Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00047550Standard Name
RPA1 (RNA Polymerase I largest subunit)Aliases
PreTt11234 | 3.m01913 | RPII | 3824.m02992Description
shared largest subunit of RNA Polymerase IGenome Browser (Macronucleus)
![]()
Genome Browser (Micronucleus)
![]()
Gene Ontology Annotations
Molecular Function
- DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity (IEA) | GO:0003899
- DNA binding (IEA) | GO:0003677
Biological Process
- transcription (IEA) | GO:0006350
Domains
No Data fetched for Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.3%
TetraMine Data
TTHERM_00047550
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Stentor Coeruleus SteCoe_9278 0 WormBase WBGene00012999 9.997093137033517e-262 locus:rpoa-1 DNA-directed RN
A polymerase status:Partiall
y_confirmed UniProt:G5ED21
protein_id:CAB07687.2
Tetrahymena borealis EI9_01697.1 9.997093137033517e-262 RNA polymerase Rpb1, domain 2
family protein (1722 aa)
DictyBase DDB_G0275759 9.997093137033517e-262 rpa1 on chromosome: 2 position
5808489 to 5813651
Oxytricha Contig17704.0.g32 9.997093137033517e-262 RNA polymerase Rpb1, domain 5
SGD YOR341W 9.997093137033517e-262 RPA190 RNA polymerase I larges
t subunit A190
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:15470252: Mochizuki K, Gorovsky MA (2004) RNA polymerase II localizes in Tetrahymena thermophila meiotic micronuclei when micronuclear transcription associated with genome rearrangement occurs. Eukaryotic cell 3(5):1233-40
- Ref:8756729: Shen X, Gorovsky MA (1996) Linker histone H1 regulates specific gene expression but not global transcription in vivo. Cell 86(3):475-83
Sequences
>TTHERM_00047550(coding)
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GACTATGAAGTTCCTTAAGGCTGGAATTTATATAACAGACCTAATTTTGTTCTCAACAGC
AAAGGTAGATTCTCTTCTAATGTTCTTAAACGTAAGCCCGAAGTTGACTATCTTTCAAAT
GAAAATCCCATTCTTGAGTAAATTCAAAGAAAGCTCGTTCGTGATCCCCAACTTGCTGAA
GCTTAAGATAATGTTTATAAGTCAACTATGTCTTAAAAAGGTTCCAAAATTCTTAACACT
GCTCTCGGTGGTCTTATTAAAAAATTCCCTTTCAACAATTTCACTACAATGACTAATTCT
GGTGCTAAGGGTTCTAAAGTCAACCATACGTAAGTTTCTGCCTTACTTGGTCAATAAGAA
TTAGAAGGTCGTAGAGTTCCCGTTATGGCTACTGGTCGTACTCTTCCTTGCTTCTTACCA
TATGATCCCAACCCAAGAGCTGGTGGTTTTATTAGTGATCGTTTCTTGAGTGGTCTTAGA
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GTTGCATATGACTACACTGTCAGAGATGCTGATGGCTCAGTTGTCCAATTCTATTATGGT
GAAGACTCTATTGATCCCAATAAAGTTAAATATTTAGAAAAATTCCGTTTCTTAGCTGAA
AACTTTACTTCTTTCACTCAAAAATATGATCCTTATCACTTGAAAGACTCTCATGATTTC
GAATCTGTCAATCGTTTCTTGAAGAAAAGAAAGAGATAAGAAAGTTCTGAAACAGAAAAG
AAAACTTGTGACACTATTATGAACAACTTTTTACCTGGTAAACACATTGGCTCTGTTTCT
GAACGTGTCTACAAGAATGTAAAGGAATACATTAAGAAAGAATAGCAAAGTGCTGATCCT
TACAGCAACATCTTCAACATAAAGTAGGATTAATTAAGTCCTTAAAAATTCCATATGCTT
TTCAATGTAAAATACCTTAACTCTCTCATTCATCCTGGTGATTCTGTTGGTTGTCTTGCA
GCCCAAGCTATCGGTGAACCATCTACATAGATGACATTGAATACTTTCCACTTGGCTGGT
CACGGTGGTGTTAACCTTACCTTGGGTATTCCTCGTCTAAGAGAAATCTTGATGACTGCT
ACAGACAAATTGAAGACTCCAGTCATGCTTTTAAATCTTTCAAATCCTGAAGTTGCTTAA
AACAAAGAATAAGTTCAAAATCATGCTCGTAAGCTCTAAAAAATTAATTTATTAGAACTT
GTTAATAACATCGAAGTCAAGGAACAAAAAATTATTGTTGTTGATAACAATATTTTACCC
TTCAATGAACGTTTCAGACACTATGAAATTAAAATCAACTTAGAAGACTTAGAAGCTATT
CACTTCGCATTCTAATTAAACATTGACACAATTAATCGTAGAATTGAAAAGGTCTTCCTT
CCTAACCTCTTCTAATACATTAACAAAGAACTTAAACGTGATTAAAAATCTGAACTTTAA
ACTAGAGTTCTTAAGAAGAAAGAAAATGAAAGCAGCGGTATGGAAACTGAAGGCTTAGTT
AGCGATTTCGACAAAGAAGCTGCTTCAGATGGTGAAGAATTAAAGAAAGCTGCTGATGCT
TTAGTAAGCGAAGTAGAATATGGCATATTTACTGAGACAGAAGATGAATTAAAATCTAAG
TCCAAACCTCAATCTGCAGAACCAGTAAAGAGAGTCCCAACTAGAACTTCCAAAGCAGAA
TTATTTGAAGCTTCTCCTTATTACAACGGTCATACTATAGAAGGTGAACGTATAGTTTGT
AACATTAAATTACCTTTAGATTCTAAGAAGTTATTGATGGTCAACTTGGTTGAAAAAATA
TTAAAGAAGACTTTGGTTTATGAAGTAAAGAATATCTCTAATGCAACTGTCCTCAAAAAG
GATAATAAAGGAGCCACTTCTTATCAAATTTAAACAGAAGGTGTTAATTTCAAGTAAATC
TGGAAAATGGATCACTTCGACTCTAATACTATAGACTCAAATGATATAGCTGCCTTAAAC
AAATGTTACGGTATTGAAGCTGCTAGAAATGCAATTGTAAAAGAAATCGTCACTGTGTTC
GGTGTTTATGGTGTCGTTGTTGATTACAGACACTTGTACTTAATTGCTGATTATCTTACT
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CTCAAGATGTCTTTCGAAACTTGTGTTAAATTCCTTACAAATGCTGCTACAAATAATGAA
ATCGATACTCTTTCTACTCCTTCTTCCTCAATTGTCTTAGGTAGAGTTCCCTAAGTAGGT
ACTGGTGTTTTCGACATTCTCCATAAGGTTTGA>TTHERM_00047550(protein)
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TATTATTATATACTTATAGATATTAAATGAGTAATAGTTTAGGCTAATTCCAAGAGGTCA
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TGATTATTTAAAGATTGTAGTTATGGAATCTTTTAAAACTTTGATATTTTTTTTCCCAAA
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GCCTTATAAGATTTTCTTAGTTCCTCCTGCTATTCAAAAACCCAAACCTTTGTGGACTGG
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TGAATAAGGTGTCTATATGGAAATGAAGGCAAAGCTTACTGCTGACGAATTGACTGGTAT
TTATAAGGACGATACAGTTGTCATAATCAGAGATAATGAACTTCTTTAGGGTGTTTTGGA
TAAAAACTAATTTGGTGCTGGTGCCACTTATGGTCTTATGCACGCTTTTTATGAATTATA
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ATAACGTCTTCAAGAAATCAAGGCTGCACACGTTGATGGTGTCCTTGCATGTGCTGAATT
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AATGACTAATTCTGGTGCTAAGGGTTCTAAAGTCAACCATACGTAAGTTTCTGCCTTACT
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TTGCTTCTTACCATATGATCCCAACCCAAGAGCTGGTAATAAAAAAATTTATTTACTTGT
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TTGAGTGGTCTTAGACCTGCTGAATTCTTCTTCCATTGTATGGCTGGTAGAGAAGGTTTG
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GTTGGTTGTCTTGCAGCCCAAGCTATCGGTGAACCATCTACATAGATGACATTGAATACT
TTCCACTTGGCTGGTCACGGTGGTGTTAACCTTACCTTGGGTATTCCTCGTCTAAGAGAA
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CCTGAAGTTGCTTAAAACAAAGAATAAGTTCAAAATCATGCTCGTAAGCTCTAAAAAATT
AATTTATTAGAACTTGTTAATAACATCGAAGTCAAGGAACAAAAAATTATTGTTGTTGAT
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GACTTAGAAGCTATTCACTTCGCATTCTAATTAAACATTGACACAATTAATCGTAGAATT
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GAAGGCTTAGTTAGCGATTTCGACAAAGAAGCTGCTTCAGATGGTGAAGAATTAAAGAAA
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TCCAAAGCAGAATTATTTGAAGCTTCTCCTTATTACAACGTAAGCTATTAATAAATATTC
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ATAGTTTGTAACATTAAATTACCTTTAGATTCTAAGAAGTTATTGATGGTCAAGTAATAA
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CTCATTTTACATAAAATAGCTTGGTTGAAAAAATATTAAAGAAGACTTTGGTTTATGAAG
TAAAGAATATCTCTAATGCAACTGTCCTCAAAAAGGATAATAAAGGAGCCACTTCTTATC
AAATTTAAACAGAAGGTGTTAATTTCAAGTAAATCTGGAAAATGGATCACTTCGACTCTA
ATACTATAGACTCAAATGATATAGCTGCCTTAAACAAATGTTACGGTGTAAGAAATTCAT
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TAGATTGAAGCTGCTAGAAATGCAATTGTAAAAGAAATCGTCACTGTGTTCGGTGTTTAT
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CTTTCTACTCCTTCTTCCTCAATTGTCTTAGGTAGAGTTCCCTAAGTAGGTACTGGTGTT
TTCGACATTCTCCATAAGGTTTGAAAGAAATAAATAACTTCCTACTTTTGATAAAATCTA
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TTCATCAATCAATCCATCCATCCATCTAAATCATTAAGAAAATAATATTTATAATTATTA
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CCAAATTAAACAAAATTAATTGTTTATATACAAAAATATGTTTGTTGTATACCATTTTTA
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