Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00112910
Standard Name
RIO2 (RIO2 subfamily protein kinase)
Aliases
PreTt27105 | 8.m00365 | 3812.m02402
Description
RIO2 RIO kinase family protein; serine kinase involved in the processing of the 20S pre-rRNA into mature 18S rRNA
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Molecular Function Biological Process
Domains
No Data fetched for Domains
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%
TetraMine Data
TTHERM_00112910
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_03929.1 9.997093137033517e-262 RIO1 family protein (539 aa)
Oxytricha Contig1004.1.g80 1.999787596754473e-118 RIO1 family
DictyBase DDB_G0282099 5.997605038815675e-110 rio2 on chromosome: 3 position
5366397 to 5368196
WormBase WBGene00013688 9.99583921019208e-96 locus:riok-2 status:Confirme
d UniProt:Q95Q34 protein_i
d:CAC70109.2
SGD YNL207W 2.0000012618802033e-84 RIO2 Essential serine kinase i
nvolved in the processing of t
he 20S pre-rRNA into mature 18
S rRNA; has similarity to Rio1
p
Stentor Coeruleus SteCoe_22437 1.368539471173853e-44
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:16933976 : Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,
Sequences
>TTHERM_00112910(coding)ATG GCT AGC TGC TAA AAC AAG TAT TTA GAA TAT ATG ACA AAG GAT GAA TTC CGT GTC TTG ACA GCA ATT GAA ATC GGT ATG AGA AAT CAT GAA CTT GTA CCT ATG CAT CTT ATA GAA AGA ATC TCT CAT TTA AAG AGA GTA TGT GCT AGT AAA GTA GTA AAG TTA CTT CTT AAA AAT AAG TTT ATT GCA CAT GAA AAT AAA AAA TTC GAC GGT TAT AAA TTA ACT TAC TTG GGA TAT GAT TAT CTT GCT TTA CAG GTT TTT ATC AGA AGA GGA GCT ATT AAG GAA GTA TTA GGA AAA GTA GGA TGT GGT AAA GAG TCA GAT ATT TAT AAA TGT GTA AAT GAA AAT GGA GAT TTT GTT ATC TTG AAA TTC ACT CGT TTG GGC AGA ACT TCA TTT AGA ACA ATT AAA AAA AAT AGA GAT TAT ATT TAG CAT AGA ACA AGT TAT AGT TGG TTA TAT TTA TCC AGA CTT TCT GCT ATT AAA GAA TAC ACT TTT ATG GAT CTT CTA CAT AAG AAT AAC TTC CCT ACA CCT ATT CCT ATT GAG TAA AAT AGA CAT GGT ATT GTT ATG AGC TTA ATT AAT GGT GTT CCT ATG CAA AAC ATT TCT GAA ATT GAC AAT CCA AAA TAT GTT TTT GAC TAA TGC TTT TAT TTG ATT AAA AGA TTA GCT GAG AAT GGA CTT ATC CAT AGT GAT TTT AAT GAG TTT AAC TTG ATG GTA GAA GAT AAT GGA AAA GTT ATT ATG ATT GAT TTT CCT CAG ATG GTT AGC ACA AAG CAT AAA AAT GCA TAA TTT TAC TTT GAT AGA GAT GTT GAA TGC ATT CAC GTT TTC TTT GAA AGA AGA TTC AAT TAC CAG ATT ACT GAT ACT CTT GAT TTC AAC AAA ATT GCT AGA TTA AAT GAT CTT GAT GTA TAA GTA AAA GCT TCT GGA TTT ATC AAA AAG GAA ATA AAG AAT ATT GAT GAT TTT GAT ATT GAT TTG AGA GGT AGT GAT GAT GAT GGC GAC GAT GAT AAT AGT GAT GAT GAA AAT GAA TAG AAT GAT TTA GAT AAA AAT ATA GAA TAA GAA GAT AGC GAT AAT GAA ATA GAA GAA TCT AAT AAG AGA ATA CAA AAT TTA AAT ATC TTA AAT GAT GAA GAT ATT AGC TAA GAT GAA AAT GAA GAA GAG CAA AAA AAT AAC AAA AAA TAA AAA AAG CAT CAC CTT AAA AAG CAA TCA AAA TCA AAA TCT AAA AAG TAA AAC TAA GAA TAA GAA GGA AAA GAT GGA GAA GAT GAT GAA GAT AAC TAA AAA AAT AAC TTT TCT CCT GAT CTT TCT GAA ATA TCA ATA GAA GAT TTG AAA GAA CTT TAA AAG GTA AAC TAA GAT TTA TTT TCT GAT GAT GAT AAT GAA GAT GAT CCA TTG GCT TTG AAT GAG GTT AAA GAT ATT AAT GGA AAT ATT GTA GTT CCT GAA TAA AAA GAG AAG AAA AAA CCT AAA AAG AAA ATG GTA GAT ATT GCT AAT GAA TAA GAC CAG GAT AAC AAA CAA GAC CTA AAA GAA AAA ATA TAT ATT AAA GAA TCA GAA TTA GCT GAA AAA GCA AAG GCT TAT ATT TAA AGA TAA GTA GAA AAG TAA TTT AAG TAA AAA TAT AAA ATT CTT AAG AAA AAT ACA AAA AGC AGT AAC AGT AAT AAA GTT TTA GCT TCA GAG TAT ATG TGA >TTHERM_00112910(protein)M A S C Q N K Y L E Y M T K D E F R V L T A I E I G M R N H E L V P M H L I E R I S H L K R V C A S K V V K L L L K N K F I A H E N K K F D G Y K L T Y L G Y D Y L A L Q V F I R R G A I K E V L G K V G C G K E S D I Y K C V N E N G D F V I L K F T R L G R T S F R T I K K N R D Y I Q H R T S Y S W L Y L S R L S A I K E Y T F M D L L H K N N F P T P I P I E Q N R H G I V M S L I N G V P M Q N I S E I D N P K Y V F D Q C F Y L I K R L A E N G L I H S D F N E F N L M V E D N G K V I M I D F P Q M V S T K H K N A Q F Y F D R D V E C I H V F F E R R F N Y Q I T D T L D F N K I A R L N D L D V Q V K A S G F I K K E I K N I D D F D I D L R G S D D D G D D D N S D D E N E Q N D L D K N I E Q E D S D N E I E E S N K R I Q N L N I L N D E D I S Q D E N E E E Q K N N K K Q K K H H L K K Q S K S K S K K Q N Q E Q E G K D G E D D E D N Q K N N F S P D L S E I S I E D L K E L Q K V N Q D L F S D D D N E D D P L A L N E V K D I N G N I V V P E Q K E K K K P K K K M V D I A N E Q D Q D N K Q D L K E K I Y I K E S E L A E K A K A Y I Q R Q V E K Q F K Q K Y K I L K K N T K S S N S N K V L A S E Y M >TTHERM_00112910(gene)ATG GCT AGC TGC TAA AAC AAG GTA AAT GAT AAA ACG ATT TAA TTG AAA AAT AAT TTT TTT AAA TCA TTT GCT TAC TTT AAT TAC AAA AAG TTT GTA AGT TTG TTA GAT AAA TAT TTT TTT CTT GAT TTT AAT TCA GTA TGA AAA CAT TAT TTA TTT TGA TTT AAG TAT ATT AAT AAT TTA TTT GAA AAA TAT TTA ATT TTT AAA ATC AAA TAT GCT TTA TTT TGT TTT TGA AAA ATT TAA TGA TTA AAA TTA ATT TAA AAA ACA AGT ATT AGC GGG ATA TTT CAA ATT TAT TTT TTA TTT TAT AAT TAA TTT CCA TTT AGA TCT AAA AAA TAT GTG GAA ATT AAT TGT TTA TTA GTC TAA ATA TAT TTA TCA AAC ATC AAA ATT ATA ATA AAT TAA ATT ATT AAT AAT TAT AAG CAA AAT ATA AAA ATA GAT ATT TAT TAA ATT AAA TAA ATA GAT ATA GCA AGC ATA AAA TGG GAG GAG ATA ATA GCA AGA TTA TTG GTC AAT AAA GGA AAG AGT TAT CAG ATG GAC TGA GAG TTC TAG AAA ATA AAA TGA ATG ATA GAT TTA AAA CTT TCT CTT CCA CAC AAT AAA TTT TAG ACC AAA TAC TTA AAT CTT AAA GTG ACT TAT CTA AAT AAA TGA AAT CAA TAG ACA GCT AAA ATA ATG AAT TAA AAG TTG AAA TCT TAG GTG AGA TGT CTA GAA TAA GCA ATT AAT AAG AAA GTC TTA GCA ATA GTT GCA TAA AAG ATC AGT AAA TGG AAG TAG AAT TTT CTT CTA AAT TAG ATA TCC TAA AGG AAT CTA TTT CTA GAG AAT AAG ATA ATA AAC TAG TTA AGA GTT TTG AAG GTC TTC AGT CGA AGT TGA CTT TAG TAG AAA AAT AGC TAG ACC TTA TTA ATA ATT CAT TCA ACT AAA AAT GCA CAA ATC TTG AAT AAT CTT TAT TAT CTT AAA TTA AAG AAA GCT AAG AGT TGT CAA ATA TCT AAA CTA CTA AAA TGG TTG AGG AGG TTG TTT CTA CTC AAA TTG AAA AAA TTA TCA TCT CTC ACT CTC AAA AAA TTT CAA AAG TTG AAG AAG ACA TGG CTA ACT AAA AAA CTC GTA TCG ATA GTC TCG AAT CAT CTG TAA AAA ATA TTT AAG AAT CTA GTC AAT CTA CCA ATA AGG CAA TTA TCA AAT CTA TAA CTG ATT TAG AAT AGA AGT TTT CAT AAA TAT CAT AAA AAT TGG AAA GCT AAA AAG ATA ATT TGA TTT TAA CTA CTA AAG ATG AGA TAA ATT AAC TTA AAA AAG AAG TTA ACG AAT ATA AAA CTT TAA TCT TAC GTT TAG AGA AGT AGA TAG CAT CCT AAT AAT AAC AAA ATC AAA AAC TTA TAT CTT CTA ATA CAA GTA AAC CTA TCT AAC AAG ATA TAT CAT AAG ATA TAG AAG AGG AAT CAC CAG CAA AAA AAT TCA AGT AAC CCT TAT CTA AAG ATC CTA TTG ATG CTC CAA CTC CTA AAT CCA AGA AAG AAA AAG ACT AAA TGG ATA TTT AGT AAG ATA TAA CCA CAC CTA AAT AAA AAT AAC AAG GCT AAT TTA AAC AGC AGT TGG CTG AAT AAT CAT CTA CAC CTA AAG AAA AGA AAG ATA AAG TCT AAT AGT TCG AAA TTT AAG AAT TTA GCT AGA AAG CAA TCC AAA AGT AAA ATG AAA AGG AAT AAT CTT AAA CAC TCT AGA AAA GTT AGA TCA AAC AAG ATA AAA CTC CTT AAA ATA ATT CTG AAA TAA AAG TAG ATT AAA CCC CAA AGT AAA GCA ATC AAT CTA AAA CAG AAA TAA CAC CTA AGT CAT TTG CAT AAG AAT CAA AGT AAG CCC TGA AGA TAA TTA AAA AGG AGT AGC AAA TCT AAT TAA AAA ATG ATA ATG ATG ATT ATG GAT CAT CTA GCG AAG ATG AAG AAT CAA GTG AAA GTG AAA ATT TAC CAA GTA AGA GTA AAA TTA TGT CTA AAT AAA ATC AAA AAA AGA AGG AAT AAA AAA CTC CTT AAA GTG ATA AAG ATT TTA ATA ATT TGA ATA AAT TGA AAG AGA ATA CTA AAA ATT TCA TAA AAC AAG AGT AAA ATA ACA ACA ATA AAG GAG AAA ATA CTC CTA ATT AAA AGA AAA ACT TGA TTA ATA ACT AAA ATA TCA CAA ATA ACT AAT AAA ACT AAT AAT CTA ACT TTA ATG GTA AAA ATA AAT AGA ATT TAA AAG AAT AAT AGC AAG AAT CAA CTC CAC AAA GCT AGC AGA AGG GTA AAA AAA ACT TCA AAA ATT AAT ATT GAT AAA TGT ATC AGT ATG ATC TTA AAT CTC ATT TTA AAA TTA GTA GAT ATA CTT AAT AAA ACT GTA ATA AAA TTT TTG ATA TTG AAT TAA GTA AAA ATA ATT AAT CTA CAA AAG TTA AGA GAT TTA TGT TTT GTT TTC GTT TAT AAA TAA AAA ATG TTT CTT TCT AAT TTA TAT ATT CAG TCA TTT TTG TGA TAG TTT ATA CAA TTT ATT ACT TAT TTT TAA TGC TAT TTG ATT TTT AAT ACT ATT TCT TTC TAA TTT ATT AAT TTA AAA AAA TCA AAT TTA ATT ATG TTT GCT ATT TGT TCA TGT ATT TTA CAA AAG GCC TAA ATT ATT ATG ATT ATT ATC AAA ATT AGT AAT CCC ATG CAA ATC AAA ATT AAA TAA AAA GAA TTT GTT ATT ACC TCA AAA TAT CAA ATA TCA TCA AAA AGT ATT GAA AAT AAT TAA ACT ATA AAT TCA CTT CTA TTA AAT TTA ATA AGT AAA AAG CAA GAA AAA AAA AAA AAA AAT GAG ATT AGA CCC TTC AGT AAA GAT TTA TAT TTA ATA TCA ATT TAA GAT GTT CAA TTC CCA TTT TTA AAG TAT TTA GAA TAT ATG ACA AAG GAT GAA TTC CGT GTC TTG ACA GCA ATT GAA ATC GGT ATG AGA AAT CAT GAA GTA ATT TAA TTA ATT TGT TAT TTC TAA ACT GAG TAA TAA TAT TTT TTA ATA AAG CTT GTA CCT ATG CAT CTT ATA GAA AGA ATC TCT CAT TTA AAG AGA GTA TGT GCT AGT AAA GTA GTA AAG TTA CTT CTT AAA AAT AAG TTT ATT GCA CAT GAA AAT AAA AAA TGT AAG TTT TAA AAA TAT TTT TGC TTG ATT AAC AAA ACT CCT ACT TGA TTA AAT TGA AAT TTA AAA ACA AAT TTA TTA TAA TAT GGA CAC TTA TTT TAA AAA ATC AAA ATA GTC GAC GGT TAT AAA TTA ACT TAC TTG GGA TAT GAT TAT CTT GCT TTA CAG GTA CCT ATT TAG CTA ATC ATT TTG AAA TTT ATT TAT CAA TAA ATA TTT TAA TAA CAG GTT TTT ATC AGA AGA GGA GCT ATT AAG GAA GTA TTA GGA AAA GTA GGA TGT GGT AAA GAG TCA GAT ATT TAT AAA TGT GTA AAT GAA AAT GGA GAT TTT GTT ATC TTG AAA TTC ACT CGT TTG GGC AGA ACT TCA TTT AGA ACA ATT AAA AAA AAT AGA GAT TAT ATT TAG CAT AGA ACA AGT TAT AGT TGG TTA TAT TTA TCC AGA CTT TCT GCT ATT AAA GAA TAC ACT TTT ATG GAT CTT CTA CAT AAG GTA TTT ATT TTA ATC AAT ATT TAG TAT TTA GTA AGC TAA ATT ATT AAC CAT ATA AAT AGA ATA ACT TCC CTA CAC CTA TTC CTA TTG AGT AAA ATA GAC ATG GTA TTG TTA TGA GCT TAA TTA ATG GTG TTC CTA TGC AAA ACA TTT CTG AAA TTG ACA ATC CAA AAT ATG TTT TTG ACT AAT GCT TTT ATT TGA TTA AAA GAT TAG CTG AGG TAA AGA AAT TAT TAA TTA ATT ACG TAA AAA ATA TTT ATA TTT ATT ACT TTA ATA AAA AAG AAT GGA CTT ATC CAT AGT GAT TTT AAT GAG TTT AAC TTG ATG GTA GAA GAT AAT GGA AAA GTT ATT ATG ATT GAT TTT CCT CAG ATG GTT AGC ACA AAG CAT AAA AAT GCA TAA TTT TAC TTT GAT AGA GAT GTT GAA TGC ATT CAC GTT TTC TTT GAA AGA AGA TTC AAT TAC CAG ATT ACT GAT ACT CTT GAT TTC AAC AAA ATT GCT AGA TTA AAT GAT CTT GAT GTA TAA GTA AAA GCT TCT GGA TTT ATC AAA AAG GAA ATA AAG AAT ATT GAT GAT TTT GAT ATT GAT TTG AGA GGT AGT GAT GAT GAT GGC GAC GAT GAT AAT AGT GAT GAT GAA AAT GAA TAG AAT GAT TTA GAT AAA AAT ATA GAA TAA GAA GAT AGC GAT AAT GAA ATA GAA GAA TCT AAT AAG AGA ATA CAA AAT TTA AAT ATC TTA AAT GAT GAA GAT ATT AGC TAA GAT GAA AAT GAA GAA GAG CAA AAA AAT AAC AAA AAA TAA AAA AAG CAT CAC CTT AAA AAG CAA TCA AAA TCA AAA TCT AAA AAG TAA AAC TAA GAA TAA GAA GGA AAA GAT GGA GAA GAT GAT GAA GAT AAC TAA AAA AAT AAC TTT TCT CCT GAT CTT TCT GAA ATA TCA ATA GAA GAT TTG AAA GAA CTT TAA AAG GTA AAC TAA GAT TTA TTT TCT GAT GAT GAT AAT GAA GAT GAT CCA TTG GCT TTG AAT GAG GTT AAA GAT ATT AAT GGA AAT ATT GTA GTT CCT GAA TAA AAA GAG AAG AAA AAA CCT AAA AAG AAA ATG GTA GAT ATT GCT AAT GAA TAA GAC CAG GAT AAC AAA CAA GAC CTA AAA GAA AAA ATA TAT ATT AAA GAA TCA GAA TTA GCT GAA AAA GCA AAG GCT TAT ATT TAA AGA TAA GTA GAA AAG TAA TTT AAG TAA AAA TAT AAA ATT CTT AAG AAA AAT ACA AAA AGC AGT AAC AGT AAT AAA GTT TTA GCT TCA GAG TAT ATG TGA