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Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00658770Standard Name
RRM42 (RNA recognition motif-containing protein 42)Aliases
PreTt02162 | 97.m00148 | 3724.m00055Description
RRM42 polypyrimidine tract-binding proteinGenome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
- Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.3%
TetraMine Data
TTHERM_00658770
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_16215.1 9.997093137033517e-262 polypyrimidine tract binding p
rotein (1174 aa)
WormBase WBGene00004207 0.000000009996807949091551 locus:ptb-1 status:Confirmed
UniProt:Q18999 protein_id
:CAA85411.3
DictyBase DDB_G0274995 0.000009999254677478949 DDB_G0274995 on chromosome: 2
position 4844842 to 4848156
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00658770(coding)
ATGAATCCATCAAATGACACTACCAAAGGGTAACCATTTTACATAGAAAAAGAAGATTAA
GAGCAGGGGAAAATCTAAAATACCAATTAAATGATCAATTAAGAGTAAAATCATACTAAC
TTAAACAATAATTTGGATGAAAATTGTGAGTCACCAAGCGATACTACTCATAGTAACTCG
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TCTCAACCTCAAAATGAGTGCTCTAAGGAAATAGATGGTTTGATTGCCTCTGAAAAAAAG
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CATATTGCATCTTAATTTGTTTCTGCGCAGAGTATGTAGTTACCAAATCCCTAGTTACAA
ATGCTTAAAGTTACTGACCCTTCAGCTGTTTAGTCTATGACCTTTTAAGTTGGGGTTCCT
CCATAAAAGGTCTAAATAATGAGTAGTAGCTTGATATAATAAGATCAAAATTAATACATA
CCTTAGTAAATGGCCCCAATAGTAGTTACTAACTCTGGAATGCAAACTATTTAGCCTTAA
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GGATTTAATGATCAAAAGACAAGTATTGGTTAAGAAAATTTATAAAATAATCAACAATTG
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GGAACTTTCAATGGGTCTACCTACATAAAGTAAGGATTTTTGGAAGACAGCAAACCTTCT
TTAGTCATTTATGTTAACCATTTAATGAATAAAGATATTACTGTTACTCACCTCTACAAT
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GATGACAAATTCCAAGAATAATTTATAGGAAGCGAATAAACTAACCGTTTCTAAAAAGAT
AGCAAAATGACTTTAAACCCTCCTTCTCTAGTTCTTCATATTTCAAGTCTCAAATAAGAA
ATTTGTGATCACGAGAAAATACATGAATTGTTCCGTCCTTATGGCAAAATTGAAGCAATC
CATATTGAAAAAGTTCCTCCTAGATACATGAGCCATATAAAATTTTCTTCGTTGAAGGAG
TCTTTAATGGCTATAGCTCATATGCACAACAAAGAAATCAAAGGAAGAAAGATGCTTATT
TCATTTACTAGAAAAAAACTAGACACAACAACTAAAAATGTAGTAACTTACTCTAAAAAT
ATTCAATTCAACAATTGA>TTHERM_00658770(protein)
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QIIKKQEQQQDSSSQSDYQYLYYVSSNNNGNSNNDSSKNQMNNDNNSGGNNNTNKHFGIS
NNNISPQNDSSSKIDQLSKGIRPSKVLLVMVQNPQDEVIEHRIIFEKFSFFGEVEQILIF
SKKQPWKLFVDMNSIEVAIKAKNALENSSICVNNLELKMKVQFSSQQNLVLKNGNGGINY
KDLNKKFEKTQLSYSIKIDPTSSQSQNLYQSAQIMDMNRRHIASQFVSAQSMQLPNPQLQ
MLKVTDPSAVQSMTFQVGVPPQKVQIMSSSLIQQDQNQYIPQQMAPIVVTNSGMQTIQPQ
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IQFNN>TTHERM_00658770(gene)
ATGAATCCATCAAATGACACTACCAAAGGGTAACCATTTTACATAGAAAAAGAAGATTAA
GAGCAGGGGAAAATCTAAAATACCAATTAAATGATCAATTAAGAGTAAAATCATACTAAC
TTAAACAATAATTTGGATGAAAATTGTGAGTCACCAAGCGATACTACTCATAGTAACTCG
AACATAGTAAATGGTAATTTTAATTATTCGTCTTCTTCATCATCGTGCTCATATAAAAAT
CAAAATCAAGAAAAATAAAATCTTTAAGCTTATCTTATGTTTGACTCGGGAAATTCATCT
CAACCTCAAAATGAGTGCTCTAAGGAAATAGATGGTTTGATTGCCTCTGAAAAAAAGGAA
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AATAATGATAACAATTCTGGCGGCAATAACAATACCAACAAACATTTTGGAATCAGTAAT
AATAATATTAGCCCTTAGAATGATTCAAGTTCTAAGATTGATTAATTGTCAAAAGGGATT
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AAGAAGCAACCATGGAAATTGTTTGTGGATATGAATTCAATAGAAGTTGCTATAAAGGCT
AAAAATGCGCTTGAAAACTCTTCAATATGTGTCAATAATTTAGAACTTAAAATGAAGGTT
TAATTTTCGAGCCAATAAAATCTTGTTCTTAAGAATGGTAATGGAGGAATAAACTATAAA
GATTTAAACAAGAAATTTGAGAAAACTTAGCTCTCTTACAGCATTAAAATTGATCCAACC
TCTTCATAAAGCTAAAACTTATATTAATCAGCTCAAATTATGGATATGAACAGGCGCCAT
ATTGCATCTTAATTTGTTTCTGCGCAGAGTATGTAGTTACCAAATCCCTAGTTACAAATG
CTTAAAGTTACTGACCCTTCAGCTGTTTAGTCTATGACCTTTTAAGTTGGGGTTCCTCCA
TAAAAGGTCTAAATAATGAGTAGTAGCTTGATATAATAAGATCAAAATTAATACATACCT
TAGTAAATGGCCCCAATAGTAGTTACTAACTCTGGAATGCAAACTATTTAGCCTTAAGTT
CCTATCTATTAAACAGGTAGAGATTCTCCACAAATGATGCAAAATTCAGGTTTAGCTCAT
CCAAAGTAGTAGAATTATTTATAAAATTATTTGATTTTTAATAATTTAAACTAAAAATAG
ATTTTTATATTATTTTATTTCAAGGTAAGTTTGATAAATTTAAAGTATTTCTTTCTTACC
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AGATAGAATTCAATATTTTCTTCTTTATCATATAAATATGATCTGTTTATTTATCTTTCT
TAAGCTCAAGGCAGGCAATATATATATTCTTAAATACCATCAATAGAAGTTTTCTTATTT
ATTAATAATAAATAGTTAAAACTTTATTAAACTTATTTAAATCAAACAAACTTGCATTTT
AAAATAACTTATAAAAATATGATTAAAAAATTACTATTTTAATTAAATTGATTTTTTAAT
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TAAATGGCACCTTATAATTAATACGAGTAGCTTTAATAACCTTTAATGACTTATAGCTTT
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TAGAATTAGTTATTCTAATCTTAACATTATATTGGCTAGCATTTAAATAATTAGTATTAA
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CCAAATTAGTATGGATACAATATGAGATAAAATAGGTAAAGAATGCAATAAAATAGTAAC
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TAAATTAAACCAAATTTCCATAGTATGAGTACAAATATTTCAGGTATGAGAATGGAAGAA
AATATGGGAACTTTCAATGGGTCTACCTACATAAAGTAAGGATTTTTGGAAGACAGCAAA
CCTTCTTTAGTCATTTATGTTAACCATTTAATGAATAAAGATATTACTGTTACTCACCTC
TACAATATCTTTAGCAATTTTGGTGACATAGTTAAAATTATATTGAAAAGAAATAAATGT
ACAGCTTTCATTGAGTATACGATGTAAGAGAACGCTACAAAAGCAAAGGAATTTATGGAT
AAAAAAATCTTCTTTGATAATGAGATCAGAGTATTCTATTCTCACTTTGAAACTCTCTAA
AAATAAGATGACAAATTCCAAGAATAATTTATAGGAAGCGAATAAACTAACCGTTTCTAA
AAAGATAGCAAAATGACTTTAAACCCTCCTTCTCTAGTTCTTCATATTTCAAGTCTCAAA
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CTTATTTCATTTACTAGAAAAAAACTAGACACAACAACTAAAAATGTAGTAACTTACTCT
AAAAATATTCAATTCAACAATTGA
