Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00658770

Standard Name

RRM42 (RNA recognition motif-containing protein 42)

Aliases

PreTt02162 | 97.m00148 | 3724.m00055

Description

RNA recognition motif-containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF04394 ) Protein of unknown function, DUF536
  • ( TIGR01659 ) sex-lethal family splicing factor
  • ( TIGR01649 ) hnRNP-L/PTB/hephaestus splicing factor family
  • ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

TetraMine Data

TTHERM_00658770

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_16215.19.997093137033517e-262polypyrimidine tract binding p
rotein (1174 aa)
WormBaseWBGene000042070.000000009996807949091551locus:ptb-1 status:Confirmed
UniProt:Q18999 protein_id
:CAA85411.3
DictyBaseDDB_G02749950.000009999254677478949DDB_G0274995 on chromosome: 2
position 4844842 to 4848156

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00658770(coding)
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GAGCAGGGGAAAATCTAAAATACCAATTAAATGATCAATTAAGAGTAAAATCATACTAAC
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GAAAAAAGTTTAAGTCAAGAAATTGAAAATAAGCAGCAAACTTAGTCTTAAACAGATCTT
TAAATAATAAAAAAGTAGGAATAGCAACAAGACTCTAGTTCTTAATCTGATTATTAGTAT
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ATGAATAATGATAACAATTCTGGCGGCAATAACAATACCAACAAACATTTTGGAATCAGT
AATAATAATATTAGCCCTTAGAATGATTCAAGTTCTAAGATTGATTAATTGTCAAAAGGG
ATTAGACCTTCTAAAGTTCTTTTAGTTATGGTATAAAATCCACAGGATGAAGTCATAGAA
CATAGAATTATTTTTGAAAAGTTTTCATTTTTTGGAGAGGTAGAATAGATTCTTATATTT
AGTAAGAAGCAACCATGGAAATTGTTTGTGGATATGAATTCAATAGAAGTTGCTATAAAG
GCTAAAAATGCGCTTGAAAACTCTTCAATATGTGTCAATAATTTAGAACTTAAAATGAAG
GTTTAATTTTCGAGCCAATAAAATCTTGTTCTTAAGAATGGTAATGGAGGAATAAACTAT
AAAGATTTAAACAAGAAATTTGAGAAAACTTAGCTCTCTTACAGCATTAAAATTGATCCA
ACCTCTTCATAAAGCTAAAACTTATATTAATCAGCTCAAATTATGGATATGAACAGGCGC
CATATTGCATCTTAATTTGTTTCTGCGCAGAGTATGTAGTTACCAAATCCCTAGTTACAA
ATGCTTAAAGTTACTGACCCTTCAGCTGTTTAGTCTATGACCTTTTAAGTTGGGGTTCCT
CCATAAAAGGTCTAAATAATGAGTAGTAGCTTGATATAATAAGATCAAAATTAATACATA
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GTTCCTATCTATTAAACAGGTAGAGATTCTCCACAAATGATGCAAAATTCAGGTTTAGCT
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AAGTCTGAAATGACTAGCAGTTTGCAATATCCCATTAATTAAATATCTAGCTATCACTAA
ACAATAAATATGACTTAATCTATGAATATTCATAGCAATAGTATGACTTTCAGTAAACCC
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TCTAAAGAAGACCTTAAAGACTTAGAAGAGCAAAAATCAAATTCATTTGACGATTTTAAA
GGATTTAATGATCAAAAGACAAGTATTGGTTAAGAAAATTTATAAAATAATCAACAATTG
TTAAATAGCTCTGACAATAGGAATGGCATTAACTAATCTCCCTTTAGTCCTGAGTAAAAA
AGTATTTAACCATAATCCACCATGCAAAGATCTCATAGCAATAGTTCAGATGGGAATTAA
ATGACTGGCATCTAAAAATTAGATTAACTTATTGGATAGGCGTAAGGTTCAGATTAATCT
GATGGTGAATAATACCCACTATCAGACGATGAAGGACCTACTTTTCCTTTCTAAAAAACT
TAATAAAAATCTTAGCAATAATAACCTATTAGAGCAATATAGTAACTGGATACTCAGCTA
AAAACATAATATGGTAGTAATAATTAAGGAGCTTACTTTATAAATATGTAAGGCAGTGCA
GGATAGTAGAATTAAAGCGCAAATATTATTGGAAATTAATTAATGAGCTCATCTTAAGGC
AAGCCTATTCATGGTAGCTTAATGATGTAGCCATATATTTAAAATAATTAATTAAATTAA
AATTAATCTCTCATGAACCAAGGATAAGTATAAATGCTACAGCAGTAAGCTAATTCTGGA
GTTTAATTTGGTCAATTTTAAAACTAAAATGCTAATAACTCGTATTAGTAAATACCAAAT
TAGTATGGATACAATATGAGATAAAATAGGTAAAGAATGCAATAAAATAGTAACCCAGCT
TATGCCTAATCATGCATGTTAGTTAATTAGCAGTAATAATAAAATTTATAATTATAACAA
TCTGGTTAGGTTAATTTACAATAATTTGATGGCTAAAATATTTCGTATAGCATGTAAATT
AAACCAAATTTCCATAGTATGAGTACAAATATTTCAGGTATGAGAATGGAAGAAAATATG
GGAACTTTCAATGGGTCTACCTACATAAAGTAAGGATTTTTGGAAGACAGCAAACCTTCT
TTAGTCATTTATGTTAACCATTTAATGAATAAAGATATTACTGTTACTCACCTCTACAAT
ATCTTTAGCAATTTTGGTGACATAGTTAAAATTATATTGAAAAGAAATAAATGTACAGCT
TTCATTGAGTATACGATGTAAGAGAACGCTACAAAAGCAAAGGAATTTATGGATAAAAAA
ATCTTCTTTGATAATGAGATCAGAGTATTCTATTCTCACTTTGAAACTCTCTAAAAATAA
GATGACAAATTCCAAGAATAATTTATAGGAAGCGAATAAACTAACCGTTTCTAAAAAGAT
AGCAAAATGACTTTAAACCCTCCTTCTCTAGTTCTTCATATTTCAAGTCTCAAATAAGAA
ATTTGTGATCACGAGAAAATACATGAATTGTTCCGTCCTTATGGCAAAATTGAAGCAATC
CATATTGAAAAAGTTCCTCCTAGATACATGAGCCATATAAAATTTTCTTCGTTGAAGGAG
TCTTTAATGGCTATAGCTCATATGCACAACAAAGAAATCAAAGGAAGAAAGATGCTTATT
TCATTTACTAGAAAAAAACTAGACACAACAACTAAAAATGTAGTAACTTACTCTAAAAAT
ATTCAATTCAACAATTGA


>TTHERM_00658770(protein)
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NIVNEKQNLQAYLMFDSGNSSQPQNECSKEIDGLIASEKKEKSLSQEIENKQQTQSQTDL
QIIKKQEQQQDSSSQSDYQYLYYVSSNNNGNSNNDSSKNQMNNDNNSGGNNNTNKHFGIS
NNNISPQNDSSSKIDQLSKGIRPSKVLLVMVQNPQDEVIEHRIIFEKFSFFGEVEQILIF
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KPNFHSMSTNISGMRMEENMGTFNGSTYIKQGFLEDSKPSLVIYVNHLMNKDITVTHLYN
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IQFNN


>TTHERM_00658770(gene)
AACATTGATATATTTTTTTATAAATTATCTAGTACTTTATTCAAAGAATTAACATATATA
TATAAGAAAGCTAGTTAGCCTTAAATCAATCAATATTTTGCTGCCATAAAAAAATTAAGA
AATTAACAAATTGAGATATCATTTTCTGCAAAGCAAACAAAAAGAATGAATCCATCAAAT
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TAAAATACCAATTAAATGATCAATTAAGAGTAAAATCATACTAACTTAAACAATAATTTG
GATGAAAATTGTGAGTCACCAAGCGATACTACTCATAGTAACTCGAACATAGTAAATGGT
AATTTTAATTATTCGTCTTCTTCATCATCGTGCTCATATAAAAATCAAAATCAAGAAAAA
TAAAATCTTTAAGCTTATCTTATGTTTGACTCGGGAAATTCATCTCAACCTCAAAATGAG
TGCTCTAAGGAAATAGATGGTTTGATTGCCTCTGAAAAAAAGGAAAAAAGTTTAAGTCAA
GAAATTGAAAATAAGCAGCAAACTTAGTCTTAAACAGATCTTTAAATAATAAAAAAGTAG
GAATAGCAACAAGACTCTAGTTCTTAATCTGATTATTAGTATTTATATTATGTAAGTAGC
AATAATAATGGCAATAGCAACAATGATAGCAGCAAAAACTAAATGAATAATGATAACAAT
TCTGGCGGCAATAACAATACCAACAAACATTTTGGAATCAGTAATAATAATATTAGCCCT
TAGAATGATTCAAGTTCTAAGATTGATTAATTGTCAAAAGGGATTAGACCTTCTAAAGTT
CTTTTAGTTATGGTATAAAATCCACAGGATGAAGTCATAGAACATAGAATTATTTTTGAA
AAGTTTTCATTTTTTGGAGAGGTAGAATAGATTCTTATATTTAGTAAGAAGCAACCATGG
AAATTGTTTGTGGATATGAATTCAATAGAAGTTGCTATAAAGGCTAAAAATGCGCTTGAA
AACTCTTCAATATGTGTCAATAATTTAGAACTTAAAATGAAGGTTTAATTTTCGAGCCAA
TAAAATCTTGTTCTTAAGAATGGTAATGGAGGAATAAACTATAAAGATTTAAACAAGAAA
TTTGAGAAAACTTAGCTCTCTTACAGCATTAAAATTGATCCAACCTCTTCATAAAGCTAA
AACTTATATTAATCAGCTCAAATTATGGATATGAACAGGCGCCATATTGCATCTTAATTT
GTTTCTGCGCAGAGTATGTAGTTACCAAATCCCTAGTTACAAATGCTTAAAGTTACTGAC
CCTTCAGCTGTTTAGTCTATGACCTTTTAAGTTGGGGTTCCTCCATAAAAGGTCTAAATA
ATGAGTAGTAGCTTGATATAATAAGATCAAAATTAATACATACCTTAGTAAATGGCCCCA
ATAGTAGTTACTAACTCTGGAATGCAAACTATTTAGCCTTAAGTTCCTATCTATTAAACA
GGTAGAGATTCTCCACAAATGATGCAAAATTCAGGTTTAGCTCATCCAAAGTAGTAGAAT
TATTTATAAAATTATTTGATTTTTAATAATTTAAACTAAAAATAGATTTTTATATTATTT
TATTTCAAGGTAAGTTTGATAAATTTAAAGTATTTCTTTCTTACCTCAAAATATTTCAGT
TTTTTTATAAAATAAAATTAAATTAAAAATACAAAAAAATAAAAAATTAAATTATCAAAT
CATATCTTAAGCAAGGTTTGTAATTTTAACTGCATAGGATGAGATAGATAGAATTCAATA
TTTTCTTCTTTATCATATAAATATGATCTGTTTATTTATCTTTCTTAAGCTCAAGGCAGG
CAATATATATATTCTTAAATACCATCAATAGAAGTTTTCTTATTTATTAATAATAAATAG
TTAAAACTTTATTAAACTTATTTAAATCAAACAAACTTGCATTTTAAAATAACTTATAAA
AATATGATTAAAAAATTACTATTTTAATTAAATTGATTTTTTAATTTATTTATAAACAGA
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AATTAATACGAGTAGCTTTAATAACCTTTAATGACTTATAGCTTTGGTGGAAACCCTGTA
ATTCTTAAGGATGATTCTTTTTCAAATTAATAGGTTCAGCAGAATTAGAATTAGTTATTC
TAATCTTAACATTATATTGGCTAGCATTTAAATAATTAGTATTAACAACCTAAGTCTGAA
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ATGACTTAATCTATGAATATTCATAGCAATAGTATGACTTTCAGTAAACCCTAAGAATCT
ATTTTTGCATTAAATAAAAATGATAATAACCCAAAAAATGAATCAGTAGAACAACTTGAT
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GACCTTAAAGACTTAGAAGAGCAAAAATCAAATTCATTTGACGATTTTAAAGGATTTAAT
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CCATAATCCACCATGCAAAGATCTCATAGCAATAGTTCAGATGGGAATTAAATGACTGGC
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TAATACCCACTATCAGACGATGAAGGACCTACTTTTCCTTTCTAAAAAACTTAATAAAAA
TCTTAGCAATAATAACCTATTAGAGCAATATAGTAACTGGATACTCAGCTAAAAACATAA
TATGGTAGTAATAATTAAGGAGCTTACTTTATAAATATGTAAGGCAGTGCAGGATAGTAG
AATTAAAGCGCAAATATTATTGGAAATTAATTAATGAGCTCATCTTAAGGCAAGCCTATT
CATGGTAGCTTAATGATGTAGCCATATATTTAAAATAATTAATTAAATTAAAATTAATCT
CTCATGAACCAAGGATAAGTATAAATGCTACAGCAGTAAGCTAATTCTGGAGTTTAATTT
GGTCAATTTTAAAACTAAAATGCTAATAACTCGTATTAGTAAATACCAAATTAGTATGGA
TACAATATGAGATAAAATAGGTAAAGAATGCAATAAAATAGTAACCCAGCTTATGCCTAA
TCATGCATGTTAGTTAATTAGCAGTAATAATAAAATTTATAATTATAACAATCTGGTTAG
GTTAATTTACAATAATTTGATGGCTAAAATATTTCGTATAGCATGTAAATTAAACCAAAT
TTCCATAGTATGAGTACAAATATTTCAGGTATGAGAATGGAAGAAAATATGGGAACTTTC
AATGGGTCTACCTACATAAAGTAAGGATTTTTGGAAGACAGCAAACCTTCTTTAGTCATT
TATGTTAACCATTTAATGAATAAAGATATTACTGTTACTCACCTCTACAATATCTTTAGC
AATTTTGGTGACATAGTTAAAATTATATTGAAAAGAAATAAATGTACAGCTTTCATTGAG
TATACGATGTAAGAGAACGCTACAAAAGCAAAGGAATTTATGGATAAAAAAATCTTCTTT
GATAATGAGATCAGAGTATTCTATTCTCACTTTGAAACTCTCTAAAAATAAGATGACAAA
TTCCAAGAATAATTTATAGGAAGCGAATAAACTAACCGTTTCTAAAAAGATAGCAAAATG
ACTTTAAACCCTCCTTCTCTAGTTCTTCATATTTCAAGTCTCAAATAAGAAATTTGTGAT
CACGAGAAAATACATGAATTGTTCCGTCCTTATGGCAAAATTGAAGCAATCCATATTGAA
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GCTATAGCTCATATGCACAACAAAGAAATCAAAGGAAGAAAGATGCTTATTTCATTTACT
AGAAAAAAACTAGACACAACAACTAAAAATGTAGTAACTTACTCTAAAAATATTCAATTC
AACAATTGA