Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00158460

Standard Name

RRM68 (RNA recognition motif-containing protein 68)

Aliases

PreTt28436 | 13.m00395 | 3829.m01250

Description

RNA recognition motif 2 family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF04059 ) RNA recognition motif 2
• ( PF07576 ) BRCA1-associated protein 2

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%

TetraMine Data

TTHERM_00158460

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_05301.1	9.997093137033517e-262	hypothetical protein (976 aa)
Oxytricha	Contig6775.0.g21	9.995739965151785e-43	RNA recognition motif 2
DictyBase	DDB_G0279255	4.998394530072393e-19	DDB_G0279255 on chromosome: 3 position 1840170 to 1845388
Stentor Coeruleus	SteCoe_9238	1.5628821893349888e-18

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00158460(coding)
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TAATAAGATGATATAGAATAATTCCTTGCCTTCGTTAGATCTTATGGAGATATACAAAAC
ATAGATCGCCATAAATACCAGCTTGAAAAAATAATAGTATTAAGCTTCTACAACATTCAG
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AGTGCTTCTTAAGTTCAATAACATTAATAATAACAGTCTAATCAACAAATAGTGAAATAA
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AATGCAAATTGCTAACCTTAAATAAAATAAAACAATTGTTAACTGAATGTGAATTCCTTA
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CAATACAGTTAGGGACACTTCAATACTAACTTCAATTAAATGAGAAAAAGCTAAGATGAA
AATCCCTTTTCAGCTTCCTCTTTGAGAATGAGTTTTGACAATAACCAAATCTATCAAATA
AATAACAGCTTTTACCAAAATAACAACACTAACAATACCTCATAAACTAATATAAGTAAT
ATTAGTAATACTTAAAACTTAAATAACTAAATGCTCAACAGCTAAAATAATTCAGTGGCT
AATTCAATGCAAGTCCGCTTATAAAATAACTAGCAAGCATAATTTATGAATTTATTGAAT
AACAATAGCTAATTTTTAAATGAAATGTGTTTCAACAACCCTCAAAATCCAAGTATCATT
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TACGCAAACACAATTAACCTACAGAATAACTATCAAACATCTCAGACTTCAAACAAGGTG
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TACGATTTCGTATACCTTCCCATGGACTTCAAAAATCATTGCAACATCGGCTATGCTTTC
ATCAATTTTATTGATCCGAAACATATAATTCCTTTCTACAATGAATTCAACGGTAAAAGG
TGGGAGATGATAAGAAGTGAAAAGGTTTGCTATATTTGCTATGCAAGGATACAAGGAAGA
AACGAGTTAATTGCTCACTTTAAAAAATCAGGAGTGATGAGCGCTTTAGTTGACAAATCA
TTTAAACCTCTAATCTTGCCAAATCCTTAGTTAGATCTCCAAATTCTTTAACAATGA

>TTHERM_00158460(protein)
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SASQVQQHQQQQSNQQIVKQHEVVIQQLGLLPTSPNSTSSPALPNALEIGYNQRLNSLSF
FSSNNTHPIQQQNMNNVFNSFFNFEENTNNQFPVIQSSKQDNIYQHTYSNQNVLGMTQNL
NQQPQLYGYQQRRELQEISDYQNTFQQSISQSNKQNQYLSSNSSNSLSSQIDNQSFANNE
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ISNTQNLNNQMLNSQNNSVANSMQVRLQNNQQAQFMNLLNNNSQFLNEMCFNNPQNPSII
EQYEATQIQNNLSNSSSNRQYANTINLQNNYQTSQTSNKVSTILGSNGAKQQNNNQNFQV
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INFIDPKHIIPFYNEFNGKRWEMIRSEKVCYICYARIQGRNELIAHFKKSGVMSALVDKS
FKPLILPNPQLDLQILQQ

>TTHERM_00158460(gene)
ATGGACCCACATATAGACGACGAACTCAAAGAATACTTAAGACTCATAGACGCTACAGTA
AAGTCTGCTTCTACTAACCATATTTCACCTGAAAAGGGGGCTTTTGTTTAATTTCCTCAT
CAATTTAAGACTAATGAGCTATTTTAAAATGGCATTAAATTGATAAGTAATTGCGATGAG
AAAGAATAAAAAAGGTATTTACTTTCAAATTTATTATTTAACATACCCAAAATTTTATTT
GATTTGCATGCATTTAACTATTTAAATAATGAAACAAAGCAGTCATTATCCAAAAAGAAA
AAAGCCTGAAATACTCGATGATAGCATTGATTGGAATATTGGTTCACAATAGACTACATT
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GTGTGGAGGTAGTGTCTAATGTGCATAAAGCTAGCAAAGTCAACACTTTAGCTCGTTGAA
TTGCATCACAGCATCCTCTTAATTCTTTTAAAAGCTCTAACGCTTTTTCCCTGAATAGCA
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TTAAAATAGAGTCTTGATTCTTCTTCTAAGCCTTCAAGGAATATGGTTGTCTAGCTCAGC
TAATAAGATGATATAGAATAATTCCTTGCCTTCGTTAGATCTTATGGAGATATACAAAAC
ATAGATCGCCATAAATACCAGCTTGAAAAGTAATTGCGAAAATCATTTTTATTTGCAAAA
AATTAACTACTGAAGAGTTCTTAATCCATTTCACAATTTATATAAATAGAATAATAGTAT
TAAGCTTCTACAACATTCAGTCCTCCCTGTCAGCTTTTCAGTCTATATCTTAATCGCATT
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TGGTAATATTGATTAAACTATTTGAACTCTTTGTTTTTTATTTTTTTTCTACTTATTTAA
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TTTTTGTTAACTCTCTTTGATAATTGTTTGTCTGAACACTCACTAACATTTTTTTTATTT
GAAAAATTAATAATTTCTACTAATAATTGCGCAATTTTTACTAAAAAGTTATCATTTTTC
CATTTATTTTGCATTTTTTTATACAAATTAAATCTTTTCTTTGTTTTAGTGAAGTAAAAT
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TTTTGTATCAACTAAAATTTAGTGACATTGTTAAATATTGCTCATAATTTTTTACCTCAT
CTATTCAAATTTATTTATATTTTCTTTAATCAGCTTCATATAAATTATTTTTGTTAATAA
ATAGCTCATTTCTAATGCTAATAGCTTTAATTAAAAATTGGTTCTTGATTACCTTGGATG
CTTTGGTAAAATTCTTGAATACTCAAGTATAAACAGCAAACTTGTTGTAAGATATTTTGA
TGTGAGATCATTAAAAGAGGTTGATAGGATAATTAAGCTATAAGAGAAAGATAAAAAGTC
CTTTATTTACTTGCATAGAACTCATTTCCCTGAGGTAGAAGAAAAGTTTATTTTAGAGCT
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AAGGGTAAAATCAGTTAAGCAAAGTGCTTCTTAAGTTCAATAACATTAATAATAACAGTC
TAATCAACAAATAGTGAAATAACACGAAGTAGTTATATAATAGTTAGGATTGCTTCCTAC
CTCGCCTAATAGCACTTCGTCTCCAGCACTTCCTAATGCATTAGAAATAGGATATAATCA
AAGATTAAATTCTCTATCTTTTTTCAGCTCTAATAATACACATCCTATCTAGCAATAAAA
TATGAATAATGTTTTCAACAGTTTCTTTAATTTTGAAGAAAACACAAATAATTAGTTCCC
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TTAACTGAATGTGAATTCCTTATAATAACCTATTTGCAATTTGTAAATGAGCTAAGAAAT
AGGTTCTTCTCAACAATAGATTCAATACTTGCAGCAAATTTCACAATCTTCTTCATCTTC
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TTTTATTGATCCGAAACATATAATTCCTTTCTACAATGAATTCAACGGTAAAAGGTGGGA
GATGATAAGAAGTGAAAAGGTAATAAATTTTTAATATTAAAAATATTAAAAAATTAAATT
ATAAATTATAAAATTTAGGTTTGCTATATTTGCTATGCAAGGATACAAGGAAGAAACGAG
TTAATTGCTCACTTTAAAAAATCAGGAGTGATGAGCGCTTTAGTTGTAATAAAAATAAAT
ATTTTTAAATATTATTTTAATTTATTTTTATAATTTAATTAAAAGGACAAATCATTTAAA
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