Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00825460

Standard Name

RAD4 (RADiation sensitive 4)

Aliases

PreTt04010 | 142.m00107 | 3683.m00040

Description

DNA repair protein Rad4 containing protein; homolog of human XPC

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

• nucleus (IEA) | GO:0005634

Molecular Function

• damaged DNA binding (IEA) | GO:0003684

Biological Process

• nucleotide-excision repair (IEA) | GO:0006289

Domains

• ( PF03835 ) DNA repair protein Rad4
• ( PF06696 ) Streptococcal surface antigen repeat

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.8%

TetraMine Data

TTHERM_00825460

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_18272.1	9.997093137033517e-262	DNA repair protein Rad4 contai ning protein (932 aa)
Oxytricha	Contig15291.0.g9	9.003144504923815e-42	Rad4 beta-hairpin domain 3
DictyBase	DDB_G0292296	1.000116773704384e-19	xpc on chromosome: 6 position 1414792 to 1417980
WormBase	WBGene00022296	1.000361553249356e-16	locus:xpc-1 status:Partially _confirmed UniProt:Q9N4C3 protein_id:CCD73179.1
SGD	YER162C	0.0000009995106777214876	RAD4 Protein that recognizes a nd binds damaged DNA (with Rad 23p) during nucleotide excisio n repair; subunit of Nuclear E xcision Repair Factor 2 (NEF2) ; also involved, with Rad23p, in turnover of ubiquitylated p roteins

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:SUPR000123
2. Ref:SUPR000122

Sequences

>TTHERM_00825460(coding)
ATGGATTCAAATGAAGATCTTGATTTCAATGATGAATTTGAAGAAGTAGATGAAAAATAA
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>TTHERM_00825460(protein)
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AENLKKELMGFWRKIFKGVLLKKSISDRQNKISM

>TTHERM_00825460(gene)
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