Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00158460

Standard Name

RRM68 (RNA recognition motif-containing protein 68)

Aliases

PreTt28436 | 13.m00395 | 3829.m01250

Description

RRM68 RNA recognition motif 3 in plant Mei2-like protein; RNA recognition motif 2 family protein

Genome Browser (Macronucleus)

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Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF04059 ) RNA recognition motif 2
  • ( PF07576 ) BRCA1-associated protein 2

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%

TetraMine Data

TTHERM_00158460

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_05301.19.997093137033517e-262hypothetical protein (976 aa)
OxytrichaContig6775.0.g219.995739965151785e-43RNA recognition motif 2
DictyBaseDDB_G02792554.998394530072393e-19DDB_G0279255 on chromosome: 3
position 1840170 to 1845388
Stentor CoeruleusSteCoe_92381.5628821893349888e-18

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00158460(coding)
ATGGACCCACATATAGACGACGAACTCAAAGAATACTTAAGACTCATAGACGCTACAGTA
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TATGCTTTCATCAATTTTATTGATCCGAAACATATAATTCCTTTCTACAATGAATTCAAC
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CAATGA


>TTHERM_00158460(protein)
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KEQKSSHYPKRKKPEILDDSIDWNIGSQQTTLESPKSQDDIKDLCLGIQSLQCGGSVQCA
QSQQSQHFSSLNCITASSQFFQKLQRFFPEQQPNDQLNLSCLCSLDSSSKPSRNMVVQLS
QQDDIEQFLAFVRSYGDIQNIDRHKYQLEKIIVLSFYNIQSSLSAFQSISQSHSNKMKVS
YLSDFNDFDYIDYMNHCNIGYAFINFIDPKHIIPFYNEFNGKRWEMIRSEKVCYICYARI
QGRNELIAHFKKSGVMSALVDKSFKPLILPNPQLDLQILQQ


>TTHERM_00158460(gene)
ATGGACCCACATATAGACGACGAACTCAAAGAATACTTAAGACTCATAGACGCTACAGTA
AAGTCTGCTTCTACTAACCATATTTCACCTGAAAAGGGGGCTTTTGTTTAATTTCCTCAT
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ATTTCTTATATATTTGAAAATAAAGCAAAAAACACTCCCTTTCAAAAAAAAATAAACAAA
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TATCATTTAAATCAATAAATTAAAAAACCCAGTTTATTTAATTAATTAAAATTATTTAAT
TTTTGTATCAACTAAAATTTAGTGACATTGTTAAATATTGCTCATAATTTTTTACCTCAT
CTATTCAAATTTATTTATATTTTCTTTAATCAGCTTCATATAAATTATTTTTGTTAATAA
ATAGCTCATTTCTAATGCTAATAGCTTTAATTAAAAATTGGTTCTTGATTACCTTGGATG
CTTTGGTAAAATTCTTGAATACTCAAGTATAAACAGCAAACTTGTTGTAAGATATTTTGA
TGTGAGATCATTAAAAGAGGTTGATAGGATAATTAAGCTATAAGAGAAAGATAAAAAGTC
CTTTATTTACTTGCATAGAACTCATTTCCCTGAGGTAGAAGAAAAGTTTATTTTAGAGCT
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AAGGGTAAAATCAGTTAAGCAAAGTGCTTCTTAAGTTCAATAACATTAATAATAACAGTC
TAATCAACAAATAGTGAAATAACACGAAGTAGTTATATAATAGTTAGGATTGCTTCCTAC
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TAAACAAAATTAATATTTATCTTCAAATTCATCGAATTCTCTAAGCAGCTAAATTGATAA
CTAGTCTTTCGCTAATAATGAAAATGAAAATATTCATATCAATAAATAATTACAACAAAA
AAATAAAAAAAGATGAACCCTAATGTAAATAACTTTAGTTCCCTTAATTATAATAGCAAC
GGAAGCAATCATAATAATAATAACAATAGCACCAACAGTAACAGCTCATCTCTTAAACTT
CTTTAAAGCAGCTATTCAGTAAATGCAAATTGCTAACCTTAAATAAAATAAAACAATTGT
TAACTGAATGTGAATTCCTTATAATAACCTATTTGCAATTTGTAAATGAGCTAAGAAATA
GGTTCTTCTCAACAATAGATTCAATACTTGCAGCAAATTTCACAATCTTCTTCATCTTCT
CTTTCTTCTACAAACTTCCCTCAATACAGTTAGGGACACTTCAATACTAACTTCAATTAA
ATGAGAAAAAGCTAAGATGAAAATCCCTTTTCAGCTTCCTCTTTGAGAATGAGTTTTGAC
AATAACCAAATCTATCAAATAAATAACAGCTTTTACCAAAATAACAACACTAACAATACC
TCATAAACTAATATAAGTAATATTAGTAATACTTAAAACTTAAATAACTAAATGCTCAAC
AGCTAAAATAATTCAGTGGCTAATTCAATGCAAGTCCGCTTATAAAATAACTAGCAAGCA
TAATTTATGAATTTATTGAATAACAATAGCTAATTTTTAAATGAAATGTGTTTCAACAAC
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TCTCAGACTTCAAACAAGGTGAGCACAATACTTGGAAGCAATGGAGCTAAACAATAAAAT
AACAACTAAAACTTCTAAGTAAATTTAGAAAATATTGCTTCTTTTAAAGACAGACGAGCA
ACAGTCATGGTGAGAAATATCCCAAACAGATATAACTAAGAAGATTTCCTAAGAATCATA
GATATTAATTACAAAGGTCTTTACGATTTCGTATACCTTCCCATGGACTTCAAAGTAATT
ATTTATTTATTTGTATTTATTCTTAATTTTAAGAATTCTTTAACTTTTTTCTTAATTTAA
TTCCTACTTAGTAATTTCTATCAATAAAAATAAACATTAAAAATTTATTAAAATAAACAA
ACAATATCAACAATATTTAAATAATAGAATCATTGCAACATCGGCTATGCTTTCATCAAT
TTTATTGATCCGAAACATATAATTCCTTTCTACAATGAATTCAACGGTAAAAGGTGGGAG
ATGATAAGAAGTGAAAAGGTAATAAATTTTTAATATTAAAAATATTAAAAAATTAAATTA
TAAATTATAAAATTTAGGTTTGCTATATTTGCTATGCAAGGATACAAGGAAGAAACGAGT
TAATTGCTCACTTTAAAAAATCAGGAGTGATGAGCGCTTTAGTTGTAATAAAAATAAATA
TTTTTAAATATTATTTTAATTTATTTTTATAATTTAATTAAAAGGACAAATCATTTAAAC
CTCTAATCTTGCCAAATCCTTAGTTAGATCTCCAAATTCTTTAACAATGA