Identifiers and Description
Gene Model Identifier
TTHERM_00535890Standard Name
PUF1 (PUmilio-family protein 1)Aliases
PreTt03174 | 69.m00216 | 3718.m00078Description
PUF1 pumilio-family RNA-binding repeat protein; Pumilio-family RNA binding repeat containing proteinGenome Browser (Macronucleus)
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Genome Browser (Micronucleus)
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Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
Gene Expression Profile
Change in Gene Expression
TMHMM
TMHMM
Signal Peptide
Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%
TetraMine Data
TTHERM_00535890
WebApollo
Fullscreen View
Tetrahymena Stock Center
No Data fetched for StockID
Homologs (v.2006 protein sequences)
Source Identifier Score Description Tetrahymena borealis EI9_11150.1 9.997093137033517e-262 pumilio-family RNA binding rep
eat containing protein (707 aa
)
Oxytricha Contig474.1.g52 2.9993110246221282e-28 Pumilio-family RNA binding rep
eat
SGD YGL014W 2.0002795641672355e-21 PUF4 Member of the PUF protein
family, which is defined by t
he presence of Pumilio homolog
y domains that confer RNA bind
ing activity; preferentially b
inds mRNAs encoding nucleolar
ribosomal RNA-processing facto
rs
DictyBase DDB_G0289987 7.997402223525235e-19 DDB_G0289987 on chromosome: 5
position 3515224 to 3518414
WormBase WBGene00004245 0.000000000000004001928599951003 locus:puf-9 status:Partially
_confirmed UniProt:Q23191
protein_id:CCD69461.1
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>TTHERM_00535890(coding)
ATGTAAATATAATAGTATAATTAAGCTATTTTCGTTAATCTTAATTATAAAGTAGGTACA
TCAAGTTCTAAAAACGCATTTGGAAATGGTCTTTTTATTTAAGATGATTTCAAAGCAAAC
GTGCCAGCTGATGTAAAAAAGATATTCTCGAGCGATGATGATAATTTAGGAAGTATATCT
ACTAATTAAAATGATTTTGTCCTATCAGGATTTGATGAAGAAGAAAATGAATCTGAATCG
ATCTATAAGACATGTAGCGAGACATTACAAACATTGCCTTTATAAATCTGCCCTTATTGC
CTCAAATTGGTGAATGAGATTCCTTATAAGATTGTAGAATTTCACAAATTAAAAGAAAAA
AAATTTGCAATTCATAAGTAATGTGACGAAGGAATCATTAGATTAAAGAACTAATATGAG
TTTGTCAACACTATGTATACCTTTTAGTAGAATGAAGGACGGCTTTTTTCAAGTAGCTAT
TCTTAAGTTGGAAGACCAAAATTGCATTAGTCTCATCTAATTATGGTTGAAATATAACAT
CCGATATCAAATGCAACAATATTTAGTATTCAATAAATTTCTGATCTTTATCAGAGCCCT
CATTCTATGAATAATGACTATATAAAGCTTAACTTAAATTCAGGTCAGTTATATTAACCT
TAATAATACATCGTTCCTATACATATATTTAGTTTAAGATCGACGGTCATTAACCTTGAA
GATAGAAAACACTTTGTAATTGATATGGTTATAAATCTTTCTTAGTTTGAAGATGGCACA
GAATTAGAATTAAAAGGGAGAAAAGATGAAGTAGGAGAATTAAAGGTGTGCGGAATAGTT
TTGGAAAAAAATATCAACAAAATTAATTCAAATAAAAATAATTACTAAATTCCATAATAA
TGGTTTTAGTAGGGTACAGGAAACAAATGTTTTGAGATATTTTCAATTGAGCTCGATTTC
ATTGATCCAGCTATTGAAAAAGTAAGAAAGACAATTCAAGAAATATTTCCTAAATTGAAT
GTTAGTAACTAACCTTATACTCCTCCTCTTTCACATGGAAGTAATTCTCCTACGTTTAGC
CCTTAAAGAGACATGAGTCCATCGACAACTGGGTGCACTACACCACCTCATGAATAATTA
ACATACTCACAAATCAAAGGCTAAATAGCAAATAAAGTTCAAAAAAATAAGGAATGGTCT
ATGGCAATCTAAATGCTCATCAAAAAGTCAGCTGAAAATAATGCTTATTATGAAATATAA
GCAGTTATAGATGAAATTAAAGGAAGATTAGTTGAATTAATGAAGCACCACTATGGAAAT
TATTTTTCTAAAACTTTAGTTTAAGTCTGTACTATGCAGCAAAAGTGCATAATACTACAA
GAAATAAAAGACATGTTCCCTGATATTTCTTAAGATCCCTAAGGAACTCATGCTATTTAA
TCTTTGGTAGAAACGATAAAGCTAGAAAATGAAAGGGAATAAATCCTTGTAATTTAGTGT
GTTGGAATGTACATTATCCCTATGACTTTAAATCCTAATGCTACTCATGTAATTAATAAA
ATCGTTCAGAACTTTACTTTAAACAATATCCTGTGTATATACGATGCAGTCATTAAAAAT
TTCAAAGAGGTGGTTAAAAATAAACAAGGAGTGTGCATTATAAAGTCTTTAATGAATAGA
TTCAAAGATACAATATAAAAAAAATAATAAATTTTATAGCTGTTAAAAGTAGATATAAGA
AATACTGTTATAGATAAATATGGAAATTATGCTCTCTAGGAGGCTATTAAAATATATCCG
AATGACGAAACAGAATTCATATGCGATTACGTTTTTGAAAACATGATTATGCTAGCATAA
AATTAGGTTTCATCTAATATCGTAGAATCGGTTTTACAGTTTTGCAAAAAGTAAAGAGCT
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TTTGTTATAAAGAGAGTGATAAATTTAGTGGATGTTGACAATTTCTAGATGCTTTAGTTT
AAATAGATTTTAAATTAATGTATTGCTAACAACCCAAAATAAGGAGCATTTTACACAAAC
TAAAAATCATAGATAAGTCCTAAGAGTAAAAATATGTTGAATTGA>TTHERM_00535890(protein)
MQIQQYNQAIFVNLNYKVGTSSSKNAFGNGLFIQDDFKANVPADVKKIFSSDDDNLGSIS
TNQNDFVLSGFDEEENESESIYKTCSETLQTLPLQICPYCLKLVNEIPYKIVEFHKLKEK
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DRKHFVIDMVINLSQFEDGTELELKGRKDEVGELKVCGIVLEKNINKINSNKNNYQIPQQ
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NDETEFICDYVFENMIMLAQNQVSSNIVESVLQFCKKQRAKYIQKIMENMILLFNDSFGK
FVIKRVINLVDVDNFQMLQFKQILNQCIANNPKQGAFYTNQKSQISPKSKNMLN>TTHERM_00535890(gene)
ATGTAAATATAATAGTATAATTAAGCTATTTTCGTTAATCGTATTATATTAAATTCAAAG
TATCTCAAATTTCAGTCCTAATAAAATAAACTATGAATATCAATTTTTTTTAGAAAAATA
GATTTTTAAAACATCTAAAATGGTATTTCAAAAATTTTTTTGTTATACTTTTTTTCTTTA
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AAAAATAATAAAAAATTATCATTTGATATAAAATTAAAATCATAAATAATTAATGAATTC
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AATATAGAAAGATTAAATTTGAAAAAGGATAGAACTATGCTTTAAATCTAGATACCTCTA
TAAAACATATGTATTTAGACCACTTATTACTGAGTAATTAATATATTTTTTTTTGTTATT
GCCTGTAATGATTTATTACTTAAAAGATTAATGAAATGAAGTGAATTATAGCTTAGAGTA
AAAATAATTACAATTAAATCTTTATATAAGTTAAACACTTAAGCTAAAGTAGAAAAGAGG
AAATTAAATCTTATATAAAAACAAAATTTATATTATAAAATATCTTAAACTTTAACAAGT
AGAAAAAAGAAAGAAAAAAACACTTCAATCCAATAAGATATTTCTTTTATTAATTTTAAT
AAATAATTCTTTTATTAACATCAATTGTCCTTTTTACATTAACAAAACAATTTTATATGT
ATTTTAAAAATATCTAAATTAAATATTTTAAATTTTTTTAAGAAATTTATAAATAATTTT
AATAATTACTATTGAATTATTGATTACTAATTGATGCATTGGATATTAATGAAATTTCGT
AAAAAATAATACTTGAAAATATTACTAAAAAGTGAAATCTTAAATTGAATAAATAAATAA
TTTAATGAATAATTAATCAATCAAATAATCTATGAATAGTTTATTTTAAATAACTTTAAC
TAGTAATATTTACATAACCATATACTTAAAACATTGTAAATAAATAAACAAAGTAGGAAG
AATATTTGCAAATTAATTGATTTTAATTAAAAATAAGCAAATTGTCAAAGCAAAGATACA
TTCATATCGTTTTTGTATTTAAAAGAAAGCATTTTGCTAAATAAAGCTCACAGATTGTTA
ATTTTAAACATACATATTACTTACTTACTAGATTAGACCATTATATATTATCATAAGCTT
AGCTATACTTGTATACTCATATTAAAGTAGTTCTTAATTAGATATAATTCTTCTCTACCT
CAAATGGATAATCAGTATTTATTTTTATTATCACTTTTATTAATTTGCATTCAAAAACTT
TTTCAGTCCTACAAACAAGCAAGATCAATTTGTTAAATCATTTTTTATTTAGAAAAAGGT
TTTAAGGTATAAACTCAATTGCATTTACTCTATTATTAGGATTTTATTTCATAATTAACT
TTCGAATTGAAAGGAGCAGCGTATAGACGCATTAAATTAGTTAATTATAAAGTAGGTACA
TCAAGTTCTAAAAACGCATTTGGAAATGGTCTTTTTATTTAAGATGATTTCAAAGCAAAC
GTGCCAGCTGATGTAAAAAAGATATTCTCGAGTAAATAAAAATAAATAAATTTATTTAAA
TAATTGGTTATGTTGAGCTCTTTTAAATTTAGAAGAATCTTGTTTTTATTTATTTAATTA
TTTACTGGAAATAACAATTCAGAAAAATTTTTATAAATATGTTAAAGGCGATGATGATAA
TTTAGGAAGTATATCTACTAATTAAAATGATTTTGTCCTATCAGGATGTAAATTAGATCA
ATTGTTCAAATAAAAAAGAGAGAATATTTTTTATACAATCAAAAAAAGTTGATGAAGAAG
AAAATGAATCTGAATCGATCTATAAGACATGTAGCGAGACATTACAAACATTGCCTTTAT
AAATCTGCCCTTATTGCCTCAAATGTAATATTTTTATAACTAATATTTTAGTTTAATGAG
CGAAGAAGCGAAATACATCTGAAGCACAACCTTTTCCTTTTATTTATATTCATACAAATA
ATAATTTAAAAAGTGGTGAATGAGATTCCTTATAAGATTGTAGAATTTCACAAATTAAAA
GAAAAAAAATTTGCAATTCATAAGTAATGTGACGAAGGAATCATTAGATTAAAGAACTAA
TATGAGTTTGTCAACACTATGTATACCTTTTAGTAGAATGAAGGACGGCTTTTTTCAAGT
AGCTATTCTTAAGTTGGAAGACCAAAATTGCATTAGTCTCATCTAATTATGGTTGAAATA
TAACATCCGATATCAAATGCAACAATATTTAGTATTCAATAAATTTCTGATCTTTATCAG
AGCCCTCATTCTGTAATTACATTTAAACAAATATCATTTACAAACAAATACTTTATTTTA
AGAAGAATAAGAATTATAAATTAAAATTATTTTTAATATAAATGAGTTAATCTGAGTATT
TACTTTTTTAAAATAAAGATGAATAATGACTATATAAAGCTTAACTTAAATTCAGGTCAG
TTATATTAACCTTAATAATACATCGTTCCTATACATATATTTAGTTTAAGATCGACGGTC
ATTAACCTTGAAGATGTATTTATTATTAAAATATGAATTCAAAAAAAGTAAATGGGATTT
AAAAATATAATAGAGAAAACACTTTGTAATTGATATGGTTATAAATCTTTCTTAGTTTGA
AGATGGCACAGAATTAGAATTAAAAGGGGTAAAATATACAAAAAATAATATTGAGTAATA
GTTTTAATTAATTAATAATTTACTTATTTAGAGAAAAGATGAAGTAGGAGAATTAAAGGT
GTGCGGAATAGTTTTGGAAAAAAATATCAACAAAATTAATTCAAATAAAAATAATTACTA
AATTCCATAATAATGGTTTTAGTAGGGTACAGGAAACAAATGTTTTGAGATATTTTCAAT
TGAGCTCGATTTCATTGATCCAGCGTAAATAATGAATTTGCATTTATAACATTTAACAAT
AAGTTAATTTTAAAGTATTGAAAAAGTAAGAAAGACAATTCAAGAAATATTTCCTAAATT
GAATGTTAGTAACTAACCTTATACTCCTCCTCTTTCACATGGAAGTAATTTACATAAAAC
TAATAAATATTACAAAATTTATAATTTATGAAATTGTAGGTAATTCTCCTACGTTTAGCC
CTTAAAGAGACATGAGTCCATCGACAACTGGGTGCACTACACCACCTCATGAATAATTAA
CATACTCACAAATCAAAGGCTAAATAGCAAATAAAGTTCAAAAAAATAAGGAATGGTCTA
TGGCAATCTAAATGCTCATCAAAAAGTCAGCTGAAAATAATGCTTATTATGAAATATAAG
CAGTTATAGATGAAATTAAAGGAAGATTAGTTGAATTAATGAAGCACCACTATGGAAATT
ATTTTTCTAAAACTTTAGTTTAAGTCTGTACTATGCAGCAAAAGTGCATAATACTACAAG
AAGTAAAGCATTATAAATTTTATTTTCTATTTTGAATAAATAATTTACATAGATAAAAGA
CATGTTCCCTGATATTTCTTAAGATCCCTAAGGAACTCATGCTATTTAATCTTTGGTAGA
AACGATAAAGCTAGAAAATGAAAGGGAATAAATCCTTGTAATTTAGTGTGTTGGAATGTA
CATTATCCCTATGACTTTAGTAATGAAAAATACATTCTTATAAAAATTTTAATAAAGCAA
TTTTTTATAATTTTAAAGAATCCTAATGCTACTCATGTAATTAATAAAATCGTTCAGAAC
TTTACTTTAAACAATATCCTGTGTATATACGATGCAGTCATTAAAAATTTCAAAGAGGTG
GTTAAAAATAAACAAGGAGTGTGCATTGTAAATTTTTATAGTTTTCTAAAATTTATTTTT
TCTAAACTGATTTTATTGAATTATAAATAAATAAACAGATAAAGTCTTTAATGAATAGAT
TCAAAGATACAATATAAAAAAAATAATAAATTTTATAGCTGTTAAAAGTAGATATAAGAA
ATACTGTTATAGATAAATATGGAAATTATGCTCTCTAGGAGGCTATTAAAGTAAAAAAAA
AAATTGTATTATTATCAATTCAATTAATTAAATATTTTATCACAGATATATCCGAATGAC
GAAACAGAATTCATATGCGATTACGTTTTTGAAAACATGATTATGCTAGCATAAAATTAG
GTTTCATCTAATATCGTAGAATCGGTTTTACAGTTTTGCAAAAAGGTAATAATAATATTT
TTTTATTTTAGAAAGATTAAAATTAACCTATTAAATAAACAAATAAAAATAGTAAAGAGC
TAAATACATTCAAAAGATTATGGAGAACATGATATTACTATTTAATGATTCATTTGGTAA
ATTTGTTATAAAGAGAGTGATAAATTTAGTGGATGTTGACAATTTCTAGATGCTTTAGTT
TAAATAGATTTTAAATTAATGTATTGCTAACAACCCAAAATAAGGAGCATTTTACACAAA
CTAAAAATCATAGATAAGTCCTAAGAGTAAAAATATGTTGAATTGA