Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00444880Standard Name
RRM51 (RNA recognition motif-containing protein 51)Aliases
PreTt03856 | 51.m00222 | 3704.m00078Description
RRM51 RNA recognition motif 3 in plant Mei2-like protein; RNA recognition motif 2 family proteinGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.3%
TetraMine Data
TTHERM_00444880
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_10866.1 9.996162112727537e-67 RNA recognition domain-contain
ing protein 2 family protein (
1485 aa)
Oxytricha Contig6775.0.g21 7.998336109808381e-38 RNA recognition motif 2
Stentor Coeruleus SteCoe_8158 2.8625185805493937e-20 DictyBase DDB_G0279255 8.997498379799854e-17 DDB_G0279255 on chromosome: 3
position 1840170 to 1845388
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00444880(coding)
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TAGAATGCTCATGACATTTTGGCTAAATCTAAACTCCAAAATTCTTATCATTAACGAGGA
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AAAGGTGGATCTTCTCAATCTTTATAGAATTAAGTTGCTTAATCATAATCCCTAGCTAAC
AGCTTTGTATCTGTTAATCAGCAAGCAGTAGGTTCATCTGGAGATGAAAAATCTGGAGCA
AATGTTTGCTAATCTTTCTCTGCCGTCATCTCAGCTCAGCCTGTATCTGAACTTAAAATT
GCAGGTCCTGAGATTAATAACCTTTAAGTATCATCACAAAGTTAGCCATTATCTGATAAT
TTAGTATTTAAACACGCTTCGTCACTTGATCTCCCTCCTTAATCCTCTCTAAATGTCAGT
TCAAAATTAATTAATCAATAAGTAAATGCCGCTCATAAGTATAATAATCCCAAATAGCTA
AATGAGTAGTAAATTTTAAAGTCATAAAAGCACAAGTAAAAAAATATACTAGAAAATGAA
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GAATTATAGCAAGCATAGGGTATTGAAGCCTTCGATGTAGTAGCTAACAACAAAGCAGAT
TCTGAAAATTAGATGAGTTAAGTTTAAATATAAGGGAATAATATATTTGGAATAAATACT
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ACATCAAGGTCACATAAAAATTAGTCAAATATCTCTGATGATTTTTTGTAGGATTCAAAA
TAAGAAAGTGTAAACAACAACAGTATGATTGTTAGCAGTAGCAATAATAGCAGCAGGGTT
TTTAAAGGATCAAGCAACAATAGCTTTATCCTAAATTAATGTACTTAAAAAGCAGCTGCA
TAAAATCCTTTAAACGAATTTATTCAATCCAAGGAAGAAATCAAAGAAAGCATAAGTAGA
TCTAAATATTGCGCAAAGCCTAGAGATGCTCATATACTTTAAAATGCAAGATTGCCTATC
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AAAGGCAAACAAAAATTAAAATAACTTATGCATAGAAGAGGAAATACTTTAAGTAGAAAT
GATATAGAAGATTTGTAGTTCTTTGAGTTTTAAGACTCAGTCTTCCAAAAGGTTTCATCT
GAAGATGAAAAAGTAAATTCTAACTAATTGGAAAACAAGCAAACATCTCAGGAAAATTTA
AGCACAAATCCTCTTTCTTTTATCAACCCTTCCTAGGTCTATGACTTTTAGAATAAGAAC
AATGAAGAAGATAATCAAAACGAGCAAGACTACTAACAGGAAGATTAAGATGAAGATATT
GAAATCAAAAAATAAGTAGAACTGCTAAACAGTGACGACTCTGAGAACGAAGATAAGGTA
AGAAATATAGGTAAGCCCAGTCCTCATCCTCCTGTTGGTGTTTACTAATAACAAATTTAT
CATCCGATTCCTTAGCAATAATCCCAGTAATAAATGAGTTTTCATCCTCACTTAAATCCT
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AGCAAGCAATCTTCTACTCCTAATCAACAATTAGAGTATATTAGCTCAAAGAGAATTGTT
GGCCCTAGACCAATGTCTATTGATTAGCAATTTTCTTAATTCTTTGCTACTCCTAATTAG
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TCTATTTATAACTAAGGGATGAAGTAACCTACAAATAATATGAATAATATTATTTAATTT
AATTAAATGAATACACCTTCTCCCCCAATCCAAGGCAACTAATAAAAGAACTATTAGATC
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GGTATCTAGTAGCCTTAACAAAATTAATAGGGTAATCAATAGCAATAGTAATAGGCTGGT
TAGATATTTAATTAGAACTAAATAAGCTTGGGATAATAGGGCTAATAATAAATGATGGCT
ATGATGAAGAACTAAAAGCAGCACTTGTAAATATAGCCTAACTCTTTGTTCTCTTCAAAT
TCAAGCTCTACATACCACTTGTAGAAATAAAATTGCAATCTATCTCAAGCATCAACAATA
GACTCAGCAGATTATATCAACACTTTCAGATCAGGATCTTCTTATGGTGTTTAGGATGTC
TAGTAAGATCAAGTAGTTAAGATGATTAAGCAATAGAGTTAGTCGATATAGTAATAACTG
CAAGTTAGAAGCTAATGTATTCAATCTCAAGTGCAGCAACAATAAAGCTAGCAAGGACCT
TAACTCAACTAGCAGCTAAACTTCTTCCCAAACCATCATCTCGCAAATTAATAAGAAAAA
GGTTTCTTTTAATAACCTAATACAAACGCAAATTAATTTTTGCTTGAACCTTTTACTTCT
TAACCTCAGTTTAATTAATATTAAATGAGCCAATTCTAACAAAATTAATAAATTCCGTTT
ACAAATGAGTTCATGCAAACGCCTTTTCCTCTTCAATACCTTTAAGTATACATTCCTTAA
AATCATGCATAGGTTGTTTAATAACCAATTGGTTAGATCTCTCCAGAAAAATTTGATTAA
GTACCTCAAGCTCCTCCTCCTCACATTTTTGCTAATTCTTAATTGCTAAATAATTAAGAC
ATTTCAAAGATATCTAAAAATCAATTCTAGCTAAAATAATAAATGTAAGGCTATAATAAG
CCTTCTCACTCCAAATAGCTATCATGCTAATAATTAGGATAATACGATTAATAGAACTAA
GTATAACAACTTTAATAGAGTCAAATTTAATTTTCATAAGGAAATTAATACTAGCTTAAG
AATAACAAATTTAACTAAGATAGTAGCAATATTGTTAACCAAAGCTAATAAGGTAACAGC
ATCTGCAACAACAGCATGACTTTCCATAATAATTCATAGAATAAAAATTAAATTAATAGC
TCTAACGTTAACAGCTAACCTATTAAAGGAAAAAAGAAATTAGAAATAAAAGAGGAGGAT
ATAAGCTATGATATTGATTTAGATAAGTTAGGTGAAGATAAGCGTACTACCGTTTGCATT
AAAAATATCCCAAACAAATATTAGCTTAACTGTGTTTTACAAACAATAGAAAAAAATCAC
AAGGATAACTTTGACTTTTTCTACTTGCCTATTGATTTTAATAATAAGTGCAATGTTGGC
TATGCATTCATTAATTTTATCAAGCCAGAATACATTAAAGATTTTTATCTTGAGTTTAAT
GGCAAAAAATGGAAGAAGTTTAATTCAGACAAGATTTGCAGCTTAAAATATGCTACAATA
TAAGGTATTCCTTAATTACAAGAGCATTTCTAGAATTCGAGCGTTATGAACTAAAGAGAA
AAAAAGTTTAAACCAGTGTTTTTAAATGTCATAAGCAATATGATTGACAAACAAAAGCAA
CAATCTACATAAAATGATTGTAATAAATCAAATTTTAACGATGATAATAATGGCATTAAT
TAATAAATGGGTAAAAACAATTTTATGGAAGGAAGCACCAGTTAAAACTAGACTGAATAA
GCTTTCAACTATAACAATAACAAGTAAAACAACTATTCCTATCAAAGCAATCACAGCCAA
CATAGCAACAGCAATAATAATACCAGCTAAGGAGGTTAAAATAGCACTAATTATCACAAA
AAAAATAACAGTAATAGTAATAACAACTATTTTAATAGATACCATAATTCTAATTAGAAG
AATTACAATAATAACAAACATGAATATGTTCAAAAGCAATGA>TTHERM_00444880(protein)
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NEKSKRPSSVTQRPSSIPKFVSSFSNEAQKIGLNGNTRSQDDSYAVNSLISSMNNSYCIQ
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LVFKHASSLDLPPQSSLNVSSKLINQQVNAAHKYNNPKQLNEQQILKSQKHKQKNILENE
EDCDQKDKQEDEEQNEQNVCELQQAQGIEAFDVVANNKADSENQMSQVQIQGNNIFGINT
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SIYNQGMKQPTNNMNNIIQFNQMNTPSPPIQGNQQKNYQIFQQHTQMQQMMCQIPAQHSI
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KNNSNSNNNYFNRYHNSNQKNYNNNKHEYVQKQ>TTHERM_00444880(gene)
ATGAAGAATTAAAGCTCTAATAGTTCAGTAGATATAGAGATTAATTCACAGTGCTAAAAG
CCTTCTTAACAACTTTTAGGCCCAAGTATAATTTTGAAAGACCATCAGGAAGATAGAAGT
ATTTATTATACATCCACATTTCATTCATTTATCAAGCCTTGCCTTCAAAAATTTTATCCA
TTTTTAAAAATGATTCTTTTGCATTAATTAAAAGTTTTGTAAATAATTGAAAGATTAAAA
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TATAGCTAAAAGCAATTCTTCCTCATAGAACAGCACCTTCAGAAAGGTTCATTCAACTAA
AGGCAAAAATGAGAAAAGTAAAAGGCCTTCTAGTGTGACCCAAAGACCAAGTTCGATTCC
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AAGTTAAGATGATAGTTATGCAGTAAATAGTCTAATTAGTAGCATGAATAATAGTTATTG
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CAATCTTAAAGGTGGATCTTCTCAATCTTTATAGAATTAAGTTGCTTAATCATAATCCCT
AGCTAACAGCTTTGTATCTGTTAATCAGCAAGCAGTAGGTTCATCTGGAGATGAAAAATC
TGGAGCAAATGTTTGCTAATCTTTCTCTGCCGTCATCTCAGCTCAGCCTGTATCTGAACT
TAAAATTGCAGGTCCTGAGATTAATAACCTTTAAGTATCATCACAAAGTTAGCCATTATC
TGATAATTTAGTATTTAAACACGCTTCGTCACTTGATCTCCCTCCTTAATCCTCTCTAAA
TGTCAGTTCAAAATTAATTAATCAATAAGTAAATGCCGCTCATAAGTATAATAATCCCAA
ATAGCTAAATGAGTAGTAAATTTTAAAGTCATAAAAGCACAAGTAAAAAAATATACTAGA
AAATGAAGAGGATTGTGATCAAAAAGATAAGTAAGAAGATGAAGAATAGAATGAGTAAAA
TGTATGCGAATTATAGCAAGCATAGGGTATTGAAGCCTTCGATGTAGTAGCTAACAACAA
AGCAGATTCTGAAAATTAGATGAGTTAAGTTTAAATATAAGGGAATAATATATTTGGAAT
AAATACTGAGTTAGAAAAAATAGATCTCAATAATAGCAGCTCATCTAAGCATACTTCTAA
CTCAATAACATCAAGGTCACATAAAAATTAGTCAAATATCTCTGATGATTTTTTGTAGGA
TTCAAAATAAGAAAGTGTAAACAACAACAGTATGATTGTTAGCAGTAGCAATAATAGCAG
CAGGGTTTTTAAAGGATCAAGCAACAATAGCTTTATCCTAAATTAATGTACTTAAAAAGC
AGCTGCATAAAATCCTTTAAACGAATTTATTCAATCCAAGGAAGAAATCAAAGAAAGCAT
AAGTAGATCTAAATATTGCGCAAAGCCTAGAGATGCTCATGTAAATTTTAAAAAATAGAT
TTCGACTTGAATTTGCTTTGTTGGTTATAAATGAAACCATTTTTATTTTGCAATTTGATT
TCTTTACAAATATATCTATCTCTCTATCAATCTAAGCTTTAAAAAATAGGAACAAATTTT
CTTTTTATTAAATTGATTAATTTAATTTTTTTGTTAAGTTCTAAATAAGATTTTTAAACA
AACATGCAAAACACTTATAGATAAATAGAATAGATATACATAAATACATATATTTATGCA
TGAATGCATACTTACCTATTATGATATTTTTTTTTAAATATTTATAAAATTTAAATAGAT
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TCTAACTCTAGATGACAAGTTAATTGCTCCTCCTTCAATTTAAGTAATATAAAAACCTAG
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TAATTTTGAATTCATTTTGAATATTTTTGTTTATATTAATCTACTATTTTTAAAAGACTC
AGTCTTCCAAAAGGTTTCATCTGAAGATGAAAAAGTAAATTCTAACTAATTGGAAAACAA
GCAAACATCTCAGGAAAATTTAAGCACAAATCCTCTTTCTTTTATCAACCCTTCCTAGGT
CTATGACTTTTAGAATAAGAGTAATCCCCTATAATATGCATTCAATTATTTTTAAATTTT
TTTTCAACTCTTTCAATTTTTAGGATAGAAAAGAAGCAAATAAATAAGCTAAGAAATAAA
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TGTATTAATTATTTATTAAAGACAATGAAGAAGATAATCAAAACGAGCAAGACTACTAAC
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CTTTATAATTTACTGATTACTCTCAATAGTAAGGGTAGTCTCCTTACATCTTATACGAAT
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ACCATAATTCTAATTAGAAGAATTACAATAATAACAAACATGAATATGTTCAAAAGCAAT
GA