Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00535890

Standard Name

PUF1 (PUmilio-family protein 1)

Aliases

PreTt03174 | 69.m00216 | 3718.m00078

Description

Pumilio-family RNA binding repeat containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

GBrowse

Genome Browser (Micronucleus)

GBrowse

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

  • ( PF00210 ) Ferritin-like domain
  • ( PF00806 ) Pumilio-family RNA binding repeat
  • ( TIGR00213 ) D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase

Gene Expression Profile

  • Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%

TetraMine Data

TTHERM_00535890

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

SourceIdentifierScoreDescription
Tetrahymena borealisEI9_11150.19.997093137033517e-262pumilio-family RNA binding rep
eat containing protein (707 aa
)
OxytrichaContig474.1.g522.9993110246221282e-28Pumilio-family RNA binding rep
eat
SGDYGL014W2.0002795641672355e-21PUF4 Member of the PUF protein
family, which is defined by t
he presence of Pumilio homolog
y domains that confer RNA bind
ing activity; preferentially b
inds mRNAs encoding nucleolar
ribosomal RNA-processing facto
rs
DictyBaseDDB_G02899877.997402223525235e-19DDB_G0289987 on chromosome: 5
position 3515224 to 3518414
WormBaseWBGene000042450.000000000000004001928599951003locus:puf-9 status:Partially
_confirmed UniProt:Q23191
protein_id:CCD69461.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00535890(coding)
ATGGATAATCAAAAAAGGTTTTAAGTTAATTATAAAGTAGGTACATCAAGTTCTAAAAAC
GCATTTGGAAATGGTCTTTTTATTTAAGATGATTTCAAAGCAAACGTGCCAGCTGATGTA
AAAAAGATATTCTCGAGCGATGATGATAATTTAGGAAGTATATCTACTAATTAAAATGAT
TTTGTCCTATCAGGATTTGATGAAGAAGAAAATGAATCTGAATCGATCTATAAGACATGT
AGCGAGACATTACAAACATTGCCTTTATAAATCTGCCCTTATTGCCTCAAATTGGTGAAT
GAGATTCCTTATAAGATTGTAGAATTTCACAAATTAAAAGAAAAAAAATTTGCAATTCAT
AAGTAATGTGACGAAGGAATCATTAGATTAAAGAACTAATATGAGTTTGTCAACACTATG
TATACCTTTTAGTAGAATGAAGGACGGCTTTTTTCAAGTAGCTATTCTTAAGTTGGAAGA
CCAAAATTGCATTAGTCTCATCTAATTATGGTTGAAATATAACATCCGATATCAAATGCA
ACAATATTTAGTATTCAATAAATTTCTGATCTTTATCAGAGCCCTCATTCTATGAATAAT
GACTATATAAAGCTTAACTTAAATTCAGGTCAGTTATATTAACCTTAATAATACATCGTT
CCTATACATATATTTAGTTTAAGATCGACGGTCATTAACCTTGAAGATAGAAAACACTTT
GTAATTGATATGGTTATAAATCTTTCTTAGTTTGAAGATGGCACAGAATTAGAATTAAAA
GGGAGAAAAGATGAAGTAGGAGAATTAAAGGTGTGCGGAATAGTTTTGGAAAAAAATATC
AACAAAATTAATTCAAATAAAAATAATTACTAAATTCCATAATAATGGTTTTAGTAGGGT
ACAGGAAACAAATGTTTTGAGATATTTTCAATTGAGCTCGATTTCATTGATCCAGCTATT
GAAAAAGTAAGAAAGACAATTCAAGAAATATTTCCTAAATTGAATGTTAGTAACTAACCT
TATACTCCTCCTCTTTCACATGGAAGTAATTCTCCTACGTTTAGCCCTTAAAGAGACATG
AGTCCATCGACAACTGGGTGCACTACACCACCTCATGAATAATTAACATACTCACAAATC
AAAGGCTAAATAGCAAATAAAGTTCAAAAAAATAAGGAATGGTCTATGGCAATCTAAATG
CTCATCAAAAAGTCAGCTGAAAATAATGCTTATTATGAAATATAAGCAGTTATAGATGAA
ATTAAAGGAAGATTAGTTGAATTAATGAAGCACCACTATGGAAATTATTTTTCTAAAACT
TTAGTTTAAGTCTGTACTATGCAGCAAAAGTGCATAATACTACAAGAAATAAAAGACATG
TTCCCTGATATTTCTTAAGATCCCTAAGGAACTCATGCTATTTAATCTTTGGTAGAAACG
ATAAAGCTAGAAAATGAAAGGGAATAAATCCTTGTAATTTAGTGTGTTGGAATGTACATT
ATCCCTATGACTTTAAATCCTAATGCTACTCATGTAATTAATAAAATCGTTCAGAACTTT
ACTTTAAACAATATCCTGTGTATATACGATGCAGTCATTAAAAATTTCAAAGAGGTGGTT
AAAAATAAACAAGGAGTGTGCATTATAAAGTCTTTAATGAATAGATTCAAAGATACAATA
TAAAAAAAATAATAAATTTTATAGCTGTTAAAAGTAGATATAAGAAATACTGTTATAGAT
AAATATGGAAATTATGCTCTCTAGGAGGCTATTAAAATATATCCGAATGACGAAACAGAA
TTCATATGCGATTACGTTTTTGAAAACATGATTATGCTAGCATAAAATTAGGTTTCATCT
AATATCGTAGAATCGGTTTTACAGTTTTGCAAAAAGTAAAGAGCTAAATACATTCAAAAG
ATTATGGAGAACATGATATTACTATTTAATGATTCATTTGGTAAATTTGTTATAAAGAGA
GTGATAAATTTAGTGGATGTTGACAATTTCTAGATGCTTTAGTTTAAATAGATTTTAAAT
TAATGTATTGCTAACAACCCAAAATAAGGAGCATTTTACACAAACTAAAAATCATAGATA
AGTCCTAAGAGTAAAAATATGTTGAATTGA


>TTHERM_00535890(protein)
MDNQKRFQVNYKVGTSSSKNAFGNGLFIQDDFKANVPADVKKIFSSDDDNLGSISTNQND
FVLSGFDEEENESESIYKTCSETLQTLPLQICPYCLKLVNEIPYKIVEFHKLKEKKFAIH
KQCDEGIIRLKNQYEFVNTMYTFQQNEGRLFSSSYSQVGRPKLHQSHLIMVEIQHPISNA
TIFSIQQISDLYQSPHSMNNDYIKLNLNSGQLYQPQQYIVPIHIFSLRSTVINLEDRKHF
VIDMVINLSQFEDGTELELKGRKDEVGELKVCGIVLEKNINKINSNKNNYQIPQQWFQQG
TGNKCFEIFSIELDFIDPAIEKVRKTIQEIFPKLNVSNQPYTPPLSHGSNSPTFSPQRDM
SPSTTGCTTPPHEQLTYSQIKGQIANKVQKNKEWSMAIQMLIKKSAENNAYYEIQAVIDE
IKGRLVELMKHHYGNYFSKTLVQVCTMQQKCIILQEIKDMFPDISQDPQGTHAIQSLVET
IKLENEREQILVIQCVGMYIIPMTLNPNATHVINKIVQNFTLNNILCIYDAVIKNFKEVV
KNKQGVCIIKSLMNRFKDTIQKKQQILQLLKVDIRNTVIDKYGNYALQEAIKIYPNDETE
FICDYVFENMIMLAQNQVSSNIVESVLQFCKKQRAKYIQKIMENMILLFNDSFGKFVIKR
VINLVDVDNFQMLQFKQILNQCIANNPKQGAFYTNQKSQISPKSKNMLN


>TTHERM_00535890(gene)
ATGGATAATCAGTATTTATTTTTATTATCACTTTTATTAATTTGCATTCAAAAACTTTTT
CAGTCCTACAAACAAGCAAGATCAATTTGTTAAATCATTTTTTATTTAGAAAAAGGTTTT
AAGGTATAAACTCAATTGCATTTACTCTATTATTAGGATTTTATTTCATAATTAACTTTC
GAATTGAAAGGAGCAGCGTATAGACGCATTAAATTAGTTAATTATAAAGTAGGTACATCA
AGTTCTAAAAACGCATTTGGAAATGGTCTTTTTATTTAAGATGATTTCAAAGCAAACGTG
CCAGCTGATGTAAAAAAGATATTCTCGAGTAAATAAAAATAAATAAATTTATTTAAATAA
TTGGTTATGTTGAGCTCTTTTAAATTTAGAAGAATCTTGTTTTTATTTATTTAATTATTT
ACTGGAAATAACAATTCAGAAAAATTTTTATAAATATGTTAAAGGCGATGATGATAATTT
AGGAAGTATATCTACTAATTAAAATGATTTTGTCCTATCAGGATGTAAATTAGATCAATT
GTTCAAATAAAAAAGAGAGAATATTTTTTATACAATCAAAAAAAGTTGATGAAGAAGAAA
ATGAATCTGAATCGATCTATAAGACATGTAGCGAGACATTACAAACATTGCCTTTATAAA
TCTGCCCTTATTGCCTCAAATGTAATATTTTTATAACTAATATTTTAGTTTAATGAGCGA
AGAAGCGAAATACATCTGAAGCACAACCTTTTCCTTTTATTTATATTCATACAAATAATA
ATTTAAAAAGTGGTGAATGAGATTCCTTATAAGATTGTAGAATTTCACAAATTAAAAGAA
AAAAAATTTGCAATTCATAAGTAATGTGACGAAGGAATCATTAGATTAAAGAACTAATAT
GAGTTTGTCAACACTATGTATACCTTTTAGTAGAATGAAGGACGGCTTTTTTCAAGTAGC
TATTCTTAAGTTGGAAGACCAAAATTGCATTAGTCTCATCTAATTATGGTTGAAATATAA
CATCCGATATCAAATGCAACAATATTTAGTATTCAATAAATTTCTGATCTTTATCAGAGC
CCTCATTCTGTAATTACATTTAAACAAATATCATTTACAAACAAATACTTTATTTTAAGA
AGAATAAGAATTATAAATTAAAATTATTTTTAATATAAATGAGTTAATCTGAGTATTTAC
TTTTTTAAAATAAAGATGAATAATGACTATATAAAGCTTAACTTAAATTCAGGTCAGTTA
TATTAACCTTAATAATACATCGTTCCTATACATATATTTAGTTTAAGATCGACGGTCATT
AACCTTGAAGATGTATTTATTATTAAAATATGAATTCAAAAAAAGTAAATGGGATTTAAA
AATATAATAGAGAAAACACTTTGTAATTGATATGGTTATAAATCTTTCTTAGTTTGAAGA
TGGCACAGAATTAGAATTAAAAGGGGTAAAATATACAAAAAATAATATTGAGTAATAGTT
TTAATTAATTAATAATTTACTTATTTAGAGAAAAGATGAAGTAGGAGAATTAAAGGTGTG
CGGAATAGTTTTGGAAAAAAATATCAACAAAATTAATTCAAATAAAAATAATTACTAAAT
TCCATAATAATGGTTTTAGTAGGGTACAGGAAACAAATGTTTTGAGATATTTTCAATTGA
GCTCGATTTCATTGATCCAGCGTAAATAATGAATTTGCATTTATAACATTTAACAATAAG
TTAATTTTAAAGTATTGAAAAAGTAAGAAAGACAATTCAAGAAATATTTCCTAAATTGAA
TGTTAGTAACTAACCTTATACTCCTCCTCTTTCACATGGAAGTAATTTACATAAAACTAA
TAAATATTACAAAATTTATAATTTATGAAATTGTAGGTAATTCTCCTACGTTTAGCCCTT
AAAGAGACATGAGTCCATCGACAACTGGGTGCACTACACCACCTCATGAATAATTAACAT
ACTCACAAATCAAAGGCTAAATAGCAAATAAAGTTCAAAAAAATAAGGAATGGTCTATGG
CAATCTAAATGCTCATCAAAAAGTCAGCTGAAAATAATGCTTATTATGAAATATAAGCAG
TTATAGATGAAATTAAAGGAAGATTAGTTGAATTAATGAAGCACCACTATGGAAATTATT
TTTCTAAAACTTTAGTTTAAGTCTGTACTATGCAGCAAAAGTGCATAATACTACAAGAAG
TAAAGCATTATAAATTTTATTTTCTATTTTGAATAAATAATTTACATAGATAAAAGACAT
GTTCCCTGATATTTCTTAAGATCCCTAAGGAACTCATGCTATTTAATCTTTGGTAGAAAC
GATAAAGCTAGAAAATGAAAGGGAATAAATCCTTGTAATTTAGTGTGTTGGAATGTACAT
TATCCCTATGACTTTAGTAATGAAAAATACATTCTTATAAAAATTTTAATAAAGCAATTT
TTTATAATTTTAAAGAATCCTAATGCTACTCATGTAATTAATAAAATCGTTCAGAACTTT
ACTTTAAACAATATCCTGTGTATATACGATGCAGTCATTAAAAATTTCAAAGAGGTGGTT
AAAAATAAACAAGGAGTGTGCATTGTAAATTTTTATAGTTTTCTAAAATTTATTTTTTCT
AAACTGATTTTATTGAATTATAAATAAATAAACAGATAAAGTCTTTAATGAATAGATTCA
AAGATACAATATAAAAAAAATAATAAATTTTATAGCTGTTAAAAGTAGATATAAGAAATA
CTGTTATAGATAAATATGGAAATTATGCTCTCTAGGAGGCTATTAAAGTAAAAAAAAAAA
TTGTATTATTATCAATTCAATTAATTAAATATTTTATCACAGATATATCCGAATGACGAA
ACAGAATTCATATGCGATTACGTTTTTGAAAACATGATTATGCTAGCATAAAATTAGGTT
TCATCTAATATCGTAGAATCGGTTTTACAGTTTTGCAAAAAGGTAATAATAATATTTTTT
TATTTTAGAAAGATTAAAATTAACCTATTAAATAAACAAATAAAAATAGTAAAGAGCTAA
ATACATTCAAAAGATTATGGAGAACATGATATTACTATTTAATGATTCATTTGGTAAATT
TGTTATAAAGAGAGTGATAAATTTAGTGGATGTTGACAATTTCTAGATGCTTTAGTTTAA
ATAGATTTTAAATTAATGTATTGCTAACAACCCAAAATAAGGAGCATTTTACACAAACTA
AAAATCATAGATAAGTCCTAAGAGTAAAAATATGTTGAATTGA