Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00825460Standard Name
RAD4 (RADiation sensitive 4)Aliases
PreTt04010 | 142.m00107 | 3683.m00040Description
DNA repair protein Rad4 containing protein; homolog of human XPCGenome Browser (Macronucleus)
![]()
Genome Browser (Micronucleus)
![]()
Gene Ontology Annotations
Cellular Component
- nucleus (IEA) | GO:0005634
Molecular Function
- damaged DNA binding (IEA) | GO:0003684
Biological Process
- nucleotide-excision repair (IEA) | GO:0006289
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.8%
TetraMine Data
TTHERM_00825460
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_18272.1 9.997093137033517e-262 DNA repair protein Rad4 contai
ning protein (932 aa)
Oxytricha Contig15291.0.g9 9.003144504923815e-42 Rad4 beta-hairpin domain 3
DictyBase DDB_G0292296 1.000116773704384e-19 xpc on chromosome: 6 position
1414792 to 1417980
WormBase WBGene00022296 1.000361553249356e-16 locus:xpc-1 status:Partially
_confirmed UniProt:Q9N4C3
protein_id:CCD73179.1
SGD YER162C 0.0000009995106777214876 RAD4 Protein that recognizes a
nd binds damaged DNA (with Rad
23p) during nucleotide excisio
n repair; subunit of Nuclear E
xcision Repair Factor 2 (NEF2)
; also involved, with Rad23p,
in turnover of ubiquitylated p
roteins
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00825460(coding)
ATGGATTCAAATGAAGATCTTGATTTCAATGATGAATTTGAAGAAGTAGATGAAAAATAA
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CTGAAAAAGAGTATTTCAGATAGATAAAATAAAATAAGTATGTGA>TTHERM_00825460(protein)
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GLPKLLKKHNIEYVEAVCGFESTASGRSHVVKNGILAHKKDEERIRQIYQDNYEIMKAQQ
AENLKKELMGFWRKIFKGVLLKKSISDRQNKISM>TTHERM_00825460(gene)
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AGAAAATCTTAAAAAAGAGCTTATGGGATTTTGGAGAAAAATATTTAAAGGAGTTTTACT
GAAAAAGAGTATTTCAGATAGATAAAATAAAATAAGTATGTGA