Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00427410

Standard Name

RRM21 (RNA Recognition Motif-containing protein 21)

Aliases

PreTt14077 | 47.m00272

Description

RRM21 RNA recognition motif protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF00404 ) Dockerin type I repeat
• ( TIGR01649 ) hnRNP-L/PTB/hephaestus splicing factor family
• ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 12%

TetraMine Data

TTHERM_00427410

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_00155.1	9.997093137033517e-262	hypothetical protein (571 aa)
WormBase	WBGene00004207	0.0000000010002658722841845	locus:ptb-1 status:Confirmed UniProt:Q8T3E6 protein_id :CAD30435.1
DictyBase	DDB_G0284321	0.000000007002490258088747	DDB_G0284321 on chromosome: 4 position 1760065 to 1764027
SGD	YER165W	0.000019995566179747357	PAB1 Poly(A) binding protein, part of the 3-end RNA-processi ng complex, mediates interacti ons between the 5 cap structur e and the 3 mRNA poly(A) tail, involved in control of poly(A ) tail length, interacts with translation factor eIF-4G

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00427410(coding)
ATGGAAAATAGCAATGAAAAATCATTATAATTAATTAATTGCTGCAAAAAACAAAGACTA
ATTAAATTGATAATAATCATTTAAGAAACAATAAGCATAGAAATTTATCTTCAATTTAAT
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TTAAATAACTTTTAGATATTACCCGATGGAACTAAATTCGTAATTTTGCCTTCAACAAAA
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GTAGATGATATTATTGAAGATGGCAATTCACCTTAAAAATAGCTGATTTCAAGTGATAAT
TAAGAAGTTACTATTTCATACCATTCTAGCTAATCTTCAAACGCAACATTTAATTCAGGA
AATAATTCTAAAGTAAAGGGAATTAAGAATTTTAATAATAACAACGCTAATAGCAATAAT
TATAATTTTAAACCTACAAACTATAACAGCTAAAAAAATTCACTTCATAATTCTTTTTCA
TAAGAAGAGGTGAATGATTAAAGCAACTACTCTCATATGGCTAATGAATCATCTGTGCAC
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AATGGCAAATATCACACATCAATTAGTAATAGCAACATAAAAAATAACTCCATTCATTCT
GATAACTCATTAAATTTCGGTAAAAAGGCTGTTTGTAGCACTACTAGCCGTAATTAAGGC
TAAAGCTTCTAAAAGCAAGGACATAACTTAACCAATTCTGCTCCAAACGACCTTTGCTTT
TAAAAATCCTCAAATAGTTTACAAAGTGATATATATGAAAATGTTGATGAAAAAACAGAT
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GTTAATAGATTTGACTCTTCTAAAACTACAATGTAGTAAATTTTTAACTTGTTCAGCGCA
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TCTACTGTTGACTTTGCTTGTTAAGCTAAAGATTTGTTGAGCGATACAACTTTTAATGGC
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AAGCCAGAAGACGAAGAATACTTTGAACCTAATGAGAAATTAAATAGATTTAAAAGTGAC
GCTCAGGCCATTATAAATACTCCTATTGATACTTTACACATATCTAATATTAGAATTAAC
GATTGCAACTTCGAAACAATAAAAAAAATTACAGAGCCTTATGGTCAAATTAAAAAAATA
AAATTCATGCTTGAAAAAAATAACAAAAATATGTGTTTAGTCAAATTTGAAACAGTATCA
ATAGCTATGTGGGTTTTAGCTAATGTTCACAATAAAATGATTTCTGATAGACCAATCAAA
ATTTCTTTTTCGAAAAGAACTTTGGAATGA

>TTHERM_00427410(protein)
MENSNEKSLQLINCCKKQRLIKLIIIIQETISIEIYLQFNMNINQSTKDEMTEQKVSLSS
RISVSDQINELKQSKPKETRVLLVTLVNNVNNTVLQHNVYYQAFSNYGEVQRILIFQKIS
PWATFIEMDTVENARNARQKLNNFQILPDGTKFVILPSTKERIEFQEKNVSGIDYTILKQ
KILERQINNEAEALFEQLLKVDDIIEDGNSPQKQLISSDNQEVTISYHSSQSSNATFNSG
NNSKVKGIKNFNNNNANSNNYNFKPTNYNSQKNSLHNSFSQEEVNDQSNYSHMANESSVH
TELDDLNLAQSVYSNVSEEQNGKYHTSISNSNIKNNSIHSDNSLNFGKKAVCSTTSRNQG
QSFQKQGHNLTNSAPNDLCFQKSSNSLQSDIYENVDEKTDISQYVHPQFSQMIKKSKVIY
VNRFDSSKTTMQQIFNLFSAFGNIVKMIFMKSKSAVLIEYSTVDFACQAKDLLSDTTFNG
NIIKIFYSRYENIFFKEAEEKPEDEEYFEPNEKLNRFKSDAQAIINTPIDTLHISNIRIN
DCNFETIKKITEPYGQIKKIKFMLEKNNKNMCLVKFETVSIAMWVLANVHNKMISDRPIK
ISFSKRTLE

>TTHERM_00427410(gene)
ATGGAAAATAGCAATGAAAAATCATTATAATTAATTAATTGCTGCAAAAAACAAAGACTA
ATTAAATTGATAATAATCATTTAAGAAACAATAAGCATAGAAATTTATCTTCAATTTAAT
ATGAATATCAACTAATCTACAAAAGATGAAATGACTGAGCAGAAGGTTTCTCTTAGCTCC
AGGATATCAGTTTCAGATTAAATCAATGAATTAAAATAATCAAAACCAAAGGAGACCCGA
GTGCTCCTTGTAACTCTTGTTAATAACGTTAATAACACTGTTTTGTAACATAATGTTTAC
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AAAATATTTTTTCTTTAAAAAATATATCCTCAGTTTTTAATATAAATTCTAAATTTAGAT
CTTGATTTTCCAAAAAATATCACCATGGGCTACTTTTATAGAAATGGATACTGTTGAAAA
TGCGCGTAATGCAAGATAAAAATTAAATAACTTTTAGATATTACCCGATGGAACTAAATT
CGTAATTTTGCCTTCAACAAAAGAAAGAATTGAATTTTAAGAAAAAAATGTTTCTGGCAT
AGGTAAAAATATTAATTTAATTCTATTTATATTATAAACTCATCATGAATGAATGAATGA
AATGATTATATATTGATCAATTCATAACCAGCAGCACTCAGCTTAATAAATAATATCTTC
TTAAAATTGATGATTGCTAGCCAGCTAATTCAATAAATTAATTTAAAGCCAATTTTTAAT
AATTTGATTAATTTTTTTTCATTTAATTGGTTTTTGATTATTAAGAGAACGAACACAATT
AACAAATTCAAAACAACCTATTACACATTTTTTTTTTTCGAGAGAGTAAAAATCGTTTCA
GTGAATTGCTTCGACATATTCCACAACCAAAATATTTGAGAAATACTTCAGATTTTTAGT
TATTTAGAATCTCAATTTATGATTGAAGAAAGCCATAAGGCTATTTTTTAGAAAAGTATT
CGTTGATTGCAAAATTATTTGAAAAAATGTTTTAATGTCATTAAAATTTACCAATAACCA
TAAAATTACTAGTTTTTTGAAGGAAAATTTTACCATGAGTAAATAAAATTACAAAATTCT
TTCAATATTTTTACAATTAACAAGGACTTTATAGAAAAATAAATAAATAATTTTTAAGTT
CTAAGTAAAATTAAAAAGCTGTTTGTTTCCATCAATCAAATTTATTTAACAAATCAATAA
AAGGCTATTCTTATAATAAGAAAATTTTCTGGTTAAAGCAATTTATTTTTTATTCATAAA
AGATATTTTACAGTTATGCAAATATATTTTTTGGCAAAACAAACATTTTGTAATGAGTTA
GCTAGCTCCTAAATTAATTGTCTTTATTTAGCTTTCTTAACGAATTCAAATTATTTAAAA
AGATTATACAATTCTCAAGTAAAAGATCTTGGAAAGACAAATCAACAATGAAGCAGAAGC
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ATAGCTGATTTCAAGTGATAATTAAGAAGTTACTATTTCATACCATTCTAGCTAATCTTC
AAACGCAACATTTAATTCAGGAAATAATTCTAAAGTAAAGGGAATTAAGAATTTTAATAA
TAACAACGCTAATAGCAATAATTATAATTTTAAACCTACAAACTATAACAGCTAAAAAAA
TTCACTTCATAATTCTTTTTCATAAGAAGAGGTGAATGATTAAAGCAACTACTCTCATAT
GGCTAATGAATCATCTGTGCACACAGAATTAGATGATTTAAATCTAGCTCAATCTGTTTA
TTCAAATGTGAGTGAGGAGTAAAATGGCAAATATCACACATCAATTAGTAATAGCAACAT
AAAAAATAACTCCATTCATTCTGATAACTCATTAAATTTCGGTAAAAAGGCTGTTTGTAG
CACTACTAGCCGTAATTAAGGCTAAAGCTTCTAAAAGCAAGGACATAACTTAACCAATTC
TGCTCCAAACGACCTTTGCTTTTAAAAATCCTCAAATAGTTTACAAAGTGATATATATGA
AAATGTTGATGAAAAAACAGATATATCTCAATATGTTCATCCACAGTTCTCTTAAAGTAA
AATTTACATTAAAAATATTCTTTTTTTAAAATAAAATTGTTGTTATTACTGAATTAAGAA
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CTTGTAATTCACTTACCAAAAATTATTAAAGAATTTTAAGGTAAGTAAAATCTAATTTGT
TGCGAATTAAAAAAAAACCATTAAAATTTAAAAATCGCATAATACAAAAGTTTAAAAAGC
CTCTCTCAAATTAGTTATCTAAAATTTAGAACCTTCGACTATAAAAATACTATTTAAAAT
ATATTTCAAAGAGCTTAATCCAATTTATAAAAATATTAGCTTCATTTTCTCATATTAATT
AATTTTTATTTTATGAATATAGTGATAAAGAAGTCAAAAGTAATCTATGTTAATAGATTT
GACTCTTCTAAAACTACAATGTAGTAAATTTTTAACTTGTTCAGCGCATTTGGCAATATT
GTTAAGATGATTTTCATGAAATCAAAATCAGCTGTTTTGATCGAATACTCTACTGTTGAC
TTTGCTTGTTAAGCTAAAGATTTGTTGAGCGATACAACTTTTAATGGCAACATTATAAAA
ATATTTTATTCAAGATATGAAAATATTTTCTTCAAAGAAGCAGAAGAAAAGCCAGAAGAC
GAAGAATACTTTGAACCTAATGAGAAATTAAATAGATTTAAAAGTGACGCTCAGGCCATT
ATAAATACTCCTATTGATACTTTACACATATCTAATATTAGAATTAACGATTGCAACTTC
GAAACAATAAAAAAAATTACAGAGCCTTATGGTCAAATTAAAAAAATAAAGTAAAAATTC
TTTTTTAATTTATTCCAAATTGAATTTCATAAAAAATATTTAAATAAAATAAATTTAATT
TTAATTCTTCAAATAAAAAACTTTATTAAATAAAATAAATAGATTCATGCTTGAAAAAAA
TAACAAAAATATGTGTTTAGTCAAATTTGAAACAGTATCAATAGCTATGTGGGTTTTAGC
TAATGTTCACAATAAAATGATTTCTGATAGGTAAAATAAAAATTCATTTTTAATAATATT
TGTTTTTTTAAAATTTATTTCTTTAATAAATTAACTAACTTAATTTTTTATAAATTAAAG
ACCAATCAAAATTTCTTTTTCGAAAAGAACTTTGGAATGA