Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00047480Standard Name
RPS1 (Ribosomal Protein of the Small subunit 1)Aliases
PreTt11227 | 3.m01917 | 3824.m02985Description
RPS1 40S ribosomal protein S3a; Homolog of yeast RPS1- human RPS3AGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
Cellular Component
- ribosome (IEA) | GO:0005840
- intracellular (IEA) | GO:0005622
Molecular Function
- structural constituent of ribosome (IEA) | GO:0003735
Biological Process
- translation (IEA) | GO:0006412
Domains
No Data fetched for Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%
TetraMine Data
TTHERM_00047480
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_01703.1 2.9990501533945683e-168 ribosomal S3Ae family protein
(266 aa)
SGD YLR441C 3.9997119520108244e-79 RPS1A Ribosomal protein 10 (rp
10) of the small (40S) subunit
; nearly identical to Rps1Bp a
nd has similarity to rat S3a r
ibosomal protein
Oxytricha Contig850.1.g11 7.000846320060671e-65 Ribosomal S3Ae family
WormBase WBGene00004470 3.0014802379878627e-60 locus:rps-1 40S ribosomal pr
otein S3a status:Confirmed
UniProt:P48154 protein_id:C
AA83605.1
DictyBase DDB_G0277345 2.9997246065828143e-59 rps3a on chromosome: 2 positio
n 7795600 to 7797187
Stentor Coeruleus SteCoe_1787 1.8048513878454153e-35
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:21205638: Rabl J, Leibundgut M, Ataide SF, Haag A, Ban N (2011) Crystal structure of the eukaryotic 40S ribosomal subunit in complex with initiation factor 1. Science (New York, N.Y.) 331(6018):730-6
Sequences
>TTHERM_00047480(coding)
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TCTAGAAAGGGGCTTTGA>TTHERM_00047480(protein)
MLYIKKKIITIQFGSLENLNLSNGDVLEREDVLGFLFNLLGVVFSDEVLGEFSNTQLSGF
IGDEGVDLSSDGSDLRRLSITSRGGRLLTSRGLLGESKSENSDDVTVVGLAVNSSFDESL
PLSDHGAQSVSGDVQTVEREERNSNHDGKILTVAGALGDEGLTEGLGGEGDGGSEVVPFL
SRKGL>TTHERM_00047480(gene)
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CTCGGTGAATGTTATATAATCGTTTATCATTTAAAGGAGATTTAAAGTTGTCAGATATTC
GAAAAAATGGCGATATTCAAAAAATGCAATTCGTTTTGAAAATAAGGAAAATAGAGGAGA
GAAATAGTAATCATGATGGAAAAATTCTTACTGTTGCCGGAGCTCTTGGTGACGAGGGTC
TTACCGAAGGACTTGGAGGAGAAGGGGATGGGGGCTCTGAAGTCGTACCATTCCTTTCTA
GAAAGGGGGTCGATAGTTCTCTTCTTGGCGCCCTTCTTACCACCACCAGCCTTCAAACCA
GGATTCTTACCTTGAGTCATTTTTACTTTTGTTCCTTTTTTGTTTTGTGTTTTATTATCT
TTAATTATTTCTTAAAAAATTACCCTTGTATTGCTTTTTTAGCTTTGA