Gene Model Identifier
TTHERM_00339610
Standard Name
RPN1
Aliases
PreTt06102 | 34.m00339 | 3689.m00133
Description
Proteasome/cyclosome repeat family protein
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Cellular Component
( TIGR01752 ) flavodoxin
( PF01851 ) Proteasome/cyclosome repeat
( TIGR03338 ) phosphonate utilization associated transcriptional regulator
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Signal Peptide Present?: No
TTHERM_00339610
Fullscreen View
No Data fetched for StockID
(v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Stentor Coeruleus SteCoe_14790 0
Tetrahymena borealis EI9_15097.1 9.997093137033517e-262 proteasome/cyclosome repeat fa
DictyBase DDB_G0293752 9.997093137033517e-262 psmD2 on chromosome: 6 positio
Oxytricha Contig7554.0.g32 9.997093137033517e-262 Proteasome/cyclosome repeat
WormBase WBGene00004458 9.998707956568768e-117 locus:rpn-1 status:Confirmed
SGD YHR027C 5.0021648428951944e-116 RPN1 Non-ATPase base subunit o
No Data fetched for General Information
Ref:21637855 : Xiong J, Yuan D, Fillingham JS, Garg J, Lu X, Chang Y, Liu Y, Fu C, Pearlman RE, Miao W (2011) Gene network landscape of the ciliate Tetrahymena thermophila. PloS one 6(5):e20124
>TTHERM_00339610(coding)ATG TCT GAC AAA AAC AAA ATG GAG GAA GAA AAG CCT GTT GCT GAG TAA CCT AAG AAA AAC AAT AAA AAG GAT AAG AAA GAA AAG GAA GAC GAA CTC AGT GAG GAA GAT AAA AAG TTG AAG GAA AAT ATA GAA TTG TGG GTA CTT AGA ATA TAG GAT GTC GAT ACT AAT TTA GCT AGT GTT GCT CTT GGT TAA TTA AGA GAG GAA GTC AGA AAA ACT ACT ACT TCA ATG ACT TCA GTT CCT AAA CCT TTT AAA TTC TTA AAG GCA CAC TAT GAA GGC TTG TCT AAA TTC TAT GAA TCA AGT GCT CCT TCT TAA TTT AAA AAA GAA TTA GCT GAT TTC TTA TCA GTC ATC TCC ATG ACA ATG GCA GAA AGA GGA AAA TAA ATC TCT CTC AGA TAT TTA AAG GAA GGT ACT CTC AAT GAT TTC AAA AAT TGG GGT TAT GAA TAT CTT AAT CAT TTA TCA GCT GAT ATT GGA TAA ACA TAC AAC TAG CGT ATT GAA AAG AAA GAA AGT ACA GAT GAT CTT ATC TAG TTA GTT GAA GAT ATA GTC CCT TAC TTT GTA GAA AAC AAT GCT GAG CAC GAT GCT GTT GAT TTA TTA CTT GAA GTA GAC AAG CTC TAA TTT ATT AAA AAG TTC GTA AAT AAA GAA AAT TTT GAA AGA ATC TCT TTG TAT TTG CAA TAA TGC TGT TAA TAT TGT GTA GAT TAA AAT GAA ATG GAA GAA ACC TTA AAA GTT AAT TAT GAA ATA GCA TTG TCA CTT TAA CTT TAT GTT AGC GCA TTG AGA TTA GCC ATT AAG TTA GAT GAT ATT GAA AAA ATT AAA GAA GTT TTC TAA AGT TGT AAA GAT AAA TTA ATT TTA AAA TAA CTC TGC TAC CTT ATT GCC AGA CAA AGA ATT GTT CTT AGC GAG TTA GAC CTT GAT GAA GAT CTT TTA AAA ATT GCT TCC AAC TAG CAT CTC ACT GAT TTT TAT TTG CGT TTT GCC AAA GAA TTA GAT GCC TTA GAA CCC AAA AAG CCC GAA TAG GTT TAT AAA TCT GTC CTT GAA GAT AAT AAG GCA TAA ATT GAT TCT TTA AAT GCC AAT ATT GCA GAT ACT TAC GTA AAT GCT TTT GTC AAT ATG GGT TGC AAG AAG GAC ACC CTT ATG GTA GTT CCA AAA ACT GAA AAG CCT TGG ATT TAT AAC TTA AAG AAA ACC GGT ATT GCT GCT GCT ACT TCT TCA ATC GGT TTG ATT GAT ATG TGG GAT ATT GAA TCA GGT ACT GAA CAT ATT AAC GAA TAT CTT AAT CTT TCT GAT GGT TAC GGT AAA TAA GGT GCA TTA ATA GGT ATT GGT TTG TTC TCC AGT GGT ATT GTT GAT GAG AAC TTA ACT GCT AAG GCA TTA CTT GAA AGT GAA TTA AGT TCA AAA GAT GAA CTC TGC AAA CTT GGA GCT ATT ATT GGT TTA GGT ATG GCT TAT GCA GGT AGT GCA AAT GAA GAT TTA AAG GCT ATT TTT GAA CCC ATT TTC TCA GAC TCA TCC AGT AAA TTA TAA ATC ACT GCT TTC GCT GCT TTG AGT TTA GGT TTA ATT TTT GTT GGT AAA TGT GAT GAA GAT ATT TCC TAA TGG ATT ATT CAA ATT TTA GCT GAA TAT GCT TCT TCT ACT GAA AAA TAT CTT GAT ACT CAT TTA GCT AGA TAT TTC GCT GTT GCT ATG GGT CTT CTC TTC TTA GGT TAA TAA GAA AGA GCT GAG GCA ACT ATT GAA TGC ATG GGT ATT ATT GAA CAT GAT TTC GCC AAA TAT TGT GAA ATC ACC ATT GAA GGT TGT GCT TAC GCT GGT AGT GGC AAT GTC TTA AAA GTA TAA AAA ATG TTA CAT CAC TGC ACT TAG AAG GTA GAA GAA GAC AAG TCT GCT TTC TAA TAA GCT GCA ATT GTT TCT CTT GCT TTG ATA AGT TCA AGT GAA GGT ATT GGT AAT GAA ATG GCT CAC CGC TCA TTA AAT CAT ATT TTA TAA TAC TGT GAA TTA CCT GTT AAA AGA GCA GTT CCA TTA GCT CTC GCA ATT TTA AAT ATT TCA AAT CCT AAA ATT AAT GTT ATG GAT CTC TTA TTA AAA TTC AGT CAT GAT GAT GAC TAA GAA CTC AGC TAG AGA GCC ATC TTC TCT ATG GGT TTA GTA GGT GCT GGT ACC AAT AAT TCA AGA TTA GCT GAT ATT TTG AGA AAT TTA TCA TCA ACT TAT AAG TAA GAC AGT AGC AAT AAA TTC TTT ATC AGA ATT GCT TAA GGT CTT GTT TAG ATG GGA AAA GGT ATG GTA ACA TTG TAA CCT TAC TAT TCT GAC AAA TTC TTG TTG AAC AAG GTC GGA TTA TCT GGC ATA ATT ACA GTA ATT CAC TCT TTA ATG GAT ACT AAA TCT GTT TTC GGT GAT TAA CAT TAC ACC ATG CTT TAT CTA GGA TTA GCT GCC TAT CCT CGT ATG CTC TTT ACA GTT GAT GAA AAT GGT GAA AAT AAA GCT ATA GAT ATC AGA GTT GGA CAA GCT GTA GAT GTT GTT GGT CAA GCT GGT AAG CCT AAG AAA ATT ACT GGT TTC TAA ACT CAT CAA TCA CCT GTC CTT ATC AGT TAT GGT GAA AGA GCT GAG TTA GGA AGC GAC GAA TAT ATT CCT TTA TAA GCA ACT GTT CTT GAA AAT ATT ATC ATA GTA TAG AAA AAT CCC GAT TAT GTT CCT GAA GAA GAA AGT AAA AAT AAA AGA AAG CAA TGA >TTHERM_00339610(protein)M S D K N K M E E E K P V A E Q P K K N N K K D K K E K E D E L S E E D K K L K E N I E L W V L R I Q D V D T N L A S V A L G Q L R E E V R K T T T S M T S V P K P F K F L K A H Y E G L S K F Y E S S A P S Q F K K E L A D F L S V I S M T M A E R G K Q I S L R Y L K E G T L N D F K N W G Y E Y L N H L S A D I G Q T Y N Q R I E K K E S T D D L I Q L V E D I V P Y F V E N N A E H D A V D L L L E V D K L Q F I K K F V N K E N F E R I S L Y L Q Q C C Q Y C V D Q N E M E E T L K V N Y E I A L S L Q L Y V S A L R L A I K L D D I E K I K E V F Q S C K D K L I L K Q L C Y L I A R Q R I V L S E L D L D E D L L K I A S N Q H L T D F Y L R F A K E L D A L E P K K P E Q V Y K S V L E D N K A Q I D S L N A N I A D T Y V N A F V N M G C K K D T L M V V P K T E K P W I Y N L K K T G I A A A T S S I G L I D M W D I E S G T E H I N E Y L N L S D G Y G K Q G A L I G I G L F S S G I V D E N L T A K A L L E S E L S S K D E L C K L G A I I G L G M A Y A G S A N E D L K A I F E P I F S D S S S K L Q I T A F A A L S L G L I F V G K C D E D I S Q W I I Q I L A E Y A S S T E K Y L D T H L A R Y F A V A M G L L F L G Q Q E R A E A T I E C M G I I E H D F A K Y C E I T I E G C A Y A G S G N V L K V Q K M L H H C T Q K V E E D K S A F Q Q A A I V S L A L I S S S E G I G N E M A H R S L N H I L Q Y C E L P V K R A V P L A L A I L N I S N P K I N V M D L L L K F S H D D D Q E L S Q R A I F S M G L V G A G T N N S R L A D I L R N L S S T Y K Q D S S N K F F I R I A Q G L V Q M G K G M V T L Q P Y Y S D K F L L N K V G L S G I I T V I H S L M D T K S V F G D Q H Y T M L Y L G L A A Y P R M L F T V D E N G E N K A I D I R V G Q A V D V V G Q A G K P K K I T G F Q T H Q S P V L I S Y G E R A E L G S D E Y I P L Q A T V L E N I I I V Q K N P D Y V P E E E S K N K R K Q >TTHERM_00339610(gene)ATG TCT GAC AAA AAC AAA ATG GAG GAA GAA AAG CCT GTT GCT GAG TAA CCT AAG AAA AAC AAT AAA AAG GAT AAG AAA GAA AAG GAA GAC GAA CTC GTA AAA CAA ATT TCA CAA TTA AAT AGT TAA AGA AGG AGA ATA TTA TTT TAT TTA TTT GGC TAT TAT GTA AAT TGA AAT AAC AAA AAT ATT GCA TAA TCA ATT TGT AGC AAA ATG CAA GCT AGG TTA ATG AGT ATT GAT AAA AGG CTC TAA TAA AAA ATC ATC TTT AAG TTT TTG AGT TTG ATT CAA GAT TTT TTG ATT TTA ATG AAA ATG TTT TTT CTA CTT TAA ATG AAT CTA TCT TCT CCT TCT TTA AAA TAA CAA AAA TAT CAA AGA AAA GTT TTT AAT TTT TAA AAT TTT ATC AAG AGT GAG GAA GAT AAA AAG TTG AAG GAA AAT ATA GAA TTG TGG GTA CTT AGA ATA TAG GAT GTC GAT ACT AAT TTA GCT AGT GTT GCT CTT GGT TAA TTA AGA GAG GAA GTC AGA AAA ACT ACT ACT TCA ATG ACT TCA GTT CCT AAA CCT TTT AAA TTC TTA AAG GCA CAC TAT GAA GGC TTG TCT AAA TTC TAT GAA TCA AGT GCT CCT TCT TAA TTT AAA GTA AAT AAA TAT AAT TAT ATT ATT GCC TTG TGA ATG ATT TTA ATG CTT TAT TTC CGT AAA AAA CTA GAA AGA ATT AGC TGA TTT CTT ATC AGT CAT CTC CAT GAC AAT GGC AGA AAG AGG AAA ATA AAT CTC TCT CAG ATA TTT AAA GGA AGG TAC TCT CAA TGA TTT CAA AAA TTG GGG TTA TGA ATA TCT TAA TCA TTT ATC AGC TGA TAT TGG ATA AAC GTA ATA AAT AAA ATA TTA ATA AGC TTA TTC CTT CAA AAA TTT ATT TTA AGG TTT TTG TTA AAT TAA TTG ATT TTT AAA TAA CTA GAT ACA ACT AGC GTA TTG AAA AGA AAG AAA GTA CAG ATG ATC TTA TCT AGT TAG TTG AAG ATA TAG TCC CTT ACT TTG TAG AAA ACA ATG CTG AGC ACG ATG CTG TTG ATT TAT TAC TTG AAG TAG ACA AGC TCT AAT TTA TTA AAA AGG TAA AAA AGA GTC AAA TAG TTT TCA AAC ATT TTA AAA TAA TTA ATT AGC AAA GAA ATT TGA TTG CTC CTC ATG AAT TAA TTT TAG AAA TTA ATG GAG TTG AGT TTA AAT TTT TCT TTA TAT AAA TAA ATA GTT CGT AAA TAA AGA AAA TTT TGA AAG AAT CTC TTT GTA TTT GCA ATA ATG CTG TTA ATA TTG TGT AGA TTA AAA TGA AAT GGA AGA AAC CTT AAA AGT TAA TTA TGA AAT AGC ATT GTC ACT TTA ACT TTA TGT TAG CGC ATT GAG ATT AGC CAT TAA GTT AGA TGA TAT TGA AAA AAT TAA AGA AGT TTT CTA AAG TTG TAA AGA TAA ATT AAT TTT AAA ATA ACT CTG CTA CCT TAT TGC CAG ACA AAG AAT TGT TCT TAG CGA GTT AGA CCT TGA TGA AGA TCT TTT AAA AAT TGC TTC CAA CTA GCA TCT CAC TGA TTT TTA TTT GCG TTT TGC CAA AGA ATT AGA TGC CTT AGA ACC CAA AAA GCC CGA ATA GGT TTA TAA ATC TGT CCT TGA AGA TAA TAA GGC ATA AAT TGA TTC TTT AAA TGC CAA TAT TGC AGA TAC TTA CGT AAA TGC TTT TGT CAA TAT GGG TTG CAA GAA GGA CAC CCT TAT GGT AGT TCC AAA AAC TGA AAA GCC TTG GAT TTA TAA CTT AAA GAA AAC CGG TAT TGC TGC TGC TAC TTC TTC AAT CGG TTT GAT TGA TAT GTG GGA TAT TGA ATC AGG TAA AAT AAA ATA GAA TAT TAT TAT TAA TTT ATT CAA TTA ATT ACT TTG AAT TAA AAT AAA TTT GGA TAT AAA CTC AAT TCA AAA CTT TTA AAA TAA TTA GGT ACT GAA CAT ATT AAC GAA TAT CTT AAT CTT TCT GAT GGT TAC GGT AAA TAA GGT GCA TTA ATA GGT ATT GGT TTG TTC TCC AGT GGT ATT GTT GAT GAG AAC TTA ACT GCT AAG GCA TTA CTT GAA AGT GAA TTA AGT TCA AAA GAT GAA CTC TGC AAA CTT GGA GCT ATT ATT GGT TTA GGT ATG GCT TAT GCA GGT AGT GCA AAT GAA GAT TTA AAG GCT ATT TTT GAA CCC ATT TTC TCA GAC TCA TCC AGT AAA TTA TAA ATC ACT GCT TTC GCT GCT TTG AGT TTA GGT TTA ATT TTT GTT GGT AAA TGT GAT GAA GAT ATT TCC TAA TGG ATT ATT CAA ATT TTA GCT GAA TAT GCT TCT TCT ACT GAA AAA TAT CTT GAT ACT CAT TTA GCT AGA TAT TTC GCT GTT GCT ATG GGT CTT CTC TTC TTA GGT TAA TAA GAA AGA GCT GAG GCA ACT ATT GAA TGC ATG GGT ATT ATT GAA CAT GAT TTC GGT AAA TTA CTA ATT TAA ATT CTT TCA TAA AAG ATT GAT TTC ATT TCT TAT TAT AAA TTG ATT TGA ATA AAA AAA CAT ATT TTA TCA CAT TTA ATG ATA AGT TGG ATT TTA ACA TTA TGA ATT CAA ATT AAA ATA TAA TTT CTT AAA AAA AAT AAA GCC AAA TAT TGT GAA ATC ACC ATT GAA GGT TGT GCT TAC GCT GGT AGT GGC AAT GTC TTA AAA GTA TAA AAA ATG TTA CAT CAC TGC ACT TAG AAG GTA GAA GAA GAC AAG GTA TTT ATT AGT TAA ATA AAC TAT TGA GTT TAA ATT AAA ATA TTA TCA TAT TTA TAA AAG TCT GCT TTC TAA TAA GCT GCA ATT GTT TCT CTT GCT TTG ATA AGT TCA AGT GAA GGT ATT GGT AAT GAA ATG GCT CAC CGC TCA TTA AAT CAT ATT TTA TAA TAC TGT GAA TTA CCT GTT AAA AGA GCA GTT CCA TTA GCT CTC GCA ATT TTA AAT ATT TCA AAT CCT AAA ATT AAT GTT ATG GAT CTC TTA TTA AAA TTC AGT CAT GAT GAT GAC TAA GAA CTC AGC TAG AGA GCC ATC TTC TCT ATG GGT TTA GTA GGT GCT GGT ACC AAT AAT TCA AGA TTA GCT GAT ATT TTG AGA AAT TTA TCA TCA ACT TAT AAG TAA GAC AGT AGC AAT AAA TTC TTT ATC AGA ATT GCT TAA GGT CTT GTT TAG ATG GGA AAA GTA ATT AAT ATC TAA AAA TTT TGC AAT TAA TGT ATT AAA AAT TAA TTA ATT AAT CAA TTA GGG TAT GGT AAC ATT GTA ACC TTA CTA TTC TGA CAA ATT CTT GTT GAA CAA GGT CGG ATT ATC TGG CAT AAT TAC AGT AAT TCA CTC TTT AAT GGA TAC TAA ATC TGT TTT CGG TGA TTA ACA TTA CAC CAT GCT TTA TCT AGG ATT AGC TGC CTA TCC TCG TAT GCT CTT TAC AGT AAA ATA TTT ATT CAA TAT TGA AAT AGC AGT TTT AAA GTA TTA ATT ATA TTT TCA TTA ATA AAA TAG GTT GAT GAA AAT GGT GAA AAT AAA GCT ATA GAT ATC AGA GTT GGA CAA GCT GTA GAT GTT GTT GGT CAA GCT GGT AAG CCT AAG AAA ATT ACT GGT TTC TAA ACT CAT CAA TCA CCT GTC CTT ATC AGT TAT GGT GAA AGG TAA TAA ATA TGA TTT TAT TTA ACA AAA AGT ATT AAT TTA AAA TAA AAA TAA ATA GAG CTG AGT TAG GAA GCG ACG AAT ATA TTC CTT TAT AAG CAA CTG TTC TTG AAA ATA TTA TCA TAG TAT AGA AAA ATC CCG ATT ATG TTC CTG AAG AAG AAA GTA AAA ATA AAA GAA AGC AAT GA
Login
Recent Activity
Recent Papers
Identifiers and Description
Gene Ontology Annotations 
Domains
Gene Expression Profile
Signal Peptide
Homologs (v.2006 protein sequences)
General Information 
Associated Literature 
Sequences
