Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00443100

Standard Name

RRM22 (RNA recognition motif-containing protein 22)

Aliases

PreTt05710 | 50.m00279 | 3681.m00138

Description

RNA recognition motif-containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF07676 ) WD40-like Beta Propeller Repeat
• ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.6%

TetraMine Data

TTHERM_00443100

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_12642.1	9.997093137033517e-262	hypothetical protein (731 aa)
DictyBase	DDB_G0283597	9.9981864321491e-40	eif3B on chromosome: 4 positio n 847464 to 849687
Oxytricha	Contig19782.0.g58	5.001052752541194e-37	Eukaryotic translation initiat ion factor eIF2A
WormBase	WBGene00001225	3.0010664139725277e-29	locus:eif-3.B Eukaryotic tra nslation initiation factor 3 s ubunit B status:Confirmed UniProt:Q9XWI6 protein_id:CA A21681.2
Stentor Coeruleus	SteCoe_160	7.781132241133797e-20
SGD	YOR361C	1.000116773704384e-19	PRT1 eIF3b subunit of the core complex of translation initia tion factor 3 (eIF3), essentia l for translation; part of a s ubcomplex (Prt1p-Rpg1p-Nip1p) that stimulates binding of mRN A and tRNA(i)Met to ribosomes

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00443100(coding)
ATGGTCGATTTATACAAAGAAATAGATTTTTCTTAAGAATTAAAGGATACCCCAGAATTA
GAACCTTTCTTAAAAGCAAAAGCAAAAGAAGAATAGGAAGAATTGAGCTCAGATTATATT
CAAAAGCCATTCTTAGATAGATCATATCATGAGTTTATTATTGTTACTGGTTTACCCAAT
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TTAGAGTGGAACTTTGAAAACAGAAAAAGTTTAATGTCATTATAAATCGGTAACAAGGTC
TATAATTACTGGGTTTCCCATCTAGAAAACGAACTTTAAAACATTTTAATGAAGCCTGTT
GAAGAAGGTTAAGCTCCAGTCAATCCTGAAAATTTGTACACACCCCTTGAAAGCTCTACT
AATGAAATCGTTTGGAGCAAGAATGGTACTTACATGGTTGAAATTTTACCTACTGGTTTC
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ACAAACGAAATCTAGTTCTCTAACAGCAGTGGATTCTTTGTTTTGATTAATAAGGATATT
AATTCTTCCTATTGTGGTTATATGGAAACTGGTTTCACTCGTAAGGATAAGGGCAAATTA
ATTAGTGAAATTACCAGATCTTACAATAACTTATCATATATTGATAGTGCTGCTTACGAT
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GCTTTTGGTGATTAAATTTTCAAGGATACTATAACTGACCCTGCTGGTATTAAAAATATA
ATTTGGAGACCTAGACTTACTCATTTACTTGACGAAAAGTAGGAATCATTAATCCAAACC
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GAACATGAAAGAAGAGAAAAAAGAGACAAATTAAAATAAGAATTCTTAGAATATTTAAAT
GCCAAGAGAAAAGAATGGAAAGATACTAAACAAGAAAGAGTTGCTCTTTTAGGTTTTGAT
GAAGAAGATGAGACTGATATTGTTTATGATGAATTCATTGAAAACGAAAGAGTTGTACAA
ACTGAAATCATTGATGAAGAAGAAATCGAAGATCCTAACAACTGA

>TTHERM_00443100(protein)
MVDLYKEIDFSQELKDTPELEPFLKAKAKEEQEELSSDYIQKPFLDRSYHEFIIVTGLPN
TEAAKTEQFKTFFQNKILQPTALLEKIKVIEFQLDNDGNFQGICILAFDNATNAQEGLNK
LNGLKFMKYQLSAYSLYSFQQALDCPDEFTAPVNLTKRELLEWNFENRKSLMSLQIGNKV
YNYWVSHLENELQNILMKPVEEGQAPVNPENLYTPLESSTNEIVWSKNGTYMVEILPTGF
RLYGGKDLKKLSFFPHPEVKNIEFSPCENYILSYNGTIVDAPNEDNFIVWQLNEVKVLRV
FKAKQQDVWTTMKWSYDGKYIGKIDDHKVSVYELPEMKMLEDSSKNPTSINIRNVQKFFW
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KAGELRGEQKSMIYHTQIYHIEEESKSYTIKDAGRFSNKNTNEIQFSNSSGFFVLINKDI
NSSYCGYMETGFTRKDKGKLISEITRSYNNLSYIDSAAYDQSGRYIFTSSQKTKSFQIWT
AFGDQIFKDTITDPAGIKNIIWRPRLTHLLDEKQESLIQTTYKDYKKTYEEEDDKIINKK
EHERREKRDKLKQEFLEYLNAKRKEWKDTKQERVALLGFDEEDETDIVYDEFIENERVVQ
TEIIDEEEIEDPNN

>TTHERM_00443100(gene)
ATGGTCGATTTATACAAAGAAATAGATTTTTCTTAAGAATTAAAGGATACCCCAGAATTA
GAACCTTTCTTAAAAGCAAAAGCAAAAGAAGAATAGGAAGAATTGAGCTCAGATTATATT
CAAAAGCCATTCTTAGATAGATCATATCATGAGTTTATTATTGGTAATTTGCCTTTATAT
TTTGCATAATATCCAAATGTCTAGATTCATCACAATCATTCATTAATTTGTTTGTTTGCA
AGAAAATTTCATTGATTTCTTATCTATTAAGGCTTTTTTTTATAAAATATTTTTTAATTA
TTATAGTTACTGGTTTACCCAATACTGAAGCAGCAAAAACTGAACAATTTAAAACTTTCT
TCTAAAATAAAATTCTTTAACCAACTGCTCTTCTTGAAAAGATTAAAGTTATCGAATTCT
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ATTAATGACTGAAAATTTAACTTTAGTTAGTTAAATAAGATTAAGATAAAGAAAAATAAT
ATATTAATATAATATAAATTTTCAATTTTAAATCAATCATTAAGTTGTTTAATGTTTAAT
AGAAAATTAGTAATGTAAAAATTAGATGATGTTTAAATTTATTTTTAAAATTAAATCAAA
CAGTATCTGCATTCTCGCTTTCGATAACGCTACTAATGCTTAAGAAGGTTTAAATAAATT
GAACGGTCTTAAATTCATGAAATATTAATTGAGCGCTTATTCTTTGTATAGTTTCTAACA
AGCTCTTGACTGTCCTGATGAATTCACAGCTCCTGTTAATTTGACCAAAAGAGAACTTTT
AGAGTGGAACTTTGAAAACAGAAAAAGTTTAATGTCATTATAAATCGGTAACAAGGTCTA
TAATTACTGGGTTTCCCATCTAGAAAACGAACTTTAAAACATTTTAATGAAGCCTGTTGA
AGAAGGTAATACTTTGTTTATTTCAATAAAAGATATTTTTATTTTCTTCTTTTTAAAAAA
ACAAAAAAAATTAATAAATCAAAAGTTTTTTTAATTTTAGCTTAGTTAGCAAAGTGCTAC
TTGATAATTATTTTAAAAATGGATAGAAAATCAATCGCAATCAATTAAAAAAAACAAATC
AACAATTAACAACCCTTTTAACAATATATTTTGATAGAAATAAAACCTAATTTAGCAATT
ATAATATTTTTTTACTCAATAAAAATTAATTATGCAAATCAGCCACATTAAATTGATAAT
CAGAAATAATCATCGAAATTAACATGCATTAATTTTTATAAAATACAAACGCTTTTTATA
TTGAGATTGTAATATTCTTTTTTATGCCAACAATTAGGTTAAGCTCCAGTCAATCCTGAA
AATTTGTACACACCCCTTGAAAGCTCTACTAATGAAATCGTTTGGAGCAAGAATGGTACT
TACATGGTTGAAATTTTACCTACTGGTTTCAGATTATATGGTGGAAAAGATTTGAAAAAG
CTTTCTTTCTTCCCTCACCCTGAAGTTAAAAATATCGAATTCTCTCCTTGCGAAAACTAT
ATTCTTTCTTATAACGGAACTATTGTCGATGCTCCTAATGAAGATAATTTCATCGTATGG
TAACTTAACGAAGTTAAGGTACTCAGAGTTTTCAAAGCTAAACAACAAGATGTTTGGACT
ACTATGAAATGGAGTTACGATGGTAAATATATTGGTAAAATCGATGATCACAAGGTCTCC
GTTTACGAACTCCCTGAAATGAAAATGCTTGAAGATAGTTCAAAAAATCCTACATCAATA
AATATTAGAAATGTACAGAAATTTTTCTGGTCTAGCAAGTAAAATATTCTTATTGGCTGT
TCTTACTATGGTCCTCATCGTGAACACGATAAGCAAGTCTCAACTAGAATTTCAATGTTT
GAAGTAAGCATTTAAATATTAAAATCAAATTGTTTTTATTTACATATACTGACATTAATT
TGTAATAAAAAGATTCCTAGTAGAAGAGAATTCAAGTGGAGAACAATTAGCAACGAAAGT
TCTGATATTGATATTTTCCCAAGTGTCAATGGTCAATACGTTATTGCCATCATTAAAAAG
ATTAAGAATAAAAAATCTAATTAATAGTCCTCTTCCCATACTATATAAGTTGCCAATATT
CGTAACAAAGGTTAAATGGATATCTGTGAACAAGAAATTAATGAAAAGGTTCACACTTAC
TCTGTCGATCCTTACTAAGGTCGTATTGGTTTAATTTACAAGGCTGGCGAATTAAGTAAG
ATCAATAATTTATTTTGGATAGCTTATAAATTTTAAATTAAATTTGCAAATTATTAGGAG
GAGAATAAAAGTCTATGATTTATCACACTTAAATTTACCATATTGAAGAAGAAAGCAAGA
GTTATACCATTAAAGATGCTGGTAGATTTAGCAATAAAAATACAAACGAAATCTAGTTCT
CTAACAGCAGTGGATTCTTTGTTTTGATTAATAAGGATATTAATTCTTCCTATTGTGGTT
ATATGGAAACTGGTTTCACTCGTAAGGATAAGGGCAAATTAATTAGTGAAATTACCAGAT
CTTACAATAACTTATCATATATTGATAGTGCTGCTTACGATCAATCAGGACGTTACATAT
TTACTAGCTCTCAAAAAACAAAATCATTCCAAATTTGGACTGCTTTTGGTGATTAAATTT
TCAAGGATACTATAACTGACCCTGCTGGTATTAAAAATATAATTTGGAGACCTAGACTTA
CTCATTTACTTGACGAAAAGTAGGAATCATTAATCCAAACCACTTACAAGGATTACAAAA
AAACGTAAATTTTAAATTATTAATGAAACACCATAATAGTAAAATGTTAAAAAAATAGCT
ACGAAGAAGAAGACGATAAGATTATCAATAAGAAAGAACATGAAAGAAGAGAAAAAAGAG
ACAAATTAAAATAAGAAGTAATAATATTAATTGATATGTTATAATTAATAATAATAATAA
TTTATTATAAAATATAAGTTCTTAGAATATTTAAATGCCAAGAGAAAAGAATGGAAAGAT
ACTAAACAAGAAAGAGTTGCTCTTTTAGGTAATTAATTAATTAATTAATTTTATTAAGTA
TATTAATAATTTTATTCACTTATTTATATAGGTTTTGATGAAGAAGATGAGACTGATATT
GTTTATGATGAATTCATTGAAAACGAAAGAGTTGTACAAACTGAAATCATTGATGAAGAA
GAAATCGAAGATCCTAACAACTGA