Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00161180Standard Name
RFC5 (Replication factor C 5)Aliases
PreTt28510 | 13.m00538 | 3829.m01331Description
Subunit of Replication factor C (RF-C), which acts as a clamp loader of the proliferating cell nuclear antigen (PCNA)Genome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 34.8%
TetraMine Data
TTHERM_00161180
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_05372.1 9.997093137033517e-262 replication factor C subunit (
359 aa)
DictyBase DDB_G0293702 3.0014466598835893e-101 rfc3 on chromosome: 6 position
3014705 to 3015924
Oxytricha Contig1144.0.g118 3.9985196551577655e-99 Replication factor C C-termina
l domain
SGD YBR087W 2.9986068920536807e-84 RFC5 Subunit of heteropentamer
ic Replication factor C (RF-C)
, which is a DNA binding prote
in and ATPase that acts as a c
lamp loader of the proliferati
ng cell nuclear antigen (PCNA)
processivity factor for DNA p
olymerases delta and epsilon
WormBase WBGene00004339 9.996373193201036e-79 locus:rfc-3 status:Confirmed
UniProt:Q18547 protein_id
:CAA94339.1
Stentor Coeruleus SteCoe_34117 2.7487850079102147e-43
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00161180(protein)
MLRGQFQKIQIIRIILLKIQVLKARDRQTERYINISYSKFFAKKQFISISTKQFKKRFIN
KKILQMEKLWVDEIRPKSLDKLDYHPLLTEKLQKLAHSEDFPHLLLYGPNGAGKKTRAMA
FLQEVYGNGVHKVKSEEREFKVNPNTSTTVEVNIISSNYHLDVTPADAENQDRAVIQKLI
KEVASTHQLDPNSQRRFKVIIINEVDRLTLEAQASLRRTMEKYIGRCRLILIAENIGRVI
LPLRSRCLLIRVAAPSEQDVKAVVRKLNNEKNLNIPDDLACKFAKSCDYNLRAVILNLQT
QKLLKSTYNNSMEVQEPEWKKEIKNIAGIIKEHQNPAKLKEIRSKFYDLLVNCIPGDIII
KNLMYSLLDLIDQNDVHTKQEIIYYAAHHENLMNMGSKPVFHLEAFAAQCMLSYKKSILK
LKD>TTHERM_00161180(coding)
ATGTTACGCGGTTAATTCCAAAAAATATAAATAATTAGAATTATACTTCTTAAAATCTAA
GTTTTGAAAGCTAGAGACAGGCAAACAGAAAGATATATAAATATTAGCTATTCAAAATTT
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TTCCCTCATTTGTTATTATATGGACCTAATGGTGCAGGTAAAAAAACAAGAGCTATGGCT
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GAAATCATATACTATGCTGCTCACCATGAGAATTTGATGAATATGGGATCAAAGCCTGTC
TTCCACTTAGAAGCATTTGCTGCATAGTGCATGCTAAGCTACAAGAAATCTATATTAAAA
TTAAAAGATTGA>TTHERM_00161180(gene)
ATGTTACGCGGTTAATTCCAAAAAATATAAATAATTAGAATTATACTTCTTAAAATCTAA
GTTTTGAAAGCTAGAGACAGGCAAACAGAAAGATATATAAATATTAGCTATTCAAAATTT
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TTCTTGCAAGAAGTTTATGGAAATGGTGTGCATAAAGTCAAATCTGAAGAAAGAGAATTT
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TTAGATGTCACACCTGCTGATGCAGAGAATTAAGATAGAGCAGTCATTTAGAAGTTGATT
AAAGAAGTTGCTTCAACACATTAGTTAGATCCAAATTCTCAAAGACGTTTTAAAGTTATT
ATTATAAACGAAGTAGATCGTCTTACTCTTGAAGCTTAAGCCTCTCTAAGAAGAACTATG
GAAAAATATATTGGCAGATGCAGGTAAAATAATATACCAATCATTATTTAAAAATGAAAT
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AAAAAGAATAATTTTATTTTTCATTTCCTAAAATTTATTTTATTAAAATTATTTATTTTA
TAACTAAATAAATCCTAAAACAAATTTCTTTATTGACATAAAAGTAATTACAAATATTTT
GATCAGAAAAGTAGAAATACAAAATATTAAACAAATTAGATATCTATCTTAAAATAATTC
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AATATAAATAGAAGTATAAATAATTATCTGAATTACTATTTGATTTGTATAAAATTAAAA
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AAAAGGTTATTTGTTTTAGATAAAAGTAAAATAAATCCTAAATCAAATAACTTTATTAAC
ACAAAAATACTAGCAAATATTTTGATCAGAAAAGTAGAAATAAAAAATATTAAAAAACAT
TTAAATTAGATATTTTATAGTCATCCCATTATGTCATTTTGAGAATAATAAAGATATTTT
AAAGTCAACAAAAACTTAGCTGAGATTTATAAACTAAATTTATTTGGATATTTTAAATTT
GTAAATAATAATAGATATCGAGAAAAACAATAAATAGAAGTTTAAAATAATTATCTGAGT
TATTATTAGCTACATAAAAAATAGTGATAAAAATATTAAGAAGTTAAATATTTTTTTAAA
TAATTTTGAAGAGTTATCATAATTATATAAAGATATAACCCCTTGTTTTTGAACAATAAA
TAAAATAACATAGAAAATATAATTTAGATTATTTATCAAATTAAAAATCAATTTTTTATG
AGTCCTAAAACATAAATCTATAATTCAATAATAATTCAATCAATTCAAATCAAAAAATAT
TATTTTTAATAATAAATTCAATGATAATTATAATTTAAAAAGATAATTTTTTTTTATAAA
ATATTTTATGAGCAATTATTTGATAGTTTTAAGCAAAAATATAATTTATCTTTTTGATTC
ATAAAACAATTATTTGAGTAAAATAAAATTGCATAATTGTTCTTTTTTATATAGGATTTT
TTTCTATAACAAATTTTAATCAGATATTTTCTATAACTTACAAATTCTAAATAAAATTAA
TACTTTTACACTGAATTTAAAACAAGTAACTTATCAATTTTTTATAATATTGATTAATTT
ACAGTTTAAAATGTAAGAGTAAATAACTAACGTGCGATTACTTACTTAATTAATGTATTG
ATTTTTTATATATAGATTAATTTTGATAGCTGAAAATATTGGAAGAGTTATTTTACCACT
TAGAAGTAGATGCCTATTAATTAGAGTTGCTGCACCCTCAGAGCAAGATGTTAAAGCTGT
TGTTAGAAAGCTTAATAATGAAAAGAATTTAAATATACCTGATGATCTAGCTTGCAAATT
CGCAAAATCATGTGATTATAATTTAAGAGCAGTCATTTTAAATTTGCAAACACAAAAGCT
ACTCAAAAGTACTTACAACAATTCTATGGAGGTATAAGAGCCTGAATGGAAGAAAGAAAT
TAAAAATATCGCAGGAATTATCAAAGAGCATTAAAATCCAGCAAAGTAATTTCATCATAT
CTATTAATATAATTTCTAGTTTTAAACAAACACAAAGTTTCAATTCATATTTTATTAAGA
AAGAAACTTATTTGCTAAAATATTTCCATAAAATAAATATTTTGATCATTTAATTTTAAT
CGGAATCATAAAAAATATTTCGTATTAAGTATTCTTCAAAAAAGTAACAGATATATTTTT
AGAGAAACCTTAAACCTTTAGATATTAGACCATTATTAGATAAATTGATTGAGCTATTTA
ATTTAATTCGATAAAGTTAATGAATTACATAGATTAATTCAATCTTTGTTTGATCAAAAT
AAAATTTTGCTTATTATCAACACATAGTTAGTTATTTTATTATCAACATCAGCCAATATA
TATTGATCAATTTTTAATCATCTTAACTTAATTTCAAACTTGAAAAACACTAAATCAAAA
ATTTTTATTGTTCACTCATTCAATCACTCTCATACACATTTACTGTTGAAATGTAATATT
TAATTTAAAGCAAGACGTCAGAGTAAATAAAATTTGATCAAGCTTAACTTACTTTTGATT
TAAAAAAATAAAATATTGACACTTTTTATATGAGTTTTATCTAAATAAATTAGGTTAAAA
GAAATTAGAAGTAAATTTTATGACTTATTGGTAAATTGCATACCAGGAGATATAATTATA
AAGAATTTGATGTACAGTCTTCTTGATTTAATTGACCAAAATGATGTACATACTAAATAA
GAAATCATATACTATGCTGCTCACCATGAGAATTTGATGAATATGGGATCAAAGCCTGTC
TTCCACTTAGAAGCATTTGCTGCATAGTGCATGCTAAGCTACAAGAAATCTATATTAAAA
TTAAAAGATTGA