Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00658770

Standard Name

RRM42 (RNA recognition motif-containing protein 42)

Aliases

PreTt02162 | 97.m00148 | 3724.m00055

Description

RNA recognition motif-containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF04394 ) Protein of unknown function, DUF536
• ( TIGR01659 ) sex-lethal family splicing factor
• ( TIGR01649 ) hnRNP-L/PTB/hephaestus splicing factor family
• ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.3%

TetraMine Data

TTHERM_00658770

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_16215.1	9.997093137033517e-262	polypyrimidine tract binding p rotein (1174 aa)
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DictyBase	DDB_G0274995	0.000009999254677478949	DDB_G0274995 on chromosome: 2 position 4844842 to 4848156

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00658770(coding)
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GAGCAGGGGAAAATCTAAAATACCAATTAAATGATCAATTAAGAGTAAAATCATACTAAC
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ATTAGACCTTCTAAAGTTCTTTTAGTTATGGTATAAAATCCACAGGATGAAGTCATAGAA
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TCTTTAATGGCTATAGCTCATATGCACAACAAAGAAATCAAAGGAAGAAAGATGCTTATT
TCATTTACTAGAAAAAAACTAGACACAACAACTAAAAATGTAGTAACTTACTCTAAAAAT
ATTCAATTCAACAATTGA

>TTHERM_00658770(protein)
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IQFNN

>TTHERM_00658770(gene)
AACATTGATATATTTTTTTATAAATTATCTAGTACTTTATTCAAAGAATTAACATATATA
TATAAGAAAGCTAGTTAGCCTTAAATCAATCAATATTTTGCTGCCATAAAAAAATTAAGA
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GTTAATTTACAATAATTTGATGGCTAAAATATTTCGTATAGCATGTAAATTAAACCAAAT
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GATAATGAGATCAGAGTATTCTATTCTCACTTTGAAACTCTCTAAAAATAAGATGACAAA
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ACTTTAAACCCTCCTTCTCTAGTTCTTCATATTTCAAGTCTCAAATAAGAAATTTGTGAT
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