Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_000486877

Standard Name

RRM30 (RNA recognition motif protein)

Aliases

None

Description

RNA recognition motif protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%

TetraMine Data

TTHERM_000486877

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_12183.1	1.0001267035975107e-72	hypothetical protein (438 aa)
Oxytricha	Contig7157.0.g23	0.0000007997233352734267	RNA recognition motif_ (a_k_a_ RRM, RBD, or RNP domain)
DictyBase	DDB_G0282873	0.0000009995106777214876	DDB_G0282873 on chromosome: 3 position 6325570 to 6328516
SGD	YNL175C	0.00003998524687536623	NOP13 Nucleolar protein found in preribosomal complexes; con tains an RNA recognition motif (RRM)

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_000486877(coding)
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AAAAGCAAAACTGATTACAAAGAATCTATCGAAGAAGAAGATATTGAATTAGATATTGGA
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TAAGGCCAAAATAGAAGCAATTATAACAACAATAACGGTAACCGCAATTATGGAGGTGGA
TAAAGGCACGGAGGTTAAGGATCACACTATGGTGGCAGTGGACACAGAAATTGA

>TTHERM_000486877(protein)
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QNNQQQENNPSKENNNNESDIEEKVVGGDYEEPEFLGEEEAEGENDDKKYDWMDSDDEED
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SSSRSRSSNSGSQSQSRSRSNSQGEDKKSSSRRDSTQHNRHRDRYRNQDRRKNDSRSRSR
SQERRNSQHSRDNNRHYNRHQHGRQQYQNKNYQSQGQRGGQGQNRSNYNNNNGNRNYGGG
QRHGGQGSHYGGSGHRN

>TTHERM_000486877(gene)
ATGTTTACAAGTGTTAGAAAAAATAAAATAAAACCAGTATTGGGATCTGACAGAACCGAA
AAAAGCAAAACTGATTACAAAGAATCTATCGAAGAAGAAGATATTGAATTAGATATTGGA
GAAGACTTAGTTGATGATGATAAAGATGAAAAAGTTTAGTTATAGGAAAGATCTGATAAA
TAAAACAATCAGCAATAAGAAAACAATCCATCTAAGGAAAATAATAATAATGAAAGTGAT
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GAATAAAAATATATTTTTTAGATATGAGATTTCATAAATCTAAAAAATGAATTAATTAAT
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TATTCTTTTAAAATTTATTTTAATAAATTTGTTATTAAAAAAGCCTGAGTAGAGAACCAT
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TTTAGAATTTTTTTCAAATGAATGTAAACAAAATAATAAATTATTAAGCTTGCAGTAGAG
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TTAATAAGAATATCTAAAATAATTTTTTGAGAGGCATAAAGCCATTTTTGAATTATTAAG
TTTAAATTTTTTTAAATGATTTTTAACTATCTATTACATATATTTTAAATTAATATGAAA
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TTAAATTAACTTATTTATTAATATTTGAAAGATTAATCAATATTTCCTCTCTCTGCTTTA
CTGCTCTAAATAAATACCATCATCAATCAGCTATTATTATTTTAATTACTTTTTGTTGAA
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TTTTTAAATAATGAATAGTACCCTAAATTTAAGTATCTTGCTACTTTTAATTGAAATCAA
TTTAATTAAAGGGGTAGGAATTTATCTTTAGATATCAACAAATATGGCAATTTATTCCTA
ATATAATATACACTAGAAATGTTTGAGAGCATTTTTTTATAAATAAATTCATATTATTTT
CCCGCGATAATCTCTTCAACTAAAGCCATTTTATTCAATTAAAACAAAAAAAAATATTTT
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AATAATTAATCTAAATTCTTTTTTAATTGAGTGTCGTAATATTTAAAAATTTTTTATCCC
TTTTTCCATATTCTAATAAGATCATGCATGATACATCTATTGTATTTATTACTACCAAAT
AATTTGCATACATATGAATTACTCTTAAAGTTCTGAAAAAGAATTCCCTTTATATTAAAT
TGTAAAGCAGGGTATTTTAAATAAATGATTAAAATTAAATTGACTTCATATTTGAGTGAT
TAAATTAGCAGCTTTACAGATTTATTTAGATTTAATATAAAATAGAAAATAATTCAAAAT
TTCCCTCCATGATTTAAATTTTTTCATTTATTTTTAAATTAAACTTTTTTTAAATATTAA
AAATGCAAATTTTTTTAACAGTTACTTTATTTATTTTTATTAACATGCATATTATTTATG
GATATAAAAAGGCAGCTTAAAAAAATGGTGAATTGTTCAAAGGCCGTCCACTTGAAATCA
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ATAAGTCTTAGACATTTTTTAATTAAAATAAATATTAGACCTTTCATGTAAAATAAGGGC
AGCAAGCACTAATCAAAGCTACTAAAATCAAGAAGTAAAAGTAGGGAAAAGAAAAGTAGT
AGAAGTAAGAGTAATGAAGACAGCTATAGTAGAAGCAGAAGTAGAAGTAGAAGTAGTTCT
AGCAAACGTAGTAGCAGCAGAAGTAGCAGTAGAAGTCGTAGTAGTAACAGCGGTAGCTAG
AGCTAAAGTCGTAGTAGGAGTAATAGTTAAGGAGAAGATAAAAAAAGTTCTTCAAGAAGA
GATTCGACTTAGCATAATCGTCATAGGGATCGCTATAGAAACTAAGATAGAAGAAAAAAC
GATAGCCGCAGTAGATCTAGAAGCTAAGAAAGAAGAAACTCTTAGCACAGTCGTGATAAT
AACAGGCATTATAATCGTCACTAGCATGGCCGTCAATAATACTAAAACAAAAACTATTAA
AGTTAAGGGTAGAGAGGTGGTTAAGGCCAAAATAGAAGCAATTATAACAACAATAACGGT
AACCGCAATTATGGAGGTGGATAAAGGCACGGAGGTTAAGGATCACACTATGGTGGCAGT
GGACACAGAAATTGA