Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00557810

Standard Name

RRM37 (RNA recognition motif-containing protein 37)

Aliases

PreTt07879 | 73.m00123 | 3735.m00017

Description

RNA recognition motif-containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( TIGR01661 ) ELAV/HuD family splicing factor
• ( TIGR01648 ) hnRNP-R, Q splicing factor family
• ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,
• ( TIGR01628 ) polyadenylate binding protein, human types

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.4%

TetraMine Data

TTHERM_00557810

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_14346.1	6.997264088033092e-153	RNA binding protein (487 aa)
Oxytricha	Contig10739.0.g63	2.998863950472602e-38	RNA recognition motif_ (a_k_a_ RRM, RBD, or RNP domain)
SGD	YBR212W	9.998720540547892e-23	NGR1 RNA binding protein that negatively regulates growth ra te; interacts with the 3 UTR o f the mitochondrial porin (POR 1) mRNA and enhances its degra dation; overexpression impairs mitochondrial function; expre ssed in stationary phase
WormBase	WBGene00015943	1.9991095569230066e-20	locus:tiar-1 status:Confirme d UniProt:Q95QV8 protein_i d:CCD65015.1
DictyBase	DDB_G0290745	2.9992476920535046e-16	pabpc1B on chromosome: 5 posit ion 4494408 to 4497035
Stentor Coeruleus	SteCoe_7581	0.00000000027894680928689246

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00557810(coding)
ATGAGCAATTTAGATTTAAGAACATTGTGGGTTGGAGATATTGAAAACTGGATGACTGAA
TAATTTATTGAAAGTGTTTTTAATAAAGTTGGTAAGGTTGTTAGCGTTAAGTTAATCAGA
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ATACCCACTCCCTCTGTTAAGGAATCATCTTTATTCCAAAAGCCTAGCTCTGATTTCATC
GGATATTAAACTGAATACGTAAGCATGACTGGCGAGCTTGAATTCATTTTGAAGCACAAC
ATATGCTGA

>TTHERM_00557810(protein)
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GQRAIHEMNGSLFKGKFIKVSQAVSRQQQQAQAQAAGTPGFPQPAGYGAATGAADYNGYG
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NMHGYQYPATASTQNAQGQAQQYSQQYPQQGQVPQVPTATTATNPAAIQQQYYNQTAQTP
QAANSQQVASTHDKYSQNNYQSQQQSASNAHYSQQQQYSHQQQQSQVQSQASSQSQTAQQ
QQLSTQQQLNQTEKKSDANSIPTPSVKESSLFQKPSSDFIGYQTEYVSMTGELEFILKHN
IC

>TTHERM_00557810(gene)
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AAGCTGCTGGAACACCTGGATTCCCTTAACCCGCAGGTTATGGTGCTGCTACAGGTGCAG
CTGATTATAACGGTTACGGCTATTATCCTTAACAACCTTCTTAAGATCCTTATTATTAAT
ACTAATAATAGTATGCTGGCTATGCTTCTACTTAAAATACACAATATTAATATCCCTATT
CATATTCTTCTTCTTACTATTAAAACGGAGTTTATGGTACAGACCCTTCTTAAATGTATG
GCCAACCTGCTTAGGCAAGCAATATGCATGGATATCAATATCCCGCCACTGCTAGTACCT
AAAATGCATAGGGATAAGCTCAATAGTACTCATAACAATATCCATAGTAAGGTTAAGTTC
CTCAAGTACCTACTGCAACTACAGCTACTAATCCTGCTGCTATTTAATAATAGTATTATA
ATTAAACTGCTTAAACTCCTCAAGCTGCAAACAGCTAATAAGTAGCCTCTACTCATGATA
AATATTCTTAAAATAATTATTAATCCCAATAATAATCTGCTAGCAATGCTCACTACTCTC
AATAGTAATAGTATTCTCATTAATAGCAGTAATCTTAAGTTCAATCACAAGCATCCAGCC
AATCATAAACTGCTCAACAACAATAGCTCTCAACTTAATAGTAATTGAACTAAACTGAAA
AGAAGTCTGATGCTAACTCTATACCCACTCCCTCTGTTAAGGAATCATCTTTATTCCAAA
AGGTAACTTTATTAATTTAAACTAATAAAATATGATATTTATTTTAGATCGATTTTAAAT
TTAAATAAACTCTTATTATTGATCGACAACAAATATTAAATAAATCAAATATTTAATAAA
AAAATAAATTAAATTTTAATAATATAAATAGCCTAGCTCTGATTTCATCGGATATTAAAC
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