Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_000486877

Standard Name

RRM30 (RNA recognition motif protein)

Aliases

None

Description

RNA recognition motif protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

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Domains

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Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

TetraMine Data

TTHERM_000486877

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_12183.11.0001267035975107e-72hypothetical protein (438 aa)
OxytrichaContig7157.0.g230.0000007997233352734267RNA recognition motif_ (a_k_a_
RRM, RBD, or RNP domain)
DictyBaseDDB_G02828730.0000009995106777214876DDB_G0282873 on chromosome: 3
position 6325570 to 6328516
SGDYNL175C0.00003998524687536623NOP13 Nucleolar protein found
in preribosomal complexes; con
tains an RNA recognition motif
(RRM)

General Information

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Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_000486877(coding)
ATGTTTACAAGTGTTAGAAAAAATAAAATAAAACCAGTATTGGGATCTGACAGAACCGAA
AAAAGCAAAACTGATTACAAAGAATCTATCGAAGAAGAAGATATTGAATTAGATATTGGA
GAAGACTTAGTTGATGATGATAAAGATGAAAAAGTTTAGTTATAGGAAAGATCTGATAAA
TAAAACAATCAGCAATAAGAAAACAATCCATCTAAGGAAAATAATAATAATGAAAGTGAT
ATTGAAGAAAAAGTAGTAGGAGGTGATTATGAAGAGCCAGAATTTTTAGGTGAAGAAGAA
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GGAGATGATTAAAAAAATGACCATGATAAAAACGATAGCAATAGCTCTCCTAATTAAAGG
AACAGAAAAAGCTAGAACAATATGTAAATTCCTTTAAACAAAGAAGAACCTGAGTAGAGA
ACCATAGTTGTGACAAACTTAAATTTTGAGCTTTCAGATAAAGAAATAAGAAATTACTTC
TAACAATTCGGTAACATTGAAGATTTAATTGTACCCAGAAATGAAGGATAACTATTTAAC
AAAGGAAGAGCGTTTGTTTAATATTCTACAGTTGCTATGGCGTAATTGGCAGCTTAAAAA
AATGGTGAATTGTTCAAAGGCCGTCCACTTGAAATCAACTTGGGTCTTTAATCAGGAGTG
AATATGAACAAAAAAGTACCTTTCATGTAAAATAAGGGCAGCAAGCACTAATCAAAGCTA
CTAAAATCAAGAAGTAAAAGTAGGGAAAAGAAAAGTAGTAGAAGTAAGAGTAATGAAGAC
AGCTATAGTAGAAGCAGAAGTAGAAGTAGAAGTAGTTCTAGCAAACGTAGTAGCAGCAGA
AGTAGCAGTAGAAGTCGTAGTAGTAACAGCGGTAGCTAGAGCTAAAGTCGTAGTAGGAGT
AATAGTTAAGGAGAAGATAAAAAAAGTTCTTCAAGAAGAGATTCGACTTAGCATAATCGT
CATAGGGATCGCTATAGAAACTAAGATAGAAGAAAAAACGATAGCCGCAGTAGATCTAGA
AGCTAAGAAAGAAGAAACTCTTAGCACAGTCGTGATAATAACAGGCATTATAATCGTCAC
TAGCATGGCCGTCAATAATACTAAAACAAAAACTATTAAAGTTAAGGGTAGAGAGGTGGT
TAAGGCCAAAATAGAAGCAATTATAACAACAATAACGGTAACCGCAATTATGGAGGTGGA
TAAAGGCACGGAGGTTAAGGATCACACTATGGTGGCAGTGGACACAGAAATTGA


>TTHERM_000486877(protein)
MFTSVRKNKIKPVLGSDRTEKSKTDYKESIEEEDIELDIGEDLVDDDKDEKVQLQERSDK
QNNQQQENNPSKENNNNESDIEEKVVGGDYEEPEFLGEEEAEGENDDKKYDWMDSDDEED
GDDQKNDHDKNDSNSSPNQRNRKSQNNMQIPLNKEEPEQRTIVVTNLNFELSDKEIRNYF
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NMNKKVPFMQNKGSKHQSKLLKSRSKSREKKSSRSKSNEDSYSRSRSRSRSSSSKRSSSR
SSSRSRSSNSGSQSQSRSRSNSQGEDKKSSSRRDSTQHNRHRDRYRNQDRRKNDSRSRSR
SQERRNSQHSRDNNRHYNRHQHGRQQYQNKNYQSQGQRGGQGQNRSNYNNNNGNRNYGGG
QRHGGQGSHYGGSGHRN


>TTHERM_000486877(gene)
AATATATATTAGACCCTCTTAATCTTATTTAATTTGTATACATAAATAAATAGTATAATT
AATTATTTGCACTTGATTGTTTTTTTGCTTTGTAAAATCAATAATTATTAATATATAAAT
ATTAAGTTGATTGACAAATACAAACAAAGCACATTCTAAAAAAAACATAGACACAAAAGA
TTTTATTTTAAAGGATAAATGTTTACAAGTGTTAGAAAAAATAAAATAAAACCAGTATTG
GGATCTGACAGAACCGAAAAAAGCAAAACTGATTACAAAGAATCTATCGAAGAAGAAGAT
ATTGAATTAGATATTGGAGAAGACTTAGTTGATGATGATAAAGATGAAAAAGTTTAGTTA
TAGGAAAGATCTGATAAATAAAACAATCAGCAATAAGAAAACAATCCATCTAAGGAAAAT
AATAATAATGAAAGTGATATTGAAGAAAAAGTAGTAGGAGGTGATTATGAAGAGCCAGAA
TTTTTAGGTGAAGAAGAAGCGGAAGGTGAAAACGATGATAAAAAATATGATTGGATGGAT
TCCGATGACGAGGAAGATGGAGATGATTAAAAAAATGACCATGATAAAAACGATAGCAAT
AGCTCTCCTAATTAAAGTAAATGTTTAAATCATGATTAAAATGATATTCAAGAATTAAAT
AATATTTTTAAAAATGGAAAAGATGTTTTAGATTAATATCAAATATCATTTTTACTATTT
GAAATTTAATTGAGATTGCTTATGGCTATTACACAAACGCTATCTTATTTGATAGAAAAA
TTAATTATATTTGGAAATGAATAAAAATATATTTTTTAGATATGAGATTTCATAAATCTA
AAAAATGAATTAATTAATCAATTAAAAAATATCCATACATTAAAGAATAAATAAATATTA
ATATGTCATATTTATCGTTTGAATCTAATCATTAAAAGGGAACAGAAAAAGCTAGAACAA
TATGTAAATTCCTTTAAACAAAGAAGAAGTATCTTTCGTTATTCTACTTTATTTACTTTT
CTTTTATACTTAATAGAAAATTAGCTATTATAATCAAATTTATTAATTATCTAAATGAAT
ACCCCATTTTGTCATATTTATTCTTTTAAAATTTATTTTAATAAATTTGTTATTAAAAAA
GCCTGAGTAGAGAACCATAGTTGTGACAAACTTAAATTTTGAGCTTTCAGATAAAGAAAT
AAGAAATTACTTCTAACAATTCGGTAACATTGAGTAAGGATTAAATATCATTTTATTTAA
TATCAGTCTCAATATCTATCGAAATAAAATAAAAAAGAAACAAATAAATAAATAAATTTA
CTTTTGGATTCATGCATATTTCGAATAAAATAGAAAAACTATAATAAAGCAGTTAATTTG
TTTGAGAAAATGAGTTTTATTAGAAGTATTTTAAATTAGCAGATAATTTTATTTAGAAAT
AAAGCTACAAATAAAATATTCTCGATTATTTATTGAAAGAAAAACAAAATTTATTTAATA
AAATAATACTGGTATTGGCTGGGATATTATGCTTATATTCAACAAGAATAATAAAAAATA
TAAAATTTTAGAATTTCTTTTTCAAAAGCAAATTTTAAAATAATCAAGAATTCTTTTACA
GATTATTAATTATTTTTATTTAGAATTTTTTTCAAATGAATGTAAACAAAATAATAAATT
ATTAAGCTTGCAGTAGAGTCAAATCTAAAGCATAGTAAAAGTTTTTGTTTCAAACAAACA
AAAATAGCTGCAAACTAATTAATAAGAATATCTAAAATAATTTTTTGAGAGGCATAAAGC
CATTTTTGAATTATTAAGTTTAAATTTTTTTAAATGATTTTTAACTATCTATTACATATA
TTTTAAATTAATATGAAAAGAGATTTAATTGTACCCAGAAATGAAGGATAACTATTTAAC
AAAGGAAGAGCGTTTGTTTAATATTCTACAGTTGCTATGGCGTAATTGGTAAGAATTTCA
TATTATAGAGCTTAACTTGATATTTAAATGATTTAATTAATTTTTGAGATATTCTTCAAA
TTAAATTAGACAGCAAAAAAGATTTAAATTTAAATATTCTTTTAAAATATTTGTTGCATC
TACAATTACATAAATGATAAAAAAAACATGAATTTATTATCTCATTAACTTGGATGTAAA
ATTTTGTTCTAAATCCAAATCATCATGAGGGAATTAAATTTTGGTTTTTGGAGCTTGTTT
GTTTGAGTATATTATTGAAACAATATTTTTAGAATCTATTCTAAATTTTCATATACTAAC
TAGCAGATCCTTTAATATTTAAATTAACTTATTTATTAATATTTGAAAGATTAATCAATA
TTTCCTCTCTCTGCTTTACTGCTCTAAATAAATACCATCATCAATCAGCTATTATTATTT
TAATTACTTTTTGTTGAAGACAGATTTTGATTAAAAAGAAAAAAACAAAATTAAAAACCC
ACTAAAAGATACCAAAAATTTTTAAATAATGAATAGTACCCTAAATTTAAGTATCTTGCT
ACTTTTAATTGAAATCAATTTAATTAAAGGGGTAGGAATTTATCTTTAGATATCAACAAA
TATGGCAATTTATTCCTAATATAATATACACTAGAAATGTTTGAGAGCATTTTTTTATAA
ATAAATTCATATTATTTTCCCGCGATAATCTCTTCAACTAAAGCCATTTTATTCAATTAA
AACAAAAAAAAATATTTTTCACCTCATATTCGTTTTTTCAAATTATCATGAAGTTGATAA
AATAGATTATCCAAAAAAAATAATTAATCTAAATTCTTTTTTAATTGAGTGTCGTAATAT
TTAAAAATTTTTTATCCCTTTTTCCATATTCTAATAAGATCATGCATGATACATCTATTG
TATTTATTACTACCAAATAATTTGCATACATATGAATTACTCTTAAAGTTCTGAAAAAGA
ATTCCCTTTATATTAAATTGTAAAGCAGGGTATTTTAAATAAATGATTAAAATTAAATTG
ACTTCATATTTGAGTGATTAAATTAGCAGCTTTACAGATTTATTTAGATTTAATATAAAA
TAGAAAATAATTCAAAATTTCCCTCCATGATTTAAATTTTTTCATTTATTTTTAAATTAA
ACTTTTTTTAAATATTAAAAATGCAAATTTTTTTAACAGTTACTTTATTTATTTTTATTA
ACATGCATATTATTTATGGATATAAAAAGGCAGCTTAAAAAAATGGTGAATTGTTCAAAG
GCCGTCCACTTGAAATCAACTTGGGTCTTTAATCAGGAGTGAATATGAACAAAAAAGTGT
ATTGATTTCTTATATGATATAAGTCTTAGACATTTTTTAATTAAAATAAATATTAGACCT
TTCATGTAAAATAAGGGCAGCAAGCACTAATCAAAGCTACTAAAATCAAGAAGTAAAAGT
AGGGAAAAGAAAAGTAGTAGAAGTAAGAGTAATGAAGACAGCTATAGTAGAAGCAGAAGT
AGAAGTAGAAGTAGTTCTAGCAAACGTAGTAGCAGCAGAAGTAGCAGTAGAAGTCGTAGT
AGTAACAGCGGTAGCTAGAGCTAAAGTCGTAGTAGGAGTAATAGTTAAGGAGAAGATAAA
AAAAGTTCTTCAAGAAGAGATTCGACTTAGCATAATCGTCATAGGGATCGCTATAGAAAC
TAAGATAGAAGAAAAAACGATAGCCGCAGTAGATCTAGAAGCTAAGAAAGAAGAAACTCT
TAGCACAGTCGTGATAATAACAGGCATTATAATCGTCACTAGCATGGCCGTCAATAATAC
TAAAACAAAAACTATTAAAGTTAAGGGTAGAGAGGTGGTTAAGGCCAAAATAGAAGCAAT
TATAACAACAATAACGGTAACCGCAATTATGGAGGTGGATAAAGGCACGGAGGTTAAGGA
TCACACTATGGTGGCAGTGGACACAGAAATTGA