Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00421020Standard Name
RRM20 (RNA Recognition Motif-containing protein 20)Aliases
PreTt07227 | 46.m00282 | 3679.m00132Description
RRM20 RNA recognition motif proteinGenome Browser (Macronucleus)
![]()
Genome Browser (Micronucleus)
![]()
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- protein binding (IEA) | GO:0005515
- nucleic acid binding (IEA) | GO:0003676
Domains
- ( PF00397 ) WW domain
- ( TIGR01661 ) ELAV/HuD family splicing factor
- ( TIGR01622 ) splicing factor, CC1-like family
- ( TIGR01648 ) hnRNP-R, Q splicing factor family
- ( TIGR01659 ) sex-lethal family splicing factor
- ( PF00076 ) RNA recognition motif. (a.k.a. RRM,
- ( TIGR01628 ) polyadenylate binding protein, human types
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.4%
TetraMine Data
TTHERM_00421020
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_10972.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (797 aa)
WormBase WBGene00006807 9.99967697349061e-30 locus:unc-75 status:Confirme
d UniProt:G5EE68 protein_i
d:CAB03896.4
DictyBase DDB_G0291486 7.002116201343823e-26 DDB_G0291486 on chromosome: 6
position 413873 to 415521
Oxytricha Contig18677.0.g10 2.000769134519826e-18 RNA recognition motif_ (a_k_a_
RRM, RBD, or RNP domain)
SGD YGR250C 0.000000000003998907168546896 YGR250C Putative RNA binding p
rotein; localizes to stress gr
anules induced by glucose depr
ivation; interacts with Rbg1p
in a two-hybrid
Stentor Coeruleus SteCoe_10259 0.00000000003775134544279098
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00421020(coding)
ATGCAATTTTAACAATATTCAAGTTCCAGTAGCAAATCAAATAAATTGGGAGGTCAGTAA
TACTATCATCAAGAAAAGCATTATAAAAACGCTGAATAAGAAGATTCTAATTCCTCTCTT
GAAAACAAATCAAAAGGCGGCTAAAAATATAAAAGAAAATAAGTTGAAATAAAGCTATTT
GTAGGCCAAATCCCTAAAACATGGGAAGAGAATGATTTGAAAACATTTTTTGAGAAGTAT
GGTGAAATTGTGAAAGTTTAAGTAATCAGAGACAAAAATAATTAGCACAAAGGGTGTGCT
TTTGTTGTTTTTGCCTCTATTTTATGCGCCAATATTGCAATTGAAGCTCTCAAAGCAACT
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CTAGGAATCAGACAAGACCAAGACTATGTCTTATATGTAGCTCATATTCCTAAAAATGCA
TCAGAGCCTGAAATAAGAAATGTTTTTGAAAACTATGGAATTGTTAAAGAAGTTGATATC
CCTAAAGATTAATCTGGAACAAGCAGAGGATTTGTTTTTGTGAAATTTGAAAATATTGAA
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TCCTTAGTGGTCAAGTTTTATGATCCTAAAAAGAAATAAACTCAAGGAAATTAAGGACCA
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CATCACTCAAATAGGGATAACTAAGGACAGTCTAATTATTATCCATCTTCTTCATAGCCT
TAAATGTACTCATAAGGTTAATAGCCTAACCAAAGAAACTCTGACAATTATAATTACCAA
AGAGAATAGCACTCTAATTATAACTAAGGAAGCTAGTCATAAGGATATAGAGGAGGATAA
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GATAGCTTCTAAAGTCACTCTTCTAATTTTAGAGAGTAATATGGCAATCAAAATCTCCAA
TAATCATAACATAATAACGGTTATCCTCACCATAATCGTAACAACAACAGCAACAACAAT
AACAGTAATAATAGCAGCAACAATAACTTTTAGTATAGCAGTAGCTACCCCTCTAATTAG
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AGTAATGACTATAACTACCAAAACCCTTAGTAAAACGACTATGTTCCTCCACCACAAGGA
CAAAATAACTTTTAGTTTAATGATTATTAACAGCAGCATCACAGTAATAATAATGGACCT
GTTCCAAATAGTGCTAATAATAATTAAATTTAATAGTTTAATCCATACTATAATAACGAA
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TAACCTCCATAATAAATACCTTAACATGAAATAAATTAACCTCCATTATTCAATATGCCA
TAATAATAACAACAACCAATAAACCCATAGCCTTCATTAGACATTTCTTAGCCTAGTAGT
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CTATAAGTTGGAAGTAAATAAAAATTAAAGTATGAGTTTTAAATTAAATATAATTTACAT
TAAATAGAGAAAAAGCTAAAAGTAGAAGTAAAAAAAGGTCAAGGTGATGGAGATTTACCA
CCTAGTCTTAGTTAAAATGGATATTAACCCTTTTGA>TTHERM_00421020(protein)
MQFQQYSSSSSKSNKLGGQQYYHQEKHYKNAEQEDSNSSLENKSKGGQKYKRKQVEIKLF
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QQQQQPINPQPSLDISQPSSGYQEPIPAVEPNQQPIQQKAYIKYYTDDKVPYYYDTQTQS
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FIFHLPNDYRDSDLLRLFKKFGDLLSARVITRPDGSSKGYGFVSYTSPDGAQQAIQQMNG
LQVGSKQKLKYEFQIKYNLHQIEKKLKVEVKKGQGDGDLPPSLSQNGYQPF>TTHERM_00421020(gene)
ATGCAATTTTAACAATGTGAAATTTGATTTAATCTTCATTACAATAATGAGGATATTATT
TTACATGCAAACATTTTTTATGAACGATTTTAACTTATTATTCAACCTAACCTTCCTTTT
CTATTATTTGTACAATTCTTAGATTCAAGTTCCAGTAGCAAATCAAATAAATTGGGAGGT
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TCTCTTGAAAACAAATCAAAAGGCGGCTAAAAATATGTGCGAAACAATCATATAATTTAT
TTATTTATTTGCATATTTTATGAAAGTATCTGCAAGAGATTGATAAACAATTTCAAAATT
CTCAAAAAAAAAAAAATAAACTCATTTGAGAAATTATTAAAACTTAGAAAGCAGATACCA
AAAAAATTTGATGCACAAGCTCATAGACTATAATAATATATTGATGTATTTTTCTTTTAA
ATATAGAAAAGAAAATAAGTTGAAATAAAGCTATTTGTAGGCCAAATCCCTAAAACATGG
TATCATTTTCTTTTTGCATTTCTATTTTATATTTTTATGTAGGATGACACTACTAACTAA
CCTTGGGTGATGCTGCAAAAAATTAAGATTAAGAAAGAATACATTTCATTTCATTACATG
CATGAATCAATCAATCAATAACTTATTTTTAATTATAATCAAAAATAAATAACACAAAAT
TTATTTCATTTGCTCTATTAATAAAATATGTATAAAATTTTATTAATAGACACATATAAA
CAATTAATATTTAATCAAATTCTGTACTGCACCTTTTTTACAGTTTAATTAAATTTTGAT
TCTTTCTCTTGTTTTTTTTGAAAGCTATCACCCTAGCAAATAAATTTTCATTTATAATTA
ATTATTTTTTGATCTTTCTTTCTTACTTACTTACATTTATTTTGTTTGTAAACTTAAAAA
ATTTCATTTATATTTGATTTAAGGGAAGAGAATGATTTGAAAACATTTTTTGAGAAGTAT
GGTGAAATTGTGAAAGTTTAAGTAATCAGAGACAAAAATAATTAGCACAAAGGGTGTGCT
TTTGTTGTTTTTGCCTCTATTTTATGCGCCAATATTGCAATTGAAGCTCTCAAAGCAACT
AAATTGCCTGGAGTATATTTGAAATTATATATAAATATATATACATATACATTTTTTCAA
CCAATATTTTGTGAAAGAATAAATTCTATTGTTGAATGGCAAACCCATTTTCTATCAACA
TTTATTGAAATTATGTTTTCAATAAATTAATTCATTCACTCATTAACTGTTTATTTATTT
AAAATCCCATTTTTTTCAAAGGTTTGTAGGCAAACAATTTTTTTTTCAATTGTTTATTGA
AAATCCAATTTTGTTTATATTTTTTTTATGGGCTTTTCGTTTTTTGTTTGTCAAGTTTTA
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GACTATGTCTTATATGTAGCTCATATTCCTAAAAATGCATCAGAGGTGAGCTATTTATTT
TTTCAAACTTTGAATTTATGCTCTATCTATTTTAAAAATAAATCAAGTGATATTTTTTAC
ATTTATATAATACTAGCCTGAAATAAGAAATGTTTTTGAAAACTATGGAATTGTTAAAGA
AGTTGATATCCCTAAAGATTAATCTGGAACAAGCAGAGGATTTGTTTTTGTGAAATTTGA
AAATATTGAACAAGCTATTTTAGCCAAATAGGCTCTCCATGAAAAATAAGTTTTAAATAA
TCAAACACAGTCCTTAGTGGTCAAGTTTTATGATCCTAAAAAGAAATAAACTCAAGGAAA
TTAAGGACCATAGTAAGGTCAATCTGGCAATTCTTCAAACAGTAAATGCTTTTTTTTTTT
AAAGAGATAAATAAAATATATTATTTAAAAAAAATAGATTACAACAACAATGGACAGGGA
TAGCCTCATCACTCAAATAGGGATAACTAAGGACAGTCTAATTATTATCCATCTTCTTCA
TAGCCTTAAATGTACTCATAAGGTTAATAGCCTAACCAAAGAAACTCTGACAATTATAAT
TACCAAAGAGAATAGCACTCTAATTATAACTAAGGAAGCTAGTCATAAGGATATAGAGGA
GGATAAGGAAATTATCACGGGCATCATGAAAGCAAAGGGTCCTATAACTAAAATAATTAA
AATTACCCAAGAGAAAGTGCCAATTTAAACAACAGTGAACATTATGATTAGCCAAGCTAG
TCGTTCGATAGCTTCTAAAGTCACTCTTCTAATTTTAGAGAGTAATATGGCAATCAAAAT
CTCCAATAATCATAACATAAGTAAATTTTTTATTTTTATTTTTAACTTGTAAAAAGTATT
TAAGTATTTTCATTTTTAATTAGTAACGGTTATCCTCACCATAATCGTAACAACAACAGC
AACAACAATAACAGTAATAATAGCAGCAACAATAACTTTTAGTATAGCAGTAGCTACCCC
TCTAATTAGCCTGCTGGAAATAATTTGAGCAATTAGCAATTTAATTAAACTTATAATAAC
AGCAACTAGAGTAATGACTATAACTACCAAAACCCTTAGTAAAACGACTATGTTCCTCCA
CCACAAGGACAAAATAACTTTTAGTTTAATGATTATTAACAGCAGCATCACAGTAATAAT
AATGGACCTGTTCCAAATAGTGCTAATAATAATTAAATTTAATAGTTTAATCCATACTAT
AATAACGAAAATTTTGATAACTATAACAATCCTTAGATTCACAACGAATAGCCCAGCTTT
ACTCCAAATTAACCTCCATAATAAATACCTTAACATGAAATAAATTAACCTCCATTATTC
AATATGCCATAATAATAACAACAACCAATAAACCCATAGCCTTCATTAGACATTTCTTAG
CCTAGTAGTGGTTACTAAGAGCCAATCCCTGCTGTAGAACCTAATTAATAGCCAATTTAA
GTAAAATCTTTGTTTCCAATTAAATTATTTATTCTTTTTTATTTAATAGCAAAAAGCCTA
TATTAAGTATTACACTGATGACAAAGTCCCTTATTACTATGATACTCAAACTTAATCTAC
ATCATATGACTAACCTCCTTTAGGATCGATAATATATAATCCAGATGGAACACAAGAACA
TGTATAACCAGAAAGCATCGAACAACTGCAAAAATTTTAACAAGAAACAGGATTAGCAGA
AAATAAAGAACTTGAAATTTTATGTAATAAAAAGTTTTTAATTAAAGTTAAATTAAATTA
ATTAATTAAATTTTTTAAAGCCTAAAAAACAACAGGACCTCCAGGAGCTAATTTATTCAT
TTTCCATCTTCCAAACGACTACCGTGATTCAGATCTTTTAAGACTCTTCAAAAAATTCGG
TGATTTGCTCTCCGCAAGAGTTATCACACGTCCTGATGGTTCTAGCAAAGGCTATGGTAA
AAAAAAAAATTAAAATAAATTTAATTTAAACATTTAATTTTATTTGAACTAGGTTTTGTA
AGTTATACAAGCCCAGATGGTGCTCAACAAGCTATACAGTAAATGAATGGCCTATAAGTT
GGAAGTAAATAAAAATTAAAGTATGAGTTTTAAATTAAATATAATTTACATTAAATAGAG
AAAAAGCTAAAAGTAGAAGTAAAAAAAGGTCAAGGTGATGGAGATTTACCACCTAGTCTT
AGTTAAAATGGATATTAACCCTTTTGA