Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00285680

Standard Name

RRM7 (RNA recognition motif-containing protein 7)

Aliases

PreTt25897 | 26.m00249 | 3688.m00045

Description

RNA recognition motif-containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF05316 ) Mitochondrial ribosomal protein (VAR1)
• ( PF00642 ) Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and
• ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.1%

TetraMine Data

TTHERM_00285680

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_09285.1	9.997093137033517e-262	hypothetical protein (1120 aa)
Oxytricha	Contig22254.0.g55	1.0002124404074584e-26	RNA recognition motif_ (a_k_a_ RRM, RBD, or RNP domain)
SGD	YER068W	9.000561397357242e-21	MOT2 Subunit of the CCR4-NOT c omplex, which has roles in tra nscription regulation, mRNA de gradation, and post-transcript ional modifications; with Ubc4 p, ubiquitinates nascent polyp eptide-associated complex subu nits and histone demethyase Jh d2p
WormBase	WBGene00003827	3.0002687256732656e-20	locus:ntl-4 status:Partially _confirmed protein_id:CDM634 98.1
Stentor Coeruleus	SteCoe_32514	0.000000002061153622438558

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00285680(coding)
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GGAGCCCTTATCTCAACCCTCTCTATAAATTAAGCAAATTCAAATTAAAATTTACAGGAA
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TAAAGATTTTATATAAATTATAAAGAAATAGCATTAAAAATAGTGAATTAAAAAATTAGT
TTTTACAATAATTATTCATCAGTTTAAAACCCTATATTTCCAGATGTTATGATAGTATTA
AATGAATTAAAATCTTAATTATAAATACCTGATACACTCACTACTGCAGTATTAAAAGCG
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AATACTTTAAATTATTATAAGATGGTCGAAAAATTAGATTTGCCTTTTTAAAATCCTAAT
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AAAGCTGAAGAAAAATAGCAAAGTGTTTAAAATATAAATAAACCAATAAAGAGTAGTTCC
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AAATAATCTAGTAACTAAAACTCATAAAAGTTAGAGCTTAATAAAAGCGCTTCTTAATAG
TCTTCAAAAAATATAAATTCAACTGTCAACTAGCAAGTAAAAACAATTTAAAAAACAACT
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AGTTCCACTTCATAGCAAGAAACTTAAATAAAAAAGCAGGAATCAGAAAAAGAAAAGAAT
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ACAACTAAAAAGCAAAAAACCAAAGTAAAATAAGCTGAAAAACCTGAGAAAAAGACCTCA
AAAAAAATGAACTCTAAATAGCTAGAGCAATAATAATTGAAGGAAGAGAAGAAAAAGAGG
TAGGAGGAATATCAGCTTTTAAATGAACAACTTAATCTGATCAAATAAGAGAAAGAAAAA
AACAAGTAAAAACAGCAGGAGTAAAAGCAAGAATAGATGCAATAACAGCAAAAAAAAAAG
TAAAAAGAGTAAGAGAAGGAATAGTAACAATAGGCATAAGCTGATAAATCTTAAATTTTG
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AATGTTCCTATTGATAGTAAACTGAACTATAGATCTAGCAAATCTAAAAATGAGAAAAAT
CTTGCAAATAAGAAGAAAGAAGAGAAGCAAGTTTAGTATGAAAGCAAAGTGTACCACAGT
GATTTAATAAGTGAGTAGGCTGTGTACAAAGGCACTCCAGAGGTAGGAATTAATGATGAT
AATGAGTGA

>TTHERM_00285680(protein)
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DDAMTNEGIQNQNQDQNQNFEIQNQEYIQNQDINITQKDINLFNQNTNQLQHPLFDLKSM
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FQLAENSQTSRFFNDSSKSFKFKNIWGPVGQKKSSLKIENPNNPNYINGLQGNDCIQLPQ
SNEEDEFSVLNTFILAYNITHSLWIPYVKLQNLTEKIFKKLLVDQQISQFSFNKYMFDND
NWMLEFLENNLFTDEEKEIILSAARSTFKDKNLLYVDIAPQCVDLFTPVVEQKQQLQEVQ
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KTSKTKLNNNAQSSSSDAPKKAEEKQQSVQNINKPIKSSSITSQPSNLSSSIVKNEFQIQ
KQSSNQNSQKLELNKSASQQSSKNINSTVNQQVKTIQKTTQNPASNTANTNKVNGTKVVS
SSTSQQETQIKKQESEKEKNEQDEEFVSIQPKGGAIKLELADKKKERVDNNMFTFLENEQ
EEDEDKDKDKEEQQKQKNDNTTKKQKTKVKQAEKPEKKTSKKMNSKQLEQQQLKEEKKKR
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QKQISNLMSIDPKAFQFQNQNRLVNQQLAFHAEASVTNINVTKEGINISANITKSTQQGL
LPPEITKNASKIQMPNNIVVRFDNVDNTNKTSTIQNTISTNVPIDSKLNYRSSKSKNEKN
LANKKKEEKQVQYESKVYHSDLISEQAVYKGTPEVGINDDNE

>TTHERM_00285680(gene)
ATGAGTAGCGATAAAAACAAAGGCGGATTCAAAGTAGTCAATGGTCCTAAATCAAATTAA
GGAGCCCTTATCTCAACCCTCTCTATAAATTAAGCAAATTCAAATTAAAGTAGATTTATT
TTAGATTTTCGCTTATTAGAAATATTTTTTTTTGTGTATGCGTTATTATGATATTTACAA
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GCATTAAAATATATTTCTTCTTTTTCTCTTCTTCTCTCTTTTATATATATATCTCTAACT
TTTTACCAGCAAACCAAAAGAATATTACGCCAAGTGCTCTTATAATTAACTCATAAAAAT
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TACTCATAGTTTGTGGATTCCTTATGTCAAATTGCAAAATTTAACTGAAAAGATATTTAA
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CTAAAATTTAAATGCCAAACAACATAGTAGTTCGTTTTGATAATGTAGATAATACAAACA
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ATAGATCTAGCAGTAAAATAAAAATAATTTAATATCCATATTGTAATTTATTAATACTAA
AATTTTAGAATCTAAAAATGAGAAAAATCTTGCAAATAAGAAGAAAGAAGAGAAGCAAGT
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AATTTTATTTAATCTTTTTATAATTAAACAGATGATAATGAGTGA