Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00579220

Standard Name

RAB2D (RAB GTPase 2D)

Aliases

PreTt05815 | 78.m00187 | 3733.m00082

Description

Rab II family protein; small monomeric GTPase that regulates membrane fusion and fission events

Genome Browser (Macronucleus)

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Gene Ontology Annotations

Cellular Component

Molecular Function

Biological Process

Domains

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 12.9%

TetraMine Data

TTHERM_00579220

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_16334.11.000211181581171e-120Ras-like protein Rab-2A (236 a
a)
OxytrichaContig9955.0.g632.000597631390999e-64Ras family
WormBaseWBGene000068338.000035279590482e-64locus:unc-108 status:Confirm
ed UniProt:O01577 protein_
id:CCD66422.1
DictyBaseDDB_G02922683.998564387823535e-58rab2A on chromosome: 6 positio
n 1422661 to 1423817
SGDYER031C6.002524403568988e-55YPT31 Rab family GTPase, very
similar to Ypt32p; involved in
the exocytic pathway; mediate
s intra-Golgi traffic or the b
udding of post-Golgi vesicles
from the trans-Golgi
Stentor CoeruleusSteCoe_115682.9374821117108028e-30

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

  1. Ref:16933976: Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,

Sequences

>TTHERM_00579220(coding)
ATGAATTAGTACGACTATTTATTTAAGTTCATCATTATCGGAAATACAAGTGTTGGGAAA
TCTTGCATTCTTTCTTAGTTTACTGAAAACAGATTTAAAAGAGAACACGATGCGACTATA
GGAGTTGAATTTGGTTCAAAAAATATAGAGGTTGATGGATACACTATTAAAATATAAATA
TGGGATACAGCAGGATAGGAATCATTTAGAAGTATCACAAGATCCTACTACAGAGGATCT
GTTGGCGCTTTACTAGTTTATGATGTGACAAAAGAAGATAGCTTCTAAGATTTAAACAAA
TGGATCAGTGATGTCTCTGAAAACGCTAATAAAGATTTATCAGTAGCTGTTTTAGGCAAC
AAAATTGATTTAGATAATCGTGAAGTAAAAGCAAAAGATGGTGAAGCATTTGCATCAGAA
AGAAATTTTCTTTTCTTTGAAACATCAGCTTTAAATGGAGATAATATTGGTGAGGCTTTT
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ATAGAATTAAGTATAAAATACAGCTATAGAAAGCTAAAAATAGAATATAGAATTAGATCA
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AATCATTTCTAAACAATAAAATTTAAAAAATTAGCTTTTGTTATGTCATATATAGATAGA
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TAAAATAAAATGTAATAATAAATTAACACAAGGCAATTCATTAAATTATTTCTGTATTAA
AATAAATTGTCTCTTTATGTAATATATAAAGTTTTATATCTCTTTTAAAAAAATTACTAT
TTATAATTGTTCAAATTATATTCAAATTCTTCAAACATAAGAATTCAACAGAAATAAAAA
TAAAAAATATATGTGAAAATCTAAAAATTAATCAAGATGCTTATTCAAATTTTAGAAATT
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AAAAAAAAACTATTTATTTATTTATACAAATTTATCAATAAAATACTTAATTTGTAAGAA
TCTAAGGTATAGTATGGTTACAAAATAGTAAAATAAAATTGTTAATATTTTTTTGAAATA
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TTAAGTAATAAATAAATAAATTAATTACTTATATAATTAGTTTAATTATTACACATACTT
GAAAATAAATACAAATAATTAAAATGA


>TTHERM_00579220(protein)
MNQYDYLFKFIIIGNTSVGKSCILSQFTENRFKREHDATIGVEFGSKNIEVDGYTIKIQI
WDTAGQESFRSITRSYYRGSVGALLVYDVTKEDSFQDLNKWISDVSENANKDLSVAVLGN
KIDLDNREVKAKDGEAFASERNFLFFETSALNGDNIGEAFYALAKHVLDRIIEKQIDLTD
QVIIIDKQKNIVLILIIIIIIIIEQWSKSRSQKGKAKEFYIELSIKYSYRKLKIEYRIRS
KQRIYLYIQKRIKLQLLKNQNHFQTIKFKKLAFVMSYIDRYCQSESNKQVLILNTSSFQI
QNKMQQQINTRQFIKLFLYQNKLSLYVIYKVLYLFQKNYYLQLFKLYSNSSNIRIQQKQK
QKIYVKIQKLIKMLIQILEIILPFLINESFNIINIQKHFIKKKLFIYLYKFINKILNLQE
SKVQYGYKIVKQNCQYFFEIFIQKINYQSVKKNYLDIASKLTFSKIKHQDQKIIILKQKD
KLIQILLRIVKQFLKNFLCLLSNKQINQLLIQLVQLLHILENKYKQLK


>TTHERM_00579220(gene)
ATGAATTAGTACGACTATTTATTTAAGTTCATCATTATCGGAAATACAAGTAATTTTAAG
TTGTTAAACAAAACATTTTAGCTATGTTTCAATGCTATAGAGTTTATCCTACATATAAAA
ATGAACTACTTATTTTTATAAATAAATAAATAAATACATCAATATTTTATTAATAGGTGT
TGGGAAATCTTGCATTCTTTCTTAGTTTACTGAAAACAGATTTAAAAGAGAACACGATGC
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ATAAATATGGGATACAGTAATTAATTGCTAGAAATTTTCAAATTATAAAGCTTATCATTT
ATAATTATGTAAATAGGCAGGATAGGAATCATTTAGAAGTATCACAAGATCCTACTACAG
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GATCTGTTGGCGCTTTACTAGTTTATGATGTGACAAAAGAAGATAGCTTCTAAGATTTAA
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GCAACAAAATTGATTTAGATAAGTAATATTTATCAATCAACTTTTTTTATTTTGATTGAG
AAAATAAAATATATTTAATCTTAACTTCCTTAACTTAGTCGTGAAGTAAAAGCAAAAGAT
GGTGAAGCATTTGCATCAGAAAGAAATTTTCTTTTCTTTGAAACATCAGCTTTAAATGGA
GATAATATTGGTGAGGCTTTTTATGCATTAGCTAAACATGTATTAGATAGAATTATAGAA
AAGCAAATAGATTTAACAGATCAAGTAATAATAATAGATAAATAAAAAAATATAGTTTTA
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GGGAAAGCAAAAGAATTTTATATAGAATTAAGTATAAAATACAGCTATAGAAAGCTAAAA
ATAGAATATAGAATTAGATCAAAGCAGCGAATCTATCTCTATATCCAAAAAAGGATAAAA
TTGCAGTTGTTGAAAAATTAAAATCATTTCTAAACAATAAAATTTAAAAAATTAGCTTTT
GTTATGTCATATATAGATAGATACTGCTAAAGCGAAAGTAACAAATAAGTTCTAATTTTA
AATACAAGTTCTTTCTAAATTTAAAATAAAATGTAATAATAAATTAACACAAGGCAATTC
ATTAAATTATTTCTGTATTAAAATAAATTGTCTCTTTATGTAATATATAAAGTTTTATAT
CTCTTTTAAAAAAATTACTATTTATAATTGTTCAAATTATATTCAAATTCTTCAAACATA
AGAATTCAACAGAAATAAAAATAAAAAATATATGTGAAAATCTAAAAATTAATCAAGATG
CTTATTCAAATTTTAGAAATTATATTGCCATTTCTCATAAATGAAAGCTTCAATATAATT
AACATTCAAAAGCATTTTATTAAAAAAAAACTATTTATTTATTTATACAAATTTATCAAT
AAAATACTTAATTTGTAAGAATCTAAGGTATAGTATGGTTACAAAATAGTAAAATAAAAT
TGTTAATATTTTTTTGAAATATTTATTCAAAAAATAAATTATTAAAGTGTTAAAAAAAAT
TATTTAGATATAGCTTCAAAATTAACTTTTTCAAAAATCAAACATCAAGATTAAAAAATC
ATAATATTAAAATAAAAAGATAAATTAATTTAGATTTTGCTAAGAATTGTTAAATAGTTT
TTGAAAAATTTTCTTTGCCTTTTAAGTAATAAATAAATAAATTAATTACTTATATAATTA
GTTTAATTATTACACATACTTGAAAATAAATACAAATAATTAAAATGA