Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_01075780
Standard Name
RPA2 (RNA polymerase I subunit 2)
Aliases
PreTt02690 | 219.m00043
Description
RPA2 DNA-directed RNA polymerase; DNA-directed RNA polymerase I complex subunit
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Cellular Component Molecular Function Biological Process
Domains
( PF02363 ) Cysteine rich repeat
( PF09268 ) Clathrin, heavy-chain linker
( PF04560 ) RNA polymerase Rpb2, domain 7
( PF04561 ) RNA polymerase Rpb2, domain 2
( PF04565 ) RNA polymerase Rpb2, domain 3
( PF04567 ) RNA polymerase Rpb2, domain 5
( PF06883 ) RNA polymerase I, Rpa2 specific
( PF00562 ) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
( PF04563 ) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
( TIGR02013 ) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 11.2%
TetraMine Data
TTHERM_01075780
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Stentor Coeruleus SteCoe_17515 0
WormBase WBGene00008781 9.997093137033517e-262 locus:rpoa-2 DNA-directed RN
A polymerase status:Partiall
y_confirmed UniProt:Q27493
protein_id:CAA99827.1
Tetrahymena borealis EI9_15329.1 9.997093137033517e-262 DNA-directed RNA polymerase, b
eta subunit protein (1160 aa)
DictyBase DDB_G0293560 9.997093137033517e-262 rpa2 on chromosome: 6 position
3044865 to 3048492
Oxytricha Contig2863.0.g30 9.997093137033517e-262 RNA polymerase Rpb2, domain 6
SGD YPR010C 9.997093137033517e-262 RPA135 RNA polymerase I second
largest subunit A135
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_01075780(coding)ATG AAG GAA TCA TTA AGT AGA GAA GAT CAT ATT GCT CGT GCA AAG CAA TCA AAT TTA GAT TTT TCA AAA AAG CTT AAG TAA GCT GCC TTT GCT CAC ATA GAC TCT TTC AAC TTC ATT TAC GAT GAA GGA TTA AAA AAA ATC ACT TAG TAC TTG TAG CCA GTT GAA ATT ATT AAA GAA TAA AGA TCT GAA GAA TAC AAG TAG AGT TAC TTG CCC TTT AAA TCT ATG AAG GTT TGG ATT GAA AAC CTC GAA ATA GCC ACT CCT ATC AGA GCC GAT TCA GGT GTA GCT GAA GAC AAT AAA TTA ATG CCC GAA GAA TGT AGA ATA GGA AGA AAG ACT TAT GGA GCT CCT CTT TTC GCA AAG GTA GCT CGT AGT ATT GAT GGA GGA AAG CCT GAA AGC ATA AAT ATT AGA TTA GGC GAC ATT CCT ATC ATC GTT AGA AGT GAT CAT TGC CAT TTA GCA AAA ATG ACT CCT AAG GAA TTA GTG AAA GCT CAC GAA GAT TGC AAT GAA TTT GGT GGA TAT TTT ATT GTC AAT GGT AAT GAA AAG ATA GTC AGA ATG CTT ATC CTT CAA AAA AGA AAT TAT CCT ATT GCT TTT ATC AGA GCA GGT TAT GTT AAT AGA GGT CCT AAT TAC ACA CCT TTT GCA GTT TAA ATG AAG TGT GTG AGA GAA GAT TTA TAC TCA AAA ACA ATT ACT CTC CAC TAT GTT TCT GAT GGT TCT GTT TTC TTG CGT ATT CTT CAC AGA AAG CAA GAA TTC TTG ATT CCA GCT ATC GTT ATC CTT AAA GCT TTA GCT GAT ATT TCT GAC CTT CAA ATT TAC AAT AAA TTA GTT AAA GGT TAA AGC AGC AAG AGT GCT ATT AGT GAT AGA GTT GAA GTA CTT ATT AGG GGT AGT AAA GCA ATG AGT TTA AAT ACT AAG GAA GAA TGT TTG GCT CAC TTA GGT AAA AAT TTC AGA GTC GTA CTC AAC ATC ACT AAC CCA GAA ATT ACT GAT AAG CAA GTT GGT GAA ATT TTC ATG AAT GAA AAC ATT TGC GTT CAC TTA AAT AAT AAC ATC GAT AAG CTC AAC ACT ATT TGT GTT ATG ATT AGC AAA TTA TAT GCC TTA GTC AGT GAT GAA ATT TGT CCT GAT AAC TTA GAT TCT TTG CAA AAT TAG GAA GTC CTC TTA CCT GGT CAT CTC TAT ATG ATG ATT TTA AGA GAA AAG TTA GAA GAA ATG CTT TTA GGT ATC CGT GCT AAA GTT TTT AAG GAT GGT TCT AGA CCC GAA GAA GCT ATT AGA ATT CCT CAT ATC GCT TAC TTA AAA AAA GCC ATT GAA TTT TAA GGC TCT ATT GGA AAT AAA ATT GAA TAT TTC CTC TCT ACT GGT AAT TTA AAA TCC CAA ACT GGT TTA GAT CTC ATG CAA GCT AAA GGT TTC ACA ATT ATA GCT GAT AAG TTA AAT AAT ATG CGT TTC TTG AGT CAC TTT AGA AGT GTC CAT AGA GGT GCT TAT TTT ACA GAA ATG AAA ACA ACA ACA GTT AGA AAA TTA TTA CCT GAA AAT TGG GGT TTC ATT TGC CCT GTG CAC ACT CCT GAT GGT GGT CCT TGC GGT TTG TTA AAT CAC ATT TCT TAA TCA TGC AAA CCC CTT ACC AGA CCT GGG TAT GAT GGT AAT ATT CAC TTC AAT TTA GTA ACT CTC TGC ACT GAG ATA GGT ATG AAT CCT ATT GTA AAC GAT TTG TCT ATC GTA TTC CCT CCT ACT TCT GTT ACT ATT ATG CTT GAT GGT AGA GTT ATT GGT TAT ATT GAA TCT AAA AAT GCA TAA ACA TTC TGC CAA TCA TTA AAA TAT TTA AAA ATT ATG CAA GAT CCT ACT CGT TTA ATC CCT GCT GAT TTG GAA ATC GGT TAT GTT CCT AAA CTT AAT CTT GAA AAA CAA AAT ATT TTC CCA GGT ATC TTT TTA CAC ACT AAT GAA GCT CGT TTT GTT CGT CCT GTT AAG CAC TTG AAA TTA AAT GCC TTA GAA TGG ATT ACT CCT TTC GAA TAA GTC CAT CTT TCT ATT GCT TGC ATT GAA GAA GAT ATT AGA AAC GAT ACT GAA TAC TAA GAA CTC TCA CCT TCA TAC ATT CTT TCA ATT TTA CCT TCT TAA ATT CCT TTC CTC AAT TAT AAC TAA TCC CCT AGA AAT ATG TAT CAG TGC TAG ATG GCT AAG CAA ACT ATG GGT ACT TCT ATG CAC AAT TTC CCT TAT CGC TTT GAT AAC AGA ATA TAT AGA TTA TTA AAT GGT TAA ATT CCT ATG GTT AAA GGT ATG GAT CCT GAA AGT TAT GGT CTT TCT GAT TAT CCT TCT GGA ACA AAT GCT ATC GTT GCA GTT ATC AGT TAT ACT GGT TAT GAT ATG GAA GAC GCT ATG ATT CTG AAT AAA TCA TCA TAC GAA AGA GGA TTC GGA CAT GGT TGT GTC TAT AAA AAC TAC TCA TAC GAT GTT GCT GAA TTA AAT AAA GAA AAA AAT TCT AAA TTT AAG ATG TTG AAT GAA GTT AAA AAT ATT GAC AAG AGT TAA ATC GCT GAA GGT TTA GAA GGT GAT GGT ATT CCA GCT ATT GGA TCA GTA ATT AAA AAA GGC ACT GCT GTC TTC TAA ATA TAT GAT ACT TAA AAA AAT GCT ATG AAA ACT TTC TAC CAC AAG GAC TCA GAA TTA GGT AGA TTA GAT GGT ATA GCT TTA GTC CAT GAT GAA AAA ACT AAA GAA CCA AGA GTT GAA TAT AGA ATT AGA ATT CCC AGA AAT CCT ATT ATT GGT GAT AAA TTC TCA TCT CGT CAC GGT CAA AAA GGT GTT CTT TCT GTC CTT TGG CCT CAT ATC GAT ATG CCC TTC ACT GAA AGT GGT ATT ACT CCT GAT GTT ATC ATT AAC CCT CAC GCT TTC CCC TCC AGA ATG ACA ATT GGT ATG TTA ATC GAA AGT ATG GCA GGT AAA TCT GGA GCT CTT AAT GGA AAT ATA TTA GAA ACT TAA CCT TTC TAA AAT TAT TAA GAT GAT GAT ATT GTT AAT TAT TTC GGT AAA TAA CTT TAA TCT CAT GGT TAT AAT TAT TAC GGT AAC GAA GTT ATG TAT AGC GGT ACA TAT GGT TGC ATG ATG AAA GTT GAT ATC TAT ATG GGT ATT GTA TAC TAT CAA AGA TTA CGT CAC ATG GTT TCA GAT AAA GCT TAA GCA AGA TCT ACT GGT CCC GTT GAT ATG CTT ACT TAA CAA CCT ATT AAA GGT AGA AAG AGA GGT GGT GGT ATT AGA ATG GGT GAA ATG GAA AGA GAT GCT CTT CTT TCT CAC GGT ATC TCC TTC TGT ATG CAT GAT AGA TTC TTA AAC TGC TCA GAT TAT TCT GAA GGT TAT GTT TGT AAT AGT TGT GGT TCA TTG GTC TCA ACA TAC CTA CAT ACT AAT TTA ATG AGT GGT GAG GCT ATT GAT AGT TTC TAT AAT TAC AAT AAG GGT GTT TAA AAG TCA AAA CCT AAA TGC AGA AAG TGC CAA AAT GCT GAG TGT TCT AAA GTA GTA ATT CCT TTT GTA TTA AGA TAC TTG ACT AAC GAG CTT GCT GCT ATG AAT ATC AAG CTT GCC TTT AAG CTT GAA TGA >TTHERM_01075780(protein)M K E S L S R E D H I A R A K Q S N L D F S K K L K Q A A F A H I D S F N F I Y D E G L K K I T Q Y L Q P V E I I K E Q R S E E Y K Q S Y L P F K S M K V W I E N L E I A T P I R A D S G V A E D N K L M P E E C R I G R K T Y G A P L F A K V A R S I D G G K P E S I N I R L G D I P I I V R S D H C H L A K M T P K E L V K A H E D C N E F G G Y F I V N G N E K I V R M L I L Q K R N Y P I A F I R A G Y V N R G P N Y T P F A V Q M K C V R E D L Y S K T I T L H Y V S D G S V F L R I L H R K Q E F L I P A I V I L K A L A D I S D L Q I Y N K L V K G Q S S K S A I S D R V E V L I R G S K A M S L N T K E E C L A H L G K N F R V V L N I T N P E I T D K Q V G E I F M N E N I C V H L N N N I D K L N T I C V M I S K L Y A L V S D E I C P D N L D S L Q N Q E V L L P G H L Y M M I L R E K L E E M L L G I R A K V F K D G S R P E E A I R I P H I A Y L K K A I E F Q G S I G N K I E Y F L S T G N L K S Q T G L D L M Q A K G F T I I A D K L N N M R F L S H F R S V H R G A Y F T E M K T T T V R K L L P E N W G F I C P V H T P D G G P C G L L N H I S Q S C K P L T R P G Y D G N I H F N L V T L C T E I G M N P I V N D L S I V F P P T S V T I M L D G R V I G Y I E S K N A Q T F C Q S L K Y L K I M Q D P T R L I P A D L E I G Y V P K L N L E K Q N I F P G I F L H T N E A R F V R P V K H L K L N A L E W I T P F E Q V H L S I A C I E E D I R N D T E Y Q E L S P S Y I L S I L P S Q I P F L N Y N Q S P R N M Y Q C Q M A K Q T M G T S M H N F P Y R F D N R I Y R L L N G Q I P M V K G M D P E S Y G L S D Y P S G T N A I V A V I S Y T G Y D M E D A M I L N K S S Y E R G F G H G C V Y K N Y S Y D V A E L N K E K N S K F K M L N E V K N I D K S Q I A E G L E G D G I P A I G S V I K K G T A V F Q I Y D T Q K N A M K T F Y H K D S E L G R L D G I A L V H D E K T K E P R V E Y R I R I P R N P I I G D K F S S R H G Q K G V L S V L W P H I D M P F T E S G I T P D V I I N P H A F P S R M T I G M L I E S M A G K S G A L N G N I L E T Q P F Q N Y Q D D D I V N Y F G K Q L Q S H G Y N Y Y G N E V M Y S G T Y G C M M K V D I Y M G I V Y Y Q R L R H M V S D K A Q A R S T G P V D M L T Q Q P I K G R K R G G G I R M G E M E R D A L L S H G I S F C M H D R F L N C S D Y S E G Y V C N S C G S L V S T Y L H T N L M S G E A I D S F Y N Y N K G V Q K S K P K C R K C Q N A E C S K V V I P F V L R Y L T N E L A A M N I K L A F K L E >TTHERM_01075780(gene)ATG AAG GAA TCA TTA AGT AGA GAA GAT CAT ATT GCT CGT GCA AAG CAA TCA AAT TTA GAT TTT TCA AAA AAG CTT AAG TAA GCT GCC TTT GCT CAC ATA GAC TCT TTC AAC TTC ATT TAC GAT GAA GGA TTA AAA AAA ATC ACT TAG TAC TTG TAG CCA GTT GAA ATT ATT AAA GAA TAA AGA TCT GAA GAA TAC AAG TAG AGT TAC TTG CCC TTT AAA TCT ATG AAG GTT TGG ATT GAA AAC CTC GAA ATA GCG TAA TTA ATT ATG ATT TAT TCG TTT AAT TAC CTT TCA TCT GCA AAC CAA AAA GTG GTA TTT TTT GAA GAT TTG GTT TTC AAA TCT TAA ACA AGA CTA ATT TAT TTA TAA GTC CCA TCA ATG TTT TTT AAA AGA AAT CTT CTA CTT TAA AGA AAA GTA CAT TTT TTA ATT TAC TTT ACA AAC AGG ACA GCA TAC CAC AAA AAC TAA TAG AAT AGA ATC ATT TTT ATT TCA AAT ATG ATA AAA TTT ACT TTC GAT TTT GAC TTT TTT TTA AAG GAA TTA TAA AAT AAC AAA TTG TCT AAG CAA TAC TTT ATA TTT AGT AGC TAA TTT AAC CAT CTT CAA AAA TAA TTT ATT TTC CAA GGT TTA TAA TTC CAT TAA GAT AGA ATG ATT TAT TTG ATA CTT TTA TAT TTG ATA ATA ATG ATG ATG GTG GAT GAT AAG GTT AAT AAT AGA TAA ATA AAT TTA ATG ATA TTT CAA AAA CAA TTT CTT ATA GTT GTA ATG TTT TTA AAC TTT TTT AAT AAT TAT ATT CTA GCA CTC CTA TCA GAG CCG ATT CAG GTG TAG CTG AAG ACA ATA AAT TAA TGC CCG AAG AAT GTA GAA TAG GAA GAA AGA CTT ATG GAG CTC CTC TTT TCG CAA AGG TAG CTC GTA GTA TTG ATG GAG GAA AGC CTG AAA GCA TAA ATA TTA GAT TAG GCG ACA TTC CTA TCA TCG TTA GAA GTG ATC ATT GCC ATT TAG CAA AAA TGA CTC CTA AGG AAT TAG TGA AAG CTC ACG AAG ATT GCA ATG AAT TTG GTG GAT ATT TTA TTG TCA ATG GTA ATG AAA AGA TAG TCA GAA TGC TTA TCC TTC AAA AAA GAA ATT ATC CTA TTG CTT TTA TCA GAG CAG GTT ATG TTA ATA GAG GTC CTA ATT ACA CAC CTT TTG CAG TTT AAA TGA AGT GTG TGA GAG AAG ATT TAT ACT CAA AAA CAA TTA CTC TCC ACT ATG TTT CTG ATG GTT CTG TTT TCT TGC GTA TTC TTC ACA GAA AGC AAG AAT TCT TGA TTC CAG CTA TCG TTA TCC TTA AAG CTT TAG CTG ATA TTT CTG ACC TTC AAA TTT ACA ATA AAG TAA ATT TTT ATT TAA TGA TAA ATT TAT TAA GTA TTA TAG TTT AAT GAA TGA TTT TTA CAT AAA AAA ATA ATT AAA ATG AAT GTA ATA TAA TAG GAG TTA TTA AAT TTT AAA CAA TAT TAA TTA AAT AGT TAG TTA AAG GTT AAA GCA GCA AGA GTG CTA TTA GTG ATA GAG TTG AAG TAC TTA TTA GGG GTA GTA AAG CAA TGA GTT TAA ATA CTA AGG AAG AAT GTT TGG CTC ACT TAG GTA AAA ATT TCA GAG TCG TAC TCA ACA TCA CTA ACC CAG AAA TTA CTG ATA AGC AAG TTG GTG AAA TTT TCA TGA ATG AAA ACA TTT GCG TTC ACT TAA ATA ATA ACA TCG ATA AGC TCA ACA CTA TTT GTG TTA TGA TTA GCA AAT TAT ATG CCT TAG TCA GTG ATG AAA TTT GTC CTG ATA ACT TAG ATT CTT TGC AAA ATT AGG AAG TCC TCT TAC CTG GTC ATC TCT ATA TGA TGA TTT TAA GAG AAA AGT TAG AAG AAA TGC TTT TAG GTA TCC GTG CTA AAG TTT TTA AGG ATG GTT CTA GAC CCG AAG AAG CTA TTA GAA TTC CTC ATA TCG CTT ACT TAA AAA AAG CCA TTG AAT TTT AAG GCT CTA TTG GAA ATA AAA TTG AAT ATT TCC TCT CTA CTG GTA ATT TAA AAT CCC AAA CTG GTT TAG ATC TCA TGC AAG TAA TAT TTA AAT TCA TTT CTA AAA AAA TTT ATA TTG ATT AAA AAC TAT CAT AAT AAA GGC TAA AGG TTT CAC AAT TAT AGC TGA TAA GTT AAA TAA TAT GCG TTT CTT GAG TCA CTT TAG AAG TGT CCA TAG AGG TGC TTA TTT TAC AGA AAT GAA AAC AAC AAC AGT TAG AAA ATT ATT ACC TGA AAA TTG GGG TTT CAT TTG CCC TGT GCA CAC TCC TGA TGG TGG TCC TTG CGG TTT GTT AAA TCA CAT TTC TTA ATC ATG CAA ACC CCT TAC CAG ACC TGG GTA TGA TGG TAA TAT TCA CTT CAA TTT AGT AAC TCT CTG CAC TGA GAT AGG TAT GAA TCC TAT TGT AAA CGA TTT GTC TAT CGT ATT CCC TCC TAC TTC TGT TAC TAT TAT GCT TGA TGG TAG AGT TAT TGG TTA TAT TGA ATC TAA AAA TGC ATA AAC ATT CTG CCA ATC ATT AAA ATA TTT AAA AAT TAT GCA AGA TCC TAC TCG TTT AAT CCC TGC TGA TTT GGA AAT CGG TTA TGT TCC TAA ACT TAA TCT TGA AAA ACA AAA TAT TTT CCC AGG TAT CTT TTT ACA CAC TAA TGA AGC TCG TTT TGT TCG TCC TGT TAA GCA CTT GAA ATT AAA TGC CTT AGA ATG GAT TAC TCC TTT CGA ATA AGT CCA TCT TTC TAT TGC TTG CAT TGA AGA AGA TAT TAG AAA CGA TAC TGA ATA CTA AGA ACT CTC ACC TTC ATA CAT TCT TTC AAT TTT ACC TTC TTA AAT TCC TTT CCT CAA TTA TAA CTA ATC CCC TAG AAA TAT GTA TCA GTG CTA GAT GGC TAA GCA AAC TAT GGG TAC TTC TAT GCA CAA TTT CCC TTA TCG CTT TGA TAA CAG AAT ATA TAG ATT ATT AAA TGG TTA AAT TCC TAT GGT TAA AGG TAT GGA TCC TGA AAG TTA TGG TCT TTC TGA TTA TCC TTC TGG AAC AAA TGC TAT CGT TGC AGT TAT CAG TTA TAC TGG TTA TGA TAT GGA AGA CGC TAT GAT TCT GAA TAA ATC ATC ATA CGA AAG AGG ATT CGG ACA TGG TTG TGT CTA TAA AAA CTA CTC ATA CGA TGT TGC TGA ATT AAA TAA AGA AAA AAA TTC TAA ATT TAA GAT GTT GAA TGA AGT TAA AAA TAT TGA CAG TAA ATT ATC TTA ATC TTT TTT TTA ATT AAA ATT TAT ATT TTC TAT TTG AAA ATT ATT TAG AGA GTT AAA TCG CTG AAG GTT TAG AAG GTG ATG GTA TTC CAG CTA TTG GAT CAG TAA TTA AAA AAG GCA CTG CTG TCT TCT AAA TAT ATG ATA CTT AAA AAA ATG CTA TGA AAA CTT TCT ACC ACA AGG ACT CAG AAT TAG GTA GAT TAG ATG GTA TAG CTT TAG TCC ATG ATG AAA AAA CTA AAG AAC CAA GAG TTG AAT ATA GAA TTA GAA TTC CCA GAA ATC CTA TTA TTG GTG ATA AAT TCT CAT CTC GTC ACG GTC AAA AAG GTG TTC TTT CTG TCC TTT GGC CTC ATA TCG ATA TGC CCT TCA CTG AAA GTG GTA TTA CTC CTG ATG TTA TCA TTA ACC CTC ACG CTT TCC CCT CCA GAA TGA CAA TTG GTA AAT TTA CTC TTT ATT CAA GAA GAT TAA CTA ATT AAT TAA ATT TTA ATA AAA AAG GTA TGT TAA TCG AAA GTA TGG CAG GTA AAT CTG GAG CTC TTA ATG GAA ATA TAT TAG AAA CTT AAC CTT TCT AAA ATT ATT AAG ATG ATG ATA TTG TTA ATT ATT TCG GTA AAT AAC TTT AAT CTC ATG GTT ATA ATT ATT ACG GTA ACG AAG TTA TGT ATA GCG GTA CAT ATG GTT GCA TGA TGA AAG TTG ATA TCT ATA TGG GTA TTG TAT ACT ATC AAA GAT TAC GTC ACA TGG TAT TTA AAA TTT TTG TTA AAG ATT GTT AAT TAA TTG TTA TTT CTA ATA ATA TAT TAA AGG TTT CAG ATA AAG CTT AAG CAA GAT CTA CTG GTC CCG TTG ATA TGC TTA CTT AAC AAC CTA TTA AAG GTA ATT ATT AAA AAA ATA TGT CTT CTA GCT TAC TTA ATT ATA TAC AAA AAA AAA AAA AAA TAG GTA GAA AGA GAG GTG GTG GTA TTA GAA TGG GTG AAA TGG AAA GAG ATG CTC TTC TTT CTC ACG GTA TCT CCT TCT GTA TGC ATG ATA GAT TCT TAA ACT GCT CAG ATT ATT CTG AAG GTT ATG TTT GTA ATA GTT GTG GTT CAT TGG TCT CAA CAT ACC TAC ATA CTA ATT TAA TGA GTG GTG AGG CTA TTG ATA GTT TCT ATA ATT ACA ATA AGG GTG TTT AAA AGT CAA AAC CTA AAT GCA GAA AGT GCC AAA ATG CTG AGT GTT CTA AAG TAG TAA TTC CTT TTG TAT TAA GAT ACT TGA CTA ACG AGC TTG CTG CTA TGA ATA TCA AGC TTG CCT TTA AGC TTG AAT GA