Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00361720Standard Name
RCL1 (RNA terminal phosphate cyclase RCL1)Aliases
PreTt13387 | 38.m00222Description
RCL1 RNA 3-prime-terminal phosphate cyclase; RNA 3'-terminal phosphate cyclase family proteinGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.5%
TetraMine Data
TTHERM_00361720
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_01321.1 1.0002211124116698e-173 RNA 3-terminal phosphate cycla
se (374 aa)
DictyBase DDB_G0276159 3.9990760533890984e-36 rtc1 on chromosome: 2 position
6274208 to 6275509
Stentor Coeruleus SteCoe_38408 0.000000000000004658886145103398 Oxytricha Contig3020.0.g29 0.0000000010002658722841845 RNA 3-terminal phosphate cycla
se
SGD YOL010W 0.000000009996807949091551 RCL1 Subunit of U3-containing
90S preribosome processome com
plex involved in 18S rRNA biog
enesis and small ribosomal sub
unit assembly; stimulates Bms1
p GTPase and U3 binding activi
ty; similar to RNA cyclase-lik
e proteins but no activity det
ected
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00361720(coding)
ATGGTAGACGTAGTATATCTTTAAATAGATGGTTCTCTTCATGAAGGAGGAGGTTAGATA
ATCAGATCAAGCATGGCTCTTAGCAATATCTTATAAAAGCCTATTCAATTAAAAAATATA
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AGAGAAATCTCTAAAGCATAGGTAGTAGGTGATAAATAAAAATCATTGAAGATCACTTAT
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ATAAGCTTCTTAGTAAGTAAATAGCCTGGAATTAAAGAGGAAGATATTGAATTTGAAGTA
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TTTTTGGTTATATTTTTTTTAAAAAAACTCAAATAAATTTTTTAGAAATAACTCACTTAT
TTAAAAAATTAGATTTGA>TTHERM_00361720(protein)
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REISKAQVVGDKQKSLKITYEPQMKIKSGNYAGGSQSAAAISLMVQSLIPTMIFGKAQST
IKLQGGSDVNKSPPFETIQRILKPLLEKMGIHFNYNLITEGYYPRGGGQIQLEVQPIADY
IKPITITKRTVINKIYLQFILTETCEKAQKDYFRPLKKDIISFLVSKQPGIKEEDIEFEV
DVKQIKNKKYKECYSIVAHAYGSEDNYFAFSFYNDDDLKVEVIILLILIILNDVFTRMHH
KKFMKTLLKNFQKEAVQMNTIKTNYYCTWHQLMESLKLEQTQLSQITLQLAFTYLKNLSQ
KQKLMQLMKKQLVLDLKLSKLQEQVLKTNEQVLNQTCQNKLIKIFIYLQKKININKDIFI
IILVFIFNKLQIVQQNKQIECYMQNKLINNKPLYLYNIQPLSIQFPQEDLFIFLIELERV
FLVIFFLKKLKQIFQKQLTYLKNQI>TTHERM_00361720(gene)
ATGGTAGACGTAGTATATCTTTAAATAGATGGTTCTCTTCATGAAGGAGGAGGTTAGGTA
TATAAGTTATTAGTACATTTTATTTGGTATTGAATCATTATCGTGAAATTTAATTAGATA
ATCAGATCAAGCATGGCTCTTAGCAATATCTTATAAAAGCCTATTCAATTAAAAAATATA
AGAGTTAACCGACCAAATCCTGGATTGAATAATTAGCTTATGGGAGCTGTAAAAGATAAT
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CTCTAAAGCATAGGTAGTAGGTGATAAATAAAAATCATTGAAGATCACTTATGAACCTTA
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CATGGTTTAATCTTTAATTCCTACTATGATTTTTGGAAAAGCCTAGTCAACTATTAAACT
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TTAATAGACTCTTTTAAAACTAACAAATTAGTAAACAAAAAAGAGATAAAATCTTAATTT
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GTAAACAAATCTCCTCCATTTGAAACAATACAAAGAATTCTAAAGCCACTTTTAGAAAAA
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TAGATTTAATTAGAAGTATAGCCAATTGCTGATTACATAAAGCCTATTACTATAACAAAA
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TAAAAAGATTATTTTAGACCTTTGAGTAAGAAAATTAAATTTATTTAATGAATTGAATGT
TAAAGTGGTGTTAAAAAAGCAAACTTAAATTATTAAAAACAGAAAAAGACATAATAAGCT
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AGCAAATAAAAAACAAAAAATATAAAGAATGTTACTCTATTGTTGCTCATGCATATGGAT
CTGAAGATAATTATTTTGCTTTTTCTTTTTACAATGATGATGATCTAAAAGTCGAAGTAA
TTATTTTATTAATACTAATAATATTAAATGATGTTTTTACTAGGATGCATCACAAAAAGT
TTATGAAAACTTTGTTAAAGAACTTTCAGAAGGAGGCTGTTTAGATGAATACCATTAAGA
CTAAGTAATACTTTTATTTATTTATTTATTTATATTTTAACTTTAATTTTTTTTGTTAAA
GTTATTATTGTACATGGCATTAGCTAATGGAGAGTCTCAAATTAGAGTAAACCCAGCTAT
CACAGATCACTCTTTAGCTTGCTTTTACGTACTTAAAGAATTTATCCCAGAAGTAAAAAT
TGATGTAATTGATGAAGAAGTAGCTGGTCTTAGATCTAAAATTATCAAAATTGTAGGAGT
AGGTTTTAAAAACGAATGAACAAGTTTTAAATTAAACTTGCTAAAATAAATTAATAAAAA
TATTTATTTATTTATAAAAAAAAATTAACATAAATAAAGATATATTTATAATAATTTTGG
TTTTTATATTCAATAAACTTTAAATTGTATAATAAAACAAACAAATTGAATGCTACATGT
AAAATAAATTAATTAATAATAAACCTCTATACTTATATAATATATAGCCTCTTAGCATAT
AATTTCCATAAGAGGATTTATTTATATTTTTAATTGAGCTAGAAAGGGTTTTTTTGGTTA
TATTTTTTTTAAAAAAACTCAAATAAATTTTTTAGAAATAACTCACTTATTTAAAAAATT
AGATTTGA