Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00221110

Standard Name

PUF3 (PUmilio-Family protein 3)

Aliases

PreTt22439 | 18.m00465 | 3701.m00222

Description

Pumilio-family RNA binding repeat containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF05672 ) E-MAP-115 family
• ( PF02758 ) PAAD/DAPIN/Pyrin domain
• ( PF00806 ) Pumilio-family RNA binding repeat

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10.1%

TetraMine Data

TTHERM_00221110

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_06792.1	9.997093137033517e-262	pumilio-family RNA binding rep eat containing protein (871 aa )
WormBase	WBGene00004244	2.99851380290819e-19	locus:puf-8 status:Confirmed UniProt:Q09487 protein_id :CCD66262.1
Oxytricha	Contig22789.0.g9	7.001446474249442e-19	Pumilio-family RNA binding rep eat
SGD	YLL013C	5.000468829272308e-18	PUF3 Protein of the mitochondr ial outer surface, links the A rp2/3 complex with the mitocho re during anterograde mitochon drial movement; also binds to and promotes degradation of mR NAs for select nuclear-encoded mitochondrial proteins

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

1. Ref:26688337: Kataoka K, Mochizuki K (2015) Phosphorylation of an HP1-like Protein Regulates Heterochromatin Body Assembly for DNA Elimination. Developmental cell 35(6):775-88

Sequences

>TTHERM_00221110(coding)
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GAAAATCAAACTAATATACAAAGACAGGAGGAATCTAAAAAGTTATAGACGCTATATCAA
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AATCAAACAAATTAATAGGACGGCAGCGAACCAAGCAAATGA

>TTHERM_00221110(protein)
METAIMQQEQLYPRVHNIQQTASNHSEEEDLSTIPCLISVKKSHSTPQNSLADKINQFSD
RQQQQKEKELQEIKEQEKVETSNEEQVINRNKQNSAQQQKKKQEKDVEMRKISTAASEEL
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ESSEKNKLFEEKIRKSIKEFALDKYSHFVLILVLDIGSSGHKRIIIESTLKEKELFSHEQ
FGHKILNKCIEVSKKEFIDQYNEFIKYILDNQSKTYQTLQNDKFGNYVIQKCLEIFDEDH
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YVNQPSEFTDPQLLNYFDPNNLMNPPYFDFLQGAHIKVQQNKNNQNDNNKQEQQSEITTQ
PNSLNSPQTNIDKKQDENQENQTNQQDGSEPSK

>TTHERM_00221110(gene)
ATGGAAACCGCAATAATGTAGCAAGAGTAATTGTATCCTAGAGTACATAACATTCAGCAA
ACTGCCAGTAATCATTCTGAAGAAGAAGATTTAAGCACAATCCCTTGCTTAATATCAGTG
AAAAAGTCGCATTCGACTCCTCAGAATAGCTTGGCTGATAAAATTAATCAATTTTCTGAT
CGCCAATAGCAGTAGAAAGAAAAAGAATTGCAAGAGATAAAAGAATGTATTATTTCAAAT
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GTATTTAGAGATCATTTATTAGATTTGGTATTGGTTAATTCATTAATAAATTGAATGGAA
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ATGTCTATCATTTATTACTTTAAATACATTCCTTTTGCACACCTATCAGGCAAATAAGCT
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ACAAAAACTAAAATGTTGAACCTAACTAAAGCTAAGGATAATAAAATAATAATTATGATG
TGTAGATTAAAAATGGAAATACAAATAACAATAACTATAGCAGCTATAATAATCAATACT
CTTCCCATGGAAAAAGAAATCAATAAGGAAATTATAACTCTTAATAAACTAACAGCAACA
GACCTTATAGGAGATAAAACAACCATAGAGGAAATTATAATTATCACAATCCAATTTATT
ACCAAAGCTATCCTTAACAATACTTTATGTAATAACCATATTTTGGATTTACTCCCTACA
TTTATGTCAATTAGCCTTCTGAATTTACTGACCCATAACTTTTAAACTATTTCGATCCTA
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