Gene Model Identifier
TTHERM_00442210
Standard Name
RPN2
Aliases
PreTt05621 | 50.m00190 | 3681.m00049
Description
RPN2 26S proteasome regulatory complex subunit RPN2; Proteasome/cyclosome repeat family protein
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Cellular Component
( PF02985 ) HEAT repeat
( PF05972 ) APC 15 residue motif
( PF07719 ) tetratricopeptide repeat
( PF07721 ) Tetratricopeptide repeat
( PF01851 ) Proteasome/cyclosome repeat
( TIGR01716 ) transcriptional activator, Rgg/GadR/MutR family, C-terminal
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Signal Peptide Present?: No
TTHERM_00442210
Fullscreen View
No Data fetched for StockID
(v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Stentor Coeruleus SteCoe_34358 0
Tetrahymena borealis EI9_12556.1 9.997093137033517e-262 proteasome/cyclosome repeat fa
DictyBase DDB_G0287953 9.997093137033517e-262 psmD1 on chromosome: 5 positio
Oxytricha Contig8285.0.g24 9.997093137033517e-262 Proteasome/cyclosome repeat
SGD YIL075C 9.997093137033517e-262 RPN2 Subunit of the 26S protea
WormBase WBGene00004459 4.998121237022794e-130 locus:rpn-2 26S proteasome n
No Data fetched for General Information
Ref:21637855 : Xiong J, Yuan D, Fillingham JS, Garg J, Lu X, Chang Y, Liu Y, Fu C, Pearlman RE, Miao W (2011) Gene network landscape of the ciliate Tetrahymena thermophila. PloS one 6(5):e20124
>TTHERM_00442210(coding)ATG AGT TTA AGC AGC GTT AGA TAG TAC TTG CAA TTA TTG TAA GAA AAG GAT AAT GAG CTA AAA GTT ATT GGA TTG GAA AAG TTA GTT TCT GTT GTA GAA ACC AAC TGG GCT GAA ATA GCT GAT CAT CTT GGA GAT ATT GAA AAT TTA TAT GAA GAT GAG TCA TTC CCT AAG AGA TAG TTG GCC TAT TAC TTG GCA TCT AAG GTA TAT TTC AAT TTA GAA GAA TAT GAA GAT GCC CTA GAC TTA GCT TTA GAA TCA TAA GAA TAC TTT TAA GTT GAT GAA AAC ACA TAA TTT GTA GAA GTT TTA GTT AAT ACT TGC ATT AAT AAA TAT ATT ACT CAT AGA TAA TCT GAC TAG ACC ACA AAG TTA AAT CCT AAA TAT GAA TCT ATA GTT GAA CGT ATG TTT GCA AAA TGT TAG AGG GAT TAA GAT TAT AAA AGC GGT TTA GGT ATT GCA GTA GAA AGT CGT AGA ACT GAT AAA ATT AAT GAA ATA CTC TCC CAA TCA GAA GAA TCT AAG CGT GGT GAA TTA GTG AAT TAC TTA TAT GAT GTT TGT ATT AAA TCA TTA AAC AGC AGA AAT TAT CGT ATT GAA ATT ATG CAA CTC TTG ATT TCA TTT TAC AAA GAA AAA CTT GCT TCT CAA GGA TTG CTT CCT CAT GAA TAT ATT AAT TTA AGT TTA AGC TAC CAC ACT TTA GGA AAG TAT GAA GAG TGT TCA TAA TTA ATT GAT GAT CTT CTT GCC AAA AAT ATA CCT CTT GCC TAT CAA GTA GCC ACA GAA ATT AGT GAA ACT TAA AAT TAC AGC TTT ATT AAG AAG GTT ATT CAA GCT TTA CCA ATT GAG GAA AGT AAC AGC GAA AAG CGT AAA ACA GTC ATA GAT ATT TTA GAT GGT AGA ACA TAA AGA GAA ATT AAC TAA AAA GTT CTT GAA CAT TTA AAT AAA AGT GAT CCT CTC TAC ATC AAG CAA ATC CAT TCT GCA GTT GAC TCA AAG AAA TCA GTT GCT CAT ACT GCT TTG ATT CTC TGT AAT TCT ATT TTG AAT GCA GGA ACT GGA AAC GAT TAA TTC GTT AAA GAT AAT ATT GAT TGG GCT TAA AAA AGT TAA TTG TGG GCT AGA TTC GCT TCT TTG GCC TCT TTA GGT ATG ATC CAC TCT GGA AAA CCT GAA TAA GCT AAA TAA ATT TTT GCA AGT CAT CTT CCC AAG GGA TAA GCA GGT GGT AAC ACC GGA GGT GCT CCT AAT TAC TAC AGT AAT GGA GGT GCA TTA TAT GGT ATA GGT ATT ATG CAC AGT GGT ACA CGT GAT CCC GAA ACT ATT AGA TAT TTA ACA GAT ATT ATT AAA GAC CCT CAA TAA AAT AAA TAA GAA CCT ATT CTT CAT GGT GCT TGT CTT GGG CTT GGT CTT GCA GGT TTG GCT TCT GAA GAT GAA ACC TTA TTC GAA GTT TTG AAG AAT GTT TTA ATG AAC GAC AGT GCA GTA ACT GGT GAA TCT GCA GCA CTT GCT ATT GGT CTT ATC ATG GCA GGA ACA AAT AAT GAA AAT GCA ATT ACA GAA TTA TTG AAG TTC GGT TCT GAA ACA CAA CAT GAA AAA ATT ATT AGA GCA ACT GGT CTT GCT CTT GCT TTA GTT TCT TTC GGA TAA GAA GAA AAT GCT GAC GGT GTT ATC GAA TCA CTT CTT ACT GAT AAA GAT TTT ATT CTT AGA TAC GGT GGT GTC TTA ACT GTT GGT CTT GCT TAT GTT GGT ACT TCC AAC AAT AAA GCT ATT AGA AAA TTA CTT CAT TAT GCA GTT GAT GAT GTT GCT GAT GAT GTC AGA AGA GCA GCT GTT ATC GCA TTA GGT TTT GTT ATG TTT AAC TAA TAT GAA CAA ATG CCT AAA ATT ATG AAT CTT TTA GCC ATG AGT TAT AGT CCT CAC GTA AGA TAT GGT ACT GCC ATT GCT TTA GGT ATA GCA TGC GCT GGC ACT GGA TAC TAA GAA GCC TTA AAT ATG ATT GAA CCA ATG CTC ACT GAC ACC ACT GAC TTT GTA AGA TAG GGA GCT ATG ATT GGT ACA GCT CTT ATT TTA CAA TAA GCC AAT TAA AAC TCT GAA CCT AAA TTA GAA AAA TTC AAA AAG ACT CTT TAA AGC GTT TAT TCT AAA AAG CAC GAA GAT ATT TTA TGT AAG ATG GGT GCC ATA CTT TCA TCT GGT ATT ATT GAG GCT GGT GGA AGA AAT TAA GTT GTT AGA CTT GCT TCT TAA TAA GGT TTC CCT AAA TTA GCT AGT TGC GTT GGT ATG GTT ATT TTC ACC AAT TTC TGG TAC TGG TTC CCT TAT GTT AAC TTC ATT AAT TTG AGT TTT GCT CCT TCT GCT TTA ATT GGT ATT GAT TAA ACC TTA CGT ATT CCT ACA GAC TTC AGC TTT AAA ATT AAT ACA AAG AAG AGC ACT TAT GAT TAC CCT GAG CCA ATT AAA TAA GAT GAC AAC AAA GAT AAA AAG GAA TTT GAA AAG GTA ACT CTT TCA ACA ACT AAC AAG GCT AAG GCC AGA GCT GCT GTC AAA ATT GAT GCT AAA GAT AGT AAA ATG GAA GAA GAA GTT GCT GGT ACA AGT TAA GCT GAA AAT AAA GAA AAG GCA GAA GAA AAA ACT GAA GAA AAA GAG CCA AAT TCT TAT ATT TAA ACA AAT CCT GGT AGA GTA CTT GAG AAA TAA AAG AAA TAT GTT GAG TTT ATA GAG AAT CAT AGA TAT CAA CCT ATT ATT AAA GAA AGA AAA TTC GGT ATT GTA TTT TTA AAT GAT ACA TAA AAT TCA GAT GAT GCC AGC TAC CTT GGA GTT GCT AAA AAA TAA GCT GAA TAA AAA TCT GAA ATG GTT CCA GAA CAA GCT GTT GGT GAC TAA AAC GAT GAT ATA GCT CCA CCT GAG GAC TTC GTC TAT GAT GAA AAC TAA TAA CTT TTG AAT TGA >TTHERM_00442210(protein)M S L S S V R Q Y L Q L L Q E K D N E L K V I G L E K L V S V V E T N W A E I A D H L G D I E N L Y E D E S F P K R Q L A Y Y L A S K V Y F N L E E Y E D A L D L A L E S Q E Y F Q V D E N T Q F V E V L V N T C I N K Y I T H R Q S D Q T T K L N P K Y E S I V E R M F A K C Q R D Q D Y K S G L G I A V E S R R T D K I N E I L S Q S E E S K R G E L V N Y L Y D V C I K S L N S R N Y R I E I M Q L L I S F Y K E K L A S Q G L L P H E Y I N L S L S Y H T L G K Y E E C S Q L I D D L L A K N I P L A Y Q V A T E I S E T Q N Y S F I K K V I Q A L P I E E S N S E K R K T V I D I L D G R T Q R E I N Q K V L E H L N K S D P L Y I K Q I H S A V D S K K S V A H T A L I L C N S I L N A G T G N D Q F V K D N I D W A Q K S Q L W A R F A S L A S L G M I H S G K P E Q A K Q I F A S H L P K G Q A G G N T G G A P N Y Y S N G G A L Y G I G I M H S G T R D P E T I R Y L T D I I K D P Q Q N K Q E P I L H G A C L G L G L A G L A S E D E T L F E V L K N V L M N D S A V T G E S A A L A I G L I M A G T N N E N A I T E L L K F G S E T Q H E K I I R A T G L A L A L V S F G Q E E N A D G V I E S L L T D K D F I L R Y G G V L T V G L A Y V G T S N N K A I R K L L H Y A V D D V A D D V R R A A V I A L G F V M F N Q Y E Q M P K I M N L L A M S Y S P H V R Y G T A I A L G I A C A G T G Y Q E A L N M I E P M L T D T T D F V R Q G A M I G T A L I L Q Q A N Q N S E P K L E K F K K T L Q S V Y S K K H E D I L C K M G A I L S S G I I E A G G R N Q V V R L A S Q Q G F P K L A S C V G M V I F T N F W Y W F P Y V N F I N L S F A P S A L I G I D Q T L R I P T D F S F K I N T K K S T Y D Y P E P I K Q D D N K D K K E F E K V T L S T T N K A K A R A A V K I D A K D S K M E E E V A G T S Q A E N K E K A E E K T E E K E P N S Y I Q T N P G R V L E K Q K K Y V E F I E N H R Y Q P I I K E R K F G I V F L N D T Q N S D D A S Y L G V A K K Q A E Q K S E M V P E Q A V G D Q N D D I A P P E D F V Y D E N Q Q L L N >TTHERM_00442210(gene)ATG AGT TTA AGC AGC GTT AGA TAG TAC TTG CAA TTA TTG TAA GAA AAG GAT AAT GAG CTA AAA GTT ATT GGA TTG GAA AAG TTA GTT TCT GTT GTA GAA ACC AAC TGG GCT GAA ATA GCT GAT CAT CTT GGA GAT ATG TAA TTA ATT CAT AAT AAA AAT ACA CAG AAA TTA AAT AGC ACA AAG AAA AGA ATT TAG ATA GTT TCG TTA TTT TAA AGG GAT GAA GCA ATT TAT ATT TAT CCA ACA AAA GAG ATA ATC AAT TAC TTC ATA TTT TAA AAA CTG AAA ATA AGT TTA TGA TAT TTA AGA TTT AAA TAA ATA ATT GTT GCT TAG CTT TAG ATC TAA ATA GTG AGA TAA TAC TGA AAT TAT TTA AGT TCT AAA ATT GCT TAT AAT ATA AAA TAT TGT TGC CTT TTA AAA TAT AAC TTT TCT TCT AAC AAA ATA AAT AGT GAA AAT TTA TAT GAA GAT GAG TCA TTC CCT AAG AGA TAG TTG GCC TAT TAC TTG GCA TCT AAG GTA TAT TTC AAT TTA GAA GAA TAT GAA GAT GCC CTA GAC TTA GCT TTA GAA TCA TAA GAA TAC TTT TAA GTT GAT GAA AAC ACA TAA TTT GTA GAA GTT TTA GTT AAT ACT TGC ATT AAT AAA TAT ATT ACT CAT AGA TAA TCT GAC TAG GTA ATT AAT ATT AAT TAA TTA ACA AAT GAA CAA TAT TAG AAT TTA TTC AAA GAT AGA CAA ATA GAA TGA AAA ATT GAA AGA TTG AAA GAT AGA TAG ATA ATT AGA TAT GCA AAT TCA AAT CAA ATC AAA TCA AAA TTT TTG TTT GCC TGT TTA TTT ATC AAT TTA TTT TTT TAT TTT TGA ATG AAT TTT TTA CTT AAA CTG GTT TAA AAC GAT GTC CTA TTT TTT AAT CTA TTA TAA AAA AAT AAA TAG ACC ACA AAG TTA AAT CCT AAA TAT GAA TCT ATA GTT GAA CGT ATG TTT GCA AAA TGT TAG AGG GAT TAA GAT TAT AAA AGC GGT TTA GGT ATT GCA GTA GAA AGT CGT AGA ACT GAT AAA ATT AAT GAA ATA CTC TCC CAA TCA GAA GAA TCT AAG CGT GGT GAA TTA GTG AAT TAC TTA TAT GAT GTT TGT ATT AAA TCA TTA AAC AGC AGA AAT TAT CGT ATT GAA ATT ATG CAA CTC TTG ATT TCA TTT TAC AAA GAA AAA CTT GCT TCT CAA GGA TTG CTT CCT CAT GAA TAT ATT AAT TTA AGT TTA AGC TAC CAC ACT TTA GGA AAG TAT GAA GAG TGT TCA TAA TTA ATT GAT GAT CTT CTT GCC AAA AAT ATA CCT CTT GCC TAT CAA GTA GCC ACA GAA ATT AGT GAA ACT TAA AAT TAC AGC TTT ATT AAG AAG GTA ACT TAC CTA GAA TTT ATC TTT TTA AAA TAA ATT TTT ATC AGT AAA AAA ATA TAA AAG CGT TTT TGA TTT AAT TAA AAT TAG GTT ATT CAA GCT TTA CCA ATT GAG GAA AGT AAC AGC GAA AAG CGT AAA ACA GTC ATA GAT ATT TTA GAT GGT AGA ACA TAA AGA GAA ATT AAC TAA AAA GTT CTT GAA CAT TTA AAT AAA AGT GAT CCT CTC TAC ATC AAG CAA ATC CAT TCT GCA GTT GAC TCA AAG AAA TCA GTT GCT CAT ACT GCT TTG ATT CTC TGT AAT TCT ATT TTG AAT GCA GGA ACT GGA AAC GAT TAA TTC GTT AAA GAT AAT ATT GGT AAA ATT AGA CAT AAT TTT AAT AAA AAT AGT TTT ACA TAT ATT TAT TAA TTT AAA CAG ATT GGG CTT AAA AAA GTT AAT TGT GGG CTA GAT TCG CTT CTT TGG CCT CTT TAG GTA TGA TCC ACT CTG GAA AAC CTG AAT AAG CTA AAT AAA TTT TTG CAA GTC ATC TTC CCA AGG GAT AAG CAG GTG GTA ACA CCG GAG GTG CTC CTA ATT ACT ACA GTA ATG GAG GTG CAT TAT ATG GTA TAG GTA TTA TGC ACA GTG GTA CAC GTG ATC CCG AAA CTA TTA GAT ATT TAA CAG ATA TTA TTA AAG ACC CTC AAT AAA ATA AAT AAG AAC CTA TTC TTC ATG GTG CTT GTC TTG GGC TTG GTC TTG CAG GTT TGG CTT CTG AAG ATG AAA GTA AAT TTT ATA GTT TTT GTA TTA ATA CAG CCT AAA ATA AAA AAT CAA ATT ATT AAA AGC CTT ATT CGA AGT TTT GAA GAA TGT TTT AAT GAA CGA CAG TGC AGT AAC TGG TGA ATC TGC AGC ACT TGC TAT TGG TCT TAT CAT GGC AGG AAC AAA TAA TGA AAA TGC AAT TAC AGA ATT ATT GAA GTT CGG TTC TGA AAC ACA ACA TGA AAA AAT TAT TAG AGC AAC TGG TCT TGC TCT TGC TTT AGT TTC TTT CGG ATA AGA AGA AAA TGC TGA CGG TGT TAT CGA ATC ACT TCT TAC TGA TAA AGA TTT TAT TCT TAG GTA ATT TTT GAA AAT TAT TTT AGC AAA TAT ACT TAT ATA AAA TTG TTT AAT AGA TAC GGT GGT GTC TTA ACT GTT GGT CTT GCT TAT GTT GGT ACT TCC AAC AAT AAA GCT ATT AGA AAA TTA CTT CAT TAT GCA GTT GAT GAT GTT GCT GAT GAT GTC AGA AGA GCA GCT GTT ATC GCA TTA GGT TTT GTT ATG TTT AAC TAA TAT GAA CAA ATG CCT AAA ATT ATG AAT CTT TTA GCC ATG AGT TAT AGT CCT CAC GTA AGA TAT GGT ACT GCC ATT GCT TTA GGT ATA GCA TGC GCT GGC ACT GGA TAC TAA GAA GCC TTA AAT ATG ATT GAA CCA ATG CTC ACT GAC ACC ACT GAC TTT GTA AGA TAG GGA GCT ATG ATT GGT ACA GCT CTT ATT TTA CAA TAA GCC AAT TAA AAC TCT GAA CCT AAA TTA GAA AAA TTC AAA AAG ACT CTT TAA AGC GTT TAT TCT AAA AAG CAC GAA GAT ATT TTA TGT AAG ATG GGT GCC ATA CTT TCA TCT GGT ATT ATT GAG GCT GGT GGA AGA AAT TAA GTT GTT AGA CTT GCT TCT TAG TAA GCA TTT AAA ATT TAA TGA GCA TTT AAA TTT AAA TAA ATA TTT TTC TTT TAA TAG ATA AGG TTT CCC TAA ATT AGC TAG TTG CGT TGG TAT GGT TAT TTT CAC CAA TTT CTG GTA CTG GTT CCC TTA TGT TAA CTT CAT TAA TTT GAG TTT TGC TCC TTC TGC TTT AAT TGG TAT TGA TTA AAC CTT ACG TAT TCC TAC AGA CTT CAG CTT TAA AAT TAA TAC AAA GAA GAG CAC TTA TGA TTA CCC TGA GCC AAT TAA ATA AGA TGA CAA CAA AGA TAA AAA GGA ATT TGA AAA GGT AAC TCT TTC AAC AAC TAA CAA GGC TAA GGC CAG AGC TGC TGT CAA AAG TAA AAT TAT TGC CTA CCT AAA TTT AAT TTA TTA AAA ATT ATA CAA TTT ATT AAC AAA AAG TTG ATG CTA AAG ATA GTA AAA TGG AAG AAG AAG TTG CTG GTA CAA GTT AAG CTG AAA ATA AAG AAA AGG CAG AAG AAA AAA CTG AAG AAA AAG AGC CAA ATT CTT ATA TTT AAA CAA ATC CTG GTA GAG TAC TTG AGA AAT AAA AGA AAT ATG TTG AGT TTA TAG AGA ATC ATA GAT ATC AAC CTA TTA TTA AAG TAA AAC AAA CTA CTT TTT ATT AGC CAT TTT TTA TTT TAA TTT ATA AAT AAA ACT TTA TCT AGG AAA GAA AAT TCG GTA TTG TAT TTT TAA ATG ATA CAT AAA ATT CAG ATG ATG CCA GCT ACC TTG GAG TTG CTA AAA AAT GTA TAT TTT AAT TTA ATT TTT ATT ACA AAA TAA TTA ATA TTA TCT TTT TAT ATA GAA GCT GAA TAA AAA TCT GAA ATG GTT CCA GAA CAA GCT GTT GGT GAC TAA AAC GAT GAT ATA GCT CCA CCT GAG GAC TTC GTC TAT GAT GAA AAC TAA TAA CTT TTG AAT TGA
Login
Recent Activity
Recent Papers
Identifiers and Description
Gene Ontology Annotations 
Domains
Gene Expression Profile
Signal Peptide
Homologs (v.2006 protein sequences)
General Information 
Associated Literature 
Sequences
