Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00850570

Standard Name

RLI1 (RNase L Inhibitor 1)

Aliases

PreTt24959 | 149.m00085 | 3750.m00313

Description

RLI1 ABC transporter family protein; essential iron-sulfur protein required for ribosome biogenesis and translation initiation and termination

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

• iron-sulfur cluster binding (IEA) | GO:0051536
• ATPase activity (IEA) | GO:0016887
• electron transfer activity (IEA) | GO:0009055
• ATP binding (IEA) | GO:0005524

Domains

No Data fetched for Domains

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_00850570

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Stentor Coeruleus	SteCoe_27820	0
WormBase	WBGene00012714	9.997093137033517e-262	locus:abce-1 status:Partiall y_confirmed UniProt:Q9U2K8 protein_id:CAB54424.1
Tetrahymena borealis	EI9_18736.1	9.997093137033517e-262	ABC transporter (599 aa)
DictyBase	DDB_G0290483	9.997093137033517e-262	abcE1 on chromosome: 5 positio n 4209815 to 4211793
Oxytricha	Contig1173.0.g63	9.997093137033517e-262	ABC transporter
SGD	YDR091C	9.997093137033517e-262	RLI1 Essential iron-sulfur pro tein required for ribosome bio genesis and translation initia tion and termination; facilita tes binding of a multifactor c omplex (MFC) of initiation fac tors to the small ribosomal su bunit; predicted ABC family AT Pase

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00850570(coding)
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GAACAAGAATTCAAGTCTTCAATTAAGGTTTAATACGTTGATGCTATTCCTAAGCACGTT
AAGGGTGTTGTTGGTGAAATCATCAAGAAAAAAGATACTAAGGGTAACTCTGAAAGATTA
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AATATGCGTTTCCGTGACTACGGTCTCAGTTTTAAGGTTGCTGATAATTTAGAACCTATC
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>TTHERM_00850570(protein)
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CVKKCPLQAIKIINLPKDMSKDLVHRYGPNTFKLHRLPTPRAGQVLGLVGTNGIGKSTAL
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KGVVGEIIKKKDTKGNSERLIQELELSHLLERDISQLSGGELQRLAILIVCIQNVQISMF
DEPSSYLDVKQRLKAAQVIRSLIDEKNYIICVEHDLSVLDYLSDFVCCLYGSQTAYGIVT
MPFSVREGINIFLAGFIPTENMRFRDYGLSFKVADNLEPIDLKKMSHYTYPAMEKQQGAF
KLSICPGEFNQSQIVVLLGENGTGKTTFIKMLAGKDPAVKDKIPELNVSYKPQTVNPSFE
SSVRDLLNMRIPGVYTQPAFVSDVTKPMLLDDIIDNQVLELSGGELQRVCIILALGKPAD
VYLIDEPSAYLDSEQRIIAAKVIKRYILNSKKSAFVVEHDFIMATYLADSVIVYEGTPGK
ECKANSPQSLVSGMNRFLEIMGVTFRRDPSNFRPRINKIDSILDREQKIAGNYFSLEE

>TTHERM_00850570(gene)
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TGTAAACAAGAATGTAAATCTGCTTGCCCTATTAACAAATCAGGCAAATAGTGTGTTATT
GTTACTCCTAGTGATAAGATCAGCAATATTTAGGAATCATTATGTATAGGTTGTAATATG
TGTGTTAAAAAATGTCCTTTATAGGCTATCAAGATTATTAACTTGCCTAAGGATATGTCC
AAGGATTTGGTCCATAGATATGGTCCTAATACCTTCAAGTTACACAGATTACCTACTCCT
CGTGCTGGTTAGGTAAATTATTTACTTTAAAACTAATTTTTGTAATTAATTCAGTAAGAA
GTTTTTCTTAACTCTCAGTAATTTTATACTTTCTTCATTAATGTAAAATTAAAACTATCA
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AGAGTAAAAATTATAATTTAGTCTAAGAGAGTTATGTGAATATAAAATATCAAACAATTG
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CTGGTGGTGAATTATAACGTTTAGCTATTTTGATTGTTTGCATCTAAAATGTTTAGATTT
CTATGTTCGATGAACCTTCTTCTTATTTGGATGTAAAGCAAAGACTTAAAGCTGCCCAAG
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TTTTGGATTATCTTTCTGATTTCGTTTGCTGTCTCTATGGTTCTCAAACTGCTTACGGTA
TTGTTACTATGCCATTCTCTGTCCGTGAAGGTATTAACATCTTCCTTGCTGGTTTCATCC
CCACAGAAAATATGCGTTTCCGTGACTACGGTCTCAGTTTTAAGGTAAATAATTTAATTT
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TTAGAACCTATCGATTTAAAGAAGATGTCTCACTACACTTATCCTGCTATGGAAAAGCAA
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CTTTTGGGTGAAAATGGTACTGGTAAAACTACCTTCATTAAAATGTTAGCTGGTAAAGAC
CCTGCAGTTAAAGACAAAATCCCTGAATTAAATGTTTCTTACAAGCCTCAAACTGTCAAT
CCTTCCTTTGAATCCAGTGTACGTGATTTGTTAAACATGAGAATTCCTGGTGTTTACACT
CAACCTGCCTTCGTTTCTGATGTAACCAAGCCTATGCTTCTTGATGATATTATTGATAAC
TAAGTTCTTGAATTGTCAGGTATGATTACACTTTATTTGATCATTCAAATATGAGTCTAA
ATATCGATTTATTGAATTAAAAAAATAGGTGGTGAATTATAAAGAGTTTGCATTATTTTA
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GAATAGAGAATTATTGCTGCTAAAGTTATTAAGAGATATATTTTAAATAGTAAAAAATCT
GCTTTCGTTGTAGAACATGATTTCATTATGGCTACTTATCTTGCTGATAGGTAAATTTTA
TTTACAATCTGAATTTATAAATAGTATTATTTATTTAACAAATTAGTGTCATTGTTTATG
AAGGTACTCCTGGTAAAGAATGTAAGGCTAACAGTCCTCAAAGTTTAGTAAGTGGTATGA
ACAGATTCTTAGAAATTATGGGTGTCACTTTCAGAAGAGACCCTTCAAACTTCAGACCTA
GAATTAATAAAATCGACTCAATTTTGGATAGAGAACAAAAGATTGCTGGTAACTATTTCT
CCTTAGAAGAGTGA