Gene Model Identifier
TTHERM_00578940
Standard Name
RPN5
Aliases
PreTt05787 | 78.m00159 | 3733.m00633
Description
Fusion of uncharacterized protein and 26S proteasome subunit.
PCI domain containing protein
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Cellular Component
( PF01399 ) PCI domain
( PF08524 ) rRNA processing
( PF04702 ) Vicilin N terminal region
( PF05073 ) Baculovirus P24 capsid protein
( PF06102 ) Domain of unknown function (DUF947)
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Signal Peptide Present?: No
TTHERM_00578940
Fullscreen View
No Data fetched for StockID
(v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_16310.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (432 aa)
Oxytricha Contig21741.0.g7 1.0002223712504345e-79 PCI domain
DictyBase DDB_G0281051 8.999119107228014e-72 psmD12 on chromosome: 3 positi
WormBase WBGene00004461 3.998862432046419e-53 locus:rpn-5 status:Confirmed
SGD YDL147W 7.999866353200662e-52 RPN5 Subunit of the COP9 signa
Stentor Coeruleus SteCoe_7042 4.780892883885469e-25
No Data fetched for General Information
Ref:21637855 : Xiong J, Yuan D, Fillingham JS, Garg J, Lu X, Chang Y, Liu Y, Fu C, Pearlman RE, Miao W (2011) Gene network landscape of the ciliate Tetrahymena thermophila. PloS one 6(5):e20124
>TTHERM_00578940(coding)ATG GAA ATT GAA GAA AGC TCC GAA TTC GAT AGA TAG ATT GCT TCC CTC CTC GAA AAG GAA AGA GAA GCT CGT CTC AAT AAC AAG AGT GAA GAA CTT GTC AAC ATC GTT AAA CAA ATC GTC AAA TTA GCT TGG GAA GTA AAA AAT TAT GAC AAG CTC TTT GAA CTC ATG ACT ACA CTT TCT TAA AGA AGA GGT CAA AGC AAG AAA GCT TAA ACT GAT ATG ATC CAA ATT GCT ATG GGA TAT ATA GAT TAG ATT TAA GAC ATT CCC ACT AGA ATT AGA TTA ATC GAA ACT ATT AAA AAC ATT TGT GAT AAA AAA ATT TAC TTA GAA GTA GAA TAT GCT AGA TGT TGT CTA AAG CTC GTT AAA TAC AAG GAA AGT GAT AAC GAA ATT AAT GAA GCT GCT AAG ATT TTG CAA GAA GTT TAA GTT GAA ACT TAT GGC TCT ATG GAT AAG AGA GAA AAG ATT GAA TTC ATC TTA TAT CAA ATG AAG ATC ATG CTT AAG AAG AAA GAT TAC ATT CGT TTG ATG ATT ATT TCA AAG AAG TTA ACA CCT TAA GCC TTA AAT GAT AAA ACA ATA GTT GAT TTG AAG ATT TAA TAT TAC GCT TAT TTA GTT GAA TAT TAC TAT CAT GAA AGC ATA TAT TTG CAA GTT TCT AAC TGC TTC TAA CAG ATT TTT GAT GCA GTG AAT GAT AAA ATA AAC AAG GAC ATT GAA TTG CCT ACT GTT TTG GAT TTT AAC TTT GAT GCT TCC TTC TAG ACT ACA TTT GAA AAT TTT GTT GCT TAC CTT CTC ATC AAT AAG CAC TGC CAT GAA TAG GTT TAA TTG TTA CAG AAA TTA GTA AGC AGC AAG TAT AAA CAC ATT CTA GAA AGA TAT CCT GCT TTG AAG AAT GCA GTT GAA TCT TAC TTA TTA GAT GAA TTA ATT TCT ACA GAC CCT GCA AGT TAC AAT TTA CAG AAT ATT TAA TGT TTT TCT AGA CCT GAA AAG TCA GTT CAA CAC ATA ACT GAT TTC AGA AAA TAA TTA ATT CAT CAC AAT ATT CGT GTT ATT AAT AAG TAC TAC TCT TAA ATT TCT TTA TCC CGT CTT GCT GCA TTA TTG AAT ATT TCT TAA GAA GAA GCT GAA AAT GAG CTT TGT GAA ATG CAA AAC GAC TAG CTA GTA AAT TGC AAG ATT GAT CGT TTG GAA GGC GTA GTT AAT TTC AAG CTT AGA CGC TCT GAG AAC GAT ATT CTC AAC GAA TGG GCT ACC GAT GTT AAC TAA ATC TTA TCA TTG ATT GAT CAT ACT TCT AAC TTA ATT AAG AGA GAA GAA GAA TAA TAC ATC GAA GCT AAG TGA >TTHERM_00578940(protein)M E I E E S S E F D R Q I A S L L E K E R E A R L N N K S E E L V N I V K Q I V K L A W E V K N Y D K L F E L M T T L S Q R R G Q S K K A Q T D M I Q I A M G Y I D Q I Q D I P T R I R L I E T I K N I C D K K I Y L E V E Y A R C C L K L V K Y K E S D N E I N E A A K I L Q E V Q V E T Y G S M D K R E K I E F I L Y Q M K I M L K K K D Y I R L M I I S K K L T P Q A L N D K T I V D L K I Q Y Y A Y L V E Y Y Y H E S I Y L Q V S N C F Q Q I F D A V N D K I N K D I E L P T V L D F N F D A S F Q T T F E N F V A Y L L I N K H C H E Q V Q L L Q K L V S S K Y K H I L E R Y P A L K N A V E S Y L L D E L I S T D P A S Y N L Q N I Q C F S R P E K S V Q H I T D F R K Q L I H H N I R V I N K Y Y S Q I S L S R L A A L L N I S Q E E A E N E L C E M Q N D Q L V N C K I D R L E G V V N F K L R R S E N D I L N E W A T D V N Q I L S L I D H T S N L I K R E E E Q Y I E A K >TTHERM_00578940(gene)ATG GAA ATT GAA GAA AGC TCC GAA TTC GAT AGA TAG ATT GCT TCC CTC CTC GAA AAG GAA AGA GAA GCT CGT CTC AAT AAC AAG AGT GAA GAA CTT GTC AAC ATC GTT AAA CAA ATC GTA ACT CAT TCT TTT AGA AGT CAT TAT TGA TTA TTG TGT AAT GAA TGA GCT TTA TTG CAG TGT CTT TCT TTG CAA TTA GGT GCC ATT ACA TAA AAA TTG AAG CTT ATT TTT ACT CGA GAT TAA TAA TAG AAT TAT GTT TTC TTT CAT ATA TTT CTA TTA AAA TTT TTT TAT TGT AAT AAA TAG GTC AAA TTA GCT TGG GAA GTA AAA AAT TAT GAC AAG CTC TTT GAA CTC ATG ACT ACA CTT TCT TAA AGA AGA GGT CAA AGC AAG AAA GCT TAA ACT GAT ATG ATC CAA ATT GCT ATG GGA TAT ATA GAT TAG ATT TAA GAC ATT CCC ACT AGA ATT AGA TTA ATC GAA ACT ATT AAA AAC ATT TGT GAT AAA AAA ATT TAC TTA GAA GTA AAA ATT AGA TTT AAA TAA TAA ATT TTT TAG AGG AAG GAA TTA CTT TCT TAA AAT AAT TTA AAA ATA ATG CGA ATT TGA AAT AAA GTA TTT CTT GTT TTA ATA AAT AGG TAG AAT ATG CTA GAT GTT GTC TAA AGC TCG TTA AAT ACA AGG AAA GTG ATA ACG AAA TTA ATG AAG CTG CTA AGA TTT TGC AAG AAG TTT AAG TAG ACA TTT CCT TTT ATT TTA TTT AAT AAT AAA TAT ACA AAT AAA AAA GAT ACG CTA AAA ACG ATA TTT GAA ATT TTT CAA TAA AAA TTT GAA TAC ATT CAA TTC ACA AAT TGA CTA TTA ATA ACT ATG AAT CCT ACT TAA ATT AAT TAT TAC TAA AAG CAA ATC AAG ATT TAA ATC TTG AAT TCC ATT TTA CAC ATT ACT ACA TAG TTT AAA TTG AAG TAT TTT AAA TTT AAA GCT TGC AAA AAG AGT TAT CAT TTT GAG AAA TAG CAA ATA AAA ACT AAT TTT AAA CAG ATA ATA TTC TTA AAA TTA AAT ATT TTT TAT GAA TAA TCA ATG TAC TTT GAA TAA TAA AAT AAT TAC TAT TCA ATC AGA CAA TTT TAG CAT TGA TTC TCT TTA ATA AGC ACA ATA AGA ATA ATT AAT AAT TAA AAT AAT TAT TAT TTA GGT ATT GAA ATA ATT TAA TTA ACA ATT TTA CTG AAT TTA ATT TTT TAA GAT AAA GTT AAA TGA ATT TCC TCA ACA ATA AAA AAG ACA TAG TTT TTG TTT AAG AAA TGA TTA ATA ATT TTT TAG ATC ATC CAT ATA GAA AAT AAT TTT ATT ACA ACA CTC TTA ATT TAT AAA ATG TGT TAA TTA ATT ATA ATT AAA TAT ATA ATA TTC TTC AAT AAA TAA ATA GCT TGA TAT CAT ATT TTT ATA TAT TTA AAA ATA TTA TTA TTA TTC ACT CAT AGT TTA GTT TGA ATA TGA AAT ATG AAA ATG AAA TTA TTT TAA TAA TGT GAT TAT TAT AGA ATG ATT ATT AAC TTA TCT ATT TAT TTA ACG AAT AGG TTG AAA CTT ATG GCT CTA TGG ATA AGA GAG AAA AGA TTG AAT TCA TCT TAT ATC AAA TGA AGA TCA TGC TTA AGA AGA AAG ATT ACA TTC GTT TGA TGA TTA TTT CAA AGA AGT TAA CAC CTT AAG CCT TAA ATG ATA AAA CAA TAG TTG ATT TGA AGA TTT AAT ATT ACG CTT ATT TAG TTG AAT ATT ACT ATC ATG AAA GCA TAT ATT TGC AAG TTT CTA ACT GCT TCT AAC AGA TTT TTG ATG CAG TGA ATG ATA AAA TAA ACA AGG ACA TTG AAT TGC CTA CTG TTT TGG ATT TTA ACT TTG ATG CTT CCT TCT AGA CTA CAT TTG AAA ATT TTG TTG CTT ACC TTC TCA TCA ATA AGC ACT GCC ATG AAT AGG TTT AAT TGT TAC AGA AAT TAG TAA GCA GCA AGT ATA AAC ACA TTC TAG AAA GAT ATC CTG CTT TGA AGA ATG CAG TTG AAT CTT ACT TAT TAG ATG AAT TAA TTT CTA CAG ACC CTG CAA GTT ACA ATT TAC AGA ATA TTT AAT GTT TTT CTA GAC CTG AAA AGT CAG TTC AAC ACA TAA CTG ATT TCA GAA AAT AAT TAA TTC ATC ACA ATA TTC GTG TTA TTA ATA AGT ACT ACT CTT AAA TTT CTT TAT CCC GTC TTG CTG CAT TAT TGA ATA TTT CTT AAG AAG AAG CTG AAA ATG AGC TTT GTG AAA TGC AAA ACG ACT AGC TAG TAA ATT GCA AGA TTG ATC GTT TGG AAG GCG TAG TTA ATT TCA AGC TTA GAC GCT CTG AGA ACG ATA TTC TCA ACG AAT GGG CTA CCG ATG TTA ACT AAA TCT TAT CAT TGA TTG ATC ATA CTT CTA ACT TAA TTA AGA GAG AAG AAG AAT AAT ACA TCG AAG CTA AGT GA
Login
Recent Activity
Recent Papers
Identifiers and Description
Gene Ontology Annotations 
Domains
Gene Expression Profile
Signal Peptide
Homologs (v.2006 protein sequences)
General Information 
Associated Literature 
Sequences
