Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00538800

Standard Name

RRM36 (RNA recognition motif-containing protein 36)

Aliases

PreTt12137 | 70.m00133 | 3728.m00032

Description

RRM36 RNA recognition motif protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• nucleic acid binding (IEA) | GO:0003676
• zinc ion binding (IEA) | GO:0008270

Domains

• ( PF00013 ) KH domain
• ( PF02756 ) GYR motif
• ( PF01485 ) IBR domain
• ( PF07649 ) C1-like domain
• ( TIGR02794 ) protein TolA
• ( PF01840 ) TCL1/MTCP1 family
• ( PF00096 ) Zinc finger, C2H2 type
• ( PF02891 ) MIZ/SP-RING zinc finger
• ( PF04032 ) RNAse P Rpr2/Rpp21 subunit domain
• ( PF06827 ) Zinc finger found in FPG
• ( PF00097 ) zinc finger, C3HC4 type (RING
• ( TIGR00013 ) 4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme
• ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_00538800

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_18193.1	9.997093137033517e-262	hypothetical protein (1699 aa)
WormBase	WBGene00013270	5.000468829272308e-18	status:Partially_confirmed U niProt:Q9NA71 protein_id:CAB 55036.2
Oxytricha	Contig16750.0.g70	4.997543945741262e-17	IBR domain
DictyBase	DDB_G0289043	0.00000000000003999587784428659	DDB_G0289043 on chromosome: 5 position 2291494 to 2297048
SGD	YKR017C	0.0000000000009003435339752751	YKR017C Putative protein of un known function; contains a RIN G finger motif

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00538800(coding)
ATGTAGCAGCTTTAATAGGAACTCTCTGAACTCATAAACTAATAGGGTTAAGTTCAAGAT
ATACACAGTACATTAACAAGAAACTCTGCTTCTAATAGTATTATAAGAGAAGAAACATTA
CAAAACTATTTGATTTCTGAAAGTAAAGAAAGCCAAGAAAATTTAAAGCATATTATCCAA
AAAAGCAAAATAGATTATTTGTGCAAATTGTAATCAACTTTCACTAGCTCTGAATAAGAA
CAAGAGTTGGCTGAATATATCAAAGATTTCAAAAATAATTTTGGATATCTTGGAAGCGAC
TAAAATAGCCATGTTTGGTAAATTTTATAAAGTTTGAACGAACTTTAATCTGTAAATAGT
GGATTATCATTTATAACAGATAAAAACCCTATTTAGAATGGAGGACTCATTTTTTCTCTT
TTAAAGAGTGCTTTTAATCTTTATCATAAAATTAACTTAGTTAACATATTCGAATCATAA
GCTAGTGAAGACAAGAACTTAAAGCTATAACTAGACGAATAGATGATAGAGACAATTTGG
GACTCCGTTATCGTAAATGGATCCAATAATAAAAAAACTGTTTACTTTTTAAATTTAGAG
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AAAAATGAAGCTTAGATTCCAAATATCGTGATTTACTCTGATGACATTTTAGCATCATAG
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GAAGAAAAAAAACTAATAAAAGAAAAAATAAATCAATAACAAGTATAATAAATACCAGAT
GTTCATCCTTTACAACAAATTAATTAAGATGAACTTAACATTCCTCCTTTCCCTGCTGTT
CCAGAAATATAGCAATAATAGTTAAACTTATAAGAAATATAGATAAATTAAAATTAAGAG
TAAGAGATCTAATTATAGAAAGTACAAAGAGAAGAAGAGATGGTAAAAGAAGAAGAAGAG
TAAAAAAGAAAAGAAGAAGAACTAATGGTAAAAGAAGAAGAAGAGAGAAAAAGAATTGAA
GAAGAAGAAGTGAGAAAAATAAGAGAAGATGAAGAAAACATTAAATTAAAATAATTATAA
GAAGAAGAAGAGAGAAAAAGAAGAGAAGAAGAAGAAATTAAATTAAAAGAAGATGAAGAG
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AAGGCCTTTTCAGAAATTTAAAATGAGAAATGCCCTTAAAAGTAAGCAATTAGGATTTTG
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GTTTCTTAGACTGATGATTTATATTTAGCTTGCTAAAATCTCAATCTGCAGAATATTTTA
GAAAAAAATCAAGTTAATTCAAATCAATATGATAAAATTGTTTATAAAATGCTCAATATT
CAAAAAGTTTTAAATATCAAAGAAGATCCAGTTAAAATCTTACAGAAATTAGAAGCAACC
AAATTTTCAGAACTTGTTCAGTAAGTTGCTATAGAAAAATATTGGAAAAATTTATGCGTT
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TACTTTGAAGATAACAATTAAATAATTAAAGATATGGAAAATAAATTCGATTGTTATTAT
GAGCCTAATCATCATATGGACACTATAACCATACATTCTGATGCAAGCTAAAAGGAAAAA
CTAGAAAAACACTTTAATAACTTGCTTTAAGAAGCATAAAAAATACTCTCAGAAGAAGTT
ATGGAAATTTCACATGGAAACAACTGCATCCTAAAGATTTAAAAAGGAGGTACTATCAAA
GAAGTTACTATTTTACAGAATGAACACATCTTTATTGTTGATAATCTACCCTTAAATGTG
AAAGAGTAAGATGTTATAAATTTATTTGAAGAATATGGAGATATTGTTCAAGTCAAATTT
TTCACTGATCCCACCCTCAAAAATGTTGAAGAAAAATCTATTTCTGCAGAAGTTTTAGTG
GCTGAAACAGAAGATTCCAAATTTTTTGTAGAAACATTTAATTAAATAGAATTTTAAGAT
AGAGTCCTGCAGTTGCGTTTGAAAAACCACAGCTACTAAATACATCAAGATAATAATTCT
ACTAGATATCATAACATTTTTAGATGGCAAACTTGGAAATCAAAACAAACTGGAAGAATT
GAATTTCTTGATGAATCATCAGTTTAATCTTTTATGAAATTAGTTTAAAATAAACTAATT
GTTGATGGTAAGGAAATTAAAGCAGAATAGGATAAAAATTTTAATAAAACCGTCATATTG
AGTGGGCTATAAAAATGCACAGATGAAGAAACTTTAAAATCTTGTTTGATACCAGAACTT
TAAAAGAATATTGTGAGAATAAATGTAGATAGAATAGCTGATGTTGACAGAGGAATTAGC
AAAACTAGTTTAATATTCGCTCTTAATAAGATTTATAAAGAGTAACACTAAATAAGTTGG
GTAAGAAGAAAAGATCATGGTATTGTTGAAGCTAAAATATGCTTTTCTAAAAATTACTTA
TATAAGATGAACACTTACTATGAAAGATTTAATAGTAAGCCAGATATTTTAGGATAATAA
AAATTATATGTTTAAAGAAATTATATTGAAACCTTTAACTATGACTTGAAGATGATGAAC
GTAGTCTAAATGATATTAAAAGGTAATCAGGAATTAGTTTAAATGTAACAAAAGAATGAA
ATAAAACTCAAGGAAAAAATTGTAAGACCAATTCCCTCTAAATAAGAATTCATTGTAATT
TTGAAATGCAATGATGAAACCCACTTTAATAAGGCAAAAGGAATTATGTAAGCTCTGCTT
TAATCAAAACTGCTTGATTTGAGAAATGTAAAATTAGATTTGGCCAGCTTATTCGATGAG
GAAGATTAAGTAGATTACTCTTAGTTGTTCACTGAAATAGGATAAAAGAAGCTCAAAGAA
ATAGAAAGCAAATACCCAGTATTTTTCAAAATAAATTTAATCAAAGAAGAAGTTAGAGTT
TTCTGTACTGATGCCATTTATGATTTGATAAATAAAGATGTTGAGTACTTCTTAAGATAG
AGTGTCAGAGTTAAAATTCCTATTAGTGGAAAAAATATTAGAAACATACTTGGAATAGAT
GGAAGAGGTTTAGAAGAGTTTAAAAATAAAACTAACATTTGCAAAATTTAGCTAGACTAC
ATATCTAAAGACATTTATATGGAAGGTAATTCTAAGTAAGTTGACTAAGCTAAGAATGCT
TTACTTGCTTTATTGGAGGAAAAAAATAGCTAAGCATGCTTAAATAACATGCCTTATTCA
TATGAAGATTGCTAAGTCTGCTCTGACACTATTGTCACAGGATACAGATTGCAAGGCTGT
GGTCATAAATTTTGCCTAAGCTGTATTATGTTTGTAATAGATAATTCTTTAGGTGATGTG
AATTCTCTTCCAATTAAATGTCCTTTTTGCAGTTAAGCTATTATTATGAAAGATATAAAA
ACTCTTATGAGTGAGGATCAAATATAAAAAATGACAAGAATGTCTTTAAATCATTACATA
CAAAACAACTTTTAAGAATTCAGCTTTTGTGTGAATGAAAATTGTAAGTCTATTCATTCA
TCTAAACTAACTAAATATACTTGTTATGAATGCAAAAAAACTTACTGTTCAAAGTGTGCA
GCAGAATATCATTTTGGTATGACTTGTACAGTTTATTAGGAAACTGAAGCGAAAAACATA
GAATTCTTAATCAAAGAAGGTGCTCGTAAATGCCCTAATTGTGGAGTCTACATCATTCGT
ATAGATGGATGTTATAGGGTAGAATGTAGAAGATGCAACCAGCATATTTGCTGGAAAGAT
AATTGCATGAAGTTCTTTGCAACTTCATCCGAATGTTATAACCATTTAGACGAGAATCAT
GGAGGTTATTGGTGA

>TTHERM_00538800(protein)
MQQLQQELSELINQQGQVQDIHSTLTRNSASNSIIREETLQNYLISESKESQENLKHIIQ
KSKIDYLCKLQSTFTSSEQEQELAEYIKDFKNNFGYLGSDQNSHVWQILQSLNELQSVNS
GLSFITDKNPIQNGGLIFSLLKSAFNLYHKINLVNIFESQASEDKNLKLQLDEQMIETIW
DSVIVNGSNNKKTVYFLNLEFLNPSQIIFIAKLQKHLNNLKNEAQIPNIVIYSDDILASQ
LKEQIKPQLEIVLEFKRMPQKIQYVQNAILSQKSKMDLIEQLIIDALKKYKQTLLRFDVL
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QKRKEEELMVKEEEERKRIEEEEVRKIREDEENIKLKQLQEEEERKRREEEEIKLKEDEE
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>TTHERM_00538800(gene)
ATGTAGCAGCTTTAATAGGAACTCTCTGAACTCATAAACTAATAGGGTTAAGTTCAAGAT
ATACACAGTACATTAACAAGAAACTCTGCTTCTAATAGTATTATAAGAGAAGAAACATTA
CAAAACTATTTGATTTCTGAAAGTAAAGAAAGCCAAGAAAATTTAAAGCATATTATCCAA
AAAAGCAAAATAGATTATTTGTGCAAATTGTAATCAACTTTCACTAGCTCTGAATAAGAA
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TAAAATAGCCATGTTTGGTAAATTTTATAAAGTTTGAACGAACTTTAATCTGTAAATAGT
GGATTATCATTTATAACAGATAAAAACCCTATTTAGAATGGAGGACTCATTTTTTCTCTT
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TTTTTACTAGAAAATGCTCCTTCTTAATTTATTGAAAAGCATTAACTCAGACTGCTTAAA
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GAGCCTAATCATCATATGGACACTATAACCATACATTCTGATGCAAGCTAAAAGGTAATT
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GTTGATGGTAAGGAAATTAAAGCAGAATAGGATAAAAATTTTAATAAAACCGTCATATTG
AGTGGGCTATAAAAATGCACAGATGAAGAAACTTTAAAATCTTGTTTGATACCAGAACTT
TAAAAGAATATTGTGAGAATAAATGTAAATTGATTATTAATTAATATATTTGTTTATTTT
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GGGTAAGAAGAAAAGATCATGGTATTGTTGAAGCTAAAATATGCTTTTCTAAAAATTACT
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TTTAATCAAAACTGCTTGATTTGAGAAATGTATTAAAATAATTAAATTTAAAATAATTTT
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ATAGAAAGCAAATACCCAGTATTTTTCAAAATAAATTTAATCAAAGAAGAAGTTAGAGTT
TTCTGTACTGATGCCATTTATGATTTGATAAATAAAGGTAAATTATTAATTAAGTTTAAA
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CAGAGTTAAAATTCCTATTAGTGGAAAAAATATTAGAAACATACTTGGAATAGATGGAAG
AGGTTTAGAAGAGTTTAAAAATAAAACTAACATTTGCAAAATTTAGCTAGACTACATATC
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TGCTTTATTGGAGGAAAAAAATAGCTAAGCATGCTTAAATAACATGCCTTATTCATATGA
AGATTGCTAAGTCTGCTCTGACACTATTGTCACAGGATACAGATTGCAAGTAATTCAAAG
ATATCAAATATTTTATTTTAACATTAATTGATATTTTTAAATAGAAATTGTCAAATAAAA
TATTTTAGAGCAAAATATTGATTTAATTTTTTAATTTATTAATTAGGGCTGTGGTCATAA
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TCCAATTAAATGTCCTTTTTGCAGTTAAGCTATTATTATGAAAGATATAAAAACTCTTAT
GAGTGAGGATCAAATATAAAAAATGACAAGAATGTCTTTAAATCATTACATACAAAACAA
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