Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00538800Standard Name
RRM36 (RNA recognition motif-containing protein 36)Aliases
PreTt12137 | 70.m00133 | 3728.m00032Description
RRM36 RNA recognition motif proteinGenome Browser (Macronucleus)
![]()
Genome Browser (Micronucleus)
![]()
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- zinc ion binding (IEA) | GO:0008270
- nucleic acid binding (IEA) | GO:0003676
Domains
- ( PF00013 ) KH domain
- ( PF02756 ) GYR motif
- ( PF01485 ) IBR domain
- ( PF07649 ) C1-like domain
- ( TIGR02794 ) protein TolA
- ( PF01840 ) TCL1/MTCP1 family
- ( PF00096 ) Zinc finger, C2H2 type
- ( PF02891 ) MIZ/SP-RING zinc finger
- ( PF04032 ) RNAse P Rpr2/Rpp21 subunit domain
- ( PF06827 ) Zinc finger found in FPG
- ( PF00097 ) zinc finger, C3HC4 type (RING
- ( TIGR00013 ) 4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme
- ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%
TetraMine Data
TTHERM_00538800
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_18193.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (1699 aa)
WormBase WBGene00013270 5.000468829272308e-18 status:Partially_confirmed U
niProt:Q9NA71 protein_id:CAB
55036.2
Oxytricha Contig16750.0.g70 4.997543945741262e-17 IBR domain
DictyBase DDB_G0289043 0.00000000000003999587784428659 DDB_G0289043 on chromosome: 5
position 2291494 to 2297048
SGD YKR017C 0.0000000000009003435339752751 YKR017C Putative protein of un
known function; contains a RIN
G finger motif
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00538800(coding)
ATGTAGCAGCTTTAATAGGAACTCTCTGAACTCATAAACTAATAGGGTTAAGTTCAAGAT
ATACACAGTACATTAACAAGAAACTCTGCTTCTAATAGTATTATAAGAGAAGAAACATTA
CAAAACTATTTGATTTCTGAAAGTAAAGAAAGCCAAGAAAATTTAAAGCATATTATCCAA
AAAAGCAAAATAGATTATTTGTGCAAATTGTAATCAACTTTCACTAGCTCTGAATAAGAA
CAAGAGTTGGCTGAATATATCAAAGATTTCAAAAATAATTTTGGATATCTTGGAAGCGAC
TAAAATAGCCATGTTTGGTAAATTTTATAAAGTTTGAACGAACTTTAATCTGTAAATAGT
GGATTATCATTTATAACAGATAAAAACCCTATTTAGAATGGAGGACTCATTTTTTCTCTT
TTAAAGAGTGCTTTTAATCTTTATCATAAAATTAACTTAGTTAACATATTCGAATCATAA
GCTAGTGAAGACAAGAACTTAAAGCTATAACTAGACGAATAGATGATAGAGACAATTTGG
GACTCCGTTATCGTAAATGGATCCAATAATAAAAAAACTGTTTACTTTTTAAATTTAGAG
TTTTTGAATCCTTCTTAGATTATTTTTATAGCAAAGTTATAGAAACATTTAAATAATTTA
AAAAATGAAGCTTAGATTCCAAATATCGTGATTTACTCTGATGACATTTTAGCATCATAG
CTTAAAGAGTAGATAAAGCCTTAATTAGAAATAGTTTTGGAGTTCAAAAGAATGCCTCAA
AAAATTTAGTATGTATAGAATGCTATTTTATCACAAAAAAGTAAAATGGATTTAATAGAG
CAACTGATAATTGATGCTTTGAAAAAATACAAGCAAACTTTGTTGAGATTTGACGTGCTT
ATATTTGTTAAGAACATTGAAGAGAGCAAATACTTATAGCAACACTATTTAAATCTTATC
AAAGAAAAACTAAATATTATAGATTTGACAGATATTGAAGTGAATGAAGAAGAAAGTAAG
TTTTACTTAGAAGATTTCAAAAAGAATTGGGAAAAATAATTGGTCGAAAAAAAAATAAAA
GAAAAAGAATTAAAAATTTAACAAGAAAAAGAATAGTAGGCCAAGAAAATTGAGGAGGAG
TTAGCACTTGAAAGAGAAAGACAAAGGAAGATTGAAGAAGATAAAAATAAAATATTCGAT
GAAGAAAAAAAACTAATAAAAGAAAAAATAAATCAATAACAAGTATAATAAATACCAGAT
GTTCATCCTTTACAACAAATTAATTAAGATGAACTTAACATTCCTCCTTTCCCTGCTGTT
CCAGAAATATAGCAATAATAGTTAAACTTATAAGAAATATAGATAAATTAAAATTAAGAG
TAAGAGATCTAATTATAGAAAGTACAAAGAGAAGAAGAGATGGTAAAAGAAGAAGAAGAG
TAAAAAAGAAAAGAAGAAGAACTAATGGTAAAAGAAGAAGAAGAGAGAAAAAGAATTGAA
GAAGAAGAAGTGAGAAAAATAAGAGAAGATGAAGAAAACATTAAATTAAAATAATTATAA
GAAGAAGAAGAGAGAAAAAGAAGAGAAGAAGAAGAAATTAAATTAAAAGAAGATGAAGAG
ATAAAAAGAAAGCAAGATGAAGAAAATAAGTTGAAGCAGGAAGAAGAAGAAAGATAAAAA
GATATACAGCAATATAATGAAGATTTAAATAAATAGATTAATAAAAATAAGTAAAATCTC
TACAAAGCAAATGAATTTAATATTTTCATAGCTAAAAGCTATAAGCAATTGAAACATCAT
AACTTAGATAATGTAATCATTTAAATTGATACAGGTGAAGCATTCAAAGTATATTTCATG
GATACTATTTTTGATTAGATTCCTGTAGTAAGCTCTAAAATTACAAGAGAAGAAGCTATT
AAAAGAGAAAGACTCATTGGTAATACTAAATCATGCGAAATTCATAGATTGTATGAAAAA
AAAGAATTCCTTAGACTACAAAAGAGGGATTTTTTGAATTTAATAAATTTGGAATAGTAT
AAGGCCTTTTCAGAAATTTAAAATGAGAAATGCCCTTAAAAGTAAGCAATTAGGATTTTG
TTATAGATCATGATAAATCTTAGTGAAAACTGGTTTAGCTGCTCTTCAGAAGTAGGAGCT
CATATCTCAATTTTATGGAGTAGAATGGGTGATATCTTTTCTGTTCATAACTAGCTCTTG
GTTTCTTAGACTGATGATTTATATTTAGCTTGCTAAAATCTCAATCTGCAGAATATTTTA
GAAAAAAATCAAGTTAATTCAAATCAATATGATAAAATTGTTTATAAAATGCTCAATATT
CAAAAAGTTTTAAATATCAAAGAAGATCCAGTTAAAATCTTACAGAAATTAGAAGCAACC
AAATTTTCAGAACTTGTTCAGTAAGTTGCTATAGAAAAATATTGGAAAAATTTATGCGTT
TATTCAGGACATAGAAGACTTGGTTTCCGTCACTTTGAATCAGCTAAAATGTTGAACTAT
GCTGAAATAAGCAGCATGAACCTTATTTAAGAAAGACCTTTCCTTATTATTCCCCTTCAG
CTTCAAATTAATTCTAAAAATTAATATGAAATAAAGCAATGCTTAGCTATAGATCATCCT
TTTTTACTAGAAAATGCTCCTTCTTAATTTATTGAAAAGCATTAACTCAGACTGCTTAAA
AGACAAAGTTTGAATTTGCATGAGATCGAATATTTTGGTATTTCAGATGCGTTGTTCTAA
TACTTTGAAGATAACAATTAAATAATTAAAGATATGGAAAATAAATTCGATTGTTATTAT
GAGCCTAATCATCATATGGACACTATAACCATACATTCTGATGCAAGCTAAAAGGAAAAA
CTAGAAAAACACTTTAATAACTTGCTTTAAGAAGCATAAAAAATACTCTCAGAAGAAGTT
ATGGAAATTTCACATGGAAACAACTGCATCCTAAAGATTTAAAAAGGAGGTACTATCAAA
GAAGTTACTATTTTACAGAATGAACACATCTTTATTGTTGATAATCTACCCTTAAATGTG
AAAGAGTAAGATGTTATAAATTTATTTGAAGAATATGGAGATATTGTTCAAGTCAAATTT
TTCACTGATCCCACCCTCAAAAATGTTGAAGAAAAATCTATTTCTGCAGAAGTTTTAGTG
GCTGAAACAGAAGATTCCAAATTTTTTGTAGAAACATTTAATTAAATAGAATTTTAAGAT
AGAGTCCTGCAGTTGCGTTTGAAAAACCACAGCTACTAAATACATCAAGATAATAATTCT
ACTAGATATCATAACATTTTTAGATGGCAAACTTGGAAATCAAAACAAACTGGAAGAATT
GAATTTCTTGATGAATCATCAGTTTAATCTTTTATGAAATTAGTTTAAAATAAACTAATT
GTTGATGGTAAGGAAATTAAAGCAGAATAGGATAAAAATTTTAATAAAACCGTCATATTG
AGTGGGCTATAAAAATGCACAGATGAAGAAACTTTAAAATCTTGTTTGATACCAGAACTT
TAAAAGAATATTGTGAGAATAAATGTAGATAGAATAGCTGATGTTGACAGAGGAATTAGC
AAAACTAGTTTAATATTCGCTCTTAATAAGATTTATAAAGAGTAACACTAAATAAGTTGG
GTAAGAAGAAAAGATCATGGTATTGTTGAAGCTAAAATATGCTTTTCTAAAAATTACTTA
TATAAGATGAACACTTACTATGAAAGATTTAATAGTAAGCCAGATATTTTAGGATAATAA
AAATTATATGTTTAAAGAAATTATATTGAAACCTTTAACTATGACTTGAAGATGATGAAC
GTAGTCTAAATGATATTAAAAGGTAATCAGGAATTAGTTTAAATGTAACAAAAGAATGAA
ATAAAACTCAAGGAAAAAATTGTAAGACCAATTCCCTCTAAATAAGAATTCATTGTAATT
TTGAAATGCAATGATGAAACCCACTTTAATAAGGCAAAAGGAATTATGTAAGCTCTGCTT
TAATCAAAACTGCTTGATTTGAGAAATGTAAAATTAGATTTGGCCAGCTTATTCGATGAG
GAAGATTAAGTAGATTACTCTTAGTTGTTCACTGAAATAGGATAAAAGAAGCTCAAAGAA
ATAGAAAGCAAATACCCAGTATTTTTCAAAATAAATTTAATCAAAGAAGAAGTTAGAGTT
TTCTGTACTGATGCCATTTATGATTTGATAAATAAAGATGTTGAGTACTTCTTAAGATAG
AGTGTCAGAGTTAAAATTCCTATTAGTGGAAAAAATATTAGAAACATACTTGGAATAGAT
GGAAGAGGTTTAGAAGAGTTTAAAAATAAAACTAACATTTGCAAAATTTAGCTAGACTAC
ATATCTAAAGACATTTATATGGAAGGTAATTCTAAGTAAGTTGACTAAGCTAAGAATGCT
TTACTTGCTTTATTGGAGGAAAAAAATAGCTAAGCATGCTTAAATAACATGCCTTATTCA
TATGAAGATTGCTAAGTCTGCTCTGACACTATTGTCACAGGATACAGATTGCAAGGCTGT
GGTCATAAATTTTGCCTAAGCTGTATTATGTTTGTAATAGATAATTCTTTAGGTGATGTG
AATTCTCTTCCAATTAAATGTCCTTTTTGCAGTTAAGCTATTATTATGAAAGATATAAAA
ACTCTTATGAGTGAGGATCAAATATAAAAAATGACAAGAATGTCTTTAAATCATTACATA
CAAAACAACTTTTAAGAATTCAGCTTTTGTGTGAATGAAAATTGTAAGTCTATTCATTCA
TCTAAACTAACTAAATATACTTGTTATGAATGCAAAAAAACTTACTGTTCAAAGTGTGCA
GCAGAATATCATTTTGGTATGACTTGTACAGTTTATTAGGAAACTGAAGCGAAAAACATA
GAATTCTTAATCAAAGAAGGTGCTCGTAAATGCCCTAATTGTGGAGTCTACATCATTCGT
ATAGATGGATGTTATAGGGTAGAATGTAGAAGATGCAACCAGCATATTTGCTGGAAAGAT
AATTGCATGAAGTTCTTTGCAACTTCATCCGAATGTTATAACCATTTAGACGAGAATCAT
GGAGGTTATTGGTGA>TTHERM_00538800(protein)
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DSVIVNGSNNKKTVYFLNLEFLNPSQIIFIAKLQKHLNNLKNEAQIPNIVIYSDDILASQ
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NCMKFFATSSECYNHLDENHGGYW>TTHERM_00538800(gene)
ATGTAGCAGCTTTAATAGGAACTCTCTGAACTCATAAACTAATAGGGTTAAGTTCAAGAT
ATACACAGTACATTAACAAGAAACTCTGCTTCTAATAGTATTATAAGAGAAGAAACATTA
CAAAACTATTTGATTTCTGAAAGTAAAGAAAGCCAAGAAAATTTAAAGCATATTATCCAA
AAAAGCAAAATAGATTATTTGTGCAAATTGTAATCAACTTTCACTAGCTCTGAATAAGAA
CAAGAGTTGGCTGAATATATCAAAGATTTCAAAAATAATTTTGGATATCTTGGAAGCGAC
TAAAATAGCCATGTTTGGTAAATTTTATAAAGTTTGAACGAACTTTAATCTGTAAATAGT
GGATTATCATTTATAACAGATAAAAACCCTATTTAGAATGGAGGACTCATTTTTTCTCTT
TTAAAGAGTGCTTTTAATCTTTATCATAAAATTAACTTAGTTAACATATTCGAATCATAA
GCTAGTGAAGACAAGAACTTAAAGCTATAACTAGACGAATAGATGATAGAGACAATTTGG
GACTCCGTTATCGTAAATGGATCCAATAATAAAAAAACTGTTTACTTTTTAAATTTAGAG
TTTTTGAATCCTTCTTAGATTATTTTTATAGCAAAGTTATAGAAACATTTAAATAATTTA
AAAAATGAAGCTTAGATTCCAAATATCGTGATTTACTCTGATGACATTTTAGCATCATAG
CTTAAAGAGTAGATAAAGCCTTAATTAGAAATAGTTTTGGAGTTCAAAAGAATGCCTCAA
AAAATTTAGTATGTATAGAATGCTATTTTATCACAAAAAAGTAAAATGGATTTAATAGAG
CAACTGATAATTGATGCTTTGAAAAAATACAAGCAAACTTTGTTGAGATTTGACGTGCTT
ATATTTGTTAAGAACATTGAAGAGAGCAAATACTTATAGCAACACTATTTAAATCTTATC
AAAGAAAAACTAAATATTATAGATTTGACAGATATTGAAGTGAATGAAGAAGAAAGTAAG
TTTTACTTAGAAGATTTCAAAAAGAATTGGGAAAAATAATTGGTCGAAAAAAAAATAAAA
GAAAAAGAATTAAAAATTTAACAAGAAAAAGAATAGTAGGCCAAGAAAATTGAGGAGGAG
TTAGCACTTGAAAGAGAAAGACAAAGGAAGATTGAAGAAGATAAAAATAAAATATTCGAT
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TAAAAAAGAAAAGAAGAAGAACTAATGGTAAAAGAAGAAGAAGAGAGAAAAAGAATTGAA
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ATAAAAAGAAAGCAAGATGAAGAAAATAAGTTGAAGCAGGAAGAAGAAGAAAGATAAAAA
GATATACAGCAATATAATGAAGATTTAAATAAATAGATTAATAAAAATAAGTAAAATCTC
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AACTTAGATAATGTAATCATTTAAATTGATACAGGTGAAGCATTCAAAGTATATTTCATG
GATACTATTTTTGATTAGATTCCTGTAGTAAGCTCTAAAATTACAAGAGAAGAAGCTATT
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AAGGCCTTTTCAGAAATTTAAAATGAGAAATGCCCTTAAAAGTAAGCAATTAGGATTTTG
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GTTTCTTAGACTGATGATTTATATTTAGCTTGCTAAAATCTCAATCTGCAGAATATTTTA
GAAAAAAATCAAGTTAATTCAAATCAATATGATAAAATTGTTTATAAAATGCTCAATATT
CAAAAAGTTTTAAATATCAAAGAAGATCCAGTTAAAATCTTACAGAAATTAGAAGCAACC
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CTTCAAATTAATTCTAAAAATTAATATGAAATAAAGCAATGCTTAGCTATAGATCATCCT
TTTTTACTAGAAAATGCTCCTTCTTAATTTATTGAAAAGCATTAACTCAGACTGCTTAAA
AGACAAAGTTTGAATTTGCATGAGATCGAATATTTTGGTATTTCAGATGCGTTGTTCTAA
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GAGCCTAATCATCATATGGACACTATAACCATACATTCTGATGCAAGCTAAAAGGTAATT
CTTAATTTTATTATTTCAATTATGAAAATAAAAATTTTTTTTTTTTAATTTTCAACAGGA
AAAACTAGAAAAACACTTTAATAACTTGCTTTAAGAAGCATAAAAAATACTCTCAGAAGA
AGTTATGGAAATTTCACATGGAAACAACTGCATCCTAAAGATTTAAAAAGGAGGTACTAT
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TGTGAAAGAGTAAGATGTTATAAATTTATTTGAAGAATATGGAGATATTGTTCAAGTCAA
ATTTTTCACTGATCCCACCCTCAAAAATGTTGAAGAAAAATCTATTTCTGCAGAAGTTTT
AGTGGCTGAAACAGAAGATTCCAAATTTTTTGTAGAAACATTTAATTAAATAGAATTTTA
AGATAGAGTCCTGCAGTTGCGTTTGAAAAACCACAGCTACTAAATACATCAAGATAATAA
TTCTACTAGATATCATAACATTTTTAGATGGCAAACTTGGAAATCAAAACAAACTGTAAT
TTTATTCATCTTTCTTTGAATTTTTATTGAAAAATATTTTTTTAAATTAAGGGAAGAATT
GAATTTCTTGATGAATCATCAGTTTAATCTTTTATGAAATTAGTTTAAAATAAACTAATT
GTTGATGGTAAGGAAATTAAAGCAGAATAGGATAAAAATTTTAATAAAACCGTCATATTG
AGTGGGCTATAAAAATGCACAGATGAAGAAACTTTAAAATCTTGTTTGATACCAGAACTT
TAAAAGAATATTGTGAGAATAAATGTAAATTGATTATTAATTAATATATTTGTTTATTTT
ACCATTTTATTTTTAATATAAAATAGGTAGATAGAATAGCTGATGTTGACAGAGGAATTA
GCAAAACTAGTTTAATATTCGCTCTTAATAAGATTTATAAAGAGTAACACTAAATAAGTT
GGGTAAGAAGAAAAGATCATGGTATTGTTGAAGCTAAAATATGCTTTTCTAAAAATTACT
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AAAAATTATATGTTTAAAGAAATTATATTGAAACCTTTAACTATGACTTGAAGATGATGA
ACGTAGTCTAAATGATATTAAAAGGTAATCAGGAATTAGTTTAAATGTAACAAAAGAATG
AAATAAAACTCAAGGAAAAAATTGTAAGACCAATTCCCTCTAAATAAGAATTCATTGTAA
TTTTGAAATGCAATGATGAAACCCACTTTAATAAGGCAAAAGGAATTATGTAAGCTCTGC
TTTAATCAAAACTGCTTGATTTGAGAAATGTATTAAAATAATTAAATTTAAAATAATTTT
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ATAGAAAGCAAATACCCAGTATTTTTCAAAATAAATTTAATCAAAGAAGAAGTTAGAGTT
TTCTGTACTGATGCCATTTATGATTTGATAAATAAAGGTAAATTATTAATTAAGTTTAAA
ACAAAATTAAGGAATTTATAAAATAATTAAAGATGTTGAGTACTTCTTAAGATAGAGTGT
CAGAGTTAAAATTCCTATTAGTGGAAAAAATATTAGAAACATACTTGGAATAGATGGAAG
AGGTTTAGAAGAGTTTAAAAATAAAACTAACATTTGCAAAATTTAGCTAGACTACATATC
TAAAGACATTTATATGGAAGGTAATTCTAAGTAAGTTGACTAAGCTAAGAATGCTTTACT
TGCTTTATTGGAGGAAAAAAATAGCTAAGCATGCTTAAATAACATGCCTTATTCATATGA
AGATTGCTAAGTCTGCTCTGACACTATTGTCACAGGATACAGATTGCAAGTAATTCAAAG
ATATCAAATATTTTATTTTAACATTAATTGATATTTTTAAATAGAAATTGTCAAATAAAA
TATTTTAGAGCAAAATATTGATTTAATTTTTTAATTTATTAATTAGGGCTGTGGTCATAA
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TCCAATTAAATGTCCTTTTTGCAGTTAAGCTATTATTATGAAAGATATAAAAACTCTTAT
GAGTGAGGATCAAATATAAAAAATGACAAGAATGTCTTTAAATCATTACATACAAAACAA
CTTTTAAGAATTCAGCTTTTGTGTGAATGAAAATTGTAAGTCTATTCATTCATCTAAACT
AACTAAATATACTTGTTATGAATGCAAAAAAACTTACTGTTCAAAGTGTGCAGCAGAATA
TCATTTTGGTATGACTTGTACAGTTTATTAGGAAACTGAAGCGAAAAACATAGAATTCTT
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ATGTTATAGGGTAGAATGTAGAAGATGCAACCAGCATATTTGCTGGAAAGATAATTGCAT
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TTGGTGA