Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00502500

Standard Name

RRM66 (RNA recognition motif-containing protein 66)

Aliases

PreTt08089 | 63.m00267 | 3716.m00119

Description

RNA recognition motif-containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( TIGR01612 ) rhoptry protein
  • ( PF04059 ) RNA recognition motif 2
  • ( PF08252 ) arg-2/CPA1 leader peptide
  • ( PF00027 ) cyclic nucleotide-binding domain
  • ( TIGR00864 ) polycystin cation channel protein

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%

TetraMine Data

TTHERM_00502500

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_09562.13.9991157591502974e-89hypothetical protein (3206 aa)
OxytrichaContig6775.0.g217.998336109808381e-38RNA recognition motif 2
Stentor CoeruleusSteCoe_92385.242885663363464e-22
DictyBaseDDB_G02792551.0002869940498747e-21DDB_G0279255 on chromosome: 3
position 1840170 to 1845388

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences 

>TTHERM_00502500(coding)
ATGGATGGAAGTCCTAAAAGTAAAGCTGACGCGTCTTCTTCTTTGCAAAATTAATAATCT
CAATTAACATAATCCTAGCAAGCTTAAAAAATTTATCAAAGCGAAAGTGGAAATTACAAA
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GAAAATGTACTATACTATTAGGATTAAAATTTTAGAATTCAAAATATAATTTTATAGTAG
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AAAAATTAGTATTTTACTTCTCAAATTCCTATAACACCTCAATTGAATAATTAAATTAAT
ATTAATCCTCTGATTTATCCCACATAAGTTTACTTGAGTGATGAAAAAATGTAATATCAA
CAATCTATCTTAAATAACCCATCAGGATAAAAAATGAAAACGCAACCTAACCCTCAAACA
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ATGGGTTTTAAGAATTAGCTAGAAAATATTCATCTCATTGGTACAAATATTCAGAATGGG
TTAAGAAGCAGCGAGTGCTATCCTTAATCACCTTCACCAAATTTAGATTTTTTAAATTAA
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ACATCATCTAATCAGCACTCAAATTCAAGTGAGCCTAATAGTCTTATTAACTAACATCAA
TATGGTAGTGGTATTCATTTAAAAACTAGTGAGTCTACTGATTTTAGTAATTAATCTTTA
CCTTAATTTTAAAATATGTCTTCTTCTATTTCAAGCATGCAAGCTCAATAATAAAAGAAT
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GTTTATTAGCAGAAGAAAATATCTAATCAATTTTAATAGCAGAATAGTAATGATTAGACA
TCTAATTCATAATAATTTTAATTGAACAATAGTAAATAGCAATTCATACCGAAGAAAAAT
TTTAGCTAAATTAATCAAATAAACTTTTAAAACGCCTCTTTAAATAGCAACAACAGCAGT
GGAAGTAACTAAAACAATAGCAGTATTAACAATTAAAATAATAATATAACAATAAATAAT
AGCTAGTAAATCCATTACCCTAACCATCATAAGAGATAATAATCATAAACTAGCCAAAGT
GGATAAAAGCAGAATCCTACTTAAATGCAATAAAATTGTTTTTAAAAACCATAATATTAG
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TCTCAATAGGAAATAAAAAGTAAACCTATGAATAATATTTCACAACAGTAATAGTAATAA
CATTAAAACTAAAAAATTAATTAAAAGAATAATAACAATAATAATAACAACAACAATAAT
AATAGCACGATTAAAAATAATACCATAAATATGAATTAAAATAATATTGTAAATAATCTC
AATAATAGTAACATCAATAGTCTAAATAACAACAATCCTAATAACAAACAACAAGGAGGA
AGACACAGACATACAGTTTCAGAATCTTCAACTGAATATAAAATAGATTTGAAAAGAATA
AATGAAGATGGCAGAACAACTTTGATGATAAAAAATATACCAAATAAATATGAACAAGAT
CTACTTCTATAAACTATTGATAGGAAGCATAAGCATACTTACGATTTCTTTTATCTACCT
ATTGATTTTACAAATAATTGTAATGTTGGGTATGCATTTATAAATTTCAAAGAAACTAGG
TTTATTGAGCCTTTTTATAGAGAATTTAATGACTAAAAATGGAAAAAATATAATTCTGAT
AAAATTTGCTAGCTTTGTTATGCAAGAATTCAAGGAAGTGAAAGTTTAAATAATCACTTT
AGATCATCATCAGTTATGAATTAAAAAGATAACAAATATAAACCCCTATTTATAGATACT
AAAGATAAATCAGCTATATAACAAATTGTTGATTAACAAAAAAAAGATATAGAAAAAGAA
AAGAAATGA


>TTHERM_00502500(protein)
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KK


>TTHERM_00502500(gene)
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CAATTAACATAATCCTAGCAAGCTTAAAAAATTTATCAAAGCGAAAGTGGAAATTACAAA
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TTATAGAGAATTTAATGACTAAAAATGGAAAAAATATAATTCTGATAAAGTAAGTTATTG
AATATTTGTATAAAAAATAATAAATAAAATCTTACTTAAAAAAAGATTTGCTAGCTTTGT
TATGCAAGAATTCAAGGAAGTGAAAGTTTAAATAATCACTTTAGATCATCATCAGTTATG
AATTAAAAAGTATGAAACCTTATTTAATAAATTTTTCAGCTAATTTTGTATATTTATCAA
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ATTGTTGATTAACAAGTAAATATCTAATTTAATGAGTAAGATTAAATCATTTAATAATTT
ATTTTATTTTAGAAAAAAGATATAGAAAAAGAAAAGAAATGA