Gene Model Identifier
TTHERM_01207560
Standard Name
RDF1
Aliases
PreTt09110 | 274.m00027
Description
Associated with Rdr1; component of RDRC complex in RNAi pathway; involved in 23-24 nucleotide RNA metabolism
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Cellular Component
No Data fetched for Domains
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Signal Peptide Present?: No
TTHERM_01207560
Fullscreen View
No Data fetched for StockID
(v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_20940.1 9.995951036711152e-55 hypothetical protein (615 aa)
No Data fetched for General Information
Ref:19451546 : Lee SR, Talsky KB, Collins K (2009) A single RNA-dependent RNA polymerase assembles with mutually exclusive nucleotidyl transferase subunits to direct different pathways of small RNA biogenesis. RNA (New York, N.Y.) 15(7):1363-74Ref:19656801 : Couvillion MT, Lee SR, Hogstad B, Malone CD, Tonkin LA, Sachidanandam R, Hannon GJ, Collins K (2009) Sequence, biogenesis, and function of diverse small RNA classes bound to the Piwi family proteins of Tetrahymena thermophila. Genes & development 23(17):2016-32Ref:SUPR000379
>TTHERM_01207560(coding)ATG GAA GTT TAA AGT AAA CTC CTC GTA AAC GAA TAA GGC AGA TAA ATT AAT GGC AGA ATA TCA GCC GCA ATT TAA GAA ATA AAT AAT TTT GGA TTA GAT AAT ATT GTA TTG TTT TTG TGG AAC AGA GAA AGT TTA AAA ATA GAT GGA AAT AAT AAT AAT TAG ATA TAT ATA GGT AAA GAA TCT TTA GAC TAC CCT ATG CCA GAC TCA GAA GTT GTA ACA GAT ATG CTT TTG ATT AAT TAA AAT AAG TAT TTA ATA GTC TGC CTT AGC GAT GGT CAG CTT TTC ATA ACC AAA AAT AAT ATT TAG TCC TTT CAA AAT CAA AAT CAT ATA ATC ATT TAA TAA AAA TAA AGT GAT TTT TAT GAT GGT TAT TGT AGA ATT GCC TTT TTT CAG TAT GAA AAT TAA AAA GAC CGC AAA TAG AAT AAA TAC TAT TTG CTA GCT GTT GAC TAT AAA AAT AAG ATT TCC AAA TAC TCT TTC TCT TCA ATT GAA AAC TGT TAA ATT ACA AAT AGG GAA AAG TTA GCG AAT TAA TAC ATT TTT GTT TAA TAT GAT TAA ATT AAT CAA GTC TTT TTA GCT ATG GGT AGT GAC CTA GCA TTA TAT TGC TTT AAA ATG AAT GAT TTA AAT CAT AAT TTA GAA TAA TTT TAA ATT TAA TTT GAT AAG GAG GAC CTT AAA AAT TTA GGC ATA ATA TCT GTA AAA GAT TTT ATT GCA TTT GAC TTT CAA TAT AAA GAC GAA AAA TAT TAA ATT TAC ATT CTT GGA AAA TTG ATA GGA ATA TTT AGT GTA AGT ATG AAT GAT GTA GAG GAT AAC TAA AAT AAA CTA ATT GCG CAA ATT ACA TTT TTA TTT GAT CCT TTT GAG AAT GAA ATT TGC AAA TTT TGT GAT AGA AAT TAT ATA TAA ATT TTT AGT GAC AAA AGA AAA GAA AAA TTT GAT TCT TAA GAA ATT ACT GTA ATA TAC GAT AAA CTT GCT CTT AAA TTT TAT AAC TAA GAA GAT CAA TTT TTA AAA ATT TTT GAC TTA AAA GAT TTT AAT GCT GAT AAA AAT CTT AAG ATT GAT AAG TAT ATT TGT CTT TAT GGA AAC AGC TAA AAT ATT TCT TAC AAT ATC TTT AAT TGC TCT GAT TGT TAA AAT ATA GAG GAT TCA TTT AAG TAA ATT AGC TGT GAC AGA ATA TTT ATC AAT AAA GAA AAA TGA >TTHERM_01207560(protein)M E V Q S K L L V N E Q G R Q I N G R I S A A I Q E I N N F G L D N I V L F L W N R E S L K I D G N N N N Q I Y I G K E S L D Y P M P D S E V V T D M L L I N Q N K Y L I V C L S D G Q L F I T K N N I Q S F Q N Q N H I I I Q Q K Q S D F Y D G Y C R I A F F Q Y E N Q K D R K Q N K Y Y L L A V D Y K N K I S K Y S F S S I E N C Q I T N R E K L A N Q Y I F V Q Y D Q I N Q V F L A M G S D L A L Y C F K M N D L N H N L E Q F Q I Q F D K E D L K N L G I I S V K D F I A F D F Q Y K D E K Y Q I Y I L G K L I G I F S V S M N D V E D N Q N K L I A Q I T F L F D P F E N E I C K F C D R N Y I Q I F S D K R K E K F D S Q E I T V I Y D K L A L K F Y N Q E D Q F L K I F D L K D F N A D K N L K I D K Y I C L Y G N S Q N I S Y N I F N C S D C Q N I E D S F K Q I S C D R I F I N K E K >TTHERM_01207560(gene)ATG GAA GTT TAA AGT AAA CTC CTC GTA AAC GAA TAA GGC AGA TAA ATT AAT GGC AGA ATA TCA GCC GCA ATT TAA GAA ATA AAT AAT TTT GGA TTA GAT AAT ATT GTA TTG TTT TTG TGG AAC AGA GAA AGT TTA AAA ATA GAT GGA AAT AAT AAT AAT TAG ATA TAT ATA GGT AAA GAA TCT TTA GAC TAC CCT ATG CCA GAC TCA GAA GTT GTA ACA GAT ATG CTT TTG ATT AAT TAA AAT AAG TAT TTA ATA GTC TGC CTT AGC GAT GGT CAG CTT TTC ATA ACC AAA AAT AAT ATT TAG TCC TTT CAA AAT CAA AAT CAT ATA ATC ATT TAA TAA AAA TAA AGT GAT TTT TAT GAT GGT TAT TGT AGA ATT GCC TTT TTT CAG TAT GAA AAT TAA AAA GAC CGC AAA TAG AAT AAA TAC TAT TTG CTA GCT GTT GAC TAT AAA AAT AAG ATT TCC AAA TAC TCT TTC TCT TCA ATT GAA AAC TGT TAA ATT ACA AAT AGG GAA AAG TTA GCG AAT TAA TAC ATT TTT GTT TAA TAT GAT TAA ATT AAT CAA GTC TTT TTA GCT ATG GGT AGT GAC CTA GCA TTA TAT TGC TTT AAA ATG AAT GAT TTA AAT CAT AAT TTA GAA TAA TTT TAA ATT TAA TTT GAT AAG GAG GAC CTT AAA AAT TTA GGC ATA ATA TCT GTA AAA GAT TTT ATT GCA TTT GAC TTT CAA TAT AAA GAC GAA AAA TAT TAA ATT TAC ATT CTT GGA AAA TTG ATA GGA ATA TTT AGT GTA AGT ATG AAT GAT GTA GAG GAT AAC TAA AAT AAA CTA ATT GCG CAA ATT ACA TTT TTA TTT GAT CCT TTT GAG AAT GAA ATT TGC AAA TTT TGT GAT AGA AAT TAT ATA TAA ATT TTT AGT GAC AAA AGA AAA GAA AAA TTT GAT TCT TAA GAA ATT ACT GTA ATA TAC GAT AAA CTT GCT CTT AAA TTT TAT AAC TAA GAA GAT CAA TTT TTA AAA ATT TTT GAC TTA AAA GAT TTT AAT GCT GAT AAA AAT CTT AAG ATT GAT AAG TAT ATT TGT CTT TAT GGA AAC AGC TAA AAT ATT TCT TAC AAT ATC TTT AAT TGC TCT GAT TGT TAA AAT ATA GAG GAT TCA TTT AAG TAA ATT AGC TGT GAC AGA ATA TTT ATC AAT AAA GAA AAA TGA
Login
Recent Activity
Recent Papers
Identifiers and Description
Gene Ontology Annotations 
Domains
Gene Expression Profile
Signal Peptide
Homologs (v.2006 protein sequences)
General Information 
Associated Literature 
Sequences
