Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_000486877

Standard Name

RRM30 (RNA recognition motif protein)

Aliases

None

Description

RNA recognition motif protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

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Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%

TetraMine Data

TTHERM_000486877

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_12183.1	1.0001267035975107e-72	hypothetical protein (438 aa)
Oxytricha	Contig7157.0.g23	0.0000007997233352734267	RNA recognition motif_ (a_k_a_ RRM, RBD, or RNP domain)
DictyBase	DDB_G0282873	0.0000009995106777214876	DDB_G0282873 on chromosome: 3 position 6325570 to 6328516
SGD	YNL175C	0.00003998524687536623	NOP13 Nucleolar protein found in preribosomal complexes; con tains an RNA recognition motif (RRM)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_000486877(coding)
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AAAAGCAAAACTGATTACAAAGAATCTATCGAAGAAGAAGATATTGAATTAGATATTGGA
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TAAGGCCAAAATAGAAGCAATTATAACAACAATAACGGTAACCGCAATTATGGAGGTGGA
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>TTHERM_000486877(protein)
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QNNQQQENNPSKENNNNESDIEEKVVGGDYEEPEFLGEEEAEGENDDKKYDWMDSDDEED
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SSSRSRSSNSGSQSQSRSRSNSQGEDKKSSSRRDSTQHNRHRDRYRNQDRRKNDSRSRSR
SQERRNSQHSRDNNRHYNRHQHGRQQYQNKNYQSQGQRGGQGQNRSNYNNNNGNRNYGGG
QRHGGQGSHYGGSGHRN

>TTHERM_000486877(gene)
AATATATATTAGACCCTCTTAATCTTATTTAATTTGTATACATAAATAAATAGTATAATT
AATTATTTGCACTTGATTGTTTTTTTGCTTTGTAAAATCAATAATTATTAATATATAAAT
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TTAATTATATTTGGAAATGAATAAAAATATATTTTTTAGATATGAGATTTCATAAATCTA
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AAGAAATTACTTCTAACAATTCGGTAACATTGAGTAAGGATTAAATATCATTTTATTTAA
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AAAGCTACAAATAAAATATTCTCGATTATTTATTGAAAGAAAAACAAAATTTATTTAATA
AAATAATACTGGTATTGGCTGGGATATTATGCTTATATTCAACAAGAATAATAAAAAATA
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CATTTTTGAATTATTAAGTTTAAATTTTTTTAAATGATTTTTAACTATCTATTACATATA
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TATTATAGAGCTTAACTTGATATTTAAATGATTTAATTAATTTTTGAGATATTCTTCAAA
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TACAATTACATAAATGATAAAAAAAACATGAATTTATTATCTCATTAACTTGGATGTAAA
ATTTTGTTCTAAATCCAAATCATCATGAGGGAATTAAATTTTGGTTTTTGGAGCTTGTTT
GTTTGAGTATATTATTGAAACAATATTTTTAGAATCTATTCTAAATTTTCATATACTAAC
TAGCAGATCCTTTAATATTTAAATTAACTTATTTATTAATATTTGAAAGATTAATCAATA
TTTCCTCTCTCTGCTTTACTGCTCTAAATAAATACCATCATCAATCAGCTATTATTATTT
TAATTACTTTTTGTTGAAGACAGATTTTGATTAAAAAGAAAAAAACAAAATTAAAAACCC
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TATGGCAATTTATTCCTAATATAATATACACTAGAAATGTTTGAGAGCATTTTTTTATAA
ATAAATTCATATTATTTTCCCGCGATAATCTCTTCAACTAAAGCCATTTTATTCAATTAA
AACAAAAAAAAATATTTTTCACCTCATATTCGTTTTTTCAAATTATCATGAAGTTGATAA
AATAGATTATCCAAAAAAAATAATTAATCTAAATTCTTTTTTAATTGAGTGTCGTAATAT
TTAAAAATTTTTTATCCCTTTTTCCATATTCTAATAAGATCATGCATGATACATCTATTG
TATTTATTACTACCAAATAATTTGCATACATATGAATTACTCTTAAAGTTCTGAAAAAGA
ATTCCCTTTATATTAAATTGTAAAGCAGGGTATTTTAAATAAATGATTAAAATTAAATTG
ACTTCATATTTGAGTGATTAAATTAGCAGCTTTACAGATTTATTTAGATTTAATATAAAA
TAGAAAATAATTCAAAATTTCCCTCCATGATTTAAATTTTTTCATTTATTTTTAAATTAA
ACTTTTTTTAAATATTAAAAATGCAAATTTTTTTAACAGTTACTTTATTTATTTTTATTA
ACATGCATATTATTTATGGATATAAAAAGGCAGCTTAAAAAAATGGTGAATTGTTCAAAG
GCCGTCCACTTGAAATCAACTTGGGTCTTTAATCAGGAGTGAATATGAACAAAAAAGTGT
ATTGATTTCTTATATGATATAAGTCTTAGACATTTTTTAATTAAAATAAATATTAGACCT
TTCATGTAAAATAAGGGCAGCAAGCACTAATCAAAGCTACTAAAATCAAGAAGTAAAAGT
AGGGAAAAGAAAAGTAGTAGAAGTAAGAGTAATGAAGACAGCTATAGTAGAAGCAGAAGT
AGAAGTAGAAGTAGTTCTAGCAAACGTAGTAGCAGCAGAAGTAGCAGTAGAAGTCGTAGT
AGTAACAGCGGTAGCTAGAGCTAAAGTCGTAGTAGGAGTAATAGTTAAGGAGAAGATAAA
AAAAGTTCTTCAAGAAGAGATTCGACTTAGCATAATCGTCATAGGGATCGCTATAGAAAC
TAAGATAGAAGAAAAAACGATAGCCGCAGTAGATCTAGAAGCTAAGAAAGAAGAAACTCT
TAGCACAGTCGTGATAATAACAGGCATTATAATCGTCACTAGCATGGCCGTCAATAATAC
TAAAACAAAAACTATTAAAGTTAAGGGTAGAGAGGTGGTTAAGGCCAAAATAGAAGCAAT
TATAACAACAATAACGGTAACCGCAATTATGGAGGTGGATAAAGGCACGGAGGTTAAGGA
TCACACTATGGTGGCAGTGGACACAGAAATTGA