Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00658770Standard Name
RRM42 (RNA recognition motif-containing protein 42)Aliases
PreTt02162 | 97.m00148 | 3724.m00055Description
RRM42 polypyrimidine tract-binding proteinGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.3%
TetraMine Data
TTHERM_00658770
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_16215.1 9.997093137033517e-262 polypyrimidine tract binding p
rotein (1174 aa)
WormBase WBGene00004207 0.000000009996807949091551 locus:ptb-1 status:Confirmed
UniProt:Q18999 protein_id
:CAA85411.3
DictyBase DDB_G0274995 0.000009999254677478949 DDB_G0274995 on chromosome: 2
position 4844842 to 4848156
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00658770(coding)
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TAAATAATAAAAAAGTAGGAATAGCAACAAGACTCTAGTTCTTAATCTGATTATTAGTAT
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CCATAAAAGGTCTAAATAATGAGTAGTAGCTTGATATAATAAGATCAAAATTAATACATA
CCTTAGTAAATGGCCCCAATAGTAGTTACTAACTCTGGAATGCAAACTATTTAGCCTTAA
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CATCCAAAAATCAATATGACAGGATCAGTTTAAATGTAATCGGGAAATTTAATTTAAATG
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AAGTCTGAAATGACTAGCAGTTTGCAATATCCCATTAATTAAATATCTAGCTATCACTAA
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TAAGAATCTATTTTTGCATTAAATAAAAATGATAATAACCCAAAAAATGAATCAGTAGAA
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GGATTTAATGATCAAAAGACAAGTATTGGTTAAGAAAATTTATAAAATAATCAACAATTG
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AGTATTTAACCATAATCCACCATGCAAAGATCTCATAGCAATAGTTCAGATGGGAATTAA
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GGATAGTAGAATTAAAGCGCAAATATTATTGGAAATTAATTAATGAGCTCATCTTAAGGC
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AATTAATCTCTCATGAACCAAGGATAAGTATAAATGCTACAGCAGTAAGCTAATTCTGGA
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TAGTATGGATACAATATGAGATAAAATAGGTAAAGAATGCAATAAAATAGTAACCCAGCT
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TCTGGTTAGGTTAATTTACAATAATTTGATGGCTAAAATATTTCGTATAGCATGTAAATT
AAACCAAATTTCCATAGTATGAGTACAAATATTTCAGGTATGAGAATGGAAGAAAATATG
GGAACTTTCAATGGGTCTACCTACATAAAGTAAGGATTTTTGGAAGACAGCAAACCTTCT
TTAGTCATTTATGTTAACCATTTAATGAATAAAGATATTACTGTTACTCACCTCTACAAT
ATCTTTAGCAATTTTGGTGACATAGTTAAAATTATATTGAAAAGAAATAAATGTACAGCT
TTCATTGAGTATACGATGTAAGAGAACGCTACAAAAGCAAAGGAATTTATGGATAAAAAA
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GATGACAAATTCCAAGAATAATTTATAGGAAGCGAATAAACTAACCGTTTCTAAAAAGAT
AGCAAAATGACTTTAAACCCTCCTTCTCTAGTTCTTCATATTTCAAGTCTCAAATAAGAA
ATTTGTGATCACGAGAAAATACATGAATTGTTCCGTCCTTATGGCAAAATTGAAGCAATC
CATATTGAAAAAGTTCCTCCTAGATACATGAGCCATATAAAATTTTCTTCGTTGAAGGAG
TCTTTAATGGCTATAGCTCATATGCACAACAAAGAAATCAAAGGAAGAAAGATGCTTATT
TCATTTACTAGAAAAAAACTAGACACAACAACTAAAAATGTAGTAACTTACTCTAAAAAT
ATTCAATTCAACAATTGA>TTHERM_00658770(protein)
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IQFNN>TTHERM_00658770(gene)
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GAGCAGGGGAAAATCTAAAATACCAATTAAATGATCAATTAAGAGTAAAATCATACTAAC
TTAAACAATAATTTGGATGAAAATTGTGAGTCACCAAGCGATACTACTCATAGTAACTCG
AACATAGTAAATGGTAATTTTAATTATTCGTCTTCTTCATCATCGTGCTCATATAAAAAT
CAAAATCAAGAAAAATAAAATCTTTAAGCTTATCTTATGTTTGACTCGGGAAATTCATCT
CAACCTCAAAATGAGTGCTCTAAGGAAATAGATGGTTTGATTGCCTCTGAAAAAAAGGAA
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ATAATAAAAAAGTAGGAATAGCAACAAGACTCTAGTTCTTAATCTGATTATTAGTATTTA
TATTATGTAAGTAGCAATAATAATGGCAATAGCAACAATGATAGCAGCAAAAACTAAATG
AATAATGATAACAATTCTGGCGGCAATAACAATACCAACAAACATTTTGGAATCAGTAAT
AATAATATTAGCCCTTAGAATGATTCAAGTTCTAAGATTGATTAATTGTCAAAAGGGATT
AGACCTTCTAAAGTTCTTTTAGTTATGGTATAAAATCCACAGGATGAAGTCATAGAACAT
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AAGAAGCAACCATGGAAATTGTTTGTGGATATGAATTCAATAGAAGTTGCTATAAAGGCT
AAAAATGCGCTTGAAAACTCTTCAATATGTGTCAATAATTTAGAACTTAAAATGAAGGTT
TAATTTTCGAGCCAATAAAATCTTGTTCTTAAGAATGGTAATGGAGGAATAAACTATAAA
GATTTAAACAAGAAATTTGAGAAAACTTAGCTCTCTTACAGCATTAAAATTGATCCAACC
TCTTCATAAAGCTAAAACTTATATTAATCAGCTCAAATTATGGATATGAACAGGCGCCAT
ATTGCATCTTAATTTGTTTCTGCGCAGAGTATGTAGTTACCAAATCCCTAGTTACAAATG
CTTAAAGTTACTGACCCTTCAGCTGTTTAGTCTATGACCTTTTAAGTTGGGGTTCCTCCA
TAAAAGGTCTAAATAATGAGTAGTAGCTTGATATAATAAGATCAAAATTAATACATACCT
TAGTAAATGGCCCCAATAGTAGTTACTAACTCTGGAATGCAAACTATTTAGCCTTAAGTT
CCTATCTATTAAACAGGTAGAGATTCTCCACAAATGATGCAAAATTCAGGTTTAGCTCAT
CCAAAGTAGTAGAATTATTTATAAAATTATTTGATTTTTAATAATTTAAACTAAAAATAG
ATTTTTATATTATTTTATTTCAAGGTAAGTTTGATAAATTTAAAGTATTTCTTTCTTACC
TCAAAATATTTCAGTTTTTTTATAAAATAAAATTAAATTAAAAATACAAAAAAATAAAAA
ATTAAATTATCAAATCATATCTTAAGCAAGGTTTGTAATTTTAACTGCATAGGATGAGAT
AGATAGAATTCAATATTTTCTTCTTTATCATATAAATATGATCTGTTTATTTATCTTTCT
TAAGCTCAAGGCAGGCAATATATATATTCTTAAATACCATCAATAGAAGTTTTCTTATTT
ATTAATAATAAATAGTTAAAACTTTATTAAACTTATTTAAATCAAACAAACTTGCATTTT
AAAATAACTTATAAAAATATGATTAAAAAATTACTATTTTAATTAAATTGATTTTTTAAT
TTATTTATAAACAGAATCAATATGACAGGATCAGTTTAAATGTAATCGGGAAATTTAATT
TAAATGGCACCTTATAATTAATACGAGTAGCTTTAATAACCTTTAATGACTTATAGCTTT
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TAGAATTAGTTATTCTAATCTTAACATTATATTGGCTAGCATTTAAATAATTAGTATTAA
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TTTAAAGGATTTAATGATCAAAAGACAAGTATTGGTTAAGAAAATTTATAAAATAATCAA
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AGTGCAGGATAGTAGAATTAAAGCGCAAATATTATTGGAAATTAATTAATGAGCTCATCT
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AATTAAAATTAATCTCTCATGAACCAAGGATAAGTATAAATGCTACAGCAGTAAGCTAAT
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CCAAATTAGTATGGATACAATATGAGATAAAATAGGTAAAGAATGCAATAAAATAGTAAC
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TAACAATCTGGTTAGGTTAATTTACAATAATTTGATGGCTAAAATATTTCGTATAGCATG
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AATATGGGAACTTTCAATGGGTCTACCTACATAAAGTAAGGATTTTTGGAAGACAGCAAA
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