Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00643580

Standard Name

PUF4 (Pumilio-family protein 4)

Aliases

PreTt10628 | 92.m00170

Description

Pumilio-family RNA binding repeat containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF00806 ) Pumilio-family RNA binding repeat

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%

TetraMine Data

TTHERM_00643580

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_05178.1	2.9990539278805726e-74	TPR Domain containing protein (1270 aa)
Oxytricha	Contig22789.0.g9	0.00000000000059990805086298	Pumilio-family RNA binding rep eat
WormBase	WBGene00001402	0.0000000000006997872742366828	locus:fbf-2 Fem-3 mRNA-bindi ng factor 2 status:Confirmed UniProt:Q09312 protein_id :CCD66119.1
SGD	YLL013C	0.000000000010004361180063202	PUF3 Protein of the mitochondr ial outer surface, links the A rp2/3 complex with the mitocho re during anterograde mitochon drial movement; also binds to and promotes degradation of mR NAs for select nuclear-encoded mitochondrial proteins
DictyBase	DDB_G0289987	0.0000000400154582995175	DDB_G0289987 on chromosome: 5 position 3515224 to 3518414

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00643580(coding)
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GAACATGAGAGAAGCATAGCAAATAATTAGTCAAAGCACGACTAATTCAATAGCGATGAA
TTAAACAGGGATAAGTCTATTTCTGATAATCTTTCTTCCTCTCCCATGTAGTAAAAACCA
CTTAAAGAGAAGAAACTGAAATTCAAAAACCTAAACTTTAATCCAAGTGTAAACACAAAC
GCTGATTCTAATTATAGTCTCGAAAATAATCAAGAAACACAAGTTTCTCAAAACATTTAG
TCTTCTTAGCAAAACTTATAGGTATATCAACAACACTTCAAGGATAGCAATTATTCATAT
CAATCCTAACACAGCAGTGAAAGTGTTGCTTCCAATTTGAATACAACCATAAAATCTACA
AGTTTAAACCTAGATGAACCATCTTACTGTGATTTCAAAAAGGAAGAAAATGACTCAAAA
AGACTATAGGAGGAGTACTAAAAAAACAAATTCTAAACATTCGAAAATGAAATAAAAAAT
AATTTAATTAAATTCTCTACTAATCGCTATTATAAATTTATTCTTTAGAATGTGCTTGAA
TCAGATTTAATATTTAGAGATTGTGAATAAGTAGAGTAAATTTATTTTAGCAGATTCGGT
TAAAAGATTATTAGGGAGTATTTAAATATACTCGAAGGTGAAGATTTAGTTCAACTGCTT
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AAACAAGAAATTATTTTATAAAAGATTCACCAAATAATAATGAGGATAGTAAAAAAAGCT
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TTAAGCACTAACAAATTTGGAAGCAATGTGGTTGAAAAGGCTATTAGATTTGGTGATGAT
TATTTTAGAGAAGAGATTTGGAAGATTATCAGTTACTAAAGTGAAGATGGCTAATTTATT
AACTTAGAGATACTAGTTAATGATCAATTTGCAAATTATGTGATTTAAAGATATTACGAG
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TAAAGTAGGCTTCAGCAATACGGCTAACATGTAAGAATGTAAATATTTGATAAAAACAAA
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AGTTACTATTCATAAAATACTAAGATTGGTAATACCAGTAGCTTAAATAATAATTTCAGT
AACACAATTTCTCAAAAAAGATACAATTATTCCAGAAATGGAAGCATAGTAAGTAATGAG
AGTGGTGGCTTAGAGTCAGTGAGCAGTAGAAAAAGCAGCTCTAATATTCCTACTCATCTG
ATAGATCAGTCCAATCAAAGCAATTTGGTATAAACTATACCATCTTAGCAGTCTGCTTAA
TAATTTATGCCACCTAATGATTAAAATATAATAGGGTATGGGAATAATAACTATTAAAAA
AATTACAGCTTAGGTGTCAATCCTCCTAAAAACCAATTTAATAATCAATATTTTAACTAA
AATGGAGGTATCCATCCATTTAGCTATAGCTAAAATGTAAATTAAAAAGCTTAGCACTTT
AGCAATACTTTTCAGCAAACTCAATTCTAATAAAGTAATGCTTGCACTTCATATCCTTTA
GAAAATCCGTACTAAAAAACTCAAAATCAGAATTAACTCTTCAATTAAAGTCACCCAAAT
TATTTCAATAGCCAAAAGAATCAGTTTAAACCAAAGTTAACTATGTAAGGAGGCAGTTAC
AAAGGAGTCGGACAGAAGATCATTACAAATAATTTCTAATAAATGAACGAAGGGTATCAA
GTAAATTATAGTAATTATCAGAATATCTAAAATATTAATAATGTCTAAGGCAGAGATTAG
AAATTATCAGCTGAAAATAATAGAAAAATGCTAAATTAAAATTATGGCAATACAAACTAA
TTAGATTTAAAATTATCTATCGACGACTAAATAAACAAATCTGAAGGCTAGCAGAAATAT
TTTTAAGAGAACCTTAATTAAGATCAAGAGAGTTATCAGTGA

>TTHERM_00643580(protein)
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QSRLQQYGQHVRMQIFDKNKPESKVHHLQQKDYNSSNINRSYYSQNTKIGNTSSLNNNFS
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SNTFQQTQFQQSNACTSYPLENPYQKTQNQNQLFNQSHPNYFNSQKNQFKPKLTMQGGSY
KGVGQKIITNNFQQMNEGYQVNYSNYQNIQNINNVQGRDQKLSAENNRKMLNQNYGNTNQ
LDLKLSIDDQINKSEGQQKYFQENLNQDQESYQ

>TTHERM_00643580(gene)
ATGAGTAGAAAGATTTTGATATAGCTGTATTCTCAAAGAGACTCTCCTCACCTCTTCGTC
AATAGAAGCAAGTCTGCTGATTGCGATAGAGAGGAGAATTTAGTTCATTATACCTACATC
AATCCGCGGATAATTAAGTATATTTTGCAAGAAGAAACAGAGAGTAATTAAGTTTGATTT
CAATTTCTTTCTACCATTTTTTGCTTTGTCACCACTATCAAATATCATTCAATTTAATCA
ACTGAAAGCAAAAATTTAGCAACAAGAAAGAATATAAGCTAAGCATAAAATTTATTAAAA
CATATTTAATTATGATTAGGATAAGATAACAGTTAAGAACATGAGAGGTAAAGATCATTT
TCTGAGTTTAAGCAAGTGTGAAAAAAGATACATTTGTGTCGGTCTCCAACAAAAATTAAA
CAAAAGATTTTTATTATTATCAAAAGCGAATAAATAAATAAAGCAAACAAACAAACAAGC
AGAATGAAATAATTAGAGTTGATAAAAACATAATTTAATTAAAAAAAATCTGCATTATTA
ATTTTTTTTCTTTAATTGTTCCAAAATCTTTTATTAGGAATCATCAAAACAATCAACAAT
AAACAAATAAATAAATTAATAACAAAGACAATTCACCAAAAAGTCTAAATTATTTTCTCT
CTTTTCATAGCATTGAATAGCAGCTCATTTTTTGATATTATTAAAAAGAAGCATAGCAAA
TAATTAGTCAAAGCACGACTAATTCAATAGCGATGAATTAAACAGGGATAAGTCTATTTC
TGATAATCTTTCTTCCTCTCCCATGTAGTAAAGTAAAAGATATTTATTTATAAGAATTTC
AAGCAATTTTAGTATTTTCAGCTAACTAAACCCCTTTCTTCTTACTTAATTTGAAAAATT
TATAAATAAGATTTTAGAAATTTAGTAGCTTTTTGTAAAAACAACATTTTTACATTCATA
TTTCAAAGAAAAATATTAAAAAGCATCATTTTTAAGAAAAAGCTCTTGCTTTGAATGTGT
AATGAGATTATTAATTGATTAAAAAATCAATTAGAGAAGTAAAATTTAACCTAAATTGCT
TAATTAAAAATTATTAATTCAAAAAAAGTCAAATTTCCTCTTTAAAATGCAAAATATTAT
TTTATTTTATTTTATCAGCTTACTTTATTTATGTAAAAAATAAGAACCACTTAAAGAGAA
GAAACTGAAATTCAAAAACCTAAACTTTAATCCAAGTGTAAACACAAACGCTGATTCTAA
TTATAGTCTCGAAAATAATCAAGAAACACAAGTTTCTCAAAACATTTAGTCTTCTTAGCA
AAACTTATAGGTATATCAACAACACTTCAAGGATAGCAATTATTCATATCAATCCTAACA
CAGCAGTGAAAGTGTTGCTTCCAATTTGAATACAACCATAAAATCTACAAGTTTAAACCT
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ATTCTCTACTAATCGCTATTATAAATTTATTCTTTAGAATGTGCTTGAATCAGGTAAAAT
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TTATTAATTTTTTATTGATTTAATAGAAATAATTTTTTAATATATTTAAGGAAATTATGG
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGAGTTATGTAG
ATTTAATATTTAGAGATTGTGAATAAGTAGAGTAAATTTATTTTAGCAGATTCGGTTAAA
AGATTATTAGGGAGTATTTAAATATACTCGAAGGTGAAGATTTAGTTCAACTGCTTAAAG
TAATCAACACAAAGGTAAAATATTTTAATATAGCTTTTTAAAATTTATGTATGGCGTATG
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TTTTTAAGCTGCAACCTTTCAATTTAAATCAAACAATAATTAGAATTTGCAAATTAGTTC
TAATTATTAATTGCAAAATATCTAAAATGGTTTGTTTTTTAGTAAGTATTTGTGCATAAA
AATATTTACGAAACTGTTTTATTTTTTAAATTTAGATTAAACAAGAAATTATTTTATAAA
AGATTCACCAAATAATAATGAGGATAGTAAAAAAAGCTCATCAATTGTCGTAGCATTATT
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AATAGTTGAATAGAGCACTTCTTCCTTACTTCATTGATTTAAGCACTAACAAATTTGGAA
GGTAAAGAATACATTATTAATTAAATATTTAATTATAAAGAGGATTTAAATGGTATATAT
TTTAAAAATAAATAATAGCAATGTGGTTGAAAAGGCTATTAGATTTGGTGATGATTATTT
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CACTAGTTTTGCACTTATTTTATTATTGCATCGCTTTTATAGTTCTAATTCCCTTCTTTA
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CAGCAGCAGATCAGTCTTTGTTGAAATTTTATAAATTTGTTAAATTCTATTGAAAGCAAT
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AAATATTATTTATTTTTATGTTTAATTTTTTTTTTTTTGAGGAGTTTACACTTTAAAAAA
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AAACAAACCAGAATCAAAAGTCCATCACCTTTAGCAGAAAGATTATAATAGTTCTAACAT
TAATAGAAGTTACTATTCATAAAATACTAAGATTGGTAATACCAGTAGCTTAAATAATAA
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TGCTTAATAATTTATGCCACCTAATGATTAAAATATAATAGGGTATGGGAATAATAACTA
TTAAAAAAATTACAGCTTAGGTGTCAATCCTCCTAAAAACCAATTTAATAATCAATATTT
TAACTAAAATGGAGGTATCCATCCATTTAGCTATAGCTAAAATGTAAATTAAAAAGCTTA
GCACTTTAGCAATACTTTTCAGCAAACTCAATTCTAATAAAGTAATGCTTGCACTTCATA
TCCTTTAGAAAATCCGTACTAAAAAACTCAAAATCAGAATTAACTCTTCAATTAAAGTCA
CCCAAATTATTTCAATAGCCAAAAGAATCAGTTTAAACCAAAGTTAACTATGTAAGGAGG
CAGTTACAAAGGAGTCGGACAGAAGATCATTACAAATAATTTCTAATAAATGAACGAAGG
GTATCAAGTAAATTATAGTAATTATCAGAATATCTAAAATATTAATAATGTCTAAGGCAG
AGATTAGAAATTATCAGCTGAAAATAATAGAAAAATGCTAAATTAAAATTATGGCAATAC
AAACTAATTAGATTTAAAATTATCTATCGACGACTAAATAAACAAATCTGAAGGCTAGCA
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