Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00347990
Standard Name
RAB11C (RAB GTPase 11C)
Aliases
PreTt05211 | 36.m00175 | 3703.m00008
Description
RAB11C Ras family protein; Rab II family protein; small monomeric GTPase that regulates membrane fusion and fission events
Genome Browser (Macronucleus)
Genome Browser (Micronucleus)
Gene Ontology Annotations
Cellular Component Molecular Function Biological Process
Domains
( PF00071 ) Ras family
( PF08477 ) Miro-like protein
( PF01926 ) GTPase of unknown function
( PF00025 ) ADP-ribosylation factor family
( PF00027 ) cyclic nucleotide-binding domain
( TIGR00231 ) small GTP-binding protein domain
Gene Expression Profile
Tetrahymena Functional Genomics Database:
Change in Gene Expression
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%
TetraMine Data
TTHERM_00347990
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description
Tetrahymena borealis EI9_09718.1 9.997217559668329e-127 hypothetical protein (851 aa)
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
Ref:16933976 : Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Thiagarajan M, Wortman JR, Badger JH, Ren Q, Amedeo P, Jones KM, Tallon LJ, Delcher AL, Salzberg SL, Silva JC, Haas BJ, Majoros WH, Farzad M, Carlton JM, Smith RK, Garg J, Pearlman RE, Karrer KM, Sun L, Manning G, Elde NC, Turkewitz AP, Asai DJ, Wilkes DE, Wang Y, Cai H, Collins K, Stewart BA, Lee SR, Wilamowska K, Weinberg Z, Ruzzo WL, Wloga D, Gaertig J, Frankel J, Tsao CC, Gorovsky MA, Keeling PJ, Waller RF, Patron NJ, Cherry JM, Stover NA,
Sequences
>TTHERM_00347990(coding)ATG AGT AAT GTG AAA ATA TCT TCA ATA AAT GAA AAT TAA AAT ATA CAA ATG AAG CTT GCA GGG CTA AAA GAT TTG CTT AAA ACA TAA GTA GAA AAT AGA AAC TAA GAG TAG ATC AGC AAA ATT TCT AGC ATT ATT AAA TAA TTA TCT GTT CTT CCG AAC TAC TTT TCA TCT TAA AAT GTA TTG GGA TAC TAA ATA GGC AAT TAT CAA GAT AAA ATA GAT TAT TTT ATA GCT TCA TAG CTA GAA TAC TTG GTA TTC GAT TCA AAT ATT GAC ATT CAA AAT AAA ATA AGA GAC GAT AAA GGG ATT TGC CTT TTA CTA TCT GGA AAA ATA ACG CTT GAA AAG ATT ATA TAA AAT GAA AAT ATT CAA AAT AAA AGT ATT GAT AAA AGT ATA GTA GTA TTA AAA GAG TTT AAA AAG GGT AGC TTT TTC AGC TTT TAC GAT ATT CAG TAT TAA GTA GAA GGT TCA AAA ATT ACA ATT TCA GGT CAA AAC GAT TTA ATG AAT GTC CTG GGA GAA AGT GAA TAG AAA CAA AAA TTT GAC AAT ATA GAA GTT GGC TAT TTA AAT TTA TAG TTG TAG AAA GAG ATA AAA AGT TAA TTA CAA ACA GCA AAT TAT AAA TCA TCT ATA TTT AAT TAT TAT GAT AGC ATT ATA AAG AAA GAA ATA TCA TTA ATG AAA TTA AAT TAT GGT TTT ACA CAA TAT CTC TCA GAG ATC TAG ATA GGA TAA ATT CTT TTT CAT TCT TAA ATT AGA AAT TTT TCA AAT AAA GAA CCT GTG TTT CTA AAT AAA GAA GAA TCT AAT TAT GTC TAT ATT GTT AGA AAA GGA AGT TTT TAA GTT TTT TGG AGA GAC TAT TCT ATA AAT TAG TAA AGA TAA TCT ATA TTC TTT TCA AAC TTA GAC TAA GAA AAT TCC CTG CTT AGA AGA TGG TCT TTG AGA GTT TAT GAA TCT AAG GAA ATA TTT GGT GAA GAT GAT ATT ATT TTT AAT TGC AGA TAA AGA TGC TTT GAT GTT ATA TGT AAT AGT GTG TCA GGC CAA CTT ATA ACA ATA CAA AAA AAC TAT TTT CTT TAT TGC TTA TAT CCT ATG CTG AAG AAT TAC TTT AAT GTT TTG GTT GAG GAT AAA GAA AAG CTC ATT AAT GAA AGA ATT AAT TAA ATT AGA AAT TAA TAA GGC AAA AAC TTT ACT ATT GTC TCT CCA TCT TTA TAA TCT ACA CAA CCC ATA TCA AGA GAA TGT AAG GAA ATT TCC TTA GAA GAT AGC TAT AAT AGT GTG CAG TTT ATA TAA AAG TAG TAA TCA TTA TCA TCT CCT TCT GTT TCT CCT GAT AAT TTT TGT ACT AAT GTT AGT TAA AAA GAA AAA AAA GAT GCT TTA ATA TTA CAA TAA GGA CTC TCA AGT CAG CTC ACT CAA CAA AAT TCA AAA TAA GAA AGC TAA AAA AGC AAT TTA GAA CAT AAA AAT TCA AAT AAA ATG CTT TTT TAG TTT ATT TTA AAT AAA TCA AAT TAT GCT CAA AAT TAA CCA TAA TAA ATG AAC AAA AAA ATT AAT AAC AGT ATT TAA GCA AGA TTA AAT ACA AAA AGA TAT GAT AAT ATA GGT AAT GTA AAC AGG TTA GAA CAA AAT ATT ATA GAA AAT AAA TAA ATA GAA GTT AGC TAA AGC AAT AAT TTA AAT TAA AAA GTT TAA AAG TTA TTA CAA TAA AAT TTA ACA AAT TCT TTA TCC TTT ACT TAA AAG GAG GAG TTT GAA TAA TCA TTT TAA AAC TCC CTT AAC AAA TTA ATT GAA TAT CAA GTC TCT TAA ACT TTT TCT TCT CGC TCA ATA AAA AAT AAC AGT CAT ACA TTC AAC AAC CCT AAA TCA GAA ACA GCT ATT GGA ATA AAA AAG AGA TAA AAA AAT TTA ATT TCT GAA CCC TCT TTT TCG TTT TAG TAG ATA TCA CCT TCA CTT AAA GAC TCG AAT TCA TTA ATA GCT AAA CAA AAA AAA TTA AAA ACT AAT AAT TTT TAG TAT TCT TAA TCG CCA AAC AAA AAT TCT TTA CAA AAC TTT TCA GAG ATT AAT TTT CCT TAA ACT TCA GAG AGA AGA ACA ATA AAA AAA AAT AAT AGT TAA AAT GCA GTT TTA AAG AGA TAA GCA AAC AGA GTT AGC CCG ATT TAA TCG GAC AAA GCA ATA GTC TTA AAA AGT AGC AGC GAA AGT GCA AGT TAA GGA ACT AAT AAT TCT GAA GGA GTT TGT ATT TTG CAG GCT CTC CAA GCA TCA AAT AGT GCA AAT TTA ACT AAC ACT AAT AAT AGT CAT AGT ACA TAA AAT AAT AAA AGT ATA AAT TAA AAA TTA ATT TTA AAC AGC AAC AAT AGC AGT AGT ATT TCA GTT TAA AGT GCA AAA ATA TCT AAT GGC ATA TAT TTG AAT TAA AGC TCA GGA GTC ATT TAA GAA GAA AAT TAA TAA ACT TTT TAA AAA TTT CAT AGC TTT AAA TAA GAA ATG CTT GAA AAG CTA AAG GAA AAT CAC AAT TTA AAA TCT AAA AAA GAA ATT TTA TCT AAA AGT TTA TCT TAA AAA TAG CAA TAA TAA TAG TAG ACA TAA TCT CTT TCA TGC TAT AGC AAT ATG ATA TAC AGT AAA ATC AAA GAA AAA GAT AGC ATA AGA AAA AAT TTG AAA AAG GAA TAT TCT GTT TTA AAT AAA AAG GGT AAT ATT AAT GCG CTC TCA CAA TAT TCT TTT AAA CTT GGA AAT TAT AAA ATT AAA AGT GAG CTA TTG TCA AAC TCT TTT GAA AAC TTA AAA TAA ATA TCT ACT TCA AAC CAA GAA AAA ATA AAT AAG TTA AGA AGA AAG TTT TCT GGA GAA GAA AAT ATG AAT AGT AAT AAA CCA AAA TAT TTA TTT ACT CCT TCA AGC GTT TCT CAT AGT AAA TTT AGT AAA AAA AGT AAA GGT TAA TAG CTT TTA GAA AAA ATA GTA GGA GGA AGC TAG TTA AAC AAC AAG TTA GAA TAT TAA AAT TTA TTT TTG AAT TCT CCA CTT TAA TAA GAT GTT AAA AGT TTA CTT GAA AAA TAG TAG TCA TAA ATG TTT GGA ATA GAC AAA ATT CTA ACT GAG CAG AGC TAA AAA CCT TCT ATT ACT TAA AGG GCT ACC TAG TAT ATT ACT AAT GAA TTG AAA TTT TTT AAC AAT GAT ACT TAA AAC AGC TCG CAA GCT CAC ATT TAA ACT GAT ACT TCC CCT TAA ACA CAG GAT CGT CTT AAA TAA ATT AAT GAA ACA CCA TAA ACA GCT TCA AAA ACT CCA ATA AAT ACG AAT CTT GAT AAA GAA TCA GAT AAA ACA GCA AAA AGC AAT TAA AAT AAC TCT TAA AAG TTC AAC AAT ATA CAT TCG AAC TAG TAG TCT TCT AGT TAT CAT TTA CTC TAA CAA ATC ACT AAA TAT CAA CAT TTT AAC TAA AAT ATA AAA TAA ATT AAT AAT AAA AAT TTT GGA AAA TTA AAG TAG CTA ATT AGT TAA AGC TTT GCT ACT CCA AAA TGC AAG AAT ATA TCT TCT TAA AAA ATT TAA TAA ACA TGT ATC GGA GAA ACG CCT AAA AAT CTT AGT ATA TAA AAT GAT TAA AGT ATA ACT TAA CAG CAA TAA AAT TGA >TTHERM_00347990(protein)M S N V K I S S I N E N Q N I Q M K L A G L K D L L K T Q V E N R N Q E Q I S K I S S I I K Q L S V L P N Y F S S Q N V L G Y Q I G N Y Q D K I D Y F I A S Q L E Y L V F D S N I D I Q N K I R D D K G I C L L L S G K I T L E K I I Q N E N I Q N K S I D K S I V V L K E F K K G S F F S F Y D I Q Y Q V E G S K I T I S G Q N D L M N V L G E S E Q K Q K F D N I E V G Y L N L Q L Q K E I K S Q L Q T A N Y K S S I F N Y Y D S I I K K E I S L M K L N Y G F T Q Y L S E I Q I G Q I L F H S Q I R N F S N K E P V F L N K E E S N Y V Y I V R K G S F Q V F W R D Y S I N Q Q R Q S I F F S N L D Q E N S L L R R W S L R V Y E S K E I F G E D D I I F N C R Q R C F D V I C N S V S G Q L I T I Q K N Y F L Y C L Y P M L K N Y F N V L V E D K E K L I N E R I N Q I R N Q Q G K N F T I V S P S L Q S T Q P I S R E C K E I S L E D S Y N S V Q F I Q K Q Q S L S S P S V S P D N F C T N V S Q K E K K D A L I L Q Q G L S S Q L T Q Q N S K Q E S Q K S N L E H K N S N K M L F Q F I L N K S N Y A Q N Q P Q Q M N K K I N N S I Q A R L N T K R Y D N I G N V N R L E Q N I I E N K Q I E V S Q S N N L N Q K V Q K L L Q Q N L T N S L S F T Q K E E F E Q S F Q N S L N K L I E Y Q V S Q T F S S R S I K N N S H T F N N P K S E T A I G I K K R Q K N L I S E P S F S F Q Q I S P S L K D S N S L I A K Q K K L K T N N F Q Y S Q S P N K N S L Q N F S E I N F P Q T S E R R T I K K N N S Q N A V L K R Q A N R V S P I Q S D K A I V L K S S S E S A S Q G T N N S E G V C I L Q A L Q A S N S A N L T N T N N S H S T Q N N K S I N Q K L I L N S N N S S S I S V Q S A K I S N G I Y L N Q S S G V I Q E E N Q Q T F Q K F H S F K Q E M L E K L K E N H N L K S K K E I L S K S L S Q K Q Q Q Q Q Q T Q S L S C Y S N M I Y S K I K E K D S I R K N L K K E Y S V L N K K G N I N A L S Q Y S F K L G N Y K I K S E L L S N S F E N L K Q I S T S N Q E K I N K L R R K F S G E E N M N S N K P K Y L F T P S S V S H S K F S K K S K G Q Q L L E K I V G G S Q L N N K L E Y Q N L F L N S P L Q Q D V K S L L E K Q Q S Q M F G I D K I L T E Q S Q K P S I T Q R A T Q Y I T N E L K F F N N D T Q N S S Q A H I Q T D T S P Q T Q D R L K Q I N E T P Q T A S K T P I N T N L D K E S D K T A K S N Q N N S Q K F N N I H S N Q Q S S S Y H L L Q Q I T K Y Q H F N Q N I K Q I N N K N F G K L K Q L I S Q S F A T P K C K N I S S Q K I Q Q T C I G E T P K N L S I Q N D Q S I T Q Q Q Q N >TTHERM_00347990(gene)ATG AGT AAT GTG AAA ATA TCT TCA ATA AAT GAA AAT TAA AAT ATA CAA ATG AAG CTT GCA GGG GTA AGA TCT TTT CAA TAT GGC TAA TTC AGC ATT TTT TTT ATA AAT GTC AAT TCT TTA TAC AGT TTA TAC TTA TTT TTT GTT TTT TAG CTA AAA GAT TTG CTT AAA ACA TAA GTA GAA AAT AGA AAC TAA GAG TAG ATC AGC AAA ATT TCT AGC ATT ATT AAA TAA TTA TCT GTT CTT CCG AAC TAC TTT TCA TCT TAA AAT GTA TTG GGA TAC TAA ATA GGC AAT TAT CAA GAT AAA ATA GAT TAT TTT ATA GCT TCA TAG CTA GAA TAC TTG GTA TTC GAT TCA AAT ATT GAC ATT CAA AAT AAA AGT ATT TCG ATA GCA ATA TTT CTT TTC TTT AAT TAA ATA TGG ATT TTT TTA AAA ATA TTT CAA AAT ATA AAC CTA AGA CAC TAA ATT TTT TTT TCT TTG TAT TAG TAA GAG ACG ATA AAG GGA TTT GCC TTT TAC TAT CTG GAA AAA TAA CGC TTG AAA AGA TTA TAT AAA ATG AAA ATA TTC AAA ATA AAA GTA TTG ATA AAA GTA TAG TAG TAT TAA AAG AGT TTA AAA AGG GTA GCT TTT TCA GCT TTT ACG ATA TTC AGT ATT AAG TAG AAG GTT CAA AAA TTA CAA TTT CAG GTC AAA ACG ATT TAA TGA ATG TCC TGG GAG AAA GTG AAT AGA AAC AAA AAT TTG ACA ATA TAG AAG TTG GCT ATT TAA ATT TAT AGT TGT AGA AAG AGA TAA AAA GTT AAT TAC AAA CAG CAA ATT ATA AAT CAT CTA TAT TTA ATT ATT ATG ATA GCA TTA TAA AGA AAG AAA TAT CAT TAA TGA AAT TAA ATT ATG GTT TTA CAC AAT ATC TCT CAG AGA TCT AGA TAG GAT AAA TTC TTT TTC ATT CTT AAA TTA GAA ATT TTT CAA ATA AAG AAC CTG TGT TTC TAA ATA AAG AAG AAT CTA ATT ATG TCT ATA TTG TTA GAA AAG GAA GTT TTT AAG TAA TTA ATT ATT TTT TAG AGT CGT TTT ACT TGT ATT AAA AAT AAT CTA TTA TAA TAA TTC TAT GAT TTA AAT ATT TGT TAG ATC TAA TTT ATT TTT TAA ATT TTA ATT TTT AAA AAA TAT TTT AAA ATA TAA ATA AAA TTA TAG GTT TTT TGG AGA GAC TAT TCT ATA AAT TAG TAA AGA TAA TCT ATA TTC TTT TCA AAC TTA GAC TAA GAA AAT TCC CTG CTT AGA AGA TGG TCT TTG AGA GTT TAT GAA TCT AAG GAA ATA TTT GGT GAA GAT GAT ATT ATT TTT AAT TGC AGA TAA AGA TGC TTT GAT GTT ATA TGT AAT AGT GTG TCA GGC CAA CTT ATA ACA ATA CAA AAA AAC TAT TTT CTT TAT TGC TTA TAT CCT ATG CTG AAG AAT TAC TTT AAT GTT TTG GTT GAG GAT AAA GAA AAG CTC ATT AAT GAA AGA ATT AAT TAA ATT AGA AAT TAA TAA GGC AAA AAC TTT ACT ATT GTC TCT CCA TCT TTA TAA TCT ACA CAA CCC ATA TCA AGA GAA TGT AAG GAA ATT TCC TTA GAA GAT AGC TAT AAT AGT GTG CAG TTT ATA TAA AAG TAG TAA TCA TTA TCA TCT CCT TCT GTT TCT CCT GAT AAT TTT TGT ACT AAT GTT AGT TAA AAA GAA AAA AAA GAT GCT TTA ATA TTA CAA TAA GGA CTC TCA AGT CAG CTC ACT CAA CAA AAT TCA AAA TAA GAA AGC TAA AAA AGC AAT TTA GAA CAT AAA AAT TCA AAT AAA ATG CTT TTT TAG TTT ATT TTA AAT AAA TCA AAT TAT GCT CAA AAT TAA CCA TAA TAA ATG AAC AAA AAA ATT AAT AAC AGT ATT TAA GCA AGA TTA AAT ACA AAA AGA TAT GAT AAT ATA GGT AAT GTA AAC AGG TTA GAA CAA AAT ATT ATA GAA AAT AAA TAA ATA GAA GTT AGC TAA AGC AAT AAT TTA AAT TAA AAA GTT TAA AAG TTA TTA CAA TAA AAT TTA ACA AAT TCT TTA TCC TTT ACT TAA AAG GAG GAG TTT GAA TAA TCA TTT TAA AAC TCC CTT AAC AAA TTA ATT GAA TAT CAA GTC TCT TAA ACT TTT TCT TCT CGC TCA ATA AAA AAT AAC AGT CAT ACA TTC AAC AAC CCT AAA TCA GAA ACA GCT ATT GGA ATA AAA AAG AGA TAA AAA AAT TTA ATT TCT GAA CCC TCT TTT TCG TTT TAG TAG ATA TCA CCT TCA CTT AAA GAC TCG AAT TCA TTA ATA GCT AAA CAA AAA AAA TTA AAA ACT AAT AAT TTT TAG TAT TCT TAA TCG CCA AAC AAA AAT TCT TTA CAA AAC TTT TCA GAG ATT AAT TTT CCT TAA ACT TCA GAG AGA AGA ACA ATA AAA AAA AAT AAT AGT TAA AAT GCA GTT TTA AAG AGA TAA GCA AAC AGA GTT AGC CCG ATT TAA TCG GAC AAA GCA ATA GTC TTA AAA AGT AGC AGC GAA AGT GCA AGT TAA GGA ACT AAT AAT TCT GAA GGA GTT TGT ATT TTG CAG GCT CTC CAA GCA TCA AAT AGT GCA AAT TTA ACT AAC ACT AAT AAT AGT CAT AGT ACA TAA AAT AAT AAA AGT ATA AAT TAA AAA TTA ATT TTA AAC AGC AAC AAT AGC AGT AGT ATT TCA GTT TAA AGT GCA AAA ATA TCT AAT GGC ATA TAT TTG AAT TAA AGC TCA GGA GTC ATT TAA GAA GAA AAT TAA TAA ACT TTT TAA AAA TTT CAT AGC TTT AAA TAA GAA ATG CTT GAA AAG CTA AAG GAA AAT CAC AAT TTA AAA TCT AAA AAA GAA ATT TTA TCT AAA AGT TTA TCT TAA AAA TAG CAA TAA TAA TAG TAG ACA TAA TCT CTT TCA TGC TAT AGC AAT ATG ATA TAC AGT AAA ATC AAA GAA AAA GAT AGC ATA AGA AAA AAT TTG AAA AAG GAA TAT TCT GTT TTA AAT AAA AAG GGT AAT ATT AAT GCG CTC TCA CAA TAT TCT TTT AAA CTT GGA AAT TAT AAA ATT AAA AGT GAG CTA TTG TCA AAC TCT TTT GAA AAC TTA AAA TAA ATA TCT ACT TCA AAC CAA GAA AAA ATA AAT AAG TTA AGA AGA AAG TTT TCT GGA GAA GAA AAT ATG AAT AGT AAT AAA CCA AAA TAT TTA TTT ACT CCT TCA AGC GTT TCT CAT AGT AAA TTT AGT AAA AAA AGT AAA GGT TAA TAG CTT TTA GAA AAA ATA GTA GGA GGA AGC TAG TTA AAC AAC AAG TTA GAA TAT TAA AAT TTA TTT TTG AAT TCT CCA CTT TAA TAA GAT GTT AAA AGT TTA CTT GAA AAA TAG TAG TCA TAA ATG TTT GGA ATA GAC AAA ATT CTA ACT GAG CAG AGC TAA AAA CCT TCT ATT ACT TAA AGG GCT ACC TAG TAT ATT ACT AAT GAA TTG AAA TTT TTT AAC AAT GAT ACT TAA AAC AGC TCG CAA GCT CAC ATT TAA ACT GAT ACT TCC CCT TAA ACA CAG GAT CGT CTT AAA TAA ATT AAT GAA ACA CCA TAA ACA GCT TCA AAA ACT CCA ATA AAT ACG AAT CTT GAT AAA GAA TCA GAT AAA ACA GCA AAA AGC AAT TAA AAT AAC TCT TAA AAG TTC AAC AAT ATA CAT TCG AAC TAG TAG TCT TCT AGT TAT CAT TTA CTC TAA CAA ATC ACT AAA TAT CAA CAT TTT AAC TAA AAT ATA AAA TAA ATT AAT AAT AAA AAT TTT GGA AAA TTA AAG TAG CTA ATT AGT TAA AGC TTT GCT ACT CCA AAA TGC AAG AAT ATA TCT TCT TAA AAA ATT TAA TAA ACA TGT ATC GGA GAA ACG CCT AAA AAT CTT AGT ATA TAA AAT GAT TAA AGT ATA ACT TAA CAG CAA TAA AAT TGA