Login
Recent Activity
Recent Papers
Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00658770Standard Name
RRM42 (RNA recognition motif-containing protein 42)Aliases
PreTt02162 | 97.m00148 | 3724.m00055Description
RNA recognition motif-containing proteinGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
- Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.3%
TetraMine Data
TTHERM_00658770
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_16215.1 9.997093137033517e-262 polypyrimidine tract binding p
rotein (1174 aa)
WormBase WBGene00004207 0.000000009996807949091551 locus:ptb-1 status:Confirmed
UniProt:Q18999 protein_id
:CAA85411.3
DictyBase DDB_G0274995 0.000009999254677478949 DDB_G0274995 on chromosome: 2
position 4844842 to 4848156
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00658770(coding)
ATGAATCCATCAAATGACACTACCAAAGGGTAACCATTTTACATAGAAAAAGAAGATTAA
GAGCAGGGGAAAATCTAAAATACCAATTAAATGATCAATTAAGAGTAAAATCATACTAAC
TTAAACAATAATTTGGATGAAAATTGTGAGTCACCAAGCGATACTACTCATAGTAACTCG
AACATAGTAAATGAAAAATAAAATCTTTAAGCTTATCTTATGTTTGACTCGGGAAATTCA
TCTCAACCTCAAAATGAGTGCTCTAAGGAAATAGATGGTTTGATTGCCTCTGAAAAAAAG
GAAAAAAGTTTAAGTCAAGAAATTGAAAATAAGCAGCAAACTTAGTCTTAAACAGATCTT
TAAATAATAAAAAAGTAGGAATAGCAACAAGACTCTAGTTCTTAATCTGATTATTAGTAT
TTATATTATGTAAGTAGCAATAATAATGGCAATAGCAACAATGATAGCAGCAAAAACTAA
ATGAATAATGATAACAATTCTGGCGGCAATAACAATACCAACAAACATTTTGGAATCAGT
AATAATAATATTAGCCCTTAGAATGATTCAAGTTCTAAGATTGATTAATTGTCAAAAGGG
ATTAGACCTTCTAAAGTTCTTTTAGTTATGGTATAAAATCCACAGGATGAAGTCATAGAA
CATAGAATTATTTTTGAAAAGTTTTCATTTTTTGGAGAGGTAGAATAGATTCTTATATTT
AGTAAGAAGCAACCATGGAAATTGTTTGTGGATATGAATTCAATAGAAGTTGCTATAAAG
GCTAAAAATGCGCTTGAAAACTCTTCAATATGTGTCAATAATTTAGAACTTAAAATGAAG
GTTTAATTTTCGAGCCAATAAAATCTTGTTCTTAAGAATGGTAATGGAGGAATAAACTAT
AAAGATTTAAACAAGAAATTTGAGAAAACTTAGCTCTCTTACAGCATTAAAATTGATCCA
ACCTCTTCATAAAGCTAAAACTTATATTAATCAGCTCAAATTATGGATATGAACAGGCGC
CATATTGCATCTTAATTTGTTTCTGCGCAGAGTATGTAGTTACCAAATCCCTAGTTACAA
ATGCTTAAAGTTACTGACCCTTCAGCTGTTTAGTCTATGACCTTTTAAGTTGGGGTTCCT
CCATAAAAGGTCTAAATAATGAGTAGTAGCTTGATATAATAAGATCAAAATTAATACATA
CCTTAGTAAATGGCCCCAATAGTAGTTACTAACTCTGGAATGCAAACTATTTAGCCTTAA
GTTCCTATCTATTAAACAGGTAGAGATTCTCCACAAATGATGCAAAATTCAGGTTTAGCT
CATCCAAAAATCAATATGACAGGATCAGTTTAAATGTAATCGGGAAATTTAATTTAAATG
GCACCTTATAATTAATACGAGTAGCTTTAATAACCTTTAATGACTTATAGCTTTGGTGGA
AACCCTGTAATTCTTAAGGATGATTCTTTTTCAAATTAATAGGTTCAGCAGAATTAGAAT
TAGTTATTCTAATCTTAACATTATATTGGCTAGCATTTAAATAATTAGTATTAACAACCT
AAGTCTGAAATGACTAGCAGTTTGCAATATCCCATTAATTAAATATCTAGCTATCACTAA
ACAATAAATATGACTTAATCTATGAATATTCATAGCAATAGTATGACTTTCAGTAAACCC
TAAGAATCTATTTTTGCATTAAATAAAAATGATAATAACCCAAAAAATGAATCAGTAGAA
CAACTTGATGATATCTTAGAAAGAATCCAAAATAATCAGTTTGAAAACTCTGGCGAAATT
TCTAAAGAAGACCTTAAAGACTTAGAAGAGCAAAAATCAAATTCATTTGACGATTTTAAA
GGATTTAATGATCAAAAGACAAGTATTGGTTAAGAAAATTTATAAAATAATCAACAATTG
TTAAATAGCTCTGACAATAGGAATGGCATTAACTAATCTCCCTTTAGTCCTGAGTAAAAA
AGTATTTAACCATAATCCACCATGCAAAGATCTCATAGCAATAGTTCAGATGGGAATTAA
ATGACTGGCATCTAAAAATTAGATTAACTTATTGGATAGGCGTAAGGTTCAGATTAATCT
GATGGTGAATAATACCCACTATCAGACGATGAAGGACCTACTTTTCCTTTCTAAAAAACT
TAATAAAAATCTTAGCAATAATAACCTATTAGAGCAATATAGTAACTGGATACTCAGCTA
AAAACATAATATGGTAGTAATAATTAAGGAGCTTACTTTATAAATATGTAAGGCAGTGCA
GGATAGTAGAATTAAAGCGCAAATATTATTGGAAATTAATTAATGAGCTCATCTTAAGGC
AAGCCTATTCATGGTAGCTTAATGATGTAGCCATATATTTAAAATAATTAATTAAATTAA
AATTAATCTCTCATGAACCAAGGATAAGTATAAATGCTACAGCAGTAAGCTAATTCTGGA
GTTTAATTTGGTCAATTTTAAAACTAAAATGCTAATAACTCGTATTAGTAAATACCAAAT
TAGTATGGATACAATATGAGATAAAATAGGTAAAGAATGCAATAAAATAGTAACCCAGCT
TATGCCTAATCATGCATGTTAGTTAATTAGCAGTAATAATAAAATTTATAATTATAACAA
TCTGGTTAGGTTAATTTACAATAATTTGATGGCTAAAATATTTCGTATAGCATGTAAATT
AAACCAAATTTCCATAGTATGAGTACAAATATTTCAGGTATGAGAATGGAAGAAAATATG
GGAACTTTCAATGGGTCTACCTACATAAAGTAAGGATTTTTGGAAGACAGCAAACCTTCT
TTAGTCATTTATGTTAACCATTTAATGAATAAAGATATTACTGTTACTCACCTCTACAAT
ATCTTTAGCAATTTTGGTGACATAGTTAAAATTATATTGAAAAGAAATAAATGTACAGCT
TTCATTGAGTATACGATGTAAGAGAACGCTACAAAAGCAAAGGAATTTATGGATAAAAAA
ATCTTCTTTGATAATGAGATCAGAGTATTCTATTCTCACTTTGAAACTCTCTAAAAATAA
GATGACAAATTCCAAGAATAATTTATAGGAAGCGAATAAACTAACCGTTTCTAAAAAGAT
AGCAAAATGACTTTAAACCCTCCTTCTCTAGTTCTTCATATTTCAAGTCTCAAATAAGAA
ATTTGTGATCACGAGAAAATACATGAATTGTTCCGTCCTTATGGCAAAATTGAAGCAATC
CATATTGAAAAAGTTCCTCCTAGATACATGAGCCATATAAAATTTTCTTCGTTGAAGGAG
TCTTTAATGGCTATAGCTCATATGCACAACAAAGAAATCAAAGGAAGAAAGATGCTTATT
TCATTTACTAGAAAAAAACTAGACACAACAACTAAAAATGTAGTAACTTACTCTAAAAAT
ATTCAATTCAACAATTGA>TTHERM_00658770(protein)
MNPSNDTTKGQPFYIEKEDQEQGKIQNTNQMINQEQNHTNLNNNLDENCESPSDTTHSNS
NIVNEKQNLQAYLMFDSGNSSQPQNECSKEIDGLIASEKKEKSLSQEIENKQQTQSQTDL
QIIKKQEQQQDSSSQSDYQYLYYVSSNNNGNSNNDSSKNQMNNDNNSGGNNNTNKHFGIS
NNNISPQNDSSSKIDQLSKGIRPSKVLLVMVQNPQDEVIEHRIIFEKFSFFGEVEQILIF
SKKQPWKLFVDMNSIEVAIKAKNALENSSICVNNLELKMKVQFSSQQNLVLKNGNGGINY
KDLNKKFEKTQLSYSIKIDPTSSQSQNLYQSAQIMDMNRRHIASQFVSAQSMQLPNPQLQ
MLKVTDPSAVQSMTFQVGVPPQKVQIMSSSLIQQDQNQYIPQQMAPIVVTNSGMQTIQPQ
VPIYQTGRDSPQMMQNSGLAHPKINMTGSVQMQSGNLIQMAPYNQYEQLQQPLMTYSFGG
NPVILKDDSFSNQQVQQNQNQLFQSQHYIGQHLNNQYQQPKSEMTSSLQYPINQISSYHQ
TINMTQSMNIHSNSMTFSKPQESIFALNKNDNNPKNESVEQLDDILERIQNNQFENSGEI
SKEDLKDLEEQKSNSFDDFKGFNDQKTSIGQENLQNNQQLLNSSDNRNGINQSPFSPEQK
SIQPQSTMQRSHSNSSDGNQMTGIQKLDQLIGQAQGSDQSDGEQYPLSDDEGPTFPFQKT
QQKSQQQQPIRAIQQLDTQLKTQYGSNNQGAYFINMQGSAGQQNQSANIIGNQLMSSSQG
KPIHGSLMMQPYIQNNQLNQNQSLMNQGQVQMLQQQANSGVQFGQFQNQNANNSYQQIPN
QYGYNMRQNRQRMQQNSNPAYAQSCMLVNQQQQQNLQLQQSGQVNLQQFDGQNISYSMQI
KPNFHSMSTNISGMRMEENMGTFNGSTYIKQGFLEDSKPSLVIYVNHLMNKDITVTHLYN
IFSNFGDIVKIILKRNKCTAFIEYTMQENATKAKEFMDKKIFFDNEIRVFYSHFETLQKQ
DDKFQEQFIGSEQTNRFQKDSKMTLNPPSLVLHISSLKQEICDHEKIHELFRPYGKIEAI
HIEKVPPRYMSHIKFSSLKESLMAIAHMHNKEIKGRKMLISFTRKKLDTTTKNVVTYSKN
IQFNN>TTHERM_00658770(gene)
AACATTGATATATTTTTTTATAAATTATCTAGTACTTTATTCAAAGAATTAACATATATA
TATAAGAAAGCTAGTTAGCCTTAAATCAATCAATATTTTGCTGCCATAAAAAAATTAAGA
AATTAACAAATTGAGATATCATTTTCTGCAAAGCAAACAAAAAGAATGAATCCATCAAAT
GACACTACCAAAGGGTAACCATTTTACATAGAAAAAGAAGATTAAGAGCAGGGGAAAATC
TAAAATACCAATTAAATGATCAATTAAGAGTAAAATCATACTAACTTAAACAATAATTTG
GATGAAAATTGTGAGTCACCAAGCGATACTACTCATAGTAACTCGAACATAGTAAATGGT
AATTTTAATTATTCGTCTTCTTCATCATCGTGCTCATATAAAAATCAAAATCAAGAAAAA
TAAAATCTTTAAGCTTATCTTATGTTTGACTCGGGAAATTCATCTCAACCTCAAAATGAG
TGCTCTAAGGAAATAGATGGTTTGATTGCCTCTGAAAAAAAGGAAAAAAGTTTAAGTCAA
GAAATTGAAAATAAGCAGCAAACTTAGTCTTAAACAGATCTTTAAATAATAAAAAAGTAG
GAATAGCAACAAGACTCTAGTTCTTAATCTGATTATTAGTATTTATATTATGTAAGTAGC
AATAATAATGGCAATAGCAACAATGATAGCAGCAAAAACTAAATGAATAATGATAACAAT
TCTGGCGGCAATAACAATACCAACAAACATTTTGGAATCAGTAATAATAATATTAGCCCT
TAGAATGATTCAAGTTCTAAGATTGATTAATTGTCAAAAGGGATTAGACCTTCTAAAGTT
CTTTTAGTTATGGTATAAAATCCACAGGATGAAGTCATAGAACATAGAATTATTTTTGAA
AAGTTTTCATTTTTTGGAGAGGTAGAATAGATTCTTATATTTAGTAAGAAGCAACCATGG
AAATTGTTTGTGGATATGAATTCAATAGAAGTTGCTATAAAGGCTAAAAATGCGCTTGAA
AACTCTTCAATATGTGTCAATAATTTAGAACTTAAAATGAAGGTTTAATTTTCGAGCCAA
TAAAATCTTGTTCTTAAGAATGGTAATGGAGGAATAAACTATAAAGATTTAAACAAGAAA
TTTGAGAAAACTTAGCTCTCTTACAGCATTAAAATTGATCCAACCTCTTCATAAAGCTAA
AACTTATATTAATCAGCTCAAATTATGGATATGAACAGGCGCCATATTGCATCTTAATTT
GTTTCTGCGCAGAGTATGTAGTTACCAAATCCCTAGTTACAAATGCTTAAAGTTACTGAC
CCTTCAGCTGTTTAGTCTATGACCTTTTAAGTTGGGGTTCCTCCATAAAAGGTCTAAATA
ATGAGTAGTAGCTTGATATAATAAGATCAAAATTAATACATACCTTAGTAAATGGCCCCA
ATAGTAGTTACTAACTCTGGAATGCAAACTATTTAGCCTTAAGTTCCTATCTATTAAACA
GGTAGAGATTCTCCACAAATGATGCAAAATTCAGGTTTAGCTCATCCAAAGTAGTAGAAT
TATTTATAAAATTATTTGATTTTTAATAATTTAAACTAAAAATAGATTTTTATATTATTT
TATTTCAAGGTAAGTTTGATAAATTTAAAGTATTTCTTTCTTACCTCAAAATATTTCAGT
TTTTTTATAAAATAAAATTAAATTAAAAATACAAAAAAATAAAAAATTAAATTATCAAAT
CATATCTTAAGCAAGGTTTGTAATTTTAACTGCATAGGATGAGATAGATAGAATTCAATA
TTTTCTTCTTTATCATATAAATATGATCTGTTTATTTATCTTTCTTAAGCTCAAGGCAGG
CAATATATATATTCTTAAATACCATCAATAGAAGTTTTCTTATTTATTAATAATAAATAG
TTAAAACTTTATTAAACTTATTTAAATCAAACAAACTTGCATTTTAAAATAACTTATAAA
AATATGATTAAAAAATTACTATTTTAATTAAATTGATTTTTTAATTTATTTATAAACAGA
ATCAATATGACAGGATCAGTTTAAATGTAATCGGGAAATTTAATTTAAATGGCACCTTAT
AATTAATACGAGTAGCTTTAATAACCTTTAATGACTTATAGCTTTGGTGGAAACCCTGTA
ATTCTTAAGGATGATTCTTTTTCAAATTAATAGGTTCAGCAGAATTAGAATTAGTTATTC
TAATCTTAACATTATATTGGCTAGCATTTAAATAATTAGTATTAACAACCTAAGTCTGAA
ATGACTAGCAGTTTGCAATATCCCATTAATTAAATATCTAGCTATCACTAAACAATAAAT
ATGACTTAATCTATGAATATTCATAGCAATAGTATGACTTTCAGTAAACCCTAAGAATCT
ATTTTTGCATTAAATAAAAATGATAATAACCCAAAAAATGAATCAGTAGAACAACTTGAT
GATATCTTAGAAAGAATCCAAAATAATCAGTTTGAAAACTCTGGCGAAATTTCTAAAGAA
GACCTTAAAGACTTAGAAGAGCAAAAATCAAATTCATTTGACGATTTTAAAGGATTTAAT
GATCAAAAGACAAGTATTGGTTAAGAAAATTTATAAAATAATCAACAATTGTTAAATAGC
TCTGACAATAGGAATGGCATTAACTAATCTCCCTTTAGTCCTGAGTAAAAAAGTATTTAA
CCATAATCCACCATGCAAAGATCTCATAGCAATAGTTCAGATGGGAATTAAATGACTGGC
ATCTAAAAATTAGATTAACTTATTGGATAGGCGTAAGGTTCAGATTAATCTGATGGTGAA
TAATACCCACTATCAGACGATGAAGGACCTACTTTTCCTTTCTAAAAAACTTAATAAAAA
TCTTAGCAATAATAACCTATTAGAGCAATATAGTAACTGGATACTCAGCTAAAAACATAA
TATGGTAGTAATAATTAAGGAGCTTACTTTATAAATATGTAAGGCAGTGCAGGATAGTAG
AATTAAAGCGCAAATATTATTGGAAATTAATTAATGAGCTCATCTTAAGGCAAGCCTATT
CATGGTAGCTTAATGATGTAGCCATATATTTAAAATAATTAATTAAATTAAAATTAATCT
CTCATGAACCAAGGATAAGTATAAATGCTACAGCAGTAAGCTAATTCTGGAGTTTAATTT
GGTCAATTTTAAAACTAAAATGCTAATAACTCGTATTAGTAAATACCAAATTAGTATGGA
TACAATATGAGATAAAATAGGTAAAGAATGCAATAAAATAGTAACCCAGCTTATGCCTAA
TCATGCATGTTAGTTAATTAGCAGTAATAATAAAATTTATAATTATAACAATCTGGTTAG
GTTAATTTACAATAATTTGATGGCTAAAATATTTCGTATAGCATGTAAATTAAACCAAAT
TTCCATAGTATGAGTACAAATATTTCAGGTATGAGAATGGAAGAAAATATGGGAACTTTC
AATGGGTCTACCTACATAAAGTAAGGATTTTTGGAAGACAGCAAACCTTCTTTAGTCATT
TATGTTAACCATTTAATGAATAAAGATATTACTGTTACTCACCTCTACAATATCTTTAGC
AATTTTGGTGACATAGTTAAAATTATATTGAAAAGAAATAAATGTACAGCTTTCATTGAG
TATACGATGTAAGAGAACGCTACAAAAGCAAAGGAATTTATGGATAAAAAAATCTTCTTT
GATAATGAGATCAGAGTATTCTATTCTCACTTTGAAACTCTCTAAAAATAAGATGACAAA
TTCCAAGAATAATTTATAGGAAGCGAATAAACTAACCGTTTCTAAAAAGATAGCAAAATG
ACTTTAAACCCTCCTTCTCTAGTTCTTCATATTTCAAGTCTCAAATAAGAAATTTGTGAT
CACGAGAAAATACATGAATTGTTCCGTCCTTATGGCAAAATTGAAGCAATCCATATTGAA
AAAGTTCCTCCTAGATACATGAGCCATATAAAATTTTCTTCGTTGAAGGAGTCTTTAATG
GCTATAGCTCATATGCACAACAAAGAAATCAAAGGAAGAAAGATGCTTATTTCATTTACT
AGAAAAAAACTAGACACAACAACTAAAAATGTAGTAACTTACTCTAAAAATATTCAATTC
AACAATTGA
