Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00703470

Standard Name

RRM67 (RNA recognition motif-containing protein 67)

Aliases

PreTt20123 | 110.m00096

Description

RRM67 RNA recognition motif 2 family protein; RNA recognition motif 2 family protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF01020 ) ribosomal L40e family
  • ( PF04059 ) RNA recognition motif 2
  • ( PF04702 ) Vicilin N terminal region

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 13.7%

TetraMine Data

TTHERM_00703470

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_15307.19.997093137033517e-262RNA recognition domain-contain
ing protein 2 family protein (
1169 aa)
OxytrichaContig6775.0.g211.000159011384939e-43RNA recognition motif 2
Stentor CoeruleusSteCoe_92382.6102790696677047e-23
DictyBaseDDB_G02792559.997019043202629e-21DDB_G0279255 on chromosome: 3
position 1840170 to 1845388

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00703470(coding)
ATGTCGCAGTCTTCCAGACCGGATCAACTGAGATAGAATGTTGATTTTAATAGTGTTTTA
TTAGTGGGTTTTGATCAAATTGATCAACCAGAAGAAGGAGAACAAAATTTAAGTATTTGG
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TAATAAGGCAATCTTCAAAATTCTCAAATATTAAATTTTAATGAAATGGGAGGATCTTGC
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TACTCTCAAAATTCTTAACAAAATAATACCTAAATAAGTCATCCTCAATTTTCTCCTTAA
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GATAATTCAATTTCAAATAATGGAAATTCTATTTAGAACAGTACGGCTATTAAATCTTAA
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TCTAATGAATAAGAGAACTAAGCTAATACCCCAAAGCAATAATATGAAAAATCTTAAAGT
AAAGAGTCTATTTATTCAAGAGGTTCAAATCATAATTCTTCAAATCACACCTTAAAAGAT
GAGAAATGTACCATAACTTAGTCAAACGATACTCAAAATATCTAAGCTAGATCTTCAAGC
ATAAAGTCATAAACTTTACTCAATTAGACTCTAAATATATCATCTATTTCAAAAAGTATC
TCTCCAACAAATAATGAGGATATCAAACAAAAGCAAGCTCAACTCATAAAATCAAGTACT
AAAAAAGTAACTTAATGCATGAATCCTTCTTAGTAATAGTGA


>TTHERM_00703470(protein)
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SNLLHYPQKFLAKPQGIHRKNLSTSSKTNGGSQNYSNISILNNQKFESGSIQSSKQIQQN
DNSISNNGNSIQNSTAIKSQQKNDTTSSATFSQLSRKVRSITNNMIEQSQILEEDDEKID
GEFFDDSNNESETDKKQKSDDQTKGSKKAEKKNSKGTRKRKIIAQEEESNYLINPDNVKQ
DSRTTVMIKNIPNKYSLQALMEKIDQNHSKTYDFFYLPIDFRNKCNVGYAFINFIDPEFI
KNFYEEFHNQKWAKFNSEKVCLLYYARLQGRNALIHHFQHSSVMNQKDKKLKPVILPKNE
VIALEQLLKNQRDEVRKVSNSSSSADQRSKSPENINAQLSSNEQENQANTPKQQYEKSQS
KESIYSRGSNHNSSNHTLKDEKCTITQSNDTQNIQARSSSIKSQTLLNQTLNISSISKSI
SPTNNEDIKQKQAQLIKSSTKKVTQCMNPSQQQ


>TTHERM_00703470(gene)
ATGTCGCAGTCTTCCAGACCGGATCAACTGAGATAGAATGTTGATTGTAATCACGCCATT
TCTCTTTAAATATTCTTATTGTTTATACTTTTCTCTTTAACAATATGTTATTGACTTTTA
ATTAACAATAAGGAGGAAAAAATCCCTTGCTTACTTTATATTTAAAGATTGTTATTAAAC
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AGTATGAGAATATCCGCAGATCTAAATAAAATTAGTCTCAAATTCATTTGAATCAACCTA
TTCTCTTAAATTCTGTATAATAAAATTTTCCTATGTCTATGCAAATGGGATAAGCAAGTT
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AGGCTATTTTAAGTTCAACTGCAAGAGGGTTTATGCTACATGCAAGTAAAGTTTTATTAG
CATTTTTATATGTGAATTCCTATCAAATGGTTATGTATATTCACAAATTTTTATTGAAAC
ATTTTTGTCATGCTTTCTTAGAAAATTTTTTTGGAAATTTAAAAATATAATGACTTTAAT
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AATAAGGTCAATAACAATAATAACAATAGTAGCAACAATAACAACAATAATAATAGCAGT
AATAATAGTACATCAATGAAAACAGTTTTTTTCAATTTTTTGGGGATTAATCTAAAATCA
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ATACCTAAATGAATCAAAATAATAGTGTCTTCTTTTAAAACAAAAGGCCTAAATAATCTG
ATTCTACTTTTGATTCCACTTGTTCATCAACTCTTGTATAGGAATCTTCTTATGTTACCC
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AAATTTAATAATAAAACTTAATAAAATTTTTAAAAATAAATAGAACAAATGCAACGTCGG
GTATGCATTTATAAACTTCATAGATCCAGAATTTATAAAAAATTTTTATGAAGAGTTTCA
TAACCAGAAGTGGGCAAAATTCAACAGTGAAAAAGTAAATTGCATATTTTTATGTAAACT
AATTAAATTTTTTTACTTTTTTAAATTTAGGTTTGCTTGCTCTATTATGCTAGACTTCAA
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TGTTATACTCCCTAAAAATGAAGTAATAGCTTTAGAATAGCTTTTAAAGAATCAAGTAAA
ATTTATTACTATTAAATTCAAAAAAAATAAATTAAATAAATTAATTTTTAGAGGGATGAA
GTCCGTAAGGTATCCAATAGCAGTAGCTCAGCAGATCAAAGAAGCAAATCTCCTGAAAAT
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TATGAAAAATCTTAAAGTAAAGAGTCTATTTATTCAAGAGGTTCAAATCATAATTCTTCA
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TCTATTTCAAAAAGTATCTCTCCAACAAATAATGAGGATATCAAACAAAAGCAAGCTCAA
CTCATAAAATCAAGTACTAAAAAAGTAACTTAATGCATGAATCCTTCTTAGTAATAGTGA