Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00558490

Standard Name

PUF2 (Pumilio-family protein 2)

Aliases

PreTt07945 | 73.m00189 | 3735.m00083

Description

Pumilio-family RNA binding repeat containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF06994 ) Involucrin
• ( PF00806 ) Pumilio-family RNA binding repeat

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 9.9%

TetraMine Data

TTHERM_00558490

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_14415.1	9.997093137033517e-262	pumilio-family RNA binding rep eat containing protein (916 aa )
Oxytricha	Contig14151.0.g55	6.9991332754409754e-68	Pumilio-family RNA binding rep eat
WormBase	WBGene00004245	5.000891205279872e-66	locus:puf-9 status:Partially _confirmed UniProt:Q23191 protein_id:CCD69461.1
SGD	YLL013C	3.0012565309061457e-65	PUF3 Protein of the mitochondr ial outer surface, links the A rp2/3 complex with the mitocho re during anterograde mitochon drial movement; also binds to and promotes degradation of mR NAs for select nuclear-encoded mitochondrial proteins
DictyBase	DDB_G0279735	1.9994274381022833e-63	pufA on chromosome: 3 position 2548824 to 2551966
Stentor Coeruleus	SteCoe_17992	8.75651076269652e-27

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00558490(coding)
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CATAATAATTAAAATAATAACAATAATCATATTAATCATAATAACTATAAAAAGAATTAC
AACAGTAATAACCATTATTGA

>TTHERM_00558490(protein)
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SGPMNNNSNNNNNNNYNNNSNNNNGYNHHNNNNNNHHSQHHNNQNNNNNHINHNNYKKNY
NSNNHY

>TTHERM_00558490(gene)
ATGGACGATAAAGATAAGCAAAGCTTCTTATTAAAGTAGCCGCAATTTAAAGTCTACTAG
CATGCCGAACTCTTCAATGGGATTCAGAAAAAACCCGAAGAGGGTGAGCTTTTGATGGGA
GGAATATTAGATGGTTTTTATTTTTTATTTTTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTATTTTTTC
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ATTTTTAATTGTTTTATATTAATGCTGAAATAAAAAAAAGAAACGTAACAGAAAAATCTA
TTGTTTATTCTGATGAAGAATTCAAAGCTGGAGTATTGGATGTTTTATTAAGGCCAAACA
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TTAAATTAAATTTAAAAATTTAATAAAAAATAGTACAGGTATAGTTAGGTTGACAAAAAA
TGCCTTTGGTAACTATGTTGTGCAAAGGCTGTATGAAAAAGCATAACATGAGACAAAACT
AAGGGTTTGCTAATATTTGTTATAAAATAATGATGTTTACAACGAAGTAATCTCAAATAG
TTTTGGTATGCATTTTTTAATATAAAATAAAAAGCTATGAGAATAATTATTTTGATTTTA
TTGAATTAAAAATATTTAAGATAATAAATTTGATTGTGATTATTATTAATTAAAATTAAT
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TTAGCAAAATGTAGGCAACATACAAAATTAAAATATGAATAACAATAATAATAGTGGGCC
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