Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00643580Standard Name
PUF4 (PUmilio-Family protein 4)Aliases
PreTt10628 | 92.m00170Description
PUF4 pumilio-family RNA-binding repeat protein putative; Pumilio-family RNA binding repeat containing proteinGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
![]()
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
- ( PF00806 ) Pumilio-family RNA binding repeat
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.2%
TetraMine Data
TTHERM_00643580
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_05178.1 2.9990539278805726e-74 TPR Domain containing protein
(1270 aa)
Oxytricha Contig22789.0.g9 0.00000000000059990805086298 Pumilio-family RNA binding rep
eat
WormBase WBGene00001402 0.0000000000006997872742366828 locus:fbf-2 Fem-3 mRNA-bindi
ng factor 2 status:Confirmed
UniProt:Q09312 protein_id
:CCD66119.1
SGD YLL013C 0.000000000010004361180063202 PUF3 Protein of the mitochondr
ial outer surface, links the A
rp2/3 complex with the mitocho
re during anterograde mitochon
drial movement; also binds to
and promotes degradation of mR
NAs for select nuclear-encoded
mitochondrial proteins
DictyBase DDB_G0289987 0.0000000400154582995175 DDB_G0289987 on chromosome: 5
position 3515224 to 3518414
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00643580(coding)
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GAACATGAGAGAAGCATAGCAAATAATTAGTCAAAGCACGACTAATTCAATAGCGATGAA
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CTTAAAGAGAAGAAACTGAAATTCAAAAACCTAAACTTTAATCCAAGTGTAAACACAAAC
GCTGATTCTAATTATAGTCTCGAAAATAATCAAGAAACACAAGTTTCTCAAAACATTTAG
TCTTCTTAGCAAAACTTATAGGTATATCAACAACACTTCAAGGATAGCAATTATTCATAT
CAATCCTAACACAGCAGTGAAAGTGTTGCTTCCAATTTGAATACAACCATAAAATCTACA
AGTTTAAACCTAGATGAACCATCTTACTGTGATTTCAAAAAGGAAGAAAATGACTCAAAA
AGACTATAGGAGGAGTACTAAAAAAACAAATTCTAAACATTCGAAAATGAAATAAAAAAT
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TAAAAGATTATTAGGGAGTATTTAAATATACTCGAAGGTGAAGATTTAGTTCAACTGCTT
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TTAAGCACTAACAAATTTGGAAGCAATGTGGTTGAAAAGGCTATTAGATTTGGTGATGAT
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AACTTAGAGATACTAGTTAATGATCAATTTGCAAATTATGTGATTTAAAGATATTACGAG
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TAAAGTAGGCTTCAGCAATACGGCTAACATGTAAGAATGTAAATATTTGATAAAAACAAA
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AGTTACTATTCATAAAATACTAAGATTGGTAATACCAGTAGCTTAAATAATAATTTCAGT
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TAATTTATGCCACCTAATGATTAAAATATAATAGGGTATGGGAATAATAACTATTAAAAA
AATTACAGCTTAGGTGTCAATCCTCCTAAAAACCAATTTAATAATCAATATTTTAACTAA
AATGGAGGTATCCATCCATTTAGCTATAGCTAAAATGTAAATTAAAAAGCTTAGCACTTT
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GAAAATCCGTACTAAAAAACTCAAAATCAGAATTAACTCTTCAATTAAAGTCACCCAAAT
TATTTCAATAGCCAAAAGAATCAGTTTAAACCAAAGTTAACTATGTAAGGAGGCAGTTAC
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GTAAATTATAGTAATTATCAGAATATCTAAAATATTAATAATGTCTAAGGCAGAGATTAG
AAATTATCAGCTGAAAATAATAGAAAAATGCTAAATTAAAATTATGGCAATACAAACTAA
TTAGATTTAAAATTATCTATCGACGACTAAATAAACAAATCTGAAGGCTAGCAGAAATAT
TTTTAAGAGAACCTTAATTAAGATCAAGAGAGTTATCAGTGA>TTHERM_00643580(protein)
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KGVGQKIITNNFQQMNEGYQVNYSNYQNIQNINNVQGRDQKLSAENNRKMLNQNYGNTNQ
LDLKLSIDDQINKSEGQQKYFQENLNQDQESYQ>TTHERM_00643580(gene)
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AATAGAAGCAAGTCTGCTGATTGCGATAGAGAGGAGAATTTAGTTCATTATACCTACATC
AATCCGCGGATAATTAAGTATATTTTGCAAGAAGAAACAGAGAGTAATTAAGTTTGATTT
CAATTTCTTTCTACCATTTTTTGCTTTGTCACCACTATCAAATATCATTCAATTTAATCA
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CATATTTAATTATGATTAGGATAAGATAACAGTTAAGAACATGAGAGGTAAAGATCATTT
TCTGAGTTTAAGCAAGTGTGAAAAAAGATACATTTGTGTCGGTCTCCAACAAAAATTAAA
CAAAAGATTTTTATTATTATCAAAAGCGAATAAATAAATAAAGCAAACAAACAAACAAGC
AGAATGAAATAATTAGAGTTGATAAAAACATAATTTAATTAAAAAAAATCTGCATTATTA
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AAACAAATAAATAAATTAATAACAAAGACAATTCACCAAAAAGTCTAAATTATTTTCTCT
CTTTTCATAGCATTGAATAGCAGCTCATTTTTTGATATTATTAAAAAGAAGCATAGCAAA
TAATTAGTCAAAGCACGACTAATTCAATAGCGATGAATTAAACAGGGATAAGTCTATTTC
TGATAATCTTTCTTCCTCTCCCATGTAGTAAAGTAAAAGATATTTATTTATAAGAATTTC
AAGCAATTTTAGTATTTTCAGCTAACTAAACCCCTTTCTTCTTACTTAATTTGAAAAATT
TATAAATAAGATTTTAGAAATTTAGTAGCTTTTTGTAAAAACAACATTTTTACATTCATA
TTTCAAAGAAAAATATTAAAAAGCATCATTTTTAAGAAAAAGCTCTTGCTTTGAATGTGT
AATGAGATTATTAATTGATTAAAAAATCAATTAGAGAAGTAAAATTTAACCTAAATTGCT
TAATTAAAAATTATTAATTCAAAAAAAGTCAAATTTCCTCTTTAAAATGCAAAATATTAT
TTTATTTTATTTTATCAGCTTACTTTATTTATGTAAAAAATAAGAACCACTTAAAGAGAA
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TTATAGTCTCGAAAATAATCAAGAAACACAAGTTTCTCAAAACATTTAGTCTTCTTAGCA
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AGATGAACCATCTTACTGTGATTTCAAAAAGGAAGAAAATGACTCAAAAAGACTATAGGA
GGAGTACTAAAAAAACAAATTCTAAACATTCGAAAATGAAATAAAAAATAATTTAATTAA
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TTATTAATTTTTTATTGATTTAATTGAAATAATTTTTTAATATATTTAAGGAAATTATGG
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GAATTTTTAGAATGACGAAATAAAAAATAATAGGTTGCAAAAAAAGAATTTTCAGAGTAT
TATTAGAGTTATGTAGATTTAATATTTAGAGATTGTGAATAAGTAGAGTAAATTTATTTT
AGCAGATTCGGTTAAAAGATTATTAGGGAGTATTTAAATATACTCGAAGGTGAAGATTTA
GTTCAACTGCTTAAAGTAATCAACACAAAGGTAAAATATTTTAATATAGCTTTTTAAAAT
TTATGTATGGCGTATGAATAATTAAATAAATAAATATTAGTTATTAGATCCATTTGAATT
TAGTGAACAAAAAATTGATTTTCTGAGCAATAATTTGCTAAGCAAAAAATACCTTTGTGG
CGAGCAATATGGATGTCTAATTGTAAATTACATAGTAGAGCAGTATTCCTAGAATCAATT
CAAAGAAAGCACTCAATTGGTATTTCTTTTTATCATTTTAAATAATTTTACTTTCAAAAA
GTATATTCTTGTTTATTTTTTAAGCTGCAACCTTTCAATTTAAATCAAACAATAATTAGA
ATTTGCAAATTAGTTCTAATTATTAATTGCAAAATATCTAAAATGGTTTGTTTTTTAGTA
AGTATTTGTGCATAAAAATATTTACGAAACTGTTTTATTTTTTAAATTTAGATTAAACAA
GAAATTATTTTATAAAAGATTCACCAAATAATAATGAGGATAGTAAAAAAAGCTCATCAA
TTGTCGTAGCATTATTACTCAAACTATGTGATACAGCTTATTTTGGAAAAATTACCCAAT
GATTGCGAAATAAATTAATAGTTGAATAGAGCACTTCTTCCTTACTTCATTGATTTAAGC
ACTAACAAATTTGGAAGGTAAAGAATACATTATTAATTAAATATTTAATTATAAAGAGGA
TTTAAATGGTATATATTTTAAAAATAAATAATAGCAATGTGGTTGAAAAGGCTATTAGAT
TTGGTGATGATTATTTTAGAGAAGAGATTTGGAAGATTATCAGTTACTAAAGTGAAGATG
GCTAATTTATGTAATTCATACTTTATTTAAAAATATTTTTGTTTGTTTGAAGTAATTAAA
TTATAAAAATAGTAACTTAGAGATACTAGTTAATGATCAATTTGCAAATTATGTGATTTA
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GCATCATAAAATAATATTTATTTTATTAAATTATTTAAAAATACATTAAGTCGAATTGCT
CAACCTTAAAATTATTCACTAGTTTTGCACTTATTTTATTATTGCATCGCTTTTATAGTT
CTAATTCCCTTCTTTACATTATACTTTCTTTAGCAAACTTTAGAGTGGGGAATTTACACA
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TTCTATTGAAAGCAATTACTAAAAATACAAAAAATACAAAAATTTTGCTTACCCTATCTT
TTATTTAATAACAAATAAATATTATTTATTTTTATGTTTAATTTTTTTTTTTTGAGGAGT
TTACACTTTAAAAAAATTTATTTATATATTTATTTATTATAAGAAGCAATTTACTTTAGA
TTTGTAAACTTATTTTATGATTAATTTGTAAATTTTTTTAATAGGCTAACATGTAAGAAT
GTAAATATTTGATAAAAACAAACCAGAATCAAAAGTCCATCACCTTTAGCAGAAAGATTA
TAATAGTTCTAACATTAATAGAAGTTACTATTCATAAAATACTAAGATTGGTAATACCAG
TAGCTTAAATAATAATTTCAGTAACACAATTTCTCAAAAAAGATACAATTATTCCAGAAA
TGGAAGCATAGTAAGTAATGAGAGTGGTGGCTTAGAGTCAGTGAGCAGTAGAAAAAGCAG
CTCTAATATTCCTACTCATCTGATAGATCAGTCCAATCAAAGCAATTTGGTATAAACTAT
ACCATCTTAGCAGTCTGCTTAATAATTTATGCCACCTAATGATTAAAATATAATAGGGTA
TGGGAATAATAACTATTAAAAAAATTACAGCTTAGGTGTCAATCCTCCTAAAAACCAATT
TAATAATCAATATTTTAACTAAAATGGAGGTATCCATCCATTTAGCTATAGCTAAAATGT
AAATTAAAAAGCTTAGCACTTTAGCAATACTTTTCAGCAAACTCAATTCTAATAAAGTAA
TGCTTGCACTTCATATCCTTTAGAAAATCCGTACTAAAAAACTCAAAATCAGAATTAACT
CTTCAATTAAAGTCACCCAAATTATTTCAATAGCCAAAAGAATCAGTTTAAACCAAAGTT
AACTATGTAAGGAGGCAGTTACAAAGGAGTCGGACAGAAGATCATTACAAATAATTTCTA
ATAAATGAACGAAGGGTATCAAGTAAATTATAGTAATTATCAGAATATCTAAAATATTAA
TAATGTCTAAGGCAGAGATTAGAAATTATCAGCTGAAAATAATAGAAAAATGCTAAATTA
AAATTATGGCAATACAAACTAATTAGATTTAAAATTATCTATCGACGACTAAATAAACAA
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GTGA