Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00221110Standard Name
PUF3 (PUmilio-Family protein 3)Aliases
PreTt22439 | 18.m00465 | 3701.m00222Description
PUF3 pumilio-family RNA-binding repeatprotein; Pumilio-family RNA binding repeat containing proteinGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%
TetraMine Data
TTHERM_00221110
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_06792.1 9.997093137033517e-262 pumilio-family RNA binding rep
eat containing protein (871 aa
)
WormBase WBGene00004244 2.99851380290819e-19 locus:puf-8 status:Confirmed
UniProt:Q09487 protein_id
:CCD66262.1
Oxytricha Contig22789.0.g9 7.001446474249442e-19 Pumilio-family RNA binding rep
eat
SGD YLL013C 5.000468829272308e-18 PUF3 Protein of the mitochondr
ial outer surface, links the A
rp2/3 complex with the mitocho
re during anterograde mitochon
drial movement; also binds to
and promotes degradation of mR
NAs for select nuclear-encoded
mitochondrial proteins
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
- Ref:26688337: Kataoka K, Mochizuki K (2015) Phosphorylation of an HP1-like Protein Regulates Heterochromatin Body Assembly for DNA Elimination. Developmental cell 35(6):775-88
Sequences
>TTHERM_00221110(coding)
ATGGAAACCGCAATAATGTAGCAAGAGTAATTGTATCCTAGAGTACATAACATTCAGCAA
ACTGCCAGTAATCATTCTGAAGAAGAAGATTTAAGCACAATCCCTTGCTTAATATCAGTG
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AAGAAATAAGAAAAAGATGTAGAAATGAGAAAAATTTCTACTGCAGCCTCTGAAGAATTA
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GAAAATCAAACTAATATACAAAGACAGGAGGAATCTAAAAAGTTATAGACGCTATATCAA
GAATCAAGTGAGAAAAATAAGCTATTTGAAGAAAAAATTAGAAAAAGCATAAAAGAATTT
GCTTTGGATAAATACTCCCACTTTGTTTTAATTCTTGTTTTAGATATAGGCTCTTCCGGT
CATAAGAGAATAATAATTGAAAGTACATTAAAAGAGAAAGAACTATTCAGCCATGAACAA
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AAAAACTAAAATGTTGAACCTAACTAAAGCTAAGGATAATAAAATAATAATTATGATGTG
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CCAAATTCTCTTAATTCTCCGCAAACAAACATTGATAAAAAGTAAGATGAAAATTAAGAA
AATCAAACAAATTAATAGGACGGCAGCGAACCAAGCAAATGA>TTHERM_00221110(protein)
METAIMQQEQLYPRVHNIQQTASNHSEEEDLSTIPCLISVKKSHSTPQNSLADKINQFSD
RQQQQKEKELQEIKEQEKVETSNEEQVINRNKQNSAQQQKKKQEKDVEMRKISTAASEEL
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ESSEKNKLFEEKIRKSIKEFALDKYSHFVLILVLDIGSSGHKRIIIESTLKEKELFSHEQ
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YVNQPSEFTDPQLLNYFDPNNLMNPPYFDFLQGAHIKVQQNKNNQNDNNKQEQQSEITTQ
PNSLNSPQTNIDKKQDENQENQTNQQDGSEPSK>TTHERM_00221110(gene)
ATGGAAACCGCAATAATGTAGCAAGAGTAATTGTATCCTAGAGTACATAACATTCAGCAA
ACTGCCAGTAATCATTCTGAAGAAGAAGATTTAAGCACAATCCCTTGCTTAATATCAGTG
AAAAAGTCGCATTCGACTCCTCAGAATAGCTTGGCTGATAAAATTAATCAATTTTCTGAT
CGCCAATAGCAGTAGAAAGAAAAAGAATTGCAAGAGATAAAAGAATGTATTATTTCAAAT
ATAAATTTATCATTAAGCATTTTCAATAATCGATTTTATTGTAATAAAAGAGGAGAAAGT
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GTATTTAGAGATCATTTATTAGATTTGGTATTGGTTAATTCATTAATAAATTGAATGGAA
AAATTAATTGAAATCAATAATTGTGCAAAACAAAACATAAGAGAAAAATTTATTAATTTC
TAATACTAAATTTTGAAAAATTAAAAACTAAAGTAGAAACAAGCAAAACTCAGCTCAATA
ATAAAAGAAGAAATAAGAAAAAGATGTAGAAATGAGAAAAATTTCTACTGCAGCCTCTGA
AGAATTAAAAACTGATTACCCTCAGCAACTTAGCAAAAGCAATTCAAGTTCTTAGTAATA
GACAATTTTGTTTTTATTTTTTTATTTTCTGCATAATTCAAAATAGTAAAATAAGCAATT
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TTAATTTTTTTAAAGGAGACTCCTTATCTAATCCTCCTTTCTCTTTTCTCTTCAAAATAT
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ATTTTCTTTCTCTTTTTTCACCCTACTTTCTTTATTTCCTTTATTTTTTTTGCAGCAAAA
CTCAATCATCTACTTTGACTTGATTTTCACTGATTTTGAGTTTAAACTAGAAAACCTTTT
ATGTCTATCATTTATTACTTTAAATACATTCCTTTTGCACACCTATCAGGCAAATAAGCT
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GAATTACTTCATTTTTCTAAGGAAAATTTACAAAGAAAACTACCATTTTTTTTAAAAAGA
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TATTACCTACCATAAACAAAGACAAAATAAATTTATATTTGCTTATGTTATTTTACTATC
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TTAGATATAGGTATAAAAAAATTATTTTTAAAAAACTATTTTATTAAACTTACATGAAAA
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CTCTAAAAAAGAATTCATTGATTAATATAATGAATTCATCAAATATATTTTAGACAACTA
ATCAAAGACTTATCAGACTCTTCAAAATGATAAATTTGGTAATTATGTTATTTAAAAATG
CTTAGAAATTTTTGATGAAGACCATTTATCACAGCTTCTGATTCTTCTGAATGCAACAGT
AACTGAAATTAAATATTTTAATATCTTTATTATTCTTTTTCTAATAAAATCATTAGCTTC
TAATCAAACCTGAGCAAAAGCTTCCTAATTTACCAAAAGAAAGTTAATTAAAAGATAGTG
ATCTTTGCTCTGATTAATATGGTTGCTTAATAATATAAAAATTAATTGAAATATATAAGA
CCAAGCCTGATTCAAAAATCAAAAAACAAGTAATTTCTTAAATCAACTAATTATTATTTT
TATTTTATGCTTCTTTCAAATCAAATTAGGTGGGACAAATGATTGAAAAAGTGATTAATG
ATTCACACCGCTTAGCATAAAGATAATTTTCCAATTATGTTGTACAGCAAATAATTGAAA
AAGGTGCTCCTGAACACAAGAATATGTTATATCAAAATGTGATTTCAAAACACTTCATAA
GCTTAGCTATGGATAAATACGGAAGTAATGTAGCTGAAAAAGCGATAAAATATGCTGAGC
CAGATTAAAAAAAATAAATTTGGGGTCTGATTTCTGCTAACAATTTTAGGTAAATTAAAT
TACATTTTAAATTTTTTTTTTAGGTTTTATTTTATTTATTGTGTAAATTTAATTAGGTTT
TTATCTATTTATTTTTGATTGATTTGGATGATAAAAATTTTAATTTTTTTTTGCTAATAA
ATAGTGCTTTACTTAACATGGTAAATGACCAGTATGCGAATTATGTAGTCTAAAGAATTT
TTGATTCATGTTCTAACAAAGAATAAAAATAAATACATTAATAGCTAAATTTATGGAGCA
AAAAAAATCTTTTAAAAGAAAATGGTAAAAATTATTTACTTTTAATTAATTAAAATCGAT
AAATAATTCAATTTAATTAAAAATTAAATTTAATTAAACTATTTAAAGGTAAGCATCCCT
TCAAATATATTGATGACCTTCTAAGACAAAATGAGTTTCATAATAATTCTAACAACAGCT
TTAGAAGTAATCAAGGCAAGATGGTAGCTTAGGGCAATTTCTCTACTAATAATAACTAGC
ATAGCTATTAAAATAGAAATAATTAAAATATGATGCATAATAATTAGAAATAATCTTAAC
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GTTTAGTAAATAAAAATAATTTTAATTAAAAAAATCAAAATTAACATCAAAATGTTAATT
AACCGAATTTCAACTAAAAGCACAGATAAAATAACATCAACAACAGTAGTAACAACTAGA
TGACCTCTTAAATGAAAAATCCTCAAATTTAAAACAACTAAAATTAAGAGTCACCTTCAT
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AATCAATTCATAACAACTAACAACAATTTTAAAATGTAAATAATAACAATTTCAGCTATA
ACAAAAACTAAAATGTTGAACCTAACTAAAGCTAAGGATAATAAAATAATAATTATGATG
TGTAGATTAAAAATGGAAATACAAATAACAATAACTATAGCAGCTATAATAATCAATACT
CTTCCCATGGAAAAAGAAATCAATAAGGAAATTATAACTCTTAATAAACTAACAGCAACA
GACCTTATAGGAGATAAAACAACCATAGAGGAAATTATAATTATCACAATCCAATTTATT
ACCAAAGCTATCCTTAACAATACTTTATGTAATAACCATATTTTGGATTTACTCCCTACA
TTTATGTCAATTAGCCTTCTGAATTTACTGACCCATAACTTTTAAACTATTTCGATCCTA
ATAATTTAATGAACCCTCCTTATTTTGATTTTTTATAAGGTGCTCATATAAAGGTCTAAC
AAAATAAAAACAACTAAAATGACAACAACAAGCAGGAATAGCAATCAGAAATTACAACTT
AACCAAATTCTCTTAATTCTCCGCAAACAAACATTGATAAAAAGTAAGATGAAAATTAAG
AAAATCAAACAAATTAATAGGACGGCAGCGAACCAAGCAAATGA