Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00994150

Standard Name

RAB2E

Aliases

PreTt20011 | 187.m00048

Description

Rab II family protein; small monomeric GTPase that regulates membrane fusion and fission events

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

Domains

  • ( PF00071 ) Ras family
  • ( PF08477 ) Miro-like protein
  • ( PF00025 ) ADP-ribosylation factor family
  • ( TIGR00231 ) small GTP-binding protein domain
  • ( PF03029 ) Conserved hypothetical ATP binding protein

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 12%

TetraMine Data

TTHERM_00994150

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_15714.18.998068369452149e-53Ras family protein (212 aa)
OxytrichaContig22591.0.g1124.000139296874041e-45Ras family
DictyBaseDDB_G02922684.001118334825066e-42rab2A on chromosome: 6 positio
n 1422661 to 1423817
WormBaseWBGene000068335.000680012816624e-42locus:unc-108 status:Confirm
ed UniProt:O01577 protein_
id:CCD66422.1
SGDYFL038C2.9990874792167046e-33YPT1 Rab family GTPase, involv
ed in the ER-to-Golgi step of
the secretory pathway; complex
formation with the Rab escort
protein Mrs6p is required for
prenylation of Ypt1p by prote
in geranylgeranyltransferase t
ype II (Bet2p-Bet4p)
Stentor CoeruleusSteCoe_134212.1151310375910805e-19

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:16933976: Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,

Sequences

>TTHERM_00994150(coding)
ATGAAAAATATTTTTAAACTCTAGATTAAATGTTTGACTGATATTAAAATTTAGATTTCT
TCTAGTAGGTAAGAAAAAAAAAAAGAAATAAATCATAAGCGATTTAAAATTCTTTCATCT
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TTAGAATAAAATCGTCAAGTAAGTTATACAGAAGGAGAAAATTTTGCTAAAAAACATGAT
CTTTTTTTCTTTGAGGTGAGTGCATATACTGGTTATAACATTGATGAATTATTTAACAAA
ATTACTGAATTGGTATATGAAAATTAAAAATGA


>TTHERM_00994150(protein)
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SIKFKLNQYINFQSKFILFIKLQVKVVLFYKLHKITSKMNMIKRLHQNQQLKQQNKIIKS
LNYASGIQQLINKQPGQKILRCLVLHSYEKTAQGAILIYDITNRENFLNISGIIKQIRDS
EKSYVPLILVGNKFDLEQNREVSYTEGENFAKEHDLFFFEVSAFTGYNIEVLFNKITELV
LKQVSNLIEEKKITVGKSCIVLQASENKFKDEHDKTIGVEFLNKIIQYDNKIFKLSIWDT
AGQSRFRSIVFCYFEKAQGVILVYDITNRESFLNISEFIQKCRERTRSYVPLILVGNKFD
LEQNRQVSYTEGENFAKKHDLFFFEVSAYTGYNIDELFNKITELVYENQK


>TTHERM_00994150(gene)
ATGAAAAATATTTTTAAACTCTAGATTAAATGTTTGACTGATATTAAAATTTAGATTTCT
TCTAGTAGGTAAGAAAAAAAAAAAGAAATAAATCATAAGCGATTTAAAATTCTTTCATCT
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AAGCTGTAGGTAAAAGTTGTATTGTTTTATAAGCTACATAAAATAACTTCAAAGATGAAC
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TCAAAAAGAAATATGTTTAGAACTAAAAAAGAATCCCTCAATTACTTTTTTCATTAATAT
TACTTATACATACTCATAAAATAGCAAAAATGAAAAGTCTTTATTCAGAAATTTTCTAAA
ATTTAAAATCTTATTTTTAATAAGTATTATTGCTAAAACTACCATAAAAATCTCCTATTA
TTTTATTGGCTCTATCAAGTAATCATAAACCTAAGGAGTATGTGTTCTTGGTAGATTCTA
AGGATGAAATTCTATCAATTAATCATAGTGTTTCAAGCTATAGAATCAATCTAGCTTATT
TTTATTATTGAAATTGCTATACCTACCTAGTTTTTAATTGTAAAGTTTAGTTAACAAGCA
AATTAATTTTGATTAATTTAAAAATTATATATTATTGTGCAATTTTGATTAGGTTAAATT
TACTGTAGAATTAATGGTCAATTGCTTTATTTATATTTATGTTAGTTTCACTATAAAAAT
CAATATTTTTAAAATAATATCATTAATCCTTAAACTTTTATTTTAAGATGAAAAAATGTC
TTAACATATTCAGTAAAACGATGAACTTTAAAATGACTGGTAATTCTTTTAAGTTTAATG
AGTTTGAATCAAATAAATATATTATGTGCTATCTATCTTTAAAAAATTATTTTATAGAAA
ATAATAAGTCTATAATCCCTATCAACCAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAATATA
GCTATCCTAGAATAGTTATTTCTCAAGTAGGAAATAAACATTTAATACTACAATAAATAT
TATTTAATAAAATAAATTTAAAAAAAATAAAAAAAGGTTTTGAAATAGGTTTCGAACCTA
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TATTGTTTTATAAGCTTCAGAAAATAAATTCAAAGATGAACATGATAAAACGATTGGAGT
AGAATTCTTAAATAAAATAATATAATATGATAATAAAATCTTTAAACTATCCATCTGGGA
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ATTTTTGATATATTTTTAATTTTTTTTCAATATATTTATTATTTTTAGGCTGGCTAGAGT
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