Identifiers and Description

Gene Model Identifier

TTHERM_00535890

Standard Name

PUF1 (PUmilio-family protein 1)

Aliases

PreTt03174 | 69.m00216 | 3718.m00078

Description

Pumilio-family RNA binding repeat containing protein

Genome Browser (Macronucleus)

Genome Browser (Micronucleus)

Gene Ontology Annotations

No Data fetched for Gene Ontology Annotations

Domains

• ( PF00210 ) Ferritin-like domain
• ( PF00806 ) Pumilio-family RNA binding repeat
• ( TIGR00213 ) D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase

Gene Expression Profile

• Tetrahymena Functional Genomics Database:

Change in Gene Expression

TMHMM

TMHMM

Signal Peptide

Signal Peptide Present?: No
Presense Probability: 10%

TetraMine Data

TTHERM_00535890

WebApollo

Fullscreen View

Tetrahymena Stock Center

No Data fetched for StockID

Homologs (v.2006 protein sequences)

Source	Identifier	Score	Description
Tetrahymena borealis	EI9_11150.1	9.997093137033517e-262	pumilio-family RNA binding rep eat containing protein (707 aa )
Oxytricha	Contig474.1.g52	2.9993110246221282e-28	Pumilio-family RNA binding rep eat
SGD	YGL014W	2.0002795641672355e-21	PUF4 Member of the PUF protein family, which is defined by t he presence of Pumilio homolog y domains that confer RNA bind ing activity; preferentially b inds mRNAs encoding nucleolar ribosomal RNA-processing facto rs
DictyBase	DDB_G0289987	7.997402223525235e-19	DDB_G0289987 on chromosome: 5 position 3515224 to 3518414
WormBase	WBGene00004245	0.000000000000004001928599951003	locus:puf-9 status:Partially _confirmed UniProt:Q23191 protein_id:CCD69461.1

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>TTHERM_00535890(coding)
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GACTATATAAAGCTTAACTTAAATTCAGGTCAGTTATATTAACCTTAATAATACATCGTT
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TAATGTATTGCTAACAACCCAAAATAAGGAGCATTTTACACAAACTAAAAATCATAGATA
AGTCCTAAGAGTAAAAATATGTTGAATTGA

>TTHERM_00535890(protein)
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VIDMVINLSQFEDGTELELKGRKDEVGELKVCGIVLEKNINKINSNKNNYQIPQQWFQQG
TGNKCFEIFSIELDFIDPAIEKVRKTIQEIFPKLNVSNQPYTPPLSHGSNSPTFSPQRDM
SPSTTGCTTPPHEQLTYSQIKGQIANKVQKNKEWSMAIQMLIKKSAENNAYYEIQAVIDE
IKGRLVELMKHHYGNYFSKTLVQVCTMQQKCIILQEIKDMFPDISQDPQGTHAIQSLVET
IKLENEREQILVIQCVGMYIIPMTLNPNATHVINKIVQNFTLNNILCIYDAVIKNFKEVV
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VINLVDVDNFQMLQFKQILNQCIANNPKQGAFYTNQKSQISPKSKNMLN

>TTHERM_00535890(gene)
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TTTTTTAAAATAAAGATGAATAATGACTATATAAAGCTTAACTTAAATTCAGGTCAGTTA
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TTGTATTATTATCAATTCAATTAATTAAATATTTTATCACAGATATATCCGAATGACGAA
ACAGAATTCATATGCGATTACGTTTTTGAAAACATGATTATGCTAGCATAAAATTAGGTT
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TATTTTAGAAAGATTAAAATTAACCTATTAAATAAACAAATAAAAATAGTAAAGAGCTAA
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