAG
CAACAACCTTAAACCAATAATAATAAAAAATCCAAAAAAATGTCAAAAGGTAATAATGCT
AATAATGCTAGCTCTAACTTAAATATCAACAATCCTCCAATAATTTAAAATAGTCCTCAC
TTTAATAATAGCCTAAATAATAGTTTTATATGCAGCCAATCTCATAATAATCCTAACAAT
ATAACAGGAACTTTATTAAATACAAGTAGAAGCAACTATGGTTTCACTATTGATAAGCTG
AACAATATTAATGACTTAGAATACGACAGGGATAACATGATTTATGATGACGAAGATGTA
AAAGCTAATAATAATAATCATATTTTAGATTTCATAAATGAAAGTGATCCTGAATTCTAA
ATATAATAAGCCAAATATCATAAAGACAAAAAATCTTTAAATGGAAAACGTAAAAACCCA
AGTACGACTGATAATTCTGTGAATAACACTCCAATTACAAATAATGATGAAGACAGCAAC
AATTAACCTATTGTTGACTCAAAAAAAATTAGTAAAAAATCTAAAAAATCTTCTGATATT
GAAGATGATTTTAACAATGCCTCTTTTGGTAATAAAAAGTTGTGCATATAAGAAATGTAA
TTCTGAGGAAACTTAAAATGAAATAATTTAATTGATAAGCTTCGCTACTATTAAATAAAT
CTTAGCTTAGATATTTCAATCTATAATAATAATAATAACTATAAAAAAATAATAAAAAAA
TTTACTAATAAAAAATTTAAATATTTTAATTCATTATTTGCTTTGAATTATTATCACTCG
TAAATCAAGAAATAAAAAATAAATAAATAAATGAGTGAAATGTTTCTAGCGGGATTAATA
ATTTAGCATACATACATACTTTAAGCATTTAAGACAAATAAATAAATAATAAGTAAAAAA
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ATTCAAAAATATTATTTAAACCCTTAATATATTATTGTTAATTAAAACTTTTCAAATTTT
GTCTGTAAATCTCTTTATTTTATTCTACATA