Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00298220Standard Name
RAD5L4 (RADiation sensitive protein family 5-like 4)Aliases
PreTt19224 | 28.m00183 | 3691.m00002Description
SNF2 family amine-terminal proteinGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%
TetraMine Data
TTHERM_00298220
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_07549.1 9.997093137033517e-262 hypothetical protein (646 aa)
SGD YLR032W 4.0007753645635287e-88 RAD5 DNA helicase proposed to
promote replication fork regre
ssion during postreplication r
epair by template switching; R
ING finger containing ubiquiti
n ligase; stimulates the synth
esis of free and PCNA-bound po
lyubiquitin chains by Ubc13p-M
ms2p
DictyBase DDB_G0282115 5.002382393859839e-46 DDB_G0282115 on chromosome: 3
position 5399711 to 5404710
Stentor Coeruleus SteCoe_19683 7.47197233734299e-43 WormBase WBGene00010061 1.0004783691736523e-35 status:Partially_confirmed U
niProt:G5EEW5 protein_id:CAB
05213.1
Oxytricha Contig12570.0.g36 1.0000422327488734e-24 SNF2 family N-terminal domain
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00298220(coding)
ATGGATAGATTTCTACCATTGACTATTAGCAAAACATACAATATCGATTAGGCTGTTGTT
GAGAAGATTATCAAAGAAAAGGAATTGAAAAGTAGATAAGAAATAATGAATTTTTTTGCA
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GCTAAGAAAAAATATATTTTTAACGTTAATATTGAGAGTCTTTACATCTTAATTTATACT
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AATACAATTCAGTTTGCTAATTTTAGATTATTTGTCCATAAAATAGAATCTAAAAATTGT
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AATAGTGATATTGGAAGTCTTTTAGGAGTTAATGATTAGTAGATAACAGATTATTTTAAC
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CTCATGTACTTTAATGAATATTCTTAGTCATTTTCACACCGTTTTTAAAAAAGTGAGGCT
AATTTGTAAAATGGAGGTATCTTAGCAGATGAAATGGGTTTAGGTAAAACAGTTATGGCA
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TTATATAGTCTGATATATTTTTTGAAATATGACACATTTTAAGACTACTATTGGTGGAAT
AAACATATAAATAATTGTGAAAATAAAGAAGAAGTATTTAAGTTACTATAAAATATCTTA
AGACCTATACTTCTGCGTCGTACTAAAAAATCAAAGTATAATGATGGAAGTAGTATAATC
AAAATTCCTAAAAAAACATAAAAAATACTGCTTATCCCTTTTAAAAAAGCAGAAAGATAA
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AATTAATTTTCATCAAACTATCTTCATATATTTTCAATAATGACAAAACTAAGATAAATG
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TATAATATCTTTATTAGCAAAATTGTTGATAATATAATGAATGATAATGATATCTATTAG
TTCAATGCCAATAACTAATAAAGGTAACAGCAATAGTAAAATAACTATATCTAATAAAGA
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GTCAAAGATAAAAAAGAAAAGCTGAAAATTTTGAAAGTTTTATCTCCTGATAATAGTAGT
AAGCTTTAGATTATTGTGAAAGAAGTAAAAAAGGTTTAATAAATGAAAGAAAAAGTTATA
ATTTATTCATAATTTTTAAGCTTTTTGACTTACTTACAAAAAGTTCTAAATGATAGAGAT
GTGAGATATACACGTCTTGATGGGACTATGAATAAAAAGGATAGAGCTACTGCAATCAAA
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GGTCTAAACCTAGTTGCTGCCAATCACGTATTCATATGTGATCCTTGGTATAATCCAGCT
ATAGAAGAATAAGCAATTGAAAGGTGTCATAGAATAGGATAAACTAAGAGAGTTCAAGTC
ATTAATTTCATAATGGAGTCTTCAATTGAGGAAAGGATTCTTTAGTGTTAAAAAAAGAAA
AGAAGCTTAATTTAAAATACTCTTTATATTTAAAAAAATAACTTAAGTGAGTTAGAGAAA
GAACAAGAAATTCAAGCTAAGATGAAAGAAATAAGATATATTATTGGTTTTGATGAAGAT
GAAAACTAAGAGGAAAAAAATATGACTAAAATGGATGAAGAAGAAAATATCAAAGAAATA
AAAAATTAAATGTATGACGATTTTGATGATGGTGAGGAAACTATTGTCAAAGAAATAGAT
GTATGA>TTHERM_00298220(protein)
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YIGSLLIPVEVSDLPSNLQANQELCINFGAFELDTKEVQYAKKKYIFNVNIESLYILIYT
KRKEYLGKIDHRFFFIWNILNTIQFANFRLFVHKIESKNCLQIRFDVFVTEKICSLYAEH
KEEDKNVFNKETLKEMSMEDQKKLVMRKYASESIKVMKAFLYVKETIPAILTPIERSLDL
LGGIQYRMQQRQSQGPLFSFIPSKLVIKPGLLGYYSDQAQQAQNQNQQQNEQQKIITMLN
QAEKAGQDNFLKDMKERDLEIQQINQIEEEFKINESEIIKNKNDQNAQNQKQKVDIQNGA
TNKCKDPKKAKFKNGKQSDQVNKENKMMPTEEQEIQNSSSNISSEENDNIEEENDNEDDE
DDEKDNQIDQENCENNFDVFEGEEFLRNLDPNYDNNQENLWQEIPDGINRVSSSTSSTTL
NSDIGSLLGVNDQQITDYFNLQNPPSLFQTSLFEYQQQALTWMLYKEKALTFEEAARPEI
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IILPLSVLTQWCNEVNRHFKKSSLFYFEYYDSKSRSSPILHLYDIVFTTYNILGMEYKNY
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FNANNQQRQQQQQNNYIQQRQQNIQFKAQVQQSLIKKDLTECFCTEPYEQEVALLQCGHF
FHMNCIQEMFRVQQNQNIVPNCPMCRVPFEENQINKINFQQIKEESKELEAKIKQQVIQQ
VKDKKEKLKILKVLSPDNSSKLQIIVKEVKKVQQMKEKVIIYSQFLSFLTYLQKVLNDRD
VRYTRLDGTMNKKDRATAIKTFSEQSEFTAILISLKAGAFGLNLVAANHVFICDPWYNPA
IEEQAIERCHRIGQTKRVQVINFIMESSIEERILQCQKKKRSLIQNTLYIQKNNLSELEK
EQEIQAKMKEIRYIIGFDEDENQEEKNMTKMDEEENIKEIKNQMYDDFDDGEETIVKEID
V>TTHERM_00298220(gene)
ATGGATAGATTTCTACCATTGACTGTAACGCTCATCTATGAAAAATAAAATATCCAACTT
TTATTTTATTCAATTTTTTAAATAGATTAGCAAAACATACAATATCGATTAGGCTGTTGT
TGAGAAGATTATCAAAGAAAAGGAATTGAAAAGTAGATAAGAAATAATGAATTTTTTTGC
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TGAGGAATTTATGGATACTTAGAATATTGTATTAAAATAAATTCCAAATTTGATAGTGAG
CAAATACTAAAAAGCTAACTAGGATATTATTTAATCTTACTGTAATTTAATGAGGGAGCT
ATTTCCAAAACAACAAGATTTATTCAATGACATATCGTAAAATTAGCTTATTTGGCCAAA
ATACATAGGATCTCTTTTGATTCCTGTAGAAGTGTCTGACTTACCTTCAAATTTATAAGC
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TGCTAAGAAAAAATATATTTTTAACGTTAATATTGAGAGTCTTTACATCTTAATTTATAC
TAAAAGAAAAGAATATGTAAACATTTTAAAATATTTTTATTGAAATAATTTAAAGAATTA
CAAAATGTTTTAAATTAATAATTATTATTTCAATTAATATAGCTAGGAAAGATTGATCAT
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GTCCATAAAATAGAATCTAAAAATTGTTTACAAATCAGATTTGATGTAAAAAATCAATTT
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ATATGTTCTTTGTATGCTGAGCACAAAGAAGAAGATAAGAATGTTTTCAATAAAGAAACT
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CCAATAGAAAGAAGTTTAGATTTATTAGGTGGCATTTAATATCGTATGCAATAGAGACAG
TCATAAGTAAATCCTCACAAAATAAAAAAAAAATATTTTTGAATATTTTATTTATTTAAA
TAAAGGGACCTCTTTTCTCATTCATTCCTTCCAAACTAGTTATAAAACCAGGATTATTAG
GTTATTATTCAGATTAGGCTCAATAAGCTTAAAACTAAAATTAATAACAGAATGAATAAC
AAAAAATTATAACCATGCTTAATTAAGCTGAAAAGGCTGGGTAAGATAATTTCCTAAAAG
ATATGAAAGAGAGAGACTTAGAAATTTAATAAATAAATTAAATAGAAGAAGAATTTAAGA
TTAATGAAAGCGAAATCATTAAAAATAAGAATGATTAGAATGCACAAAATTAAAAATAAA
AAGTTGACATATAAAACGGAGCTACAAATAAATGCAAAGACCCTAAAAAAGCAAAGTTTA
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AAGAAATATAAAATAGCAGCAGTAATATTAGTAGCGAAGAGAATGATAACATTGAAGAAG
AAAATGATAATGAGGATGATGAAGATGATGAAAAGGATAACTAGATAGATTAAGAAAATT
GTGAAAATAATTTTGATGTATTTGAAGGCGAGGAATTTTTAAGAAATTTAGATCCAAACT
ATGATAATAATTAAGAAAATTTATGGTAAGAAATTCCTGATGGCATAAACAGAGTTAGCT
CTTCTACTTCAAGTACAACACTAAATAGTGATATTGGAAGTCTTTTAGGAGTTAATGATT
AGTAGATAACAGATTATTTTAACTTGCAAAATCCACCTAGTTTATTCTAGACATCTCTTT
TTGAATATTAATAGCAAGCTTTGACTTGGATGCTTTACAAAGAAAAAGCACTCACTTTTG
AAGAAGCAGCTAGGCCTGAAATTTAAGAAAGGCCAAGATAATTAAATGAATTTTGGTGTG
AACTCTTATTTCTTGATGGGTCTCTCATGTACTTTAATGAATATTCTTAGTCATTTTCAC
ACCGTTTTTAAAAAAGTGAGGCTAATTTGTAAAATGGAGGTATCTTAGCAGATGAAATGG
GTTTAGGTAAAACAGTTATGGCATTAAGTCTGATTGCGTCTAATCTACCTAAAATAGATC
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ACAAAAATCAAAAAGAAGCTTAAGATATGGTTGAAGCTTTTGAGTAAAAAAAAAAATAAG
GTTTGATTCGAGCTGGAACTTTAATTATTCTTCCCTTATCAGTTTTAACTTAATGGTGTA
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AAAATCAAAGTATAATGATGGAAGTAGTATAATCAAAATTCCTAAAAAAACATAAAAAAT
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TTAAAAAGTTTTAAAAAATATTCTTATTGATAAAAATTAATTTTCATCAAACTATCTTCA
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CATAATTTTTAAGCTTTTTGACTTACTTACAAAAAGTTCTAAATGATAGAGATGTGAGAT
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GGTCTAAACCTAGTTGCTGCCAATCACGTATTCATATGTGATCCTTGGTATAATCCAGCT
ATAGAAGTATTTTTATCTGCAAATAATATTATTAGTAATTATAATTTTATTAAAATTAAA
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AAGCTTAATTTAAAATACTCTTTATATTTAAAAAAATAACTTAAGTGAGTTAGAGAAAGA
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AAACTAAGAGGAAAAAAATATGACTAAAATGGATGAAGAAGAAAATATCAAAGAAATAAA
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ATGA