Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00361720

Standard Name

RCL1 (RNA terminal phosphate cyclase RCL1)

Aliases

PreTt13387 | 38.m00222

Description

RNA 3'-terminal phosphate cyclase family protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( TIGR03399 ) RNA 3'-phosphate cyclase
• ( PF01137 ) RNA 3'-terminal phosphate cyclase
• ( TIGR03400 ) 18S rRNA biogenesis protein RCL1

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.5%

TetraMine Data

TTHERM_00361720

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_01321.1	1.0002211124116698e-173	RNA 3-terminal phosphate cycla se (374 aa)
DictyBase	DDB_G0276159	3.9990760533890984e-36	rtc1 on chromosome: 2 position 6274208 to 6275509
Stentor Coeruleus	SteCoe_38408	0.000000000000004658886145103398
Oxytricha	Contig3020.0.g29	0.0000000010002658722841845	RNA 3-terminal phosphate cycla se
SGD	YOL010W	0.000000009996807949091551	RCL1 Subunit of U3-containing 90S preribosome processome com plex involved in 18S rRNA biog enesis and small ribosomal sub unit assembly; stimulates Bms1 p GTPase and U3 binding activi ty; similar to RNA cyclase-lik e proteins but no activity det ected

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00361720(coding)
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ATAAAGCCTATTACTATAACAAAACGCACTGTTATAAATAAAATTTATTTGCAATTTATT
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ATAAGCTTCTTAGTAAGTAAATAGCCTGGAATTAAAGAGGAAGATATTGAATTTGAAGTA
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GAAGTAATTATTTTATTAATACTAATAATATTAAATGATGTTTTTACTAGGATGCATCAC
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TTTTTGGTTATATTTTTTTTAAAAAAACTCAAATAAATTTTTTAGAAATAACTCACTTAT
TTAAAAAATTAGATTTGA

>TTHERM_00361720(protein)
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REISKAQVVGDKQKSLKITYEPQMKIKSGNYAGGSQSAAAISLMVQSLIPTMIFGKAQST
IKLQGGSDVNKSPPFETIQRILKPLLEKMGIHFNYNLITEGYYPRGGGQIQLEVQPIADY
IKPITITKRTVINKIYLQFILTETCEKAQKDYFRPLKKDIISFLVSKQPGIKEEDIEFEV
DVKQIKNKKYKECYSIVAHAYGSEDNYFAFSFYNDDDLKVEVIILLILIILNDVFTRMHH
KKFMKTLLKNFQKEAVQMNTIKTNYYCTWHQLMESLKLEQTQLSQITLQLAFTYLKNLSQ
KQKLMQLMKKQLVLDLKLSKLQEQVLKTNEQVLNQTCQNKLIKIFIYLQKKININKDIFI
IILVFIFNKLQIVQQNKQIECYMQNKLINNKPLYLYNIQPLSIQFPQEDLFIFLIELERV
FLVIFFLKKLKQIFQKQLTYLKNQI

>TTHERM_00361720(gene)
ATGGTAGACGTAGTATATCTTTAAATAGATGGTTCTCTTCATGAAGGAGGAGGTTAGGTA
TATAAGTTATTAGTACATTTTATTTGGTATTGAATCATTATCGTGAAATTTAATTAGATA
ATCAGATCAAGCATGGCTCTTAGCAATATCTTATAAAAGCCTATTCAATTAAAAAATATA
AGAGTTAACCGACCAAATCCTGGATTGAATAATTAGCTTATGGGAGCTGTAAAAGATAAT
TACAAAATCATTTGAATATTACAATAAATTATATTTTTAGATTAAATTGATGAGAGAAAT
CTCTAAAGCATAGGTAGTAGGTGATAAATAAAAATCATTGAAGATCACTTATGAACCTTA
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TAGTGTTTTATATACAGGAAATTATGCAGGAGGATCTTAGAGTGCAGCTGCCATAAGTCT
CATGGTTTAATCTTTAATTCCTACTATGATTTTTGGAAAAGCCTAGTCAACTATTAAACT
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TTAATAGACTCTTTTAAAACTAACAAATTAGTAAACAAAAAAGAGATAAAATCTTAATTT
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GTAAACAAATCTCCTCCATTTGAAACAATACAAAGAATTCTAAAGCCACTTTTAGAAAAA
ATGGGAATTCATTTTAATTACAATTTAATCACAGAAGGTTACTACCCAAGAGGTGGTGGA
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TAAAAAGATTATTTTAGACCTTTGAGTAAGAAAATTAAATTTATTTAATGAATTGAATGT
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CTGAAGATAATTATTTTGCTTTTTCTTTTTACAATGATGATGATCTAAAAGTCGAAGTAA
TTATTTTATTAATACTAATAATATTAAATGATGTTTTTACTAGGATGCATCACAAAAAGT
TTATGAAAACTTTGTTAAAGAACTTTCAGAAGGAGGCTGTTTAGATGAATACCATTAAGA
CTAAGTAATACTTTTATTTATTTATTTATTTATATTTTAACTTTAATTTTTTTTGTTAAA
GTTATTATTGTACATGGCATTAGCTAATGGAGAGTCTCAAATTAGAGTAAACCCAGCTAT
CACAGATCACTCTTTAGCTTGCTTTTACGTACTTAAAGAATTTATCCCAGAAGTAAAAAT
TGATGTAATTGATGAAGAAGTAGCTGGTCTTAGATCTAAAATTATCAAAATTGTAGGAGT
AGGTTTTAAAAACGAATGAACAAGTTTTAAATTAAACTTGCTAAAATAAATTAATAAAAA
TATTTATTTATTTATAAAAAAAAATTAACATAAATAAAGATATATTTATAATAATTTTGG
TTTTTATATTCAATAAACTTTAAATTGTATAATAAAACAAACAAATTGAATGCTACATGT
AAAATAAATTAATTAATAATAAACCTCTATACTTATATAATATATAGCCTCTTAGCATAT
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TATTTTTTTTAAAAAAACTCAAATAAATTTTTTAGAAATAACTCACTTATTTAAAAAATT
AGATTTGA